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Lista de obras de

"Jump start and gain" model for dosage compensation in Drosophila based on direct sequencing of nascent transcripts

artículo científico publicado en 2013

A comparative strategy for single-nucleus and single-cell transcriptomes confirms accuracy in predicted cell-type expression from nuclear RNA.

artículo científico publicado en 2017

A region of the human HOXD cluster that confers polycomb-group responsiveness

artículo científico publicado en 2010

A sequence motif within chromatin entry sites directs MSL establishment on the Drosophila X chromosome

artículo científico publicado en 2008

A transcriptomic and epigenomic cell atlas of the mouse primary motor cortex

artículo científico publicado en 2021

An assessment of histone-modification antibody quality

artículo científico publicado en 2010

An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney ⬇️

Analysis of primary structure of chromatin with next-generation sequencing

artículo científico publicado en 2010

Analysis of somatic retrotransposition in human cancers.

artículo científico publicado en 2012

Author Correction: Identification of epilepsy-associated neuronal subtypes and gene expression underlying epileptogenesis

artículo científico publicado en 2020

Bayesian approach to single-cell differential expression analysis

artículo científico publicado en 2014

BioTAP-XL: Cross-linking/Tandem Affinity Purification to Study DNA Targets, RNA, and Protein Components of Chromatin-Associated Complexes

artículo científico publicado en 2015

Cell Kinetics in the Adult Neurogenic Niche and Impact of Diet-Induced Accelerated Aging

artículo científico publicado en 2019

Cell type ontologies of the Human Cell Atlas

artículo científico

Cell types and ontologies of the Human Cell Atlas ⬇️

artículo científico

Cell-Type-Specific Alternative Splicing Governs Cell Fate in the Developing Cerebral Cortex.

artículo científico publicado en 2016

ChIP-seq guidelines and practices of the ENCODE and modENCODE consortia

artículo científico publicado en 2012

Challenges and emerging directions in single-cell analysis

artículo científico publicado en 2017

Characterizing transcriptional heterogeneity through pathway and gene set overdispersion analysis

artículo científico publicado en 2016

Chromatin proteins captured by ChIP–mass spectrometry are linked to dosage compensation in Drosophila ⬇️

artículo científico publicado el 6 de enero de 2013

Chromatin signatures of the Drosophila replication program

artículo científico publicado en 2010

Chromosomal periodicity of evolutionarily conserved gene pairs

artículo científico publicado en 2007

Circadian Kinetics of Cell Cycle Progression in Adult Neurogenic Niches of a Diurnal Vertebrate.

artículo científico publicado en 2017

Comparative analysis of H2A.Z nucleosome organization in the human and yeast genomes

artículo científico publicado en 2009

Comparative analysis of metazoan chromatin organization

artículo científico publicado en 2014

Comparative cellular analysis of motor cortex in human, marmoset and mouse

artículo científico publicado en 2021

Comprehensive analysis of the chromatin landscape in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2010

Correction: Sequence-Specific Targeting of Dosage Compensation in Drosophila Favors an Active Chromatin Context

artículo científico publicado en 2014

DAZL regulates Tet1 translation in murine embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2015

Dental cell type atlas reveals stem and differentiated cell types in mouse and human teeth

scientific article published on 23 September 2020

Design and analysis of ChIP-seq experiments for DNA-binding proteins

artículo científico publicado en 2008

Differential H3K4 methylation identifies developmentally poised hematopoietic genes

artículo científico publicado en 2008

Distinct evolutionary paths in chronic lymphocytic leukemia during resistance to the graft-versus-leukemia effect

scientific article published on 01 September 2020

Diversity of developing peripheral glia revealed by single cell RNA sequencing

artículo científico publicado en 2020

Dosage compensation in drosophila: Sequence-specific initiation and sequence-independent spreading of MSL complex to the active genes on the male X chromosome

article

Ectopic protein interactions within BRD4-chromatin complexes drive oncogenic megadomain formation in NUT midline carcinoma

artículo científico publicado en 2017

Enrichment of HP1a on Drosophila chromosome 4 genes creates an alternate chromatin structure critical for regulation in this heterochromatic domain

artículo científico publicado en 2012

Epigenetic Memory Underlies Cell-Autonomous Heterogeneous Behavior of Hematopoietic Stem Cells

artículo científico publicado en 2017

Epigenetic Memory Underlies Cell-Autonomous Heterogeneous Behavior of Hematopoietic Stem Cells.

artículo científico publicado en 2016

Epstein-Barr virus nuclear antigen 3A partially coincides with EBNA3C genome-wide and is tethered to DNA through BATF complexes

artículo científico publicado en 2014

Epstein-Barr virus nuclear antigen 3C binds to BATF/IRF4 or SPI1/IRF4 composite sites and recruits Sin3A to repress CDKN2A.

artículo científico publicado en 2013

Epstein-Barr virus nuclear antigen leader protein localizes to promoters and enhancers with cell transcription factors and EBNA2.

