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Lista de obras de

A general modeling strategy for gene regulatory networks with stochastic dynamics

artículo científico publicado en 2006

Added value of autoregulation and multi-step kinetics of transcription initiation

artículo científico publicado en 2018

Analytical kinetic model of native tandem promoters in E. coli

artículo científico publicado en 2022

Cell segmentation by multi-resolution analysis and maximum likelihood estimation (MAMLE)

artículo científico publicado en 2013

Cell-to-cell diversity in protein levels of a gene driven by a tetracycline inducible promoter

artículo científico publicado en 2011

Detecting sequence dependent transcriptional pauses from RNA and protein number time series.

artículo científico publicado en 2012

Determining noisy attractors of delayed stochastic gene regulatory networks from multiple data sources

artículo científico publicado en 2009

Dissecting the in vivo dynamics of transcription locking due to positive supercoiling buildup

artículo científico publicado en 2020

Dissecting the stochastic transcription initiation process in live Escherichia coli.

artículo científico publicado en 2016

Effects of multimerization on the temporal variability of protein complex abundance

artículo científico publicado en 2013

Effects of rate-limiting steps in transcription initiation on genetic filter motifs

artículo científico publicado en 2013

Effects of transcriptional pausing on gene expression dynamics

artículo científico publicado en 2010

Estimation of GFP-tagged RNA numbers from temporal fluorescence intensity data

artículo científico publicado en 2014

Estimation of kinetic parameters of transcription from temporal single-RNA measurements

artículo científico publicado en 2015

In vivo kinetics of segregation and polar retention of MS2-GFP-RNA complexes in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

In vivo kinetics of transcription initiation of the lar promoter in Escherichia coli. Evidence for a sequential mechanism with two rate-limiting steps

artículo científico publicado en 2011

In vivo transcription kinetics of a synthetic gene uninvolved in stress-response pathways in stressed Escherichia coli cells

artículo científico publicado en 2014

Information propagation within the Genetic Network of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2010

Kinetics of the cellular intake of a gene expression inducer at high concentrations

artículo científico publicado en 2015

Mytoe: automatic analysis of mitochondrial dynamics.

artículo científico publicado en 2012

Polar Localization of the Serine Chemoreceptor of Escherichia coli Is Nucleoid Exclusion-Dependent

artículo científico publicado en 2016

Rate-limiting steps in transcription dictate sensitivity to variability in cellular components

artículo científico publicado en 2017

Reversible Disruption of Neuronal Mitochondria by Ischemic and Traumatic Injury Revealed by Quantitative Two-Photon Imaging in the Neocortex of Anesthetized Mice

artículo científico publicado en 2017

Robustness and information propagation in attractors of Random Boolean Networks

artículo científico publicado en 2012

SCIP: a single-cell image processor toolbox

artículo científico publicado en 2018

SGN Sim, a stochastic genetic networks simulator

artículo científico publicado en 2007

Screen for mitochondrial DNA copy number maintenance genes reveals essential role for ATP synthase

artículo científico publicado en 2014

Single-cell kinetics of a repressilator when implemented in a single-copy plasmid

artículo científico publicado en 2015

Stochastic sequence-level model of coupled transcription and translation in prokaryotes

artículo científico publicado en 2011

Temperature-Dependent Model of Multi-step Transcription Initiation in Escherichia coli Based on Live Single-Cell Measurements.

artículo científico publicado en 2016

ZebIAT, an image analysis tool for registering zebrafish embryos and quantifying cancer metastasis.

artículo científico publicado en 2013

sgnesR: An R package for simulating gene expression data from an underlying real gene network structure considering delay parameters

artículo científico publicado en 2017