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Lista de obras de

A bioinformatician's guide to metagenomics

artículo científico publicado en 2008

A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea

artículo científico publicado en 2009

Assembling the marine metagenome, one cell at a time

artículo científico publicado en 2009

Comparative genome structure, secondary metabolite, and effector coding capacity across Cochliobolus pathogens

artículo científico publicado en 2013

Comparison of the complete genome sequences of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a and pv. tomato DC3000

artículo científico publicado en 2005

Complete Genome Sequence of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929, a Novel Strain from a Commercial Ethanol Plant ⬇️

artículo científico publicado el 27 de mayo de 2011

Complete Genome Sequence of Paenibacillus strain Y4.12MC10, a Novel Paenibacillus lautus strain Isolated from Obsidian Hot Spring in Yellowstone National Park

artículo científico publicado en 2012

Complete Genome Sequences of Caldicellulosiruptor sp. Strain Rt8.B8, Caldicellulosiruptor sp. Strain Wai35.B1, and "Thermoanaerobacter cellulolyticus"

artículo científico publicado en 2015

Complete Genome sequence of Burkholderia phymatum STM815(T), a broad host range and efficient nitrogen-fixing symbiont of Mimosa species

artículo científico publicado en 2014

Complete genome of the cellulolytic ruminal bacterium Ruminococcus albus 7.

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence and updated annotation of Desulfovibrio alaskensis G20.

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Acetohalobium arabaticum type strain (Z-7288)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidaminococcus fermentans type strain (VR4).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Acidimicrobium ferrooxidans type strain (ICP).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Actinosynnema mirum type strain (101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Alicyclobacillus acidocaldarius type strain (104-IA)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Aminobacterium colombiense type strain (ALA-1).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Anabaena variabilis ATCC 29413.

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of Anaerococcus prevotii type strain (PC1).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Archaeoglobus profundus type strain (AV18)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Arcobacter nitrofigilis type strain (CI)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Beutenbergia cavernae type strain (HKI 0122).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachybacterium faecium type strain (Schefferle 6-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Brachyspira murdochii type strain (56-150)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Capnocytophaga ochracea type strain (VPI 2845).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Catenulispora acidiphila type strain (ID 139908).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Chitinophaga pinensis type strain (UQM 2034).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Conexibacter woesei type strain (ID131577).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Coraliomargarita akajimensis type strain (04OKA010-24).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Cryptobacterium curtum type strain (12-3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Denitrovibrio acetiphilus type strain (N2460)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfarculus baarsii type strain (2st14).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfohalobium retbaense type strain (HR(100)).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Desulfomicrobium baculatum type strain (X)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfotomaculum acetoxidans type strain (5575)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Desulfurispirillum indicum strain S5(T).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Dyadobacter fermentans type strain (NS114)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Eggerthella lenta type strain (IPP VPI 0255).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Ferroglobus placidus AEDII12DO

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Geodermatophilus obscurus type strain (G-20)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Gordonia bronchialis type strain (3410).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Haliangium ochraceum type strain (SMP-2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Halogeometricum borinquense type strain (PR3)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halomicrobium mukohataei type strain (arg-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Halorhabdus utahensis type strain (AX-2)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Haloterrigena turkmenica type strain (4k)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Hirschia baltica type strain (IFAM 1418(T))

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Jonesia denitrificans type strain (Prevot 55134)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kangiella koreensis type strain (SW-125).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Kribbella flavida type strain (IFO 14399).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Kytococcus sedentarius type strain (541).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Leptotrichia buccalis type strain (C-1013-b).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Marinomonas posidonica type strain (IVIA-Po-181(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Marivirga tractuosa type strain (H-43) ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Meiothermus ruber type strain (21)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Meiothermus silvanus type strain (VI-R2)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Mesorhizobium australicum type strain (WSM2073(T)).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of Mesorhizobium australicum type strain (WSM2073T)

Complete genome sequence of Mesorhizobium ciceri bv. biserrulae type strain (WSM1271(T))

artículo científico publicado en 2014

Complete genome sequence of Mesorhizobium opportunistum type strain WSM2075(T.).

artículo científico publicado en 2013

Complete genome sequence of Methanocorpusculum labreanum type strain Z

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Methanoculleus marisnigri Romesser et al. 1981 type strain JR1

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Nakamurella multipartita type strain (Y-104).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Paenibacillus sp. strain JDR-2.

