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Lista de obras de Nicholas Provart

50 years of Arabidopsis research: highlights and future directions

artículo científico

A Human "eFP" Browser for Generating Gene Expression Anatograms

artículo científico publicado en 2016

A comparative genomic analysis of ESTs from Ustilago maydis

artículo científico publicado en 2004

A comprehensive expression analysis of the Arabidopsis proline-rich extensin-like receptor kinase gene family using bioinformatic and experimental approaches

artículo científico publicado en 2004

A gene expression atlas for kiwifruit (Actinidia chinensis) and network analysis of transcription factors

artículo científico publicado en 2021

A gene expression map of shoot domains reveals regulatory mechanisms

artículo científico publicado en 2019

A mesoscale abscisic acid hormone interactome reveals a dynamic signaling landscape in Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2014

A predicted interactome for Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2007

A predicted protein interactome for rice

artículo científico publicado en 2012

Abscisic acid inhibits type 2C protein phosphatases via the PYR/PYL family of START proteins

artículo científico publicado en 2009

An "Electronic Fluorescent Pictograph" browser for exploring and analyzing large-scale biological data sets

artículo científico publicado en 2007

An 'eFP-Seq Browser' for visualizing and exploring RNA sequencing data

scientific article published on 23 August 2019

An Arabidopsis lipid map reveals differences between tissues and dynamic changes throughout development

artículo científico publicado en 2021

An abscisic acid-responsive protein interaction network for sucrose non-fermenting related kinase1 in abiotic stress response

scientific article published on 26 March 2020

An extensive (co-)expression analysis tool for the cytochrome P450 superfamily in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2008

An extracellular network of Arabidopsis leucine-rich repeat receptor kinases.

artículo científico publicado en 2018

An updated gene atlas for maize reveals organ-specific and stress-induced genes

artículo científico publicado en 2019

Analyses of Protein Interaction Networks Using Computational Tools

artículo científico publicado en 2018

Analysis of gene expression patterns during seed coat development in Arabidopsis.

artículo científico publicado en 2011

Anno genominis XX: 20 years of Arabidopsis genomics

artículo científico publicado en 2021

Arabidopsis bioinformatics: tools and strategies

artículo científico publicado en 2021

Araport Lives: An Updated Framework for Arabidopsis Bioinformatics

artículo científico publicado en 2020

AtMetExpress development: a phytochemical atlas of Arabidopsis development ⬇️

article

BAR expressolog identification: expression profile similarity ranking of homologous genes in plant species ⬇️

artículo científico publicado el 12 de julio de 2012

Bioinformatic Tools in Arabidopsis Research

artículo científico publicado en 2021

Bioinformatic tools in Arabidopsis research

artículo científico publicado en 2014

BlastDigester--a web-based program for efficient CAPS marker design

artículo científico publicado en 2004

C-terminal motif prediction in eukaryotic proteomes using comparative genomics and statistical over-representation across protein families

artículo científico publicado en 2007

CapsID: a web-based tool for developing parsimonious sets of CAPS molecular markers for genotyping

artículo científico publicado en 2006

Changes in stomatal function and water use efficiency in potato plants with altered sucrolytic activity ⬇️

artículo científico publicado el 23 de noviembre de 2011

Co-expression tools for plant biology: opportunities for hypothesis generation and caveats

artículo científico publicado en 2009

Combining classifiers to predict gene function in Arabidopsis thaliana using large-scale gene expression measurements

artículo científico publicado en 2007

Comparative analyses of C₄ and C₃ photosynthesis in developing leaves of maize and rice

artículo científico publicado en 2014

Complexity and specificity of the maize (Zea mays L.) root hair transcriptome

artículo científico

Correlation networks visualization

artículo científico publicado en 2012

Current status of the multinational Arabidopsis community

artículo científico publicado en 2020

Developmental transcriptional profiling reveals key insights into Triticeae reproductive development

artículo científico publicado en 2013

Developments in plant and animal genome research

artículo científico publicado en 2004

Editorial: Resistance to Salinity and Water Scarcity in Higher Plants. Insights From Extremophiles and Stress-Adapted Plants: Tools, Discoveries and Future Prospects

article

Elevated tyrosine results in the cytosolic retention of 3‐deoxy‐ d ‐arabino‐heptulosonate 7‐phosphate synthase in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2021

