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A Compositional Approach to the Stochastic Dynamics of Gene Networks

article

A Mechanistic Model for Predicting Cell Surface Presentation of Competing Peptides by MHC Class I Molecules

artículo científico publicado en 2018

A Process Model of Actin Polymerisation

A computational method for automated characterization of genetic components

artículo científico publicado en 2014

A deep learning model for predicting next-generation sequencing depth from DNA sequence

artículo científico publicado en 2021

A logic programming language for computational nucleic acid devices

artículo científico publicado en 2018

A peptide filtering relation quantifies MHC class I peptide optimization

artículo científico publicado en 2011

A process model of Rho GTP-binding proteins

A programming language for composable DNA circuits

artículo científico publicado en 2009

A spatially localized architecture for fast and modular DNA computing

artículo científico publicado en 2017

A strand graph semantics for DNA-based computation

artículo científico publicado en 2016

Abstractions for DNA circuit design

artículo científico

Bio Simulators: a web UI for biological simulation

artículo científico publicado en 2014

Characterization of Intrinsic Properties of Promoters

artículo científico publicado en 2015

Compositionality, stochasticity, and cooperativity in dynamic models of gene regulation

artículo científico publicado en 2007

Computational design of nucleic acid feedback control circuits

artículo científico publicado en 2014

Computational modeling of synthetic microbial biofilms.

artículo científico publicado en 2012

Computational modeling of the EGFR network elucidates control mechanisms regulating signal dynamics

artículo científico publicado en 2009

Computing with biological switches and clocks

scientific article published on 01 June 2018

DNA-based communication in populations of synthetic protocells

artículo científico publicado en 2019

Design and analysis of DNA strand displacement devices using probabilistic model checking

artículo científico publicado en 2012

Distributed DNA-based Communication in Populations of Synthetic Protocells: Supporting Information

scholarly article published 4 January 2019

Domain-specific programming languages for computational nucleic acid systems

artículo científico publicado en 2020

Escherichia coli can survive stress by noisy growth modulation

scientific article published in Nature Communications

Interpretation of morphogen gradients by a synthetic bistable circuit

scientific article published on 02 November 2020

Modular verification of chemical reaction network encodings via serializability analysis

artículo científico publicado en 2016

Orthogonal intercellular signaling for programmed spatial behavior

artículo científico publicado en 2016

Predicting DNA hybridization kinetics from sequence

artículo científico publicado en 2017

Probabilistic Analysis of Localized DNA Hybridization Circuits

artículo científico publicado en 2015

Programmable chemical controllers made from DNA.

artículo científico publicado en 2013

Selector function of MHC I molecules is determined by protein plasticity

artículo científico publicado en 2015

Stochastic pulsing of gene expression enables the generation of spatial patterns in Bacillus subtilis biofilms

artículo científico publicado en 2020

Synthesizing and tuning stochastic chemical reaction networks with specified behaviours

scientific article published on 01 August 2018

Towards programming languages for genetic engineering of living cells

artículo científico publicado en 2009

Towards the rational design of synthetic cells with prescribed population dynamics

artículo científico publicado en 2012

Visual DSD: a design and analysis tool for DNA strand displacement systems ⬇️

artículo científico publicado el 7 de octubre de 2011

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