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Lista de obras de

4-Hydroxyphenylglycine biosynthesis in Herpetosiphon aurantiacus: a case of gene duplication and catalytic divergence

artículo científico publicado en 2012

A mathematical model of microbial growth including an intermediate. I. Growth in batch cultures

artículo científico publicado el 1 de enero de 1977

A review on computational systems biology of pathogen-host interactions

artículo científico publicado en 2015

A theoretical study of lipid accumulation in the liver-implications for nonalcoholic fatty liver disease

artículo científico publicado en 2013

Adapted Boolean network models for extracellular matrix formation.

artículo científico publicado en 2009

Age-dependent regulation of tumor-related microRNAs in the brain of the annual fish Nothobranchius furzeri

artículo científico publicado en 2012

An Interspecies Regulatory Network Inferred from Simultaneous RNA-seq of Candida albicans Invading Innate Immune Cells

artículo científico publicado en 2012

Analysis and simulation of complex interactions during dynamic microfiltration of Escherichia coli suspensions

artículo científico publicado en 1998

Automated image analysis of the host-pathogen interaction between phagocytes and Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2011

Batch correction of microarray data substantially improves the identification of genes differentially expressed in rheumatoid arthritis and osteoarthritis

artículo científico publicado en 2012

Biomarker-based classification of bacterial and fungal whole-blood infections in a genome-wide expression study

artículo científico publicado en 2015

Bistability in a model of microbial product formation.

artículo científico publicado en 1980

Branched-chain amino acid catabolism is a conserved regulator of physiological ageing

artículo científico publicado en 2015

Cadmium, cobalt and lead cause stress response, cell cycle deregulation and increased steroid as well as xenobiotic metabolism in primary normal human bronchial epithelial cells which is coordinated by at least nine transcription factors.

artículo científico publicado en 2008

Candida albicans infection leads to barrier breakdown and a MAPK/NF-κB mediated stress response in the intestinal epithelial cell line C2BBe1.

artículo científico publicado en 2016

Comparative Genomics of Serial Candida glabrata Isolates and the Rapid Acquisition of Echinocandin Resistance during Therapy

artículo científico publicado en 2019

Comparative and functional genomics provide insights into the pathogenicity of dermatophytic fungi

artículo científico publicado en 2011

Comparison of transcriptome technologies in the pathogenic fungus Aspergillus fumigatus reveals novel insights into the genome and MpkA dependent gene expression

artículo científico publicado en 2012

Computational prediction of molecular pathogen-host interactions based on dual transcriptome data

artículo científico publicado en 2015

Computing the various pathways of penicillin synthesis and their molar yields

artículo científico publicado en 2015

Conserved Senescence Associated Genes and Pathways in Primary Human Fibroblasts Detected by RNA-Seq

artículo científico publicado en 2016

Conserved genes and pathways in primary human fibroblast strains undergoing replicative and radiation induced senescence

artículo científico publicado en 2016

Convergence of the proteomic pattern in cancer

artículo científico publicado en 2006

D-Glucosamine supplementation extends life span of nematodes and of ageing mice

artículo científico publicado en 2014

Data and knowledge based experimental design for fermentation process optimization

artículo científico publicado en 2000

Data- and knowledge-based modeling of gene regulatory networks: an update

artículo científico publicado en 2015

Data-based Reconstruction of Gene Regulatory Networks of Fungal Pathogens

artículo científico publicado en 2016

Defining the transcriptomic landscape of Candida glabrata by RNA-Seq.

artículo científico publicado en 2015

DeltaMS: a tool to track isotopologues in GC- and LC-MS data

artículo científico publicado en 2018

Dietary L-carnitine alters gene expression in skeletal muscle of piglets

article

Differential Biphasic Transcriptional Host Response Associated with Coevolution of Hemagglutinin Quasispecies of Influenza A Virus

artículo científico publicado en 2016

Differential regulation of the transcriptomic and secretomic landscape of sensor and effector functions of human airway epithelial cells

artículo científico publicado en 2018

Discovery of an Extended Austinoid Biosynthetic Pathway in Aspergillus calidoustus

artículo científico publicado en 2017

Draft Genome Sequence and Gene Annotation of the Entomopathogenic Fungus Verticillium hemipterigenum

