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3'UTR Shortening Potentiates MicroRNA-Based Repression of Pro-differentiation Genes in Proliferating Human Cells.

artículo científico publicado en 2016

A broad analysis of splicing regulation in yeast using a large library of synthetic introns

artículo científico publicado en 2021

A catalog of stability-associated sequence elements in 3' UTRs of yeast mRNAs

artículo científico publicado en 2005

A comprehensive tRNA deletion library unravels the genetic architecture of the tRNA pool

artículo científico publicado en 2014

A dual program for translation regulation in cellular proliferation and differentiation

artículo científico publicado en 2014

A mathematical model for adaptive prediction of environmental changes by microorganisms.

artículo científico publicado en 2011

A relay race on the evolutionary adaptation spectrum

artículo científico publicado en 2015

A secretion-enhancing cis regulatory targeting element (SECReTE) involved in mRNA localization and protein synthesis

scientific article published on 01 July 2019

Adaptive prediction of environmental changes by microorganisms.

artículo científico publicado en 2009

An evolutionarily conserved mechanism for controlling the efficiency of protein translation

artículo científico publicado en 2010

Axonal transcription factors signal retrogradely in lesioned peripheral nerve

artículo científico publicado en 2012

Biological causal links on physiological and evolutionary time scales

artículo científico publicado en 2016

Can molecular motors drive distance measurements in injured neurons?

artículo científico publicado en 2009

Chromosomal duplication is a transient evolutionary solution to stress.

artículo científico publicado en 2012

Codon usage of highly expressed genes affects proteome-wide translation efficiency

artículo científico publicado en 2018

Comprehensive quantitative analyses of the effects of promoter sequence elements on mRNA transcription

artículo científico publicado en 2003

Computational identification of transcription factor binding sites via a transcription-factor-centric clustering (TFCC) algorithm

artículo científico publicado en 2002

Correction: Functional Characterization of Variations on Regulatory Motifs.

artículo científico publicado en 2008

Correction: Mitochondrial 16S rRNA Is Methylated by tRNA Methyltransferase TRMT61B in All Vertebrates

artículo científico publicado en 2017

Correction: Transcriptome Kinetics Is Governed by a Genome-Wide Coupling of mRNA Production and Degradation: A Role for RNA Pol II.

artículo científico publicado en 2011

Coupling transcriptional and post-transcriptional miRNA regulation in the control of cell fate.

artículo científico publicado en 2009

CpG Islands as a putative source for animal miRNAs: evolutionary and functional implications

artículo científico publicado en 2010

Determinants of translation efficiency and accuracy ⬇️

artículo científico publicado en 2011

Deterministic Somatic Cell Reprogramming Involves Continuous Transcriptional Changes Governed by Myc and Epigenetic-Driven Modules

scientific article published on 13 December 2018

Discrimination between paralogs using microarray analysis: application to the Yap1p and Yap2p transcriptional networks

artículo científico publicado en 2002

Dissecting splicing decisions and cell-to-cell variability with designed sequence libraries

artículo científico publicado en 2019

Does cancer strive to minimize the cost of gene expression?

artículo científico publicado en 2018

Dynamic changes in translational efficiency are deduced from codon usage of the transcriptome ⬇️

artículo científico publicado el 31 de agosto de 2012

EGF decreases the abundance of microRNAs that restrain oncogenic transcription factors

artículo científico publicado en 2010

Evolthon: A community endeavor to evolve lab evolution

artículo científico publicado en 2019

Evolution of intron splicing towards optimized gene expression is based on various Cis- and Trans-molecular mechanisms

artículo científico publicado en 2019

Experimental Evolution of Bacillus subtilis Reveals the Evolutionary Dynamics of Horizontal Gene Transfer and Suggests Adaptive and Neutral Effects

artículo científico publicado en 2020

Functional characterization of variations on regulatory motifs

artículo científico publicado en 2008

Gene Architectures that Minimize Cost of Gene Expression

artículo científico publicado en 2016

Genetic redundancy: new tricks for old genes

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide co-occurrence of promoter elements reveals a cis-regulatory cassette of rRNA transcription motifs in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2002

Global and local architecture of the mammalian microRNA-transcription factor regulatory network.

artículo científico publicado en 2007

High-throughput interrogation of programmed ribosomal frameshifting in human cells

artículo científico publicado en 2018

High-throughput interrogation of programmed ribosomal frameshifting in human cells

artículo científico publicado en 2020

Manipulation of the human tRNA pool reveals distinct tRNA sets that act in cellular proliferation or cell cycle arrest

artículo científico publicado en 2020

Measurements of the impact of 3' end sequences on gene expression reveal wide range and sequence dependent effects

artículo científico publicado en 2013

Mitochondrial 16S rRNA Is Methylated by tRNA Methyltransferase TRMT61B in All Vertebrates

scientific journal article

Nucleotide variation of regulatory motifs may lead to distinct expression patterns

artículo científico publicado en 2007

Preferential protection of protein interaction network hubs in yeast: evolved functionality of genetic redundancy

artículo científico publicado en 2008

Promoting human promoters

artículo científico publicado en 2006

RNA editing in bacteria recodes multiple proteins and regulates an evolutionarily conserved toxin-antitoxin system.

artículo científico publicado en 2017

RNA editing in bacteria: occurrence, regulation and significance

artículo científico publicado en 2018

Regulatory mechanisms and networks couple the different phases of gene expression ⬇️

artículo científico publicado el 15 de julio de 2011

Repertoires of tRNAs: The Couplers of Genomics and Proteomics

artículo científico publicado en 2018

Repression of transposable-elements - a microRNA anti-cancer defense mechanism?

artículo científico publicado en 2010

Signaling to transcription networks in the neuronal retrograde injury response.

artículo científico publicado en 2010

Specialization versus adaptation: two strategies employed by cyanophages to enhance their translation efficiencies ⬇️

artículo científico publicado el 5 de abril de 2011

Subcellular transcriptomics-dissection of the mRNA composition in the axonal compartment of sensory neurons

artículo científico publicado en 2013

Systematic Detection of Amino Acid Substitutions in Proteomes Reveals Mechanistic Basis of Ribosome Errors and Selection for Translation Fidelity

scientific article published on 25 July 2019

The Lamarckian chicken and the Darwinian egg.

artículo científico publicado en 2015

The Molecular and Functional Foundations of Conducive Somatic Cell Reprogramming to Ground State Pluripotency

The majority of endogenous microRNA targets within Alu elements avoid the microRNA machinery ⬇️

artículo científico publicado el 29 de enero de 2013

The promoters of human cell cycle genes integrate signals from two tumor suppressive pathways during cellular transformation.

artículo científico publicado en 2005

Tissue- and Time-Specific Expression of Otherwise Identical tRNA Genes

artículo científico publicado en 2016

Transcriptome Kinetics Is Governed by a Genome-Wide Coupling of mRNA Production and Degradation: A Role for RNA Pol II ⬇️

artículo científico publicado el 8 de septiembre de 2011

Transient transcriptional responses to stress are generated by opposing effects of mRNA production and degradation

artículo científico publicado en 2008

Widespread promoter-mediated coordination of transcription and mRNA degradation ⬇️

artículo científico publicado el 13 de diciembre de 2012

microRNAs and Alu elements in the p53-Mdm2-Mdm4 regulatory network.

artículo científico publicado en 2014

p53-Repressed miRNAs are involved with E2F in a feed-forward loop promoting proliferation.

artículo científico publicado en 2008

tRNA genes rapidly change in evolution to meet novel translational demands.

artículo científico publicado en 2013

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