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Lista de obras de

A computational method for identification of vaccine targets from protein regions of conserved human leukocyte antigen binding

artículo científico publicado en 2015

A concentration-dependent analysis method for high density protein microarrays

artículo científico publicado en 2008

A conserved E7-derived cytotoxic T lymphocyte epitope expressed on human papillomavirus 16-transformed HLA-A2+ epithelial cancers

artículo científico publicado en 2010

A novel H2A-E+ transgenic model susceptible to human but not mouse thyroglobulin-induced autoimmune thyroiditis: identification of mouse pathogenic epitopes.

artículo científico publicado en 2008

A systematic analysis of a broadly neutralizing antibody AR3C epitopes on Hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein and their cross-reactivity

artículo científico publicado en 2015

A systematic bioinformatics approach for selection of epitope-based vaccine targets

artículo científico publicado en 2006

ALLERDB database and integrated bioinformatic tools for assessment of allergenicity and allergic cross-reactivity.

artículo científico publicado en 2006

Accurate prediction of scorpion toxin functional properties from primary structures

artículo científico publicado en 2005

Advances in Computational Immunology

artículo científico publicado en 2015

An adaptive genetic algorithm for selection of blood-based biomarkers for prediction of Alzheimer's disease progression

artículo científico publicado en 2015

An update on the functional molecular immunology (FIMM) database

artículo científico publicado en 2005

Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs

artículo científico publicado en 2002

Analysis of viral diversity for vaccine target discovery

artículo científico publicado en 2017

Big data analytics in immunology: a knowledge-based approach.

artículo científico publicado en 2014

Bioinformatic strategies for better understanding of immune function.

artículo científico publicado en 2003

Bioinformatics for cancer immunotherapy target discovery

artículo científico publicado en 2014

Bioinformatics for characterisation of allergens, allergenicity and allergic crossreactivity ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 2003

Bioinformatics for study of autoimmunity

artículo científico publicado en 2006

Bioinformatics for venom and toxin sciences

artículo científico publicado en 2003

BlockLogo: visualization of peptide and sequence motif conservation

artículo científico publicado en 2013

Characterization of a Novel H2A−E+ Transgenic Model Susceptible to Heterologous but Not Self Thyroglobulin in Autoimmune Thyroiditis: Thyroiditis Transfer with Vβ8+ T Cells ⬇️

artículo científico publicado el 25 de agosto de 2001

Combining cellular automata and Lattice Boltzmann method to model multiscale avascular tumor growth coupled with nutrient diffusion and immune competition

artículo científico publicado en 2011

Complete-proteome mapping of human influenza A adaptive mutations: implications for human transmissibility of zoonotic strains.

artículo científico publicado en 2010

Comprehensive analysis of cancer-associated somatic mutations in class I HLA genes

artículo científico publicado en 2015

Computational and bioinformatics techniques for immunology

artículo científico publicado en 2014

Computational detection of vertebrate RNA polymerase II promoters

artículo científico publicado en 2003

Computational immunology: The coming of age.

artículo científico publicado en 2002

Computational methods for prediction of T-cell epitopes--a framework for modelling, testing, and applications

artículo científico publicado en 2004

Computational resources for high-dimensional immune analysis from the Human Immunology Project Consortium

artículo científico publicado en 2014

Computational tools for the study of allergens ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2003

Computational vaccinology and the ICoVax 2012 workshop

artículo científico publicado en 2013

Computer model for recognition of functional transcription start sites in RNA polymerase II promoters of vertebrates

article

Conservation analysis of dengue virus T-cell epitope-based vaccine candidates using Peptide block entropy

artículo científico publicado en 2011

Conservation and Variability of West Nile Virus Proteins

artículo científico publicado en 2009

Conservation and variability of dengue virus proteins: implications for vaccine design

artículo científico publicado en 2008

Critical technologies for bioinformatics

artículo científico publicado en 2008

CysView: protein classification based on cysteine pairing patterns.