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequence of Streptomyces iranensis. ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Draft Genome Sequence of the Fungus Penicillium brasilianum MG11

artículo científico publicado en 2015

Draft Genome Sequences of Fungus Aspergillus calidoustus

artículo científico publicado en 2016

Draft Genome Sequences of Symbiotic and Nonsymbiotic Rhizopus microsporus Strains CBS 344.29 and ATCC 62417.

artículo científico publicado en 2015

Dynamic model of discontinuous and continuous phaseolotoxin production of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola.

artículo científico publicado en 1984

Dynamic model of the pathogenesis of Mengo virus infection in mice

artículo científico publicado en 1987

Dynamic modelling of microRNA regulation during mesenchymal stem cell differentiation

artículo científico publicado en 2013

Dynamic network reconstruction from gene expression data applied to immune response during bacterial infection

artículo científico publicado en 2005

Dynamics of amino acid metabolism of primary human liver cells in 3D bioreactors

artículo científico publicado en 2006

Editorial: Computational Systems Biology of Pathogen-Host Interactions

artículo científico

Effect of L-carnitine on the hepatic transcript profile in piglets as animal model

artículo científico publicado en 2011

Efficiency of the cyclic batch antibiotic fermentation.

artículo científico publicado en 1982

Extension of life span by impaired glucose metabolism in Caenorhabditis elegans is accompanied by structural rearrangements of the transcriptomic network

artículo científico publicado en 2013

Facing the challenges of multiscale modelling of bacterial and fungal pathogen-host interactions

artículo científico publicado en 2016

FungiFun2: a comprehensive online resource for systematic analysis of gene lists from fungal species

artículo científico publicado en 2014

FungiFun: A web-based application for functional categorization of fungal genes and proteins ⬇️

artículo científico publicado el 10 de noviembre de 2010

Fuzzy modeling reveals a dynamic self-sustaining network of the GLI transcription factors controlling important metabolic regulators in adult mouse hepatocytes

artículo científico publicado en 2015

Gene expression profiling of peripheral blood mononuclear leukocytes from psoriasis patients identifies new immune regulatory molecules.

artículo científico publicado en 2005

Gene network activity in cultivated primary hepatocytes is highly similar to diseased mammalian liver tissue

artículo científico publicado en 2016

Gene regulatory network inference: data integration in dynamic models-a review

artículo científico publicado en 2009

Genome-Wide Expression Profiling Reveals S100B as Biomarker for Invasive Aspergillosis

artículo científico publicado en 2016

Genome-Wide Scale-Free Network Inference for Candida albicans

artículo científico publicado en 2012

Global Transcriptional Response of Human Liver Cells to Ethanol Stress of Different Strength Reveals Hormetic Behavior

artículo científico publicado en 2017

Global analysis of glycoproteins identifies markers of endotoxin tolerant monocytes and GPR84 as a modulator of TNFα expression.

artículo científico publicado en 2017

Global epithelial cell transcriptional responses reveal Streptococcus pyogenes Fas regulator activity association with bacterial aggressiveness.

artículo científico publicado en 2005

Heterogeneous expression of suppressor of cytokine signalling 2 (SOCS-2) in liver tissue.

artículo científico publicado en 2009

High-cell-density cultivation of microorganisms

artículo científico publicado en 1999

Hormetic effect of rotenone in primary human fibroblasts

artículo científico publicado en 2015

How to Predict Molecular Interactions between Species?

artículo científico publicado en 2016

Identification of intra-group, inter-individual, and gene-specific variances in mRNA expression profiles in the rheumatoid arthritis synovial membrane.

