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Lista de obras de

A De Novo Shape Motif Discovery Algorithm Reveals Preferences of Transcription Factors for DNA Shape Beyond Sequence Motifs

artículo científico publicado en 2019

A Systematic Ensemble Approach to Thermodynamic Modeling of Gene Expression from Sequence Data.

artículo científico publicado en 2015

CRISPR-DIPOFF: an interpretable deep learning approach for CRISPR Cas-9 off-target prediction

artículo científico publicado en 2024

Complex Interdependence Regulates Heterotypic Transcription Factor Distribution and Coordinates Cardiogenesis

artículo científico publicado en 2016

Evaluating thermodynamic models of enhancer activity on cellular resolution gene expression data.

artículo científico publicado en 2013

Evidence for deep regulatory similarities in early developmental programs across highly diverged insects

artículo científico publicado en 2014

Global parameter estimation for thermodynamic models of transcriptional regulation.

artículo científico publicado en 2013

Multinomial Convolutions for Joint Modeling of Regulatory Motifs and Sequence Activity Readouts

artículo científico publicado en 2022

Quantitative Measurement and Thermodynamic Modeling of Fused Enhancers Support a Two-Tiered Mechanism for Interpreting Regulatory DNA.

artículo científico publicado en 2017

Quantitative modeling of a gene's expression from its intergenic sequence.

artículo científico publicado en 2014

Simulations of enhancer evolution provide mechanistic insights into gene regulation.

artículo científico publicado en 2013

Thermodynamics-Based Models of Transcriptional Regulation by Enhancers: The Roles of Synergistic Activation, Cooperative Binding and Short-Range Repression ⬇️

artículo científico publicado el 16 de septiembre de 2010

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