artículo científico publicado en 2004

Cytokine-related genes identified from the RIKEN full-length mouse cDNA data set

artículo científico publicado en 2003

Dana-Farber repository for machine learning in immunology

artículo científico publicado en 2011

Data mining of cancer vaccine trials: a bird's-eye view

artículo científico publicado en 2008

Data processing and analysis for protein microarrays

artículo científico publicado en 2011

Database resources for proteomics-based analysis of cancer

artículo científico publicado en 2011

Deduction of functional peptide motifs in scorpion toxins

artículo científico publicado en 2006

Direct identification of an HPV-16 tumor antigen from cervical cancer biopsy specimens

artículo científico publicado en 2011

Disruption of Helix-Capping Residues 671 and 674 Reveals a Role in HIV-1 Entry for a Specialized Hinge Segment of the Membrane Proximal External Region of gp41

artículo científico publicado en 2014

Diverse patterns of T-cell response against multiple newly identified human Y chromosome-encoded minor histocompatibility epitopes

artículo científico publicado en 2010

Dragon Promoter Finder: recognition of vertebrate RNA polymerase II promoters

artículo científico publicado en 2002

Efficacious immune therapy in chronic myelogenous leukemia (CML) recognizes antigens that are expressed on CML progenitor cells

artículo científico publicado en 2010

Efficacy of HLA-DRB1∗03:01 and H2E transgenic mouse strains to correlate pathogenic thyroglobulin epitopes for autoimmune thyroiditis.

artículo científico publicado en 2011

Elemental metabolomics

artículo científico publicado en 2017

Evaluation of MHC class I peptide binding prediction servers: applications for vaccine research

artículo científico publicado en 2008

Evaluation of MHC-II peptide binding prediction servers: applications for vaccine research

artículo científico publicado en 2008

Evolutionarily conserved protein sequences of influenza a viruses, avian and human, as vaccine targets

artículo científico publicado en 2007

FIMM, a database of functional molecular immunology: update 2002

artículo científico publicado en 2002

FLAVIdB: A data mining system for knowledge discovery in flaviviruses with direct applications in immunology and vaccinology

artículo científico publicado en 2011

FluKB: A Knowledge-Based System for Influenza Vaccine Target Discovery and Analysis of the Immunological Properties of Influenza Viruses

artículo científico publicado en 2015

Food authentication: Techniques, trends & emerging approaches

scholarly article by Georgios P. Danezis et al published December 2016 in Trends in Analytical Chemistry

Food authentication: state of the art and prospects

From immunoinformatics to immunomics

artículo científico publicado en 2003

Generation and phenotypic characterization of new human ovarian cancer cell lines with the identification of antigens potentially recognizable by HLA-restricted cytotoxic T cells ⬇️

artículo científico publicado el 26 de septiembre de 1997

Graft-versus-leukemia antigen CML66 elicits coordinated B-cell and T-cell immunity after donor lymphocyte infusion

artículo científico publicado en 2010

HIV-1 broadly neutralizing antibody extracts its epitope from a kinked gp41 ectodomain region on the viral membrane

artículo científico publicado en 2008

HLA-binding properties of tumor neoepitopes in humans

artículo científico

HPVdb: a data mining system for knowledge discovery in human papillomavirus with applications in T cell immunology and vaccinology

artículo científico publicado en 2014

Hidden Markov model-based prediction of antigenic peptides that interact with MHC class II molecules

artículo científico publicado en 2002

Highlights of international conference of immunogenomics and immunomics, October 8-12, 2006 Budapest, Hungary

scientific article published on 01 December 2006

Hotspot Hunter: a computational system for large-scale screening and selection of candidate immunological hotspots in pathogen proteomes

artículo científico publicado en 2008

Human leukocyte antigen typing using a knowledge base coupled with a high-throughput oligonucleotide probe array analysis

artículo científico publicado en 2014

Identification of "pathologs" (disease-related genes) from the RIKEN mouse cDNA dataset using human curation plus FACTS, a new biological information extraction system

artículo científico publicado en 2004

Identification of human leucocyte antigen (HLA)-A*0201-restricted cytotoxic T lymphocyte epitopes derived from HLA-DOβ as a novel target for multiple myeloma

artículo científico publicado en 2013

Identification of human-to-human transmissibility factors in PB2 proteins of influenza A by large-scale mutual information analysis.