artículo científico publicado en 2008

Identification of rheumatoid arthritis and osteoarthritis patients by transcriptome-based rule set generation

artículo científico publicado en 2014

Impaired insulin/IGF1 signaling extends life span by promoting mitochondrial L-proline catabolism to induce a transient ROS signal

artículo científico publicado en 2012

Impairing L-Threonine Catabolism Promotes Healthspan through Methylglyoxal-Mediated Proteohormesis

artículo científico publicado en 2018

In silico evidence for gluconeogenesis from fatty acids in humans

artículo científico publicado en 2011

Increased Expression of RUNX1 in Liver Correlates with NASH Activity Score in Patients with Non-Alcoholic Steatohepatitis (NASH)

artículo científico publicado en 2019

Inference of Predictive Phospho-regulatory Networks from LC-MS/MS Phosphoproteomics Data

Inference of dynamical gene-regulatory networks based on time-resolved multi-stimuli multi-experiment data applying NetGenerator V2.0.

artículo científico publicado en 2013

Inflammation-associated suppression of metabolic gene networks in acute and chronic liver disease

scientific article published on 09 January 2020

Influence of steroid hormones on pS2/BCEI gene expression in xenografted colon tumors.

artículo científico publicado en 1993

Integrated metabolic spatial-temporal model for the prediction of ammonia detoxification during liver damage and regeneration

artículo científico publicado en 2014

Integrative analysis of the heat shock response in Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2010

Integrative inference of gene-regulatory networks in Escherichia coli using information theoretic concepts and sequence analysis ⬇️

artículo científico publicado en 2010

Integrative modeling of transcriptional regulation in response to antirheumatic therapy

artículo científico publicado en 2009

Interactive exploration of integrated biological datasets using context-sensitive workflows

artículo científico publicado en 2014

Knowledge-based assessment of gene expression data from chemiluminescence detection

artículo científico publicado en 2002

Longitudinal RNA-Seq Analysis of Vertebrate Aging Identifies Mitochondrial Complex I as a Small-Molecule-Sensitive Modifier of Lifespan.

artículo científico publicado en 2016

MS characterization of apheresis samples from rheumatoid arthritis patients for the improvement of immunoadsorption therapy - a pilot study

scientific article published on 01 July 2009

Mass spectrometric and peptide chip epitope analysis on the RA33 autoantigen with sera from rheumatoid arthritis patients.

artículo científico publicado en 2010

Microevolution of Candida albicans in macrophages restores filamentation in a nonfilamentous mutant

artículo científico publicado en 2014

Missing values in gel-based proteomics

artículo científico publicado en 2010

Mitochondrial hormesis links low-dose arsenite exposure to lifespan extension

scientific article published on 06 May 2013

Model aided dynamic process analysis and optimization for the nourseothricin fermentation ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1984

Module-detection approaches for the integration of multilevel omics data highlight the comprehensive response of Aspergillus fumigatus to caspofungin

artículo científico publicado en 2018

ModuleDiscoverer: Identification of regulatory modules in protein-protein interaction networks

artículo científico publicado en 2018

Molecular discrimination of responders and nonresponders to anti-TNF alpha therapy in rheumatoid arthritis by etanercept

artículo científico publicado en 2008

Monitoring of transcriptome and proteome profiles to investigate the cellular response of E. coli towards recombinant protein expression under defined chemostat conditions

artículo científico publicado en 2008

More than just a metabolic regulator--elucidation and validation of new targets of PdhR in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2011

Multiphasic growth of microorganisms: modeling and computer simulation of linear growth phases

artículo científico publicado en 1978

Multivariate analysis of flow cytometric data using decision trees

artículo científico publicado en 2012

Network Modeling Reveals Cross Talk of MAP Kinases during Adaptation to Caspofungin Stress in Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2015