Elucidating the germination transcriptional program using small molecules

artículo científico publicado en 2008

Embryogenesis: Pattern Formation from a Single Cell ⬇️

artículo científico publicado el 12 de noviembre de 2009

Evolutionary divergence in embryo and seed coat development of U’s Triangle Brassica species illustrated by a spatiotemporal transcriptome atlas

artículo científico publicado en 2021

Expansion and diversification of the Populus R2R3-MYB family of transcription factors

artículo científico publicado en 2008

Expression Atlas of Selaginella moellendorffii Provides Insights into the Evolution of Vasculature, Secondary Metabolism, and Roots

scientific article published on 27 January 2020

Expression atlas and comparative coexpression network analyses reveal important genes involved in the formation of lignified cell wall in Brachypodium distachyon

artículo científico publicado en 2017

Expression profile matrix of Arabidopsis transcription factor genes suggests their putative functions in response to environmental stresses.

artículo científico publicado en 2002

Extreme breeding: Leveraging genomics for crop improvement

artículo científico publicado en 2007

Forward and reverse genetics to identify genes involved in the age-related resistance response in Arabidopsis thaliana.

artículo científico publicado en 2009

Gene Slider: sequence logo interactive data-visualization for education and research

artículo científico publicado en 2016

Gene co-expression analysis of tomato seed maturation reveals tissue-specific regulatory networks and hubs associated with the acquisition of desiccation tolerance and seed vigour

artículo científico publicado en 2021

Gene expression analyses for elucidating mechanisms of hormonal action in plants

artículo científico publicado en 2009

Gene expression phenotypes of Arabidopsis associated with sensitivity to low temperatures

artículo científico publicado en 2003

Genome-wide network model capturing seed germination reveals coordinated regulation of plant cellular phase transitions

artículo científico publicado en 2011

Genotype and time of day shape the Populus drought response

artículo científico publicado en 2009

High Temporal-Resolution Transcriptome Landscape of Early Maize Seed Development

article

Incipient stem cell niche conversion in tissue culture: using a systems approach to probe early events in WUSCHEL‐dependent conversion of lateral root primordia into shoot meristems ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2013

Inference of Longevity-Related Genes from a Robust Coexpression Network of Seed Maturation Identifies Regulators Linking Seed Storability to Biotic Defense-Related Pathways

artículo científico publicado en 2015

Innovation, Conservation and Repurposing of Gene Function in Plant Root Cell Type Development

artículo científico publicado en 2020

Innovation, conservation, and repurposing of gene function in root cell type development

artículo científico

Innovation, conservation, and repurposing of gene function in root cell type development

artículo científico publicado en 2021

Light-responsive expression atlas reveals the effects of light quality and intensity in Kalanchoë fedtschenkoi, a plant with crassulacean acid metabolism

artículo científico publicado en 2020

Map of physical interactions between extracellular domains of Arabidopsis leucine-rich repeat receptor kinases

artículo científico publicado en 2019

MetaBase—the wiki-database of biological databases

artículo científico publicado en 2012

Multiple horizontal gene transfer events and domain fusions have created novel regulatory and metabolic networks in the oomycete genome

artículo científico publicado en 2009

NLStradamus: a simple Hidden Markov Model for nuclear localization signal prediction

artículo científico publicado en 2009

New BAR tools for mining expression data and exploring Cis-elements in Arabidopsis thaliana

artículo científico publicado en 2016

New insights into Dehalococcoides mccartyi metabolism from a reconstructed metabolic network-based systems-level analysis of D. mccartyi transcriptomes

artículo científico publicado en 2014

Next‐generation mapping of Arabidopsis genes ⬇️

artículo científico publicado el 18 de julio de 2011

Nod factors potentiate auxin signaling for transcriptional regulation and lateral root formation in Medicago truncatula

