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Lista de obras de

A Bayesian phylogenetic method to estimate unknown sequence ages

artículo científico publicado en 2010

A Simulation-Based Evaluation of Tip-Dating Under the Fossilized Birth-Death Process

artículo científico publicado en 2020

A comparison of methods for estimating substitution rates from ancient DNA sequence data.

artículo científico publicado en 2018

A potentially fatal mix of herpes in zoos

artículo científico publicado en 2012

A practical introduction to sequentially Markovian coalescent methods for estimating demographic history from genomic data

scientific article published on 07 December 2019

A review of the status of Coptotermes (Isoptera : Rhinotermitidae) species in Australia with the description of two new small termite species from northern and eastern Australia

article

Accommodating the effect of ancient DNA damage on inferences of demographic histories

artículo científico publicado en 2008

Accounting for uncertainty in the evolutionary timescale of green plants through clock-partitioning and fossil calibration strategies

article

Accuracy of rate estimation using relaxed-clock models with a critical focus on the early metazoan radiation

artículo científico publicado en 2005

Adaptation and conservation insights from the koala genome

artículo científico publicado en 2018

American mastodon mitochondrial genomes suggest multiple dispersal events in response to Pleistocene climate oscillations

artículo científico publicado en 2020

Analyses of evolutionary dynamics in viruses are hindered by a time-dependent bias in rate estimates.

artículo científico publicado en 2014

Analysis of Phylogenomic Tree Space Resolves Relationships Among Marsupial Families.

artículo científico publicado en 2017

Analysis of complete mitochondrial genomes from extinct and extant rhinoceroses reveals lack of phylogenetic resolution

artículo científico publicado en 2009

Ancient DNA chronology within sediment deposits: are paleobiological reconstructions possible and is DNA leaching a factor?

artículo científico publicado en 2007

Ancient DNA reveals that bowhead whale lineages survived Late Pleistocene climate change and habitat shifts

artículo científico publicado en 2013

Ancient hyaenas highlight the old problem of estimating evolutionary rates.

artículo científico publicado en 2014

Ancient mitochondrial DNA provides high-resolution time scale of the peopling of the Americas

artículo científico publicado en 2016

Ancient mitogenomics

artículo científico publicado en 2009

Angels in disguise: sympatric hybridization in the marine angelfishes is widespread and occurs between deeply divergent lineages

scientific article published on 05 August 2020

Assemblage accumulation curves: A framework for resolving species accumulation in biological communities using DNA sequences

artículo científico publicado en 2019

Assessing the fidelity of ancient DNA sequences amplified from nuclear genes

artículo científico publicado en 2006

Bayesian Evaluation of Temporal Signal in Measurably Evolving Populations

artículo científico publicado en 2019

Bayesian Evaluation of Temporal Signal in Measurably Evolving Populations

artículo científico publicado en 2020

Bayesian estimation of sequence damage in ancient DNA.

artículo científico publicado en 2007

Bayesian estimation of substitution rates from ancient DNA sequences with low information content

artículo científico publicado en 2011

Bayesian molecular dating: opening up the black box.

artículo científico publicado en 2017

Biogeographic calibrations for the molecular clock

artículo científico publicado en 2015

Boomeranging around Australia: Historical biogeography and population genomics of the anti-equatorial fish Microcanthus strigatus (Teleostei: Microcanthidae)

scientific article published on 01 August 2019

Calibrating the genomic clock of modern birds using fossils

artículo científico publicado en 2024

ClockstaR: choosing the number of relaxed-clock models in molecular phylogenetic analysis

artículo científico publicado en 2013

Comment on "Protein sequences from mastodon and Tyrannosaurus rex revealed by mass spectrometry"

artículo científico publicado en 2008

Comparative dating of Acacia: combining fossils and multiple phylogenies to infer ages of clades with poor fossil records

artículo científico publicado en 2013

Comparison of Methods for Molecular Species Delimitation across a Range of Speciation Scenarios

artículo científico publicado en 2018

Complete mitochondrial genomes and a novel spatial genetic method reveal cryptic phylogeographical structure and migration patterns among brown bears in north-western Eurasia

article by Marju Keis et al published 28 November 2012 in Journal of Biogeography

Complexity of avian evolution revealed by family-level genomes

artículo científico publicado en 2024

Correction: Phylogeography of the iconic Australian red-tailed black-cockatoo (Calyptorhynchus banksii) and implications for its conservation

artículo científico publicado en 2020

Correlating Bayesian date estimates with climatic events and domestication using a bovine case study

artículo científico publicado en 2008

Cross-validation to select Bayesian hierarchical models in phylogenetics

artículo científico publicado en 2016

Cryptic diversity, diversification and vicariance in two species complexes ofTomocerus(Collembola, Tomoceridae) from China

article

Dating the emergence of human pathogens

scientific article published on 01 June 2020

Dating the origin and dispersal of hepatitis B virus infection in humans and primates

artículo científico publicado en 2013

Dating the origin of hepatitis B virus reveals higher substitution rate and adaptation on the branch leading to F/H genotypes.

