Filtros de búsqueda

Lista de obras de

1D and 2D annotation enrichment: a statistical method integrating quantitative proteomics with complementary high-throughput data ⬇️

artículo científico publicado el 5 de noviembre de 2012

A "proteomic ruler" for protein copy number and concentration estimation without spike-in standards.

artículo científico publicado en 2014

A Network Module for the Perseus Software for Computational Proteomics Facilitates Proteome Interaction Graph Analysis

artículo científico publicado en 2019

A Systematic Investigation into the Nature of Tryptic HCD Spectra ⬇️

artículo científico publicado el 10 de octubre de 2012

A framework for intelligent data acquisition and real-time database searching for shotgun proteomics

artículo científico publicado en 2011

A human interactome in three quantitative dimensions organized by stoichiometries and abundances

artículo científico publicado en 2015

A large synthetic peptide and phosphopeptide reference library for mass spectrometry-based proteomics

artículo científico publicado en 2013

A novel chromatographic method allows on-line reanalysis of the proteome

artículo científico publicado en 2008

A proteome-wide, quantitative survey of in vivo ubiquitylation sites reveals widespread regulatory roles

artículo científico publicado en 2011

Accurate and Automated High-Coverage Identification of Chemically Cross-Linked Peptides with MaxLynx

artículo científico publicado en 2022

Accurate proteome-wide label-free quantification by delayed normalization and maximal peptide ratio extraction, termed MaxLFQ.

artículo científico publicado en 2014

Acetylation site specificities of lysine deacetylase inhibitors in human cells

artículo científico publicado en 2015

Analysis of the mouse liver proteome using advanced mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2007

Cell-type-resolved quantitative proteomics of murine liver

artículo científico publicado en 2014

Combined use of RNAi and quantitative proteomics to study gene function in Drosophila

artículo científico publicado en 2008

Computational principles of determining and improving mass precision and accuracy for proteome measurements in an Orbitrap

artículo científico publicado en 2009

DNA repair. Proteomics reveals dynamic assembly of repair complexes during bypass of DNA cross-links

artículo científico publicado en 2015

Deep and highly sensitive proteome coverage by LC-MS/MS without prefractionation.

artículo científico publicado en 2011

Deep proteome and transcriptome mapping of a human cancer cell line

artículo científico publicado en 2011

Deep proteomics of mouse skeletal muscle enables quantitation of protein isoforms, metabolic pathways, and transcription factors

artículo científico publicado en 2015

Deubiquitinating enzymes and the proteasome regulate preferential sets of ubiquitin substrates

artículo científico publicado en 2022

Direct identification of clinically relevant neoepitopes presented on native human melanoma tissue by mass spectrometry

artículo científico publicado en 2016

EASI-tag enables accurate multiplexed and interference-free MS2-based proteome quantification

artículo científico publicado en 2018

Expert System for Computer-assisted Annotation of MS/MS Spectra ⬇️

artículo científico publicado el 10 de agosto de 2012

First Community-Wide, Comparative Cross-Linking Mass Spectrometry Study

artículo científico publicado en 2019

Global analysis of genome, transcriptome and proteome reveals the response to aneuploidy in human cells.

artículo científico publicado en 2012

Glucose-regulated and drug-perturbed phosphoproteome reveals molecular mechanisms controlling insulin secretion

artículo científico publicado en 2016

High performance computational analysis of large-scale proteome data sets to assess incremental contribution to coverage of the human genome

artículo científico publicado en 2013

High-quality MS/MS spectrum prediction for data-dependent and data-independent acquisition data analysis

artículo científico publicado en 2019

Homology-driven assembly of NOn-redundant protEin sequence sets (NOmESS) for mass spectrometry

artículo científico publicado en 2016

How much peptide sequence information is contained in ion trap tandem mass spectra?

artículo científico publicado en 2008

IKAP: A heuristic framework for inference of kinase activities from Phosphoproteomics data

artículo científico publicado en 2015

In vivo SILAC-based proteomics reveals phosphoproteome changes during mouse skin carcinogenesis

artículo científico publicado en 2013

In-vivo quantitative proteomics reveals a key contribution of post-transcriptional mechanisms to the circadian regulation of liver metabolism.

artículo científico publicado en 2014

Iodoacetamide-induced artifact mimics ubiquitination in mass spectrometry

artículo científico publicado en 2008

Is proteomics the new genomics?

artículo científico publicado en 2007

List of Contributors

Machine Learning-based Classification of Diffuse Large B-cell Lymphoma Patients by Their Protein Expression Profiles

artículo científico publicado en 2015

Mass spectrometry-based proteomics using Q Exactive, a high-performance benchtop quadrupole Orbitrap mass spectrometer.