artículo científico publicado en 2017

PhyloPro: a web-based tool for the generation and visualization of phylogenetic profiles across Eukarya

scientific article published on 19 January 2011

Polymerization of glucans by enzymatically active membranes

artículo científico publicado en 2002

Proteome-wide, Structure-Based Prediction of Protein-Protein Interactions/New Molecular Interactions Viewer

artículo científico publicado en 2019

Publisher Correction: An extracellular network of Arabidopsis leucine-rich repeat receptor kinases

artículo científico publicado en 2018

RNA-Seq effectively monitors gene expression in Eutrema salsugineum plants growing in an extreme natural habitat and in controlled growth cabinet conditions.

artículo científico publicado en 2013

Regulation of Cell Type-Specific Immunity Networks in Arabidopsis Roots

artículo científico publicado en 2020

Regulation of Root Angle and Gravitropism

artículo científico publicado en 2018

Seed bioinformatics

artículo científico publicado en 2011

Sequence analysis and regulation of expression of a gene coding for carbonic anhydrase in Chlamydomonas reinhardtii

artículo científico publicado en 1991

Systems approaches to understanding cell signaling and gene regulation

artículo científico publicado en 2004

The Bio-Analytic Resource for Plant Biology

artículo científico publicado en 2017

The Bio-Analytic Resource: Data visualization and analytic tools for multiple levels of plant biology

artículo científico publicado en 2016

The Botany Array Resource: e-Northerns, Expression Angling, and promoter analyses

scientific article published on 01 July 2005

The Next Generation of Training for Arabidopsis Researchers: Bioinformatics and Quantitative Biology.

artículo científico publicado en 2017

The Transcriptional Landscape of Polyploid Wheats and Their Diploid Ancestors during Embryogenesis and Grain Development

scientific article published on 18 October 2019

The developmental dynamics of the maize leaf transcriptome

artículo científico publicado en 2010

The developmental transcriptome atlas of the biofuel crop Camelina sativa

artículo científico publicado en 2016

The embryonic leaf identity gene FUSCA3 regulates vegetative phase transitions by negatively modulating ethylene-regulated gene expression in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2012

The re-establishment of desiccation tolerance in germinated Arabidopsis thaliana seeds and its associated transcriptome.

artículo científico publicado en 2011

The red flower wintersweet genome provides insights into the evolution of magnoliids and the molecular mechanism for tepal color development

artículo científico publicado en 2021

The role of the Arabidopsis FUSCA3 transcription factor during inhibition of seed germination at high temperature.

artículo científico publicado en 2012

The transcriptional landscape of polyploid wheat

artículo científico publicado en 2018

Topo-phylogeny: Visualizing evolutionary relationships on a topographic landscape

artículo científico publicado en 2017

Toward a data infrastructure for the Plant Cell Atlas

artículo científico publicado en 2022

Transcriptional control of nutrient partitioning during rice grain filling

artículo científico publicado en 2003

Transcriptional networks: The next generation

artículo científico publicado en 2015

Transcriptional responses to low temperature and their regulation in Arabidopsis

artículo científico publicado en 2003

Transcriptomics at Maize Embryo/Endosperm Interfaces Identifies a Transcriptionally Distinct Endosperm Sub-domain Adjacent to the Embryo Scutellum

artículo científico publicado en 2020

Tung Tree (Vernicia fordii) Genome Provides A Resource for Understanding Genome Evolution and Improved Oil Production

scientific article published on 26 March 2020

Vision, challenges and opportunities for a Plant Cell Atlas

artículo científico publicado en 2021

Web-queryable large-scale data sets for hypothesis generation in plant biology

artículo científico publicado en 2009

ccNET: Database of co-expression networks with functional modules for diploid and polyploid Gossypium

artículo científico publicado en 2016

ccNET: Database of co-expression networks with functional modules for diploid and polyploid Gossypium

artículo científico publicado en 2016

ePlant and the 3D data display initiative: integrative systems biology on the world wide web

artículo científico publicado en 2011

ePlant: Visualizing and Exploring Multiple Levels of Data for Hypothesis Generation in Plant Biology.

artículo científico

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