Network analysis of transcriptional regulation in response to intramuscular interferon-β-1a multiple sclerosis treatment

artículo científico publicado en 2010

Network analysis of transcriptional regulation in response to intramuscular interferon-β-1a multiple sclerosis treatment

artículo científico publicado en 2011

Neuronal ROS signaling rather than AMPK/sirtuin-mediated energy sensing links dietary restriction to lifespan extension

artículo científico publicado en 2013

Novel application of multi-stimuli network inference to synovial fibroblasts of rheumatoid arthritis patients

artículo científico publicado en 2014

On the way toward systems biology of Aspergillus fumigatus infection

artículo científico publicado en 2011

Optimal regulatory strategies for metabolic pathways in Escherichia coli depending on protein costs.

artículo científico

Prediction of cardiovascular risk in hemodialysis patients by data mining

artículo científico publicado en 2004

Proteome profiling and functional classification of intracellular proteins from conidia of the human-pathogenic mold Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2010

Proteomic Profiling of Serological Responses to Aspergillus fumigatus Antigens in Patients with Invasive Aspergillosis

artículo científico publicado en 2016

Proteomics of Aspergillus fumigatus conidia-containing phagolysosomes identifies processes governing immune evasion.

artículo científico publicado en 2018

Publisher Correction: Transcriptomic alterations during ageing reflect the shift from cancer to degenerative diseases in the elderly.

artículo científico publicado en 2019

RNA-seq of the aging brain in the short-lived fish N. furzeri - conserved pathways and novel genes associated with neurogenesis

artículo científico publicado en 2014

Regulatory interactions for iron homeostasis in Aspergillus fumigatus inferred by a Systems Biology approach

artículo científico publicado en 2012

Regulatory network modelling of iron acquisition by a fungal pathogen in contact with epithelial cells

artículo científico publicado en 2010

Regulatory networks controlling nitrogen sensing and uptake in Candida albicans

artículo científico publicado en 2014

Rheumatoid arthritis, a complex multifactorial disease: on the way toward individualized medicine

artículo científico publicado en 2006

Role of sirtuins in lifespan regulation is linked to methylation of nicotinamide

artículo científico publicado en 2013

Similarities in Gene Expression Profiles during In Vitro Aging of Primary Human Embryonic Lung and Foreskin Fibroblasts

artículo científico publicado en 2015

Specific and Novel microRNAs Are Regulated as Response to Fungal Infection in Human Dendritic Cells

scientific article published on 23 February 2017

Sustained liver regeneration after portal vein embolization --a human molecular pilot study

artículo científico publicado en 2012

Systems biology of microbial infection

artículo científico publicado en 2012

The extended TILAR approach: a novel tool for dynamic modeling of the transcription factor network regulating the adaption to in vitro cultivation of murine hepatocytes

artículo científico publicado en 2012

The novel globin protein fungoglobin is involved in low oxygen adaptation of Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2014

Tick-tock hedgehog-mutual crosstalk with liver circadian clock promotes liver steatosis

artículo científico publicado en 2019

Transcription factors ETF, E2F, and SP-1 are involved in cytokine-independent proliferation of murine hepatocytes.

artículo científico publicado en 2010

Transcriptomic alterations during ageing reflect the shift from cancer to degenerative diseases in the elderly

artículo científico publicado en 2018

Two-dimensional proteome reference maps for the human pathogenic filamentous fungus Aspergillus fumigatus

artículo científico publicado en 2009

Two-pool model analysis of data in hemodialysis by means of programmable pocket calculator TI 59.

artículo científico publicado en 1985

Use of systems biology to decipher host-pathogen interaction networks and predict biomarkers

artículo científico publicado en 2016

Verticillium dahliae-Arabidopsis Interaction Causes Changes in Gene Expression Profiles and Jasmonate Levels on Different Time Scales

artículo científico publicado en 2018

Within-host influenza dynamics: a small-scale mathematical modeling approach.

artículo científico publicado en 2014

Zonation of hepatic fat accumulation: insights from mathematical modelling of nutrient gradients and fatty acid uptake

artículo científico publicado en 2017

[Changes in the pharmacokinetics of gentamycin during nephrotoxic therapy]

scientific article published on 01 January 1988

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