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AI-Driven Multiscale Simulations Illuminate Mechanisms of SARS-CoV-2 Spike Dynamics

scientific article published on 20 November 2020

Accelerating molecular modeling applications with graphics processors

artículo científico publicado en 2007

Application Experiences on a GPU-Accelerated Arm-based HPC Testbed

artículo científico publicado en 2023

Computer modeling in biotechnology: a partner in development

artículo científico publicado en 2008

Correcting Mesh-Based Force Calculations to Conserve Both Energy and Momentum in Molecular Dynamics Simulations

artículo científico publicado en 2007

GPU-accelerated molecular modeling coming of age

artículo científico publicado en 2010

High-performance scalable molecular dynamics simulations of a polarizable force field based on classical Drude oscillators in NAMD

artículo científico publicado en 2011

Molecular Dynamics Simulations Suggest that Electrostatic Funnel Directs Binding of Tamiflu to Influenza N1 Neuraminidases ⬇️

artículo científico publicado el 23 de septiembre de 2010

Multilevel Summation of Electrostatic Potentials Using Graphics Processing Units

scientific article published on March 2009

Multilevel summation method for electrostatic force evaluation

artículo científico publicado en 2014

Multilevel summation with B-spline interpolation for pairwise interactions in molecular dynamics simulations.

artículo científico publicado en 2016

Multiple grid methods for classical molecular dynamics

artículo científico publicado en 2002

Scalable molecular dynamics on CPU and GPU architectures with NAMD ⬇️

artículo científico publicado en 2020

TopoGromacs: Automated Topology Conversion from CHARMM to GROMACS within VMD.

artículo científico publicado en 2016

py-MCMD: Python Software for Performing Hybrid Monte Carlo/Molecular Dynamics Simulations with GOMC and NAMD

artículo científico publicado en 2022

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