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A comprehensive survey of 3' animal miRNA modification events and a possible role for 3' adenylation in modulating miRNA targeting effectiveness

artículo científico publicado en 2010

A field guide to cultivating computational biology

artículo científico

A promoter-level mammalian expression atlas

artículo científico publicado en 2014

An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5' ends.

artículo científico publicado en 2017

Batf2/Irf1 induces inflammatory responses in classically activated macrophages, lipopolysaccharides, and mycobacterial infection

artículo científico publicado en 2015

Comparative transcriptomics of primary cells in vertebrates

artículo científico publicado en 2020

Comparison of RNA- or LNA-hybrid oligonucleotides in template-switching reactions for high-speed sequencing library preparation

artículo científico publicado en 2013

Cross-mapping and the identification of editing sites in mature microRNAs in high-throughput sequencing libraries

artículo científico publicado en 2010

Effect of Thiazole Orange Doubly Labeled Thymidine on DNA Duplex Formation ⬇️

artículo científico publicado el 25 de julio de 2012

FANTOM enters 20th year: expansion of transcriptomic atlases and functional annotation of non-coding RNAs

artículo científico publicado en 2020

FANTOM4 EdgeExpressDB: an integrated database of promoters, genes, microRNAs, expression dynamics and regulatory interactions

artículo científico publicado en 2009

Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping

artículo científico publicado en 2020

Gateways to the FANTOM5 promoter level mammalian expression atlas

artículo científico publicado en 2015

Hierarchical Evolution of the Bacterial Sporulation Network ⬇️

artículo científico publicado el 14 de septiembre de 2010

Identification of ZNF395 as a novel modulator of adipogenesis ⬇️

artículo científico publicado el 7 de noviembre de 2012

Integration of genetics and miRNA-target gene network identified disease biology implicated in tissue specificity

article

Optimization of turn-back primers in isothermal amplification

artículo científico publicado en 2011

PAPD5-mediated 3' adenylation and subsequent degradation of miR-21 is disrupted in proliferative disease.

artículo científico publicado en 2014

Probabilistic resolution of multi-mapping reads in massively parallel sequencing data using MuMRescueLite

artículo científico publicado en 2009

Promoter Usage and Dynamics in Vascular Smooth Muscle Cells Exposed to Fibroblast Growth Factor-2 or Interleukin-1β

artículo científico publicado en 2018

Recent advances in functional genome analysis

artículo científico publicado en 2018

Reconstruction of Monocyte Transcriptional Regulatory Network Accompanies Monocytic Functions in Human Fibroblasts ⬇️

artículo científico publicado el 13 de marzo de 2012

Recounting the FANTOM CAGEAssociated Transcriptome

scientific article published on 20 February 2020

Redefining the transcriptional regulatory dynamics of classically and alternatively activated macrophages by deepCAGE transcriptomics.

artículo científico publicado en 2015

Systemic identification of estrogen-regulated genes in breast cancer cells through cap analysis of gene expression mapping

artículo científico publicado en 2014

Temporal dynamics and transcriptional control using single-cell gene expression analysis

artículo científico publicado en 2013

The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line.

artículo científico publicado en 2009

Transcribed enhancers lead waves of coordinated transcription in transitioning mammalian cells

artículo científico publicado en 2015

Transcriptome analysis of controlled and therapy-resistant childhood asthma reveals distinct gene expression profiles

artículo científico publicado en 2015

Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases

artículo científico publicado en 2019

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