artículo científico publicado en 2008

Immune system modeling and related pathologies

artículo científico publicado en 2012

ImmunoGrid, an integrative environment for large-scale simulation of the immune system for vaccine discovery, design and optimization

artículo científico

ImmunoGrid: towards agent-based simulations of the human immune system at a natural scale

artículo científico

Immunoinformatics and its relevance to understanding human immune disease

artículo científico publicado en 2005

Immunoinformatics--the new kid in town.

artículo científico publicado en 2003

Immunoinformatics-The New Kid in Town

Impaired tumor antigen processing by immunoproteasome-expressing CD40-activated B cells and dendritic cells

artículo científico publicado en 2011

In silico characterization of immunogenic epitopes presented by HLA-Cw*0401

artículo científico publicado en 2007

In silico prediction and immunological validation of common HLA-DRB1-restricted T cell epitopes of Candida albicans secretory aspartyl proteinase 2.

artículo científico publicado en 2008

InCoB2012 Conference: from biological data to knowledge to technological breakthroughs

artículo científico publicado en 2012

Information management for the study of allergies

artículo científico publicado en 2006

Information technologies for vaccine research

artículo científico publicado en 2005

Large-scale analysis of B-cell epitopes on influenza virus hemagglutinin - implications for cross-reactivity of neutralizing antibodies

artículo científico publicado en 2014

Large-scale analysis of antigenic diversity of T-cell epitopes in dengue virus

artículo científico publicado en 2006

Large-scale computational identification of HIV T-cell epitopes

article

Literature classification for semi-automated updating of biological knowledgebases

artículo científico publicado en 2013

MAGE-6 encodes HLA-DRbeta1*0401-presented epitopes recognized by CD4+ T cells from patients with melanoma or renal cell carcinoma.

artículo científico publicado en 2003

MHC molecular mimicry in diabetes ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 1995

MHCPEP, a database of MHC-binding peptides: update 1997 ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

MULTIPRED2: a computational system for large-scale identification of peptides predicted to bind to HLA supertypes and alleles

artículo científico publicado en 2010

MULTIPRED: a computational system for prediction of promiscuous HLA binding peptides

artículo científico publicado en 2005

Machine learning competition in immunology - Prediction of HLA class I binding peptides.

artículo científico publicado en 2011

Mathematical modeling for novel cancer drug discovery and development

artículo científico publicado en 2014

Methods for prediction of peptide binding to MHC molecules: a comparative study.

artículo científico publicado en 2002

Mutated BCR-ABL generates immunogenic T-cell epitopes in CML patients

artículo científico publicado en 2012

NY-ESO-1 119-143 is a promiscuous major histocompatibility complex class II T-helper epitope recognized by Th1- and Th2-type tumor-reactive CD4+ T cells ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2002

Neural models for predicting viral vaccine targets

artículo científico publicado en 2005

Neural network-based prediction of candidate T-cell epitopes ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1998

Novel myeloma-associated antigens revealed in the context of syngeneic hematopoietic stem cell transplantation

artículo científico publicado en 2012

One NY-ESO-1-derived epitope that promiscuously binds to multiple HLA-DR and HLA-DP4 molecules and stimulates autologous CD4+ T cells from patients with NY-ESO-1-expressing melanoma

scientific article published on 01 February 2005

Optimizing vaccine development

artículo científico publicado en 2011

PB1-F2 Finder: scanning influenza sequences for PB1-F2 encoding RNA segments

artículo científico publicado en 2011

PRED(TAP): a system for prediction of peptide binding to the human transporter associated with antigen processing

artículo científico publicado en 2006

PREDBALB/c: a system for the prediction of peptide binding to H2d molecules, a haplotype of the BALB/c mouse.

artículo científico publicado en 2005

PREDNOD, a prediction server for peptide binding to the H-2g7 haplotype of the non-obese diabetic mouse

artículo científico publicado en 2006

PREDmafa

Pathogenic human thyroglobulin peptides in HLA-DR3 transgenic mouse model of autoimmune thyroiditis.

