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Lista de obras de

A composite of multiple signals distinguishes causal variants in regions of positive selection

artículo científico publicado en 2010

A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals

artículo científico publicado en 2011

A high-throughput chromatin immunoprecipitation approach reveals principles of dynamic gene regulation in mammals

artículo científico publicado en 2012

A large intergenic noncoding RNA induced by p53 mediates global gene repression in the p53 response

scientific journal article

A negative feedback loop of transcription factors specifies alternative dendritic cell chromatin States.

artículo científico publicado en 2014

Ab initio reconstruction of cell type-specific transcriptomes in mouse reveals the conserved multi-exonic structure of lincRNAs

artículo científico publicado en 2010

An atlas of cell types in the mammalian epididymis and vas deferens

scientific article published on 30 July 2020

Analysis of the DNA sequence and duplication history of human chromosome 15

artículo científico publicado en 2006

Biogenesis and function of tRNA fragments during sperm maturation and fertilization in mammals

artículo científico publicado en 2015

Chromatin signature reveals over a thousand highly conserved large non-coding RNAs in mammals

artículo científico publicado en 2009

Closing gaps in the human genome using sequencing by synthesis

artículo científico publicado en 2009

Comparative Analysis of Immune Cells Reveals a Conserved Regulatory Lexicon

artículo científico publicado en 2018

Computational methods for transcriptome annotation and quantification using RNA-seq ⬇️

artículo científico publicado el 27 de mayo de 2011

Correction: Closing gaps in the human genome using sequencing by synthesis.

artículo científico publicado en 2011

DEBrowser: interactive differential expression analysis and visualization tool for count data

artículo científico publicado en 2019

DNA sequence analysis of the conserved region around the SOD1 gene locus in recessively inherited ALS.

artículo científico publicado en 2009

DNA sequence and analysis of human chromosome 18

artículo científico publicado en 2005

DNA sequence and analysis of human chromosome 8

artículo científico publicado en 2006

DNA sequence of human chromosome 17 and analysis of rearrangement in the human lineage

artículo científico publicado en 2006

DNA-binding-domain fusions enhance the targeting range and precision of Cas9.

artículo científico publicado en 2015

Defining the 5΄ and 3΄ landscape of the Drosophila transcriptome with Exo-seq and RNaseH-seq.

artículo científico publicado en 2017

Diverse repertoire of human adipocyte subtypes develops from transcriptionally distinct mesenchymal progenitor cells

scientific article published on 16 August 2019

DolphinNext: A graphical user interface for creating, deploying and executing Nextflow pipelines

artículo científico publicado en 2020

DolphinNext: a distributed data processing platform for high throughput genomics

scientific article published on 19 April 2020

Early Epstein-Barr Virus Genomic Diversity and Convergence toward the B95.8 Genome in Primary Infection

artículo científico publicado en 2017

Ebola Virus Glycoprotein with Increased Infectivity Dominated the 2013-2016 Epidemic

artículo científico publicado en 2016

End Sequence Analysis Toolkit (ESAT) expands the extractable information from single-cell RNA-seq data.

artículo científico publicado en 2016

Epstein-Barr virus latent membrane protein 1 genetic variability in peripheral blood B cells and oropharyngeal fluids

artículo científico publicado en 2014

Erratum: Corrigendum: Ab initio reconstruction of cell type–specific transcriptomes in mouse reveals the conserved multi-exonic structure of lincRNAs

scholarly article published in Nature Biotechnology

Erratum: Corrigendum: DNA sequence and analysis of human chromosome 18

artículo científico publicado en 2005

Evolutionary analysis across mammals reveals distinct classes of long non-coding RNAs

artículo científico publicado en 2016

Evolutionary analysis across mammals reveals distinct classes of long noncoding RNAs

Evolutionary dynamics and tissue specificity of human long noncoding RNAs in six mammals

artículo científico

GUIDEseq: a bioconductor package to analyze GUIDE-Seq datasets for CRISPR-Cas nucleases.

artículo científico publicado en 2017

Genetic and Epigenetic Variation, but Not Diet, Shape the Sperm Methylome

artículo científico publicado en 2015

Genome of the marsupial Monodelphis domestica reveals innovation in non-coding sequences

artículo científico publicado en 2007

Genome sequence, comparative analysis and haplotype structure of the domestic dog

artículo científico publicado en 2005

HIV type 1 (HIV-1) proviral reservoirs decay continuously under sustained virologic control in HIV-1-infected children who received early treatment

artículo científico publicado en 2014

HIV-1-induced cytokines deplete homeostatic innate lymphoid cells and expand TCF7-dependent memory NK cells

artículo científico publicado en 2020

High Epstein-Barr Virus Load and Genomic Diversity Are Associated with Generation of gp350-Specific Neutralizing Antibodies following Acute Infectious Mononucleosis

artículo científico publicado en 2016

High-Resolution Mapping of Multiway Enhancer-Promoter Interactions Regulating Pathogen Detection

artículo científico publicado en 2020

Higher-Order Inter-chromosomal Hubs Shape 3D Genome Organization in the Nucleus

artículo científico publicado en 2018

Identifying novel constrained elements by exploiting biased substitution patterns

artículo científico publicado en 2009

Large intergenic non-coding RNA-RoR modulates reprogramming of human induced pluripotent stem cells

artículo científico publicado en 2010

Many human large intergenic noncoding RNAs associate with chromatin-modifying complexes and affect gene expression

artículo científico publicado en 2009

Metabolic labeling of RNA uncovers principles of RNA production and degradation dynamics in mammalian cells

artículo científico publicado en 2011

Quality scores and SNP detection in sequencing-by-synthesis systems ⬇️

artículo científico publicado en 2008

SARS-CoV-2 Receptor ACE2 Is an Interferon-Stimulated Gene in Human Airway Epithelial Cells and Is Detected in Specific Cell Subsets across Tissues

artículo científico publicado en 2020

Semiconductor-based DNA sequencing of histone modification states

artículo científico publicado en 2013

Simultaneous generation of many RNA-seq libraries in a single reaction

artículo científico publicado en 2015

Systematic discovery of TLR signaling components delineates viral-sensing circuits

artículo científico publicado en 2011

Systematic identification of long noncoding RNAs expressed during zebrafish embryogenesis

artículo científico publicado en 2011

Transcriptome-wide Analysis of Roles for tRNA Modifications in Translational Regulation

artículo científico publicado en 2017

Transcriptome-wide analysis of roles for tRNA modifications in translational regulation

artículo científico publicado en 2017

Unbiased reconstruction of a mammalian transcriptional network mediating pathogen responses

artículo científico publicado en 2009

scRNA-seq of human vitiligo reveals complex networks of subclinical immune activation and a role for CCR5 in T<sub>reg</sub> function

artículo científico publicado en 2021

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