artículo científico publicado en 2011

MaxQuant for in-depth analysis of large SILAC datasets

artículo científico publicado en 2014

MaxQuant goes Linux

artículo científico publicado en 2018

MaxQuant software for ion mobility enhanced shotgun proteomics

scientific article published on 10 March 2020

MaxQuant.Live Enables Global Targeting of More Than 25,000 Peptides

article

More than 100,000 Detectable Peptide Species Elute in Single Shotgun Proteomics Runs but the Majority is Inaccessible to Data-Dependent LC−MS/MS ⬇️

artículo científico publicado el 28 de febrero de 2011

N-linked glycosylation enrichment for in-depth cell surface proteomics of diffuse large B-cell lymphoma subtypes

artículo científico publicado en 2013

Organellar Proteomics and Phospho-Proteomics Reveal Subcellular Reorganization in Diet-Induced Hepatic Steatosis

article

PhosphoSiteAnalyzer: a bioinformatic platform for deciphering phospho proteomes using kinase predictions retrieved from NetworKIN.

artículo científico publicado en 2012

Predicting post-translational lysine acetylation using support vector machines.

artículo científico publicado en 2010

Proceedings of the Frontiers of Retrovirology Conference 2016.

artículo científico publicado en 2016

Proteomic Analysis of Cellular Systems

article

Proteomic maps of breast cancer subtypes

artículo científico publicado en 2016

Proteomic portrait of human breast cancer progression identifies novel prognostic markers

artículo científico publicado en 2012

Proteomics on an Orbitrap benchtop mass spectrometer using all-ion fragmentation

artículo científico publicado en 2010

Quantitative proteomics combined with BAC TransgeneOmics reveals in vivo protein interactions

artículo científico publicado en 2010

Quantitative proteomics reveals subset-specific viral recognition in dendritic cells.

artículo científico publicado en 2010

Quantitative proteomics reveals that Hsp90 inhibition preferentially targets kinases and the DNA damage response

artículo científico publicado en 2011

Quantitative, high-resolution proteomics for data-driven systems biology

artículo científico publicado en 2011

Redirected nuclear glutamate dehydrogenase supplies Tet3 with α-ketoglutarate in neurons

artículo científico publicado en 2021

Role for ribosome-associated quality control in sampling proteins for MHC class I-mediated antigen presentation

scientific article published on 11 February 2020

Secretome Analysis of Lipid-Induced Insulin Resistance in Skeletal Muscle Cells by a Combined Experimental and Bioinformatics Workflow

artículo científico publicado en 2015

Sleep-wake cycles drive daily dynamics of synaptic phosphorylation

artículo científico publicado en 2019

Software lock mass by two-dimensional minimization of peptide mass errors

artículo científico publicado en 2011

Solid tumor proteome and phosphoproteome analysis by high resolution mass spectrometry

artículo científico publicado en 2008

Spatiotemporal Proteomic Profiling of Huntington's Disease Inclusions Reveals Widespread Loss of Protein Function.

artículo científico publicado en 2017

Stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC) and proteome quantitation of mouse embryonic stem cells to a depth of 5,111 proteins

artículo científico publicado en 2007

Super-SILAC Allows Classification of Diffuse Large B-cell Lymphoma Subtypes by Their Protein Expression Profiles ⬇️

artículo científico publicado el 21 de marzo de 2012

Super-SILAC mix for quantitative proteomics of human tumor tissue

artículo científico publicado en 2010

System-wide changes to SUMO modifications in response to heat shock

artículo científico publicado en 2009

System-wide perturbation analysis with nearly complete coverage of the yeast proteome by single-shot ultra HPLC runs on a bench top Orbitrap

artículo científico publicado en 2011

The Coming Age of Complete, Accurate, and Ubiquitous Proteomes ⬇️

artículo científico publicado el 21 de febrero de 2013

The Impact II, a Very High-Resolution Quadrupole Time-of-Flight Instrument (QTOF) for Deep Shotgun Proteomics.

artículo científico publicado en 2015

The Perseus computational platform for comprehensive analysis of (prote)omics data

artículo científico publicado en 2016

The Proteome of Primary Prostate Cancer

artículo científico publicado en 2015

The Proteome of Prostate Cancer Bone Metastasis Reveals Heterogeneity with Prognostic Implications

artículo científico publicado en 2018

The dental proteome of Homo antecessor

scientific article published on 01 April 2020

The nucleolus functions as a phase-separated protein quality control compartment

artículo científico publicado en 2019

The ubiquitin-proteasome system is a key component of the SUMO-2/3 cycle

artículo científico publicado en 2008

Ultra High Resolution Linear Ion Trap Orbitrap Mass Spectrometer (Orbitrap Elite) Facilitates Top Down LC MS/MS and Versatile Peptide Fragmentation Modes ⬇️

artículo científico publicado el 9 de diciembre de 2011

Ultradeep human phosphoproteome reveals a distinct regulatory nature of Tyr and Ser/Thr-based signaling

artículo científico publicado en 2014

Use of stable isotope labeling by amino acids in cell culture as a spike-in standard in quantitative proteomics

artículo científico publicado en 2011

Dominio Público Uruguay está sostenido por:

Acerca de Dominio Público Uruguay

Ayuda