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Lista de obras de

A comprehensive database for integrated analysis of omics data in autoimmune diseases

artículo científico publicado en 2021

A function-centric approach to the biological interpretation of microarray time-series

artículo científico publicado en 2006

A large scale survey reveals that chromosomal copy-number alterations significantly affect gene modules involved in cancer initiation and progression.

artículo científico publicado en 2011

A molecular hypothesis to explain direct and inverse co-morbidities between Alzheimer's Disease, Glioblastoma and Lung cancer

artículo científico publicado en 2017

A user guide for the online exploration and visualization of PCAWG data

artículo científico publicado en 2020

An in silico analysis identifies drugs potentially modulating the cytokine storm triggered by SARS-CoV-2 infection

artículo científico publicado en 2022

Analysis of normal-tumour tissue interaction in tumours: prediction of prostate cancer features from the molecular profile of adjacent normal cells

artículo científico publicado en 2011

BABELOMICS: a suite of web tools for functional annotation and analysis of groups of genes in high-throughput experiments.

artículo científico publicado en 2005

BABELOMICS: a systems biology perspective in the functional annotation of genome-scale experiments.

artículo científico publicado en 2006

Babelomics: advanced functional profiling of transcriptomics, proteomics and genomics experiments

artículo científico publicado en 2008

Beyondcell: targeting cancer therapeutic heterogeneity in single-cell RNA-seq data

artículo científico publicado en 2021

Bone progenitor dysfunction induces myelodysplasia and secondary leukaemia.

artículo científico publicado en 2010

CXCR7 Reactivates ERK Signaling to Promote Resistance to EGFR Kinase Inhibitors in NSCLC

artículo científico publicado en 2019

Changes in the pattern of DNA methylation associate with twin discordance in systemic lupus erythematosus

artículo científico publicado en 2009

Clonal dynamics monitoring during clinical evolution in chronic lymphocytic leukaemia

artículo científico publicado en 2019

Complete Regression of Advanced Pancreatic Ductal Adenocarcinomas upon Combined Inhibition of EGFR and C-RAF

scientific article published on 08 April 2019

Core Circadian Clock Genes Regulate Leukemia Stem Cells in AML

artículo científico publicado en 2016

Csnk1a1 inhibition has p53-dependent therapeutic efficacy in acute myeloid leukemia.

artículo científico publicado en 2014

DBAli tools: mining the protein structure space

artículo científico publicado en 2007

DREIMT: a drug repositioning database and prioritization tool for immunomodulation

scientific article published on 20 August 2020

Dexamethasone and lenalidomide have distinct functional effects on erythropoiesis

artículo científico publicado en 2011

Discovering molecular functions significantly related to phenotypes by combining gene expression data and biological information

artículo científico publicado en 2005

Discovery of new targets to control metastasis in pancreatic cancer by single cell transcriptomics analysis of circulating tumor cells

scientific article published on 04 June 2020

Distinct roles for long-term hematopoietic stem cells and erythroid precursor cells in a murine model of Jak2V617F-mediated polycythemia vera ⬇️

artículo científico publicado el 24 de mayo de 2012

Endothelin-1-mediated Drug Resistance in EGFR-mutant NSCLC

artículo científico publicado en 2020

Evidence for systems-level molecular mechanisms of tumorigenesis

artículo científico publicado en 2007

Exploring the antimicrobial action of a carbon monoxide-releasing compound through whole-genome transcription profiling of Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

Expression and microarrays.

artículo científico publicado en 2008

FatiGO +: a functional profiling tool for genomic data. Integration of functional annotation, regulatory motifs and interaction data with microarray experiments

artículo científico publicado en 2007

From genes to functional classes in the study of biological systems

artículo científico publicado en 2007

Functional profiling and gene expression analysis of chromosomal copy number alterations

artículo científico publicado en 2007

Functional profiling of microarray experiments using text-mining derived bioentities

artículo científico

Functional screen of MSI2 interactors identifies an essential role for SYNCRIP in myeloid leukemia stem cells

artículo científico publicado en 2017

Functional signatures identified in B-cell non-Hodgkin lymphoma profiles.

artículo científico publicado en 2009

GEPAS, a web-based tool for microarray data analysis and interpretation

artículo científico publicado en 2008

GEPAS, an experiment-oriented pipeline for the analysis of microarray gene expression data

artículo científico publicado en 2005

GEPAS: A web-based resource for microarray gene expression data analysis

artículo científico publicado en 2003

Gene set internal coherence in the context of functional profiling

artículo científico publicado en 2009

Gene set-based analysis of polymorphisms: finding pathways or biological processes associated to traits in genome-wide association studies

artículo científico publicado en 2009

Global Transcriptomic Profiling of the Bone Marrow Stromal Microenvironment during Postnatal Development, Aging, and Inflammation

scientific article published on 01 December 2019

Hsa-miR-139-5p is a prognostic thyroid cancer marker involved in HNRNPF-mediated alternative splicing

artículo científico publicado en 2019

ISACGH: a web-based environment for the analysis of Array CGH and gene expression which includes functional profiling.