artículo científico publicado en 2015

Declining transition/transversion ratios through time reveal limitations to the accuracy of nucleotide substitution models.

artículo científico publicado en 2015

Demographic reconstruction from ancient DNA supports rapid extinction of the great auk

scientific article published on 26 November 2019

Differences in Performance among Test Statistics for Assessing Phylogenomic Model Adequacy.

artículo científico publicado en 2018

Divergent evolutionary processes associated with colonization of offshore islands

artículo científico publicado en 2013

Early cave art and ancient DNA record the origin of European bison

artículo científico publicado en 2016

Early diversifications of angiosperms and their insect pollinators: Were they unlinked?

artículo científico publicado en 2021

Early diversifications of angiosperms and their insect pollinators: were they unlinked?

artículo científico publicado en 2022

Ecological diversification of the Australian Coptotermes termites and the evolution of mound building

article

Elevated substitution rates estimated from ancient DNA sequences

artículo científico publicado en 2007

Empirical calibrated radiocarbon sampler: a tool for incorporating radiocarbon-date and calibration error into Bayesian phylogenetic analyses of ancient DNA

artículo científico publicado en 2015

Estimating evolutionary rates using time-structured data: a general comparison of phylogenetic methods

artículo científico publicado en 2016

Estimating the number and assignment of clock models in analyses of multigene datasets.

artículo científico publicado en 2016

Estimating the phylogeny and divergence times of primates using a supermatrix approach

artículo científico publicado en 2009

Evaluating the Adequacy of Molecular Clock Models Using Posterior Predictive Simulations

artículo científico publicado en 2015

Evaluating the Impact of Genomic Data and Priors on Bayesian Estimates of the Angiosperm Evolutionary Timescale

artículo científico publicado en 2016

Evaluating the impact of post-mortem damage in ancient DNA: a theoretical approach.

artículo científico publicado en 2011

Evidence for Permo-Triassic colonization of the deep sea by isopods

artículo científico publicado en 2012

Evolution, systematics, and phylogeography of pleistocene horses in the new world: a molecular perspective

artículo científico publicado en 2005

Evolutionary rates are correlated between cockroach symbionts and mitochondrial genomes

artículo científico publicado en 2020

Founder-specific inbreeding depression affects racing performance in Thoroughbred horses.

artículo científico publicado en 2018

Genetic architecture of the<i>Tetragonula carbonaria</i>species complex of Australian stingless bees (Hymenoptera: Apidae: Meliponini)

artículo científico publicado en 2014

Genomic Adaptations and Evolutionary History of the Extinct Scimitar-Toothed Cat, Homotherium latidens

artículo científico publicado en 2020

Genomic Characterization of a South American Phytophthora Hybrid Mandates Reassessment of the Geographic Origins of Phytophthora infestans

artículo científico publicado en 2016

Geographic and temporal dynamics of a global radiation and diversification in the killer whale

artículo científico publicado en 2015

Habitat preference differentiates the Holocene range dynamics but not barrier effects on two sympatric, congeneric trees (Tristaniopsis, Myrtaceae)

artículo científico publicado en 2019

INSECT PHYLOGENOMICS. Comment on "Phylogenomics resolves the timing and pattern of insect evolution".

artículo científico publicado en 2015

Impacts of Taxon-Sampling Schemes on Bayesian Tip Dating Under the Fossilized Birth-Death Process

artículo científico publicado en 2023

Improved characterisation of among-lineage rate variation in cetacean mitogenomes using codon-partitioned relaxed clocks

artículo científico publicado en 2010

Inclusion of rare taxa from Blattidae and Anaplectidae improves phylogenetic resolution in the cockroach superfamily Blattoidea

artículo científico publicado en 2023

Increased Mutation Rate Is Linked to Genome Reduction in Prokaryotes

scientific article published on 29 July 2020

Intraspecific phylogenetic analysis of Siberian woolly mammoths using complete mitochondrial genomes

artículo científico publicado en 2008

Large-scale migrations of brown bears in Eurasia and to North America during the Late Pleistocene

article by Peeter Anijalg et al published 15 November 2017 in Journal of Biogeography

