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Lista de obras de

A Hump-Backed Trend in Bacterial Diversity with Elevation on Mount Fuji, Japan ⬇️

artículo científico publicado el 7 de julio de 2011

A report of 21 unreported bacterial species in Korea, belonging to the Betaproteobacteria ⬇️

A report of 39 unrecorded bacterial species in Korea, belonging to the Betaproteobacteria and Gammaproteobacteria ⬇️

AMDB: a database of animal gut microbial communities with manually curated metadata

scientific article published on 01 January 2022

Accurate delimitation of Phanerochaete chrysosporium and Phanerochaete sordida by specific PCR primers and cultural approach.

artículo científico publicado en 2007

Actibacter sediminis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium of the family Flavobacteriaceae isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2008

Aestuariibacter salexigens gen. nov., sp. nov. and Aestuariibacter halophilus sp. nov., isolated from tidal flat sediment, and emended description of Alteromonas macleodii

artículo científico publicado en 2004

Amycolatopsis thermoflava sp. nov., a novel soil actinomycete from Hainan Island, China

artículo científico publicado en 1999

An eco-friendly treatment of tannery wastewater using bioaugmentation with a novel microbial consortium ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Analysis of 16S-23S rRNA Intergenic Spacer of Vibrio cholerae and Vibrio mimicus for Detection of These Species

artículo científico publicado el 1 de enero de 2002

Application of the Whole Genome-Based Bacterial Identification System, TrueBac ID, Using Clinical Isolates That Were Not Identified With Three Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Systems

scientific article published on 01 November 2019

Aquimarina addita sp. nov., isolated from seawater ⬇️

artículo científico publicado el 12 de noviembre de 2010

Archaeal diversity in tidal flat sediment as revealed by 16S rDNA analysis.

artículo científico publicado en 2005

Arenibacter gen. nov., new genus of the family flavobacteriaceae and description of a new species, Arenibacter latericius sp. nov.

artículo científico publicado en 2001

Bacterial community structure in kimchi, a Korean fermented vegetable food, as revealed by 16S rRNA gene analysis

artículo científico publicado en 2005

Burkholderia megalochromosomata sp. nov., isolated from grassland soil.

artículo científico publicado en 2015

Burkholderia monticola sp. nov., isolated from mountain soil

artículo científico publicado en 2014

Changes in the Intestinal Microbiota of Patients with Inflammatory Bowel Disease with Clinical Remission during an 8-Week Infliximab Infusion Cycle

artículo científico publicado en 2020

Characteristics of a pandemic clone of O3 : K6 and O4 : K68 Vibrio parahaemolyticus isolated in Beira, Mozambique.

artículo científico publicado en 2008

Cholera outbreaks caused by an altered Vibrio cholerae O1 El Tor biotype strain producing classical cholera toxin B in Vietnam in 2007 to 2008.

artículo científico publicado en 2009

Classical RS1 and environmental RS1 elements in Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring a tandem repeat of CTX prophage: revisiting Mozambique in 2005.

artículo científico publicado en 2009

Classification of hybrid and altered Vibrio cholerae strains by CTX prophage and RS1 element structure.

artículo científico publicado en 2009

Clonality and Resistome analysis of KPC-producing Klebsiella pneumoniae strain isolated in Korea using whole genome sequencing

artículo científico publicado en 2014

Clostridium aestuarii sp. nov., from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2007

Clostridium ganghwense sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2006

Comamonas koreensis sp. nov., a non-motile species from wetland in Woopo, Korea

artículo científico publicado en 2002

Comparative Genomic Analysis of the 2016 Vibrio cholerae Outbreak in South Korea

scientific article published on 16 August 2019

Comparative Genomic and Phylogenomic Analyses Clarify Relationships Within and Between Bacillus cereus and Bacillus thuringiensis: Proposal for the Recognition of Two Bacillus thuringiensis Genomovars

artículo científico publicado en 2019

Comparative approach to capture bacterial diversity of coastal waters ⬇️

artículo científico publicado el 9 de noviembre de 2011

Comparative genomics of Neisseria weaveri clarifies the taxonomy of this species and identifies genetic determinants that may be associated with virulence ⬇️

artículo científico publicado el 6 de enero de 2012

Comparative genomics reveals mechanism for short-term and long-term clonal transitions in pandemic Vibrio cholerae.