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Pedobacter heparinus type strain (HIM 762-3).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus type strain (QLW-P1DMWA-1(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Rhizobium leguminosarum bv trifolii strain WSM2304, an effective microsymbiont of the South American clover Trifolium polymorphum

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii strain WSM1325, an effective microsymbiont of annual Mediterranean clovers

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Rhodospirillum rubrum type strain (S1).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Rhodothermus marinus type strain (R-10).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Saccharomonospora viridis type strain (P101).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sanguibacter keddieii type strain (ST-74)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sebaldella termitidis type strain (NCTC 11300).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Segniliparus rotundus type strain (CDC 1076)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Slackia heliotrinireducens type strain (RHS 1)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sphaerobacter thermophilus type strain (S 6022)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Spirosoma linguale type strain (1)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Stackebrandtia nassauensis type strain (LLR-40K-21).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Staphylothermus hellenicus P8

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Staphylothermus marinus Stetter and Fiala 1986 type strain F1

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Streptobacillus moniliformis type strain (9901)

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Sulfurospirillum deleyianum type strain (5175).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thauera aminoaromatica strain MZ1T

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Thermaerobacter marianensis type strain (7p75a)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermanaerovibrio acidaminovorans type strain (Su883).

artículo científico publicado en 2009

Complete genome sequence of Thermobispora bispora type strain (R51).

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermocrinis albus type strain (HI 11/12)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Thermosphaera aggregans type strain (M11TL)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Tolumonas auensis type strain (TA 4)

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of Veillonella parvula type strain (Te3)

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of the Antarctic Halorubrum lacusprofundi type strain ACAM 34.

artículo científico publicado en 2016

Complete genome sequence of the Medicago microsymbiont Ensifer (Sinorhizobium) medicae strain WSM419

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of the Thermophilic Bacterium Exiguobacterium sp. AT1b

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the aerobic, heterotroph Marinithermus hydrothermalis type strain (T1(T)) from a deep-sea hydrothermal vent chimney

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the aquatic bacterium Runella slithyformis type strain (LSU 4(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the cellulose-degrading bacterium Cellulosilyticum lentocellum

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the facultatively chemolithoautotrophic and methylotrophic alpha Proteobacterium Starkeya novella type strain (ATCC 8093(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the facultatively chemolithoautotrophic and methylotrophic alpha Proteobacterium Starkeya novella type strain (ATCC 8093T)

Complete genome sequence of the filamentous gliding predatory bacterium Herpetosiphon aurantiacus type strain (114-95(T)).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the halophilic and highly halotolerant Chromohalobacter salexigens type strain (1H11(T)).

artículo científico publicado en 2011

Complete genome sequence of the melanogenic marine bacterium Marinomonas mediterranea type strain (MMB-1(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the orange-red pigmented, radioresistant Deinococcus proteolyticus type strain (MRP(T)).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the sulfate-reducing firmicute Desulfotomaculum ruminis type strain (DL(T))

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of the thermophilic, hydrogen-oxidizing Bacillus tusciae type strain (T2) and reclassification in the new genus, Kyrpidia gen. nov. as Kyrpidia tusciae comb. nov. and emendation of the family Alicyclobacillaceae da Costa and

artículo científico publicado en 2011

Convergent losses of decay mechanisms and rapid turnover of symbiosis genes in mycorrhizal mutualists

artículo científico publicado en 2015

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

artículo científico publicado en 2018

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

article

Deinococcus geothermalis: the pool of extreme radiation resistance genes shrinks

artículo científico publicado en 2007

Draft Genome Sequence of Frankia sp. Strain DC12, an Atypical, Noninfective, Ineffective Isolate from Datisca cannabina

artículo científico publicado en 2015

Draft genome sequence of Marinobacterium rhizophilum CL-YJ9T (DSM 18822T), isolated from the rhizosphere of the coastal tidal-flat plant Suaeda japonica

artículo científico publicado en 2017

Draft genome sequences of 10 strains of the genus exiguobacterium

artículo científico publicado en 2014

Ectomycorrhizal ecology is imprinted in the genome of the dominant symbiotic fungus Cenococcum geophilum.

artículo científico publicado en 2016

Erratum to: Complete genome sequence of Atopobium parvulum type strain (IPP 1246).

artículo científico publicado en 2010

Genome Sequence of Arenibacter algicola Strain TG409, a Hydrocarbon-Degrading Bacterium Associated with Marine Eukaryotic Phytoplankton

artículo científico publicado en 2016

Genome Sequence of Halomonas sp. Strain MCTG39a, a Hydrocarbon-Degrading and Exopolymeric Substance-Producing Bacterium

artículo científico publicado en 2015

Genome Sequence of Marinobacter sp. Strain MCTG268 Isolated from the Cosmopolitan Marine Diatom Skeletonema costatum

artículo científico publicado en 2016

Genome Sequence of Oceanicola sp. Strain MCTG156(1a), Isolated from a Scottish Coastal Phytoplankton Net Sample

artículo científico publicado en 2017

Genome Sequence of Polycyclovorans algicola Strain TG408, an Obligate Polycyclic Aromatic Hydrocarbon-Degrading Bacterium Associated with Marine Eukaryotic Phytoplankton

artículo científico publicado en 2015

Genome Sequence of Porticoccus hydrocarbonoclasticus Strain MCTG13d, an Obligate Polycyclic Aromatic Hydrocarbon-Degrading Bacterium Associated with Marine Eukaryotic Phytoplankton

artículo científico publicado en 2015

Genome Sequence of Roseovarius sp. Strain MCTG156(2b) Isolated from a Phytoplankton Net Trawl on the Scottish West Coast

artículo científico publicado en 2017

Genome Sequence of the ethene- and vinyl chloride-oxidizing actinomycete Nocardioides sp. strain JS614

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence and analysis of the soil cellulolytic actinomycete Thermobifida fusca YX

artículo científico publicado en 2007

Genome sequence of "Pedosphaera parvula" Ellin514, an aerobic Verrucomicrobial isolate from pasture soil

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of Victivallis vadensis ATCC BAA-548, an anaerobic bacterium from the phylum Lentisphaerae, isolated from the human gastrointestinal tract

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of the chemoheterotrophic soil bacterium Saccharomonospora cyanea type strain (NA-134(T)).

