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Lista de obras de

ACTG: novel peptide mapping onto gene models.

artículo científico publicado en 2016

CIFTER: automated charge-state determination for peptide tandem mass spectra.

artículo científico publicado en 2008

Cataract-Associated New Mutants S175G/H181Q of βΒ2-Crystallin and P24S/S31G of γD-Crystallin Are Involved in Protein Aggregation by Structural Changes

artículo científico publicado en 2020

Characterization of disulfide bonds by planned digestion and tandem mass spectrometry.

artículo científico publicado en 2015

Common Repository of FBS Proteins (cRFP) To Be Added to a Search Database for Mass Spectrometric Analysis of Cell Secretome

scientific article published on 10 September 2019

Compact variant-rich customized sequence database and a fast and sensitive database search for efficient proteogenomic analyses

artículo científico publicado en 2014

Comprehensive analysis of human protein N-termini enables assessment of various protein forms.

artículo científico publicado en 2017

Computational methods in mass spectrometry-based structural proteomics for studying protein structure, dynamics, and interactions

scientific article published on 10 June 2020

Data-Dependent Scoring Parameter Optimization in MS-GF+ Using Spectrum Quality Filter

artículo científico publicado en 2018

Estimating influence of cofragmentation on peptide quantification and identification in iTRAQ experiments by simulating multiplexed spectra

artículo científico publicado en 2014

Evaluating the effect of database inflation in proteogenomic search on sensitive and reliable peptide identification

artículo científico publicado en 2016

Fast multi-blind modification search through tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2011

HiXCorr: a portable high-speed XCorr engine for high-resolution tandem mass spectrometry

artículo científico publicado en 2015

High-throughput peptide quantification using mTRAQ reagent triplex ⬇️

artículo científico publicado el 15 de febrero de 2011

Improved quantitative analysis of mass spectrometry using quadratic equations

artículo científico publicado en 2010

Integrated pharmaco-proteogenomics defines two subgroups in isocitrate dehydrogenase wild-type glioblastoma with prognostic and therapeutic opportunities

artículo científico publicado en 2020

Isoform-specific regulation of Akt by PDGF-induced reactive oxygen species ⬇️

artículo científico publicado el 13 de junio de 2011

Isotopic peak intensity ratio based algorithm for determination of isotopic clusters and monoisotopic masses of polypeptides from high-resolution mass spectrometric data

artículo científico publicado en 2008

MODi: a powerful and convenient web server for identifying multiple post-translational peptide modifications from tandem mass spectra

artículo científico publicado en 2006

MODplus: Robust and Unrestrictive Identification of Post-Translational Modifications Using Mass Spectrometry

artículo científico publicado en 2019

Monoisotopic mass determination algorithm for selenocysteine-containing polypeptides from mass spectrometric data based on theoretical modeling of isotopic peak intensity ratios

artículo científico publicado en 2012

Multi-layered representation for cell signaling pathways.

artículo científico

MutCombinator: identification of mutated peptides allowing combinatorial mutations using nucleotide-based graph search

artículo científico publicado en 2020

New algorithm for the identification of intact disulfide linkages based on fragmentation characteristics in tandem mass spectra.

artículo científico publicado en 2010

NextSearch: A Search Engine for Mass Spectrometry Data against a Compact Nucleotide Exon Graph

artículo científico publicado en 2015

Novel Oxidative Modifications in Redox-Active Cysteine Residues ⬇️

artículo científico publicado el 10 de diciembre de 2010

Prediction of novel modifications by unrestrictive search of tandem mass spectra.

artículo científico publicado en 2009

Proteogenomic Approach to UTR Peptide Identification

artículo científico publicado en 2019

Proteogenomic Characterization of Human Early-Onset Gastric Cancer

artículo científico publicado en 2019

Quality assessment of tandem mass spectra based on cumulative intensity normalization

artículo científico publicado en 2006

Reinvestigation of aminoacyl-tRNA synthetase core complex by affinity purification-mass spectrometry reveals TARSL2 as a potential member of the complex

artículo científico publicado en 2013

Software eyes for protein post-translational modifications.

artículo científico

Strategy for comprehensive identification of post-translational modifications in cellular proteins, including low abundant modifications: application to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase

artículo científico publicado en 2008

Systematic Comparison of False-Discovery-Rate-Controlling Strategies for Proteogenomic Search Using Spike-in Experiments.

artículo científico publicado en 2017

Target-Decoy with Mass Binning: a simple and effective validation method for shotgun proteomics using high resolution mass spectrometry

artículo científico publicado en 2010

The protein-disulfide isomerase DsbC cooperates with SurA and DsbA in the assembly of the essential β-barrel protein LptD.

artículo científico publicado en 2010

Unrestrictive identification of multiple post-translational modifications from tandem mass spectrometry using an error-tolerant algorithm based on an extended sequence tag approach

artículo científico publicado en 2008

deMix: Decoding Deuterated Distributions from Heterogeneous Protein States via HDX-MS

scientific article published on 28 February 2019

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