scientific article published on 28 October 2013

Epstein-Barr virus oncoprotein super-enhancers control B cell growth

artículo científico publicado en 2015

Estimating enrichment of repetitive elements from high-throughput sequence data

artículo científico publicado en 2010

Evidence for dosage compensation between the X chromosome and autosomes in mammals ⬇️

artículo científico publicado el 28 de noviembre de 2011

Evolution of cellular diversity in primary motor cortex of human, marmoset monkey, and mouse

artículo científico publicado en 2020

Expression dynamics of a cellular metabolic network

artículo científico publicado en 2005

Filling gaps in a metabolic network using expression information

artículo científico publicado en 2004

From Annotated Genomes to Metabolic Flux Models and Kinetic Parameter Fitting ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2003

Genome-wide chromatin interactions of the Nanog locus in pluripotency, differentiation, and reprogramming

artículo científico publicado en 2013

Heterochromatin-associated interactions of Drosophila HP1a with dADD1, HIPP1, and repetitive RNAs

artículo científico publicado en 2014

Heterogeneity of the transition/transversion ratio in Drosophila and Hominidae genomes.

artículo científico publicado en 2012

How to perform quantitative single cell proteomics with SCoPE2

artículo científico publicado en 2020

Identification of epilepsy-associated neuronal subtypes and gene expression underlying epileptogenesis

artículo científico publicado en 2020

Identification of regions in the HOX cluster that can confer repression in a Polycomb-dependent manner

Identifying metabolic enzymes with multiple types of association evidence

artículo científico publicado en 2006

Influence of metabolic network structure and function on enzyme evolution

artículo científico publicado en 2006

Integrated single-cell genetic and transcriptional analysis suggests novel drivers of chronic lymphocytic leukemia

artículo científico publicado en 2017

Integrative single-cell analysis of transcriptional and epigenetic states in the human adult brain.

artículo científico publicado en 2017

Joint analysis of heterogeneous single-cell RNA-seq dataset collections

artículo científico publicado en 2019

Landscape of somatic retrotransposition in human cancers

artículo científico publicado en 2012

Linking transcriptional and genetic tumor heterogeneity through allele analysis of single-cell RNA-seq data

artículo científico publicado en 2018

Locally disordered methylation forms the basis of intratumor methylome variation in chronic lymphocytic leukemia

artículo científico publicado en 2014

Long-range spreading of dosage compensation in Drosophila captures transcribed autosomal genes inserted on X

artículo científico publicado en 2009

Multipotent peripheral glial cells generate neuroendocrine cells of the adrenal medulla.

artículo científico publicado en 2017

Nature and function of insulator protein binding sites in the Drosophila genome.

artículo científico publicado en 2012

Nucleosome positioning in human HOX gene clusters

artículo científico publicado en 2008

Pericentromeric satellite repeat expansions through RNA-derived DNA intermediates in cancer

artículo científico publicado en 2015

Plasticity in patterns of histone modifications and chromosomal proteins in Drosophila heterochromatin

artículo científico publicado en 2010

Proximity-Based Differential Single-Cell Analysis of the Niche to Identify Stem/Progenitor Cell Regulators

artículo científico publicado en 2016

RNA velocity of single cells

scientific article published in Nature

Rapid Mobilization Reveals a Highly Engraftable Hematopoietic Stem Cell

artículo científico publicado en 2017

Reciprocal interactions of human C10orf12 and C17orf96 with PRC2 revealed by BioTAP-XL cross-linking and affinity purification

artículo científico publicado en 2014

Sequence-specific targeting of dosage compensation in Drosophila favors an active chromatin context.

artículo científico publicado en 2012

Single-cell mass-spectrometry quantifies the emergence of macrophage heterogeneity

artículo científico publicado en 2019

Single-nuclei transcriptomes from human adrenal gland reveal distinct cellular identities of low and high-risk neuroblastoma tumors

artículo científico publicado en 2021

Spatiotemporal structure of cell fate decisions in murine neural crest

artículo científico publicado en 2019

The genomic binding sites of a noncoding RNA.

artículo científico publicado en 2011

The oncogenic BRD4-NUT chromatin regulator drives aberrant transcription within large topological domains.

artículo científico publicado en 2015

Transcription factors LRF and BCL11A independently repress expression of fetal hemoglobin

artículo científico publicado en 2016

Transcriptomic Characterization of SF3B1 Mutation Reveals Its Pleiotropic Effects in Chronic Lymphocytic Leukemia

artículo científico publicado en 2016

UBiT2: a client-side web-application for gene expression data analysis

article

Unbiased classification of sensory neuron types by large-scale single-cell RNA sequencing

artículo científico publicado en 2014

Upper cortical layer–driven network impairment in schizophrenia

artículo científico publicado en 2022

Variable Requirements for DNA-Binding Proteins at Polycomb-Dependent Repressive Regions in Human HOX Clusters ⬇️

artículo científico publicado el 17 de junio de 2013

X chromosome dosage compensation via enhanced transcriptional elongation in Drosophila ⬇️

artículo científico publicado el 3 de marzo de 2011

dropEst: pipeline for accurate estimation of molecular counts in droplet-based single-cell RNA-seq experiments.

artículo científico publicado en 2018

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