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of the ocean sediment bacterium Saccharomonospora marina type strain (XMU15(T))

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the soil bacterium Saccharomonospora azurea type strain (NA-128(T)).

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of the verrucomicrobium Opitutus terrae PB90-1, an abundant inhabitant of rice paddy soil ecosystems

artículo científico publicado en 2011

Genomic differentiation among wild cyanophages despite widespread horizontal gene transfer

artículo científico publicado en 2016

High quality draft genome sequence of Leucobacter chironomi strain MM2LB(T) (DSM 19883(T)) isolated from a Chironomus sp. egg mass

artículo científico publicado en 2015

High quality permanent draft genome sequence of Phaseolibacter flectens ATCC 12775(T), a plant pathogen of French bean pods

artículo científico publicado en 2016

High-quality draft genome sequence of Flavobacterium suncheonense GH29-5(T) (DSM 17707(T)) isolated from greenhouse soil in South Korea, and emended description of Flavobacterium suncheonense GH29-5(T)

artículo científico publicado en 2016

High-quality permanent draft genome sequence of the extremely osmotolerant diphenol degrading bacterium Halotalea alkalilenta AW-7(T), and emended description of the genus Halotalea

artículo científico publicado en 2015

High-resolution phylogenetic microbial community profiling

artículo científico publicado en 2016

Horizontal gene transfer and gene dosage drives adaptation to wood colonization in a tree pathogen

artículo científico publicado en 2015

Metagenomes and metatranscriptomes from boreal potential and actual acid sulfate soil materials

scientific article published on 16 October 2019

Metagenomic analysis of microbial consortium from natural crude oil that seeps into the marine ecosystem offshore Southern California

artículo científico publicado en 2014

Metatranscriptomic Sequencing of a Cyanobacterial Soil-Surface Consortium with and without a Diverse Underlying Soil Microbiome

artículo científico publicado en 2020

Microbial Community Structure and Functional Potential in Cultivated and Native Tallgrass Prairie Soils of the Midwestern United States

artículo científico publicado en 2018

Microbial metagenomes and metatranscriptomes during a coastal phytoplankton bloom

scientific article published on 22 July 2019

Microbiomes of Velloziaceae from phosphorus-impoverished soils of the campos rupestres, a biodiversity hotspot

artículo científico publicado en 2019

Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea.

artículo científico publicado en 2017

Multiple syntrophic interactions in a terephthalate-degrading methanogenic consortium

artículo científico publicado en 2010

Next generation sequencing data of a defined microbial mock community

artículo científico publicado en 2016

Non-contiguous finished genome sequence and contextual data of the filamentous soil bacterium Ktedonobacter racemifer type strain (SOSP1-21).

artículo científico publicado en 2011

Non-contiguous finished genome sequence of Aminomonas paucivorans type strain (GLU-3).

artículo científico publicado en 2010

Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data ⬇️

artículo científico publicado el 5 de mayo de 2013

Omega: an overlap-graph de novo assembler for metagenomics.

artículo científico

One bacterial cell, one complete genome

artículo científico publicado en 2010

Permanent draft genome sequence of Comamonas testosteroni KF-1

artículo científico publicado en 2013

Phylogenetic and phylogenomic overview of the Polyporales

artículo científico publicado en 2013

Proteome specialization of anaerobic fungi during ruminal degradation of recalcitrant plant fiber

scientific article published on 14 September 2020

Sequencing of multiple clostridial genomes related to biomass conversion and biofuel production

artículo científico publicado en 2010

Shotgun metagenome data of a defined mock community using Oxford Nanopore, PacBio and Illumina technologies

artículo científico publicado en 2019

The DNA sequence and biology of human chromosome 19

artículo científico publicado en 2004

The Paleozoic Origin of Enzymatic Lignin Decomposition Reconstructed from 31 Fungal Genomes

artículo científico publicado en 2012

The Source and Evolutionary History of a Microbial Contaminant Identified Through Soil Metagenomic Analysis

artículo científico publicado en 2017

The fast changing landscape of sequencing technologies and their impact on microbial genome assemblies and annotation

artículo científico publicado en 2012

The genome of wine yeast Dekkera bruxellensis provides a tool to explore its food-related properties

scientific article published on 14 May 2012

The genome sequence of Methanohalophilus mahii SLP(T) reveals differences in the energy metabolism among members of the Methanosarcinaceae inhabiting freshwater and saline environments

artículo científico publicado en 2010

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