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A Metabolome- and Metagenome-Wide Association Network Reveals Microbial Natural Products and Microbial Biotransformation Products from the Human Microbiota

artículo científico publicado en 2019

A new approach to evaluating statistical significance of spectral identifications

artículo científico publicado en 2013

American Gut: an Open Platform for Citizen Science Microbiome Research

article

Automated genome mining of ribosomal peptide natural products

artículo científico publicado en 2014

BiosyntheticSPAdes: reconstructing biosynthetic gene clusters from assembly graphs

artículo científico publicado en 2019

Cycloquest: identification of cyclopeptides via database search of their mass spectra against genome databases

artículo científico publicado en 2011

Cytotoxic veraguamides, alkynyl bromide-containing cyclic depsipeptides from the marine cyanobacterium cf. Oscillatoria margaritifera. ⬇️

artículo científico publicado en 2011

De Novo Peptide Sequencing Reveals Many Cyclopeptides in the Human Gut and Other Environments

artículo científico publicado en 2019

Dereplication of microbial metabolites through database search of mass spectra

artículo científico publicado en 2018

Dereplication of peptidic natural products through database search of mass spectra

artículo científico publicado en 2016

Dereplication, sequencing and identification of peptidic natural products: from genome mining to peptidogenomics to spectral networks

artículo científico publicado en 2015

Feature-based molecular networking in the GNPS analysis environment

artículo científico publicado en 2020

HypoRiPPAtlas as an Atlas of hypothetical natural products for mass spectrometry database search

artículo científico publicado en 2023

Increased diversity of peptidic natural products revealed by modification-tolerant database search of mass spectra.

artículo científico publicado en 2018

Integrating genomics and metabolomics for scalable non-ribosomal peptide discovery

scientific article published on 28 May 2021

Linking genomics and metabolomics to chart specialized metabolic diversity

scientific article published on 12 May 2020

MetaMiner: A Scalable Peptidogenomics Approach for Discovery of Ribosomal Peptide Natural Products with Blind Modifications from Microbial Communities

scientific article published on 16 October 2019

Metabolic Fingerprints from the Human Oral Microbiome Reveal a Vast Knowledge Gap of Secreted Small Peptidic Molecules

artículo científico publicado en 2017

MolDiscovery: learning mass spectrometry fragmentation of small molecules

artículo científico publicado en 2021

Multiplex de novo sequencing of peptide antibiotics

artículo científico publicado en 2011

NRPquest: Coupling Mass Spectrometry and Genome Mining for Nonribosomal Peptide Discovery

artículo científico publicado en 2014

Nerpa: A Tool for Discovering Biosynthetic Gene Clusters of Bacterial Nonribosomal Peptides

artículo científico publicado en 2021

Sequencing cyclic peptides by multistage mass spectrometry ⬇️

artículo científico publicado el 9 de agosto de 2011

Sharing and community curation of mass spectrometry data with Global Natural Products Social Molecular Networking

artículo científico publicado en 2016

Spatial Molecular Architecture of the Microbial Community of a Peltigera Lichen

artículo científico publicado en 2016

microbeMASST: a taxonomically informed mass spectrometry search tool for microbial metabolomics data ⬇️

scientific article published in 2024

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