artículo científico publicado en 2007

Immunophenotype and Transcriptome Profile of Patients With Multiple Sclerosis Treated With Fingolimod: Setting Up a Model for Prediction of Response in a 2-Year Translational Study

scientific article published on 25 July 2018

In Silico Drug Prescription for Targeting Cancer Patient Heterogeneity and Prediction of Clinical Outcome

artículo científico publicado en 2019

In Vivo RNAi screening identifies a leukemia-specific dependence on integrin beta 3 signaling

scientific article published on 13 June 2013

Integrated genomic analysis illustrates the central role of JAK-STAT pathway activation in myeloproliferative neoplasm pathogenesis

artículo científico publicado en 2014

Integrated next-generation sequencing and avatar mouse models for personalized cancer treatment

artículo científico publicado en 2014

Integrative multi-omics analysis identifies a prognostic miRNA signature and a targetable miR-21-3p/TSC2/mTOR axis in metastatic pheochromocytoma/paraganglioma

artículo científico publicado en 2019

Interpreting molecular similarity between patients as a determinant of disease comorbidity relationships

artículo científico publicado en 2020

Intratumoral Heterogeneity in EGFR-Mutant NSCLC Results in Divergent Resistance Mechanisms in Response to EGFR Tyrosine Kinase Inhibition

artículo científico publicado en 2015

Long-range epigenetic silencing associates with deregulation of Ikaros targets in colorectal cancer cells

artículo científico publicado en 2011

MLL-AF9- and HOXA9-mediated acute myeloid leukemia stem cell self-renewal requires JMJD1C.

artículo científico publicado en 2016

Metatax: Metataxonomics with a Compi-Based Pipeline for Precision Medicine

artículo científico publicado en 2020

Midkine rewires the melanoma microenvironment toward a tolerogenic and immune-resistant state

artículo científico publicado en 2020

Musashi-2 controls cell fate, lineage bias, and TGF-β signaling in HSCs

artículo científico publicado en 2014

Musashi-2 regulates normal hematopoiesis and promotes aggressive myeloid leukemia

artículo científico publicado en 2010

Mutant Calreticulin Requires Both Its Mutant C-terminus and the Thrombopoietin Receptor for Oncogenic Transformation ⬇️

artículo científico publicado en 2016

New challenges in gene expression data analysis and the extended GEPAS

artículo científico publicado en 2004

Next station in microarray data analysis: GEPAS.

artículo científico publicado en 2006

Niche-based screening identifies small-molecule inhibitors of leukemia stem cells

artículo científico publicado en 2013

Ontology-driven approaches to analyzing data in functional genomics

artículo científico publicado en 2006

PanDrugs: a novel method to prioritize anticancer drug treatments according to individual genomic data.

artículo científico publicado en 2018

Pancreas Cancer Precision Treatment Using Avatar Mice from a Bioinformatics Perspective

artículo científico publicado en 2017

PheoSeq: A Targeted Next-Generation Sequencing Assay for Pheochromocytoma and Paraganglioma Diagnostics

artículo científico publicado en 2017

Precision medicine needs pioneering clinical bioinformaticians.

artículo científico publicado en 2017

PupaSNP Finder: a web tool for finding SNPs with putative effect at transcriptional level.

artículo científico publicado en 2004

SNOW, a web-based tool for the statistical analysis of protein-protein interaction networks

artículo científico publicado en 2009

Saa3 is a key mediator of the protumorigenic properties of cancer-associated fibroblasts in pancreatic tumors

artículo científico publicado en 2018

Selection upon genome architecture: conservation of functional neighborhoods with changing genes

artículo científico publicado en 2010

Stromal EGF and igf-I together modulate plasticity of disseminated triple-negative breast tumors.

artículo científico publicado en 2013

Targeted Sequencing Reveals Low-Frequency Variants in EPHA Genes as Markers of Paclitaxel-Induced Peripheral Neuropathy.

artículo científico publicado en 2016

Targeting transcriptional addictions in small cell lung cancer with a covalent CDK7 inhibitor

artículo científico publicado en 2014

Temporal Molecular and Biological Assessment of an Erlotinib-Resistant Lung Adenocarcinoma Model Reveals Markers of Tumor Progression and Treatment Response ⬇️

artículo científico publicado el 11 de septiembre de 2012

The AnnoLite and AnnoLyze programs for comparative annotation of protein structures.

artículo científico publicado en 2007

The Apc(min) mouse has altered hematopoietic stem cell function and provides a model for MPD/MDS.

artículo científico publicado en 2010

The B cell transcription program mediates hypomethylation and overexpression of key genes in Epstein-Barr virus-associated proliferative conversion.

artículo científico publicado en 2013

The use of PanDrugs to prioritize anticancer drug treatments in a case of T-ALL based on individual genomic data

scientific article published on 26 October 2019

Treatment of Pancreatic Cancer Patient-Derived Xenograft Panel with Metabolic Inhibitors Reveals Efficacy of Phenformin.

artículo científico publicado en 2017

Whole exome sequencing identifies PLEC, EXO5 and DNAH7 as novel susceptibility genes in testicular cancer

article

vulcanSpot: a tool to prioritize therapeutic vulnerabilities in cancer

scientific article published on 01 November 2019

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