Linking Branch Lengths across Sets of Loci Provides the Highest Statistical Support for Phylogenetic Inference

scientific article published on 01 April 2020

Mammalian genome evolution is governed by multiple pacemakers

artículo científico publicado en 2015

Mito-communications

artículo científico publicado en 2011

Mito-communications

artículo científico publicado en 2012

Mito-communications

artículo científico publicado en 2010

Mito-communications

Mito-communications

Mito-communications

Mitochondrial DNA analysis shows a Near Eastern Neolithic origin for domestic cattle and no indication of domestication of European aurochs

artículo científico publicado en 2007

Mitochondrial DNA diversity and evolution of the Pleistocene cave bear complex

scholarly article

Mitochondrial Phylogenomics Resolves the Global Spread of Higher Termites, Ecosystem Engineers of the Tropics

artículo científico publicado en 2016

Mitogenetic structure of brown bears (Ursus arctos L.) in northeastern Europe and a new time frame for the formation of European brown bear lineages

artículo científico publicado en 2007

Mitogenomic analysis of a 50-generation chicken pedigree reveals a rapid rate of mitochondrial evolution and evidence for paternal mtDNA inheritance

artículo científico publicado en 2015

Mitogenomic evidence of close relationships between New Zealand’s extinct giant raptors and small-sized Australian sister-taxa

article

Mitogenomics of the Extinct Cave Lion, Panthera spelaea (Goldfuss, 1810), Resolve its Position within the Panthera Cats

Molecular clocks

artículo científico publicado en 2016

Molecular data support Orianthera: a new genus of Australian Loganiaceae

artículo científico publicado en 2014

Molecular phylogenetics provides new insights into the systematics of Pimelea and Thecanthes (Thymelaeaceae)

artículo científico publicado en 2016

Molecular systematics and biogeography of Logania R.Br. (Loganiaceae).

artículo científico publicado en 2014

Molecular-clock methods for estimating evolutionary rates and timescales

artículo científico

Movements of southern elephant seals (Mirounga leonina) from Davis Base, Antarctica: combining population genetics and tracking data

artículo científico publicado en 2022

Multiple evolutionary origins of Australian soil-burrowing cockroaches driven by climate change in the Neogene

artículo científico publicado en 2016

Mutation rate is linked to diversification in birds

artículo científico publicado en 2010

Neolithic mitochondrial haplogroup H genomes and the genetic origins of Europeans

artículo científico publicado en 2013

New Statistical Criteria Detect Phylogenetic Bias Caused by Compositional Heterogeneity

artículo científico publicado en 2017

One hundred twenty years of koala retrovirus evolution determined from museum skins

artículo científico publicado en 2012

Pan-genome Analysis of Ancient and Modern Salmonella enterica Demonstrates Genomic Stability of the Invasive Para C Lineage for Millennia

artículo científico publicado en 2018

Parallel evolution of mound-building and grass-feeding in Australian nasute termites.

artículo científico publicado en 2017

Persistence of the mitochondrial lineage responsible for the Irish potato famine in extant new world phytophthora infestans

artículo científico publicado en 2014

PhyloMAd: efficient assessment of phylogenomic model adequacy

scientific article published on 01 July 2018

Phylodynamic evidence of the migration of turnip mosaic potyvirus from Europe to Australia and New Zealand

artículo científico publicado en 2014

Phylogenetic estimation of timescales using ancient DNA: the effects of temporal sampling scheme and uncertainty in sample ages.

artículo científico publicado en 2012

Phylogenomic analyses data of the avian phylogenomics project

artículo científico publicado en 2015

Phylogeographical analyses of domestic and wild yaks based on mitochondrial DNA: new data and reappraisal

Phylogeography and diversity of the terrestrial isopodSpherillo grossus(Oniscidea: Armadillidae) on the Australian East Coast

scholarly article by Timothy R. C. Lee published in 2013

Phylogeography of lions (Panthera leo ssp.) reveals three distinct taxa and a late Pleistocene reduction in genetic diversity

artículo científico publicado en 2009

Phylogeography of the iconic Australian red-tailed black-cockatoo (Calyptorhynchus banksii) and implications for its conservation

artículo científico publicado en 2020

Phylogeography, Genetic Diversity, and Management Units of Hawksbill Turtles in the Indo-Pacific.

artículo científico publicado en 2015

Plastome sequences and exploration of tree-space help to resolve the phylogeny of riceflowers (Thymelaeaceae: Pimelea)

scientific article published on 25 May 2018

Prolonged decay of molecular rate estimates for metazoan mitochondrial DNA

artículo científico publicado en 2015

Radiation of extant cetaceans driven by restructuring of the oceans

artículo científico publicado en 2009

Recalibration of the insect evolutionary time scale using Monte San Giorgio fossils suggests survival of key lineages through the End-Permian Extinction

scientific article published on 09 October 2019

Reconstructing genome evolution in historic samples of the Irish potato famine pathogen.

artículo científico publicado en 2013

Relaxed phylogenetics and dating with confidence

artículo científico publicado en 2006

Response to Comment on "Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds".

