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Lista de obras de Yves A. Lussier

'N-of-1-pathways' unveils personal deregulated mechanisms from a single pair of RNA-Seq samples: towards precision medicine

artículo científico publicado en 2014

A "systematics" tool for medical terminologies

artículo científico publicado en 2003

A Sphingosine 1–Phosphate 1 Receptor Agonist Modulates Brain Death–Induced Neurogenic Pulmonary Injury ⬇️

artículo científico publicado el 26 de mayo de 2011

A Web-based System For Prediction Of Coronary Heart Disease Risk Using The Framingham Algorithm

artículo científico publicado en 2000

A cloud-based approach to medical NLP

artículo científico publicado en 2011

A functional genomic model for predicting prognosis in idiopathic pulmonary fibrosis.

artículo científico publicado en 2015

A genome-by-environment interaction classifier for precision medicine: personal transcriptome response to rhinovirus identifies children prone to asthma exacerbations

artículo científico publicado en 2017

A study of abbreviations in the UMLS.

artículo científico publicado en 2001

ARTS: automated randomization of multiple traits for study design

artículo científico publicado en 2014

Accelerating precision biology and medicine with computational biology and bioinformatics

artículo científico publicado en 2014

Adapting current Arden Syntax knowledge for an object oriented event monitor.

artículo científico publicado en 2003

Advantages of genomic complexity: bioinformatics opportunities in microRNA cancer signatures.

artículo científico publicado en 2011

An integrated genomic approach to the assessment and treatment of acute myeloid leukemia.

scientific article published on April 2011

An integrative genomic approach to uncover molecular mechanisms of prokaryotic traits

artículo científico publicado en 2006

An integrative genomic approach to uncover molecular mechanisms of prokaryotic traits

scholarly article by Yang Liu published in January 2005

Analysis of aggregated cell-cell statistical distances within pathways unveils therapeutic-resistance mechanisms in circulating tumor cells

artículo científico publicado en 2016

Association of circulating transcriptomic profiles with mortality in sickle cell disease

artículo científico publicado en 2017

Automating ICD-9-CM Encoding Using Medical Language Processing: A Feasibility Study

Automating terminological networks to link heterogeneous biomedical databases

artículo científico publicado en 2004

Biomolecular Systems of Disease Buried Across Multiple GWAS Unveiled by Information Theory and Ontology.

artículo científico

Breakthroughs in genomics data integration for predicting clinical outcome ⬇️

artículo científico publicado el 29 de octubre de 2012

COPD Hospitalization Risk Increased with Distinct Patterns of Multiple Systems Comorbidities Unveiled by Network Modeling

artículo científico publicado en 2014

Cascading Policies Provide Fault Tolerance for Pervasive Clinical Communications

artículo científico publicado en 2005

Challenges and remediation for Patient Safety Indicators in the transition to ICD-10-CM

artículo científico publicado en 