artículo científico publicado en 2009

Comparison of the Gut Microbiota of Centenarians in Longevity Villages of South Korea with Those of Other Age Groups

artículo científico publicado en 2019

Complete Genome Sequence of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus KOR/KNIH/002_05_2015, Isolated in South Korea

artículo científico publicado en 2015

Complete genome sequence analysis of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154.

artículo científico publicado en 2010

Complete genome sequence of Mycobacterium intracellulare clinical strain MOTT-02.

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Mycobacterium intracellulare clinical strain MOTT-36Y, belonging to the INT5 genotype.

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Mycobacterium intracellulare strain ATCC 13950(T).

artículo científico publicado en 2012

Complete genome sequence of Vibrio vulnificus MO6-24/O.

artículo científico publicado en 2011

ContEst16S: an algorithm that identifies contaminated prokaryotic genomes using 16S RNA gene sequences

artículo científico publicado en 2017

Discovery of novel Vibrio cholerae VSP-II genomic islands using comparative genomic analysis

artículo científico publicado en 2010

Distinctive Phyllosphere Bacterial Communities in Tropical Trees ⬇️

artículo científico publicado el 12 de octubre de 2011

Diversity of bacterial community in freshwater of Woopo wetland

artículo científico publicado en 2008

Draft Genome Sequence of Escherichia coli W26, an Enteric Strain Isolated from Cow Feces ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2012

Draft Genome Sequence of Methylophaga aminisulfidivorans MP T ⬇️

artículo científico publicado el 17 de junio de 2011

Draft Genome sequence of Escherichia coli AI27, a porcine isolate belonging to phylogenetic group B1 ⬇️

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 2012

Draft genome sequence of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae DSM 30104T

artículo científico publicado en 2012

Draft genome sequence of Shewanella sp. strain HN-41, which produces arsenic-sulfide nanotubes ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2011

Draft genome sequence of Staphylococcus saprophyticus subsp. saprophyticus M1-1, isolated from the gills of a Korean rockfish, Sebastes schlegeli Hilgendorf, after high hydrostatic pressure processing

artículo científico publicado en 2012

Draft genome sequence of Weissella koreensis KCTC 3621T

artículo científico publicado en 2012

Draft genome sequencing of Bacillus sp. strain M2-6, isolated from the roots of Korean ginseng, Panax ginseng C. A. Meyer, after high-hydrostatic-pressure processing

artículo científico publicado en 2012

Duplex-specific nuclease efficiently removes rRNA for prokaryotic RNA-seq ⬇️

artículo científico publicado el 31 de agosto de 2011

Emotional well-being and gut microbiome profiles by enterotype

scientific article published on 26 November 2020

Evidence for several waves of global transmission in the seventh cholera pandemic

artículo científico publicado en 2011

EzEditor: a versatile sequence alignment editor for both rRNA- and protein-coding genes

artículo científico publicado en 2013

EzTaxon: a web-based tool for the identification of prokaryotes based on 16S ribosomal RNA gene sequences

artículo científico publicado en 2007

Flavivirga jejuensis gen. nov., sp. nov., and Flavivirga amylovorans sp. nov., new members of the family Flavobacteriaceae isolated from seawater, and emended descriptions of the genera Psychroserpens and Lacinutrix ⬇️

artículo científico publicado el 24 de junio de 2011

Flavobacterium antarcticum sp. nov., a novel psychrotolerant bacterium isolated from the Antarctic

artículo científico publicado en 2005

Flavobacterium limnosediminis sp. nov., isolated from sediment of a freshwater lake