artículo científico publicado en 2015

Rethinking dog domestication by integrating genetics, archeology, and biogeography

artículo científico publicado en 2012

Rethinking the evolution of extant sub-Saharan African suids (Suidae, Artiodactyla)

artículo científico publicado en 2011

Revealing the maternal demographic history of Panthera leo using ancient DNA and a spatially explicit genealogical analysis

artículo científico publicado en 2014

Sexual selection, body mass and molecular evolution interact to predict diversification in birds

artículo científico publicado en 2019

Simulating and detecting autocorrelation of molecular evolutionary rates among lineages

artículo científico publicado en 2014

Skyline-plot methods for estimating demographic history from nucleotide sequences

artículo científico publicado en 2011

Species-specific responses of Late Quaternary megafauna to climate and humans

artículo científico publicado en 2011

Statistical guidelines for detecting past population shifts using ancient DNA.

artículo científico publicado en 2012

Strategies for Partitioning Clock Models in Phylogenomic Dating: Application to the Angiosperm Evolutionary Timescale.

artículo científico publicado en 2017

Sudden expansion of a single brown bear maternal lineage across northern continental Eurasia after the last ice age: a general demographic model for mammals?

artículo científico publicado en 2009

Synchronous diversification of Sulawesi's iconic artiodactyls driven by recent geological events

artículo científico publicado en 2018

Taller plants have lower rates of molecular evolution

artículo científico publicado en 2013

Temporal analysis of reassortment and molecular evolution of Cucumber mosaic virus: Extra clues from its segmented genome

artículo científico publicado en 2015

Temporal genetic variation of the red fox, Vulpes vulpes, across western Europe and the British Isles

artículo científico publicado en 2012

Testing the impact of calibration on molecular divergence times using a fossil-rich group: the case of Nothofagus (Fagales).

artículo científico publicado en 2011

The Genome as an Evolutionary Timepiece

artículo científico publicado en 2016

The Impact of the Tree Prior on Molecular Dating of Data Sets Containing a Mixture of Inter- and Intraspecies Sampling

artículo científico publicado en 2016

The Performance of the Date-Randomization Test in Phylogenetic Analyses of Time-Structured Virus Data

artículo científico publicado en 2015

The Recovery, Interpretation and Use of Ancient Pathogen Genomes

artículo científico publicado en 2020

The Timescale of Emergence and Spread of Turnip Mosaic Potyvirus

artículo científico publicado en 2017

The effect of inappropriate calibration: three case studies in molecular ecology

artículo científico publicado en 2008

The evolutionary history and global spatio-temporal dynamics of potato virus Y

artículo científico publicado en 2020

The evolutionary history of Stomatopoda (Crustacea: Malacostraca) inferred from molecular data

artículo científico publicado en 2017

The global spread of hepatitis C virus 1a and 1b: a phylodynamic and phylogeographic analysis

artículo científico publicado en 2009

The impact of calibration and clock-model choice on molecular estimates of divergence times

artículo científico publicado en 2014

The impacts of drift and selection on genomic evolution in insects

artículo científico publicado en 2017

The influence of rate heterogeneity among sites on the time dependence of molecular rates

artículo científico publicado en 2012

The origins and radiation of Australian Coptotermes termites: from rainforest to desert dwellers.

artículo científico publicado en 2014

The temporal evolution and global spread of Cauliflower mosaic virus, a plant pararetrovirus

artículo científico publicado en 2014

Time dependency of molecular rate estimates and systematic overestimation of recent divergence times

artículo científico publicado en 2005

Time-dependent estimates of molecular evolutionary rates: evidence and causes

artículo científico publicado en 2015

Time-dependent rates of molecular evolution

scientific article published on 08 July 2011

Tracing the epidemic history of HIV-1 CRF01_AE clusters using near-complete genome sequences.

artículo científico publicado en 2017

Transoceanic dispersal and plate tectonics shaped global cockroach distributions: evidence from mitochondrial phylogenomics.

artículo científico publicado en 2018

Tree imbalance causes a bias in phylogenetic estimation of evolutionary timescales using heterochronous sequences

artículo científico publicado en 2014

Turnip mosaic potyvirus probably first spread to Eurasian brassica crops from wild orchids about 1000 years ago.

artículo científico publicado en 2013

Using multiple relaxed-clock models to estimate evolutionary timescales from DNA sequence data

artículo científico publicado en 2014

Using phylogenetics to explore interspecies genetic rescue options for a critically endangered parrot

artículo científico publicado en 2021

Vertebrate palaeontology of Australasia into the twenty-first century

artículo científico publicado en 2011

Whole-genome analyses resolve early branches in the tree of life of modern birds

artículo científico publicado en 2014

Zebra Alphaherpesviruses (EHV-1 and EHV-9): Genetic Diversity, Latency and Co-Infections

artículo científico publicado en 2016

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