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Lista de obras de

A new approach to prediction of short-range conformational propensities in proteins.

artículo científico publicado en 2004

A simple lattice model that exhibits a protein-like cooperative all-or-none folding transition

scientific article published on 01 July 2003

An Unprecedented Number of Cytochrome P450s Are Involved in Secondary Metabolism in Salinispora Species

artículo científico publicado en 2022

Ancient Bacterial Class Alphaproteobacteria Cytochrome P450 Monooxygenases Can Be Found in Other Bacterial Species

artículo científico publicado en 2021

Backbone building from quadrilaterals: a fast and accurate algorithm for protein backbone reconstruction from alpha carbon coordinates

artículo científico publicado en 2007

BioShell Threader: protein homology detection based on sequence profiles and secondary structure profiles

artículo científico publicado en 2012

BioShell--a package of tools for structural biology computations.

artículo científico publicado en 2006

BioShell-Threading: versatile Monte Carlo package for protein 3D threading.

artículo científico publicado en 2014

Biofunctionalisation of p-doped silicon with cytochrome c 553 minimises charge recombination and enhances photovoltaic performance of the all-solid-state photosystem I-based biophotoelectrode

artículo científico publicado en 2017

Coarse-Grained Modeling of the Interplay between Secondary Structure Propensities and Protein Fold Assembly

artículo científico publicado en 2018

Coarse-Grained Protein Models and Their Applications

artículo científico publicado en 2016

Coarse-Grained Protein Models in Structure Prediction

artículo científico publicado en 2014

Combining coarse-grained protein models with replica-exchange all-atom molecular dynamics.

artículo científico publicado en 2013

Comparative modeling without implicit sequence alignments

artículo científico publicado en 2007

Comparison of α-Helix and β-Sheet Structure Adaptation to a Quantum Dot Geometry: Toward the Identification of an Optimal Motif for a Protein Nanoparticle Cover

artículo científico publicado en 2019

Contrasting Health Effects of Bacteroidetes and Firmicutes Lies in Their Genomes: Analysis of P450s, Ferredoxins, and Secondary Metabolite Clusters

artículo científico publicado en 2022

Diversification of Ferredoxins across Living Organisms

artículo científico publicado en 2021

Exploring protein energy landscapes with hierarchical clustering.

artículo científico publicado en 2005

Fast and accurate methods for predicting short-range constraints in protein models

artículo científico publicado en 2008

From Coarse-Grained to Atomic-Level Characterization of Protein Dynamics: Transition State for the Folding of B Domain of Protein A

artículo científico publicado el 19 de abril de 2012

HCPM--program for hierarchical clustering of protein models

artículo científico publicado en 2005

Improving thermal stability of thermophilic L-threonine aldolase from Thermotoga maritima.

artículo científico publicado en 2015

Lifestyles Shape the Cytochrome P450 Repertoire of the Bacterial Phylum Proteobacteria

artículo científico publicado en 2022

More P450s Are Involved in Secondary Metabolite Biosynthesis in Streptomyces Compared to Bacillus, Cyanobacteria, and Mycobacterium

scientific article published on 07 July 2020

Optimization of profile-to-profile alignment parameters for one-dimensional threading

artículo científico publicado en 2012

Protein Structure Prediction Using Coarse-Grained Models

artículo científico publicado en 2018

Protein structure prediction by tempering spatial constraints.

artículo científico publicado en 2005

SURPASS Low-Resolution Coarse-Grained Protein Modeling

artículo científico publicado en 2017

T-Pile--a package for thermodynamic calculations for biomolecules

artículo científico publicado en 2007

The crystal structure of the AF2331 protein from Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 forms an unusual interdigitated dimer with a new type of alpha + beta fold.

artículo científico publicado en 2009

Towards the high-resolution protein structure prediction. Fast refinement of reduced models with all-atom force field.

artículo científico publicado en 2007

Type II restriction endonuclease R.Eco29kI is a member of the GIY-YIG nuclease superfamily

artículo científico publicado en 2007

Utility library for structural bioinformatics

artículo científico publicado en 2008