artículo científico publicado en 2013

Flavobacterium weaverense sp. nov. and Flavobacterium segetis sp. nov., novel psychrophiles isolated from the Antarctic

artículo científico publicado en 2006

Fretibacter rubidus gen. nov., sp. nov., isolated from seawater

artículo científico publicado en 2013

Genome Sequence of Escherichia coli AA86, Isolated from Cow Feces ⬇️

artículo científico publicado el 20 de mayo de 2011

Genome Sequence of Extracellular-Protease-Producing Alishewanella jeotgali Isolated from Traditional Korean Fermented Seafood ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2012

Genome Sequence of Pectin-Degrading Alishewanella aestuarii Strain B11 T , Isolated from Tidal Flat Sediment ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 2012

Genome Sequence of Pectin-Degrading Alishewanella agri, Isolated from Landfill Soil ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2012

Genome insights into the pharmaceutical and plant growth promoting features of the novel species Nocardia alni sp. nov ⬇️

scholarly article published in 2022

Genome sequence of Escherichia coli J53, a reference strain for genetic studies

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of Lactobacillus johnsonii PF01, isolated from piglet feces

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of Lactobacillus mucosae LM1, isolated from piglet feces

artículo científico publicado en 2012

Genome sequence of Lactobacillus ruminis SPM0211, isolated from a fecal sample from a healthy Korean

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of Lactobacillus salivarius GJ-24, a probiotic strain isolated from healthy adult intestine

artículo científico publicado en 2011

Genome sequence of hybrid Vibrio cholerae O1 MJ-1236, B-33, and CIRS101 and comparative genomics with V. cholerae

artículo científico publicado en 2010

Genome sequence of the moderately halophilic bacterium Salinicoccus carnicancri type strain Crm(T) (= DSM 23852(T)).

artículo científico publicado en 2013

Genome sequence of type strain of Staphylococcus aureus subsp. aureus

artículo científico publicado en 2014

Genome-based reclassification of Paenibacillus jamilae Aguilera et al. 2001 as a later heterotypic synonym of Paenibacillus polymyxa (Prazmowski 1880) Ash et al. 1994

artículo científico publicado en 2020

Genomic encyclopedia of bacteria and archaea: sequencing a myriad of type strains

artículo científico publicado en 2014

Genomic evolution of Vibrio cholerae

artículo científico publicado en 2010

Genomic insights into the taxonomic status of the three subspecies of Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2013

Genotypes associated with virulence in environmental isolates of Vibrio cholerae

artículo científico publicado en 2001

Glaciecola nitratireducens sp. nov., isolated from seawater

artículo científico publicado en 2006

Hahella ganghwensis sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2005

Hongiella mannitolivorans gen. nov., sp. nov., Hongiella halophila sp. nov. and Hongiella ornithinivorans sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2004

Hymenobacter rigui sp. nov., isolated from wetland freshwater

artículo científico publicado en 2006

Identification and characterization of metagenomic fragments from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2009

Identification of household bacterial community and analysis of species shared with human microbiome

artículo científico publicado en 2013

Idiomarina gen. nov., comprising novel indigenous deep-sea bacteria from the Pacific Ocean, including descriptions of two species, Idiomarina abyssalis sp. nov. and Idiomarina zobellii sp. nov.

artículo científico publicado en 2000

Impact of enrofloxacin on the human intestinal microbiota revealed by comparative molecular analysis ⬇️

artículo científico publicado el 3 de febrero de 2012

Improved Metagenomic Taxonomic Profiling Using a Curated Core Gene-Based Bacterial Database Reveals Unrecognized Species in the Genus Streptococcus

scientific article published on 10 March 2020

Improved pipeline for reducing erroneous identification by 16S rRNA sequences using the Illumina MiSeq platform

artículo científico publicado en 2015

Introducing EzBioCloud: a taxonomically united database of 16S rRNA gene sequences and whole-genome assemblies