artículo científico publicado en 2004

Pathway analysis and transcriptomics improve protein identification by shotgun proteomics from samples comprising small number of cells--a benchmarking study

artículo científico publicado en 2014

Predicting peptides binding to MHC class II molecules using multi-objective evolutionary algorithms

artículo científico publicado en 2007

Prediction of HLA-DQ3.2beta ligands: evidence of multiple registers in class II binding peptides

artículo científico publicado en 2006

Prediction of MHC class II-binding peptides using an evolutionary algorithm and artificial neural network ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

Prediction of promiscuous peptides that bind HLA class I molecules

artículo científico publicado en 2002

Prediction of supertype-specific HLA class I binding peptides using support vector machines

artículo científico publicado en 2007

Promiscuous T cell epitope prediction of Candida albicans secretory aspartyl protienase family of proteins

artículo científico publicado en 2007

Proteins accessible to immune surveillance show significant T-cell epitope depletion: Implications for vaccine design

artículo científico publicado en 2009

Proteome informatics for cancer research: from molecules to clinic

artículo científico publicado en 2007

Rule-based knowledge aggregation for large-scale protein sequence analysis of influenza A viruses

artículo científico publicado en 2008

SARS coronavirus nucleocapsid immunodominant T-cell epitope cluster is common to both exogenous recombinant and endogenous DNA-encoded immunogens

artículo científico publicado en 2006

SCORPION2: a database for structure-function analysis of scorpion toxins

artículo científico publicado en 2006

Serologic markers of effective tumor immunity against chronic lymphocytic leukemia include nonmutated B-cell antigens.

artículo científico publicado en 2010

Strategies for Identifying and Predicting Islet Autoantigen T-cell Epitopes in Insulin-dependent Diabetes Mellitus ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1997

Supporting the curation of biological databases with reusable text mining

artículo científico publicado en 2005

Systematic analysis of snake neurotoxins' functional classification using a data warehousing approach

artículo científico publicado en 2004

Systematic identification of personal tumor-specific neoantigens in chronic lymphocytic leukemia

artículo científico publicado en 2014

TANTIGEN: a comprehensive database of tumor T cell antigens

artículo científico publicado en 2017

The Future for Computational Modelling and Prediction Systems in Clinical Immunology

scholarly article by Nikolai Petrovsky et al published 7 October 2008 in Novartis Foundation symposium

The changing field of vaccine development in the genomics era

scientific article published on 01 September 2004

The future for computational modelling and prediction systems in clinical immunology.

artículo científico publicado en 2003

The growth of bioinformatics

artículo científico publicado en 2007

Transcriptionally abundant major histocompatibility complex class I alleles are fundamental to nonhuman primate simian immunodeficiency virus-specific CD8+ T cell responses

artículo científico publicado en 2011

Tumor antigens as proteogenomic biomarkers in invasive ductal carcinomas

artículo científico publicado en 2014

Ultra-high resolution HLA genotyping and allele discovery by highly multiplexed cDNA amplicon pyrosequencing

artículo científico publicado en 2012

Use of Artificial Neural Networks in Improving Renal Transplantation Outcomes

scholarly article by Nikolai Petrovsky et al published January 2002 in Graft: organ and cell transplantation

Use of Artificial Neural Networks in Improving Renal Transplantation Outcomes

scholarly article by Nikolai Petrovsky et al published 1 January 2002 in CrossRef Listing of Deleted DOIs

Using Gaussian process with test rejection to detect T-cell epitopes in pathogen genomes.

artículo científico publicado en 2010

Virtual models of the HLA class I antigen processing pathway

artículo científico publicado en 2004

West Nile virus T-cell ligand sequences shared with other flaviviruses: a multitude of variant sequences as potential altered peptide ligands

artículo científico publicado en 2012

[Bioinformatics in Asia]

scientific article published on 01 January 2004

gp100/pmel17 and tyrosinase encode multiple epitopes recognized by Th1-type CD4+T cells ⬇️

artículo científico publicado el 30 de noviembre de 2001

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