artículo científico publicado en 2016

Introducing EzTaxon-e: a prokaryotic 16S rRNA gene sequence database with phylotypes that represent uncultured species ⬇️

artículo científico publicado el 25 de noviembre de 2011

Introducing Murine Microbiome Database (MMDB): A Curated Database with Taxonomic Profiling of the Healthy Mouse Gastrointestinal Microbiome

scientific article published on 23 October 2019

Isolation of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Paratyphi B dT+, or Salmonella Java, from Indonesia and alteration of the d-tartrate fermentation phenotype by disrupting the ORF STM 3356.

artículo científico publicado en 2006

Kordia algicida gen. nov., sp. nov., an algicidal bacterium isolated from red tide

artículo científico publicado en 2004

Kordia algicida gen. nov., sp. nov., an algicidal bacterium isolated from red tide

artículo científico publicado en 2005

Large-Scale Genomics Reveals the Genetic Characteristics of Seven Species and Importance of Phylogenetic Distance for Estimating Pan-Genome Size

article

Large-scale evaluation of experimentally determined DNA G+C contents with whole genome sequences of prokaryotes.

artículo científico publicado en 2014

Luteimonas marina sp. nov., isolated from seawater

artículo científico publicado en 2008

Marinifilum fragile gen. nov., sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2009

Metagenomic Association Analysis of Gut Symbiont <i>Limosilactobacillus reuteri</i> Without Host-Specific Genome Isolation

artículo científico publicado en 2020

Metagenomic insights into the bioaerosols in the indoor and outdoor environments of childcare facilities

artículo científico publicado en 2015

Multilocus sequence typing (MLST) analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor isolates from Mozambique that harbour the classical CTX prophage.

artículo científico publicado en 2006

Multilocus sequence typing analysis of Shigella flexneri isolates collected in Asian countries

artículo científico publicado en 2007

Multilocus variable-number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae O1 El Tor strains harbouring classical toxin B.

artículo científico publicado en 2010

Neisseria weaveri Andersen et al. 1993 is a later heterotypic synonym of Neisseria weaveri Holmes et al. 1993.

artículo científico publicado en 2014

Nocardia crassostreae sp. nov., the causal agent of nocardiosis in Pacific oysters

artículo científico publicado en 1998

Nocardia flavorosea sp. nov.

artículo científico publicado en 1998

Nocardia salmonicida nom. rev., a fish pathogen

artículo científico publicado en 1999

Nocardia uniformis nom. rev.

artículo científico publicado en 1999

Nocardioides aestuarii sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2004

Nocardioides dokdonensis sp. nov., an actinomycete isolated from sand sediment

artículo científico publicado en 2008

Nocardioides ganghwensis sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2004

Occurrence of the Vibrio cholerae seventh pandemic VSP-I island and a new variant.

artículo científico publicado en 2010

OrthoANI: An improved algorithm and software for calculating average nucleotide identity

artículo científico publicado en 2015

Photobacterium ganghwense sp. nov., a halophilic bacterium isolated from sea water

artículo científico publicado en 2006

Phylogenetic Analysis of the nef Gene Reveals a Distinctive Monophyletic Clade in Korean HIV-1 Cases ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

Phylogenetic analysis of the genera Streptomyces and Kitasatospora based on partial RNA polymerase beta-subunit gene (rpoB) sequences

artículo científico publicado en 2004

Phylogenetic study of the species within the family Streptomycetaceae

artículo científico publicado en 2011

Profiling bacterial community in upper respiratory tracts.

artículo científico publicado en 2014

Proposal to transfer Flavobacterium oceanosedimentum Carty and Litchfield 1978 to the genus Curtobacterium as Curtobacterium oceanosedimentum comb. nov.

artículo científico

Pseudoalteromonas byunsanensis sp. nov., isolated from tidal flat sediment in Korea

artículo científico publicado en 2005

Pseudomonas panacis sp. nov., isolated from the surface of rusty roots of Korean ginseng

artículo científico publicado en 2005

Pseudomonas segetis sp. nov., isolated from soil

artículo científico publicado en 2006

Reclassification of Alteromonas distincta Romanenko et al. 1995 as Pseudoalteromonas distincta comb. nov.

artículo científico publicado en 2000

Reclassification of Flavobacterium resinovorum Delaporte and Daste 1956 as Novosphingobium resinovorum comb. nov., with Novosphingobium subarcticum (Nohynek et al. 1996) Takeuchi et al. 2001 as a later heterotypic synonym

artículo científico

Replication of Vibrio cholerae classical CTX phage

artículo científico publicado en 2017

Report on 14 unrecorded bacterial species in Korea that belong to the phyla Bacteroidetes and Deinococcus-Thermus ⬇️

Report on 24 unrecorded bacterial species of Korea belonging to the phylum Firmicutes ⬇️

Report on 31 unrecorded bacterial species in Korea that belong to the phylum Actinobacteria ⬇️

Rhodococcal systematics: problems and developments

artículo científico publicado en 1998

Sejongia antarctica gen. nov., sp. nov. and Sejongia jeonii sp. nov., isolated from the Antarctic

artículo científico publicado en 2005

Snuella lapsa gen. nov., sp. nov., isolated from tidal flat sediment ⬇️

artículo científico publicado el 19 de noviembre de 2010

TBC: a clustering algorithm based on prokaryotic taxonomy

artículo científico publicado en 2012

Taxonomic evaluation of the genera Ruegeria and Silicibacter: a proposal to transfer the genus Silicibacter Petursdottir and Kristjansson 1999 to the genus Ruegeria Uchino et al. 1999.

artículo científico publicado en 2007

Thalassobius aestuarii sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2006

Thalassomonas ganghwensis sp. nov., isolated from tidal flat sediment

artículo científico publicado en 2004

The Complete Genome Sequence of Thermococcus onnurineus NA1 Reveals a Mixed Heterotrophic and Carboxydotrophic Metabolism

artículo científico publicado en 2008

The pre-seventh pandemic Vibrio cholerae BX 330286 El Tor genome: evidence for the environment as a genome reservoir

artículo científico publicado en 2010

Towards a taxonomic coherence between average nucleotide identity and 16S rRNA gene sequence similarity for species demarcation of prokaryotes

artículo científico publicado en 2014

Transcriptomic Analysis of Genes Modulated by Cyclo(L-Phenylalanine-L-Proline) in Vibrio vulnificus ⬇️

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 2013

Transfer of Hongia koreensis Lee et al. 2000 to the genus Kribbella Park et al. 1999 as Kribbella koreensis comb. nov.

artículo científico publicado en 2003

Tsukamurella pseudospumae sp. nov., a novel actinomycete isolated from activated sludge foam

artículo científico publicado en 2004

Tsukamurella spumae sp. nov., a novel actinomycete associated with foaming in activated sludge plants

artículo científico publicado en 2003

UBCG2: Up-to-date bacterial core genes and pipeline for phylogenomic analysis

artículo científico publicado en 2021

UBCG: Up-to-date bacterial core gene set and pipeline for phylogenomic tree reconstruction

scientific article published on 28 February 2018

Unification of the genera Nonlabens, Persicivirga, Sandarakinotalea and Stenothermobacter into a single emended genus, Nonlabens, and description of Nonlabens agnitus sp. nov ⬇️

artículo científico publicado el 10 de febrero de 2012

VCGIDB: A Database and Web Resource for the Genomic Islands from Vibrio Cholerae

artículo científico publicado en 2019

Zooshikella ganghwensis gen. nov., sp. nov., isolated from tidal flat sediments

artículo científico publicado en 2003

rRNASelector: a computer program for selecting ribosomal RNA encoding sequences from metagenomic and metatranscriptomic shotgun libraries

artículo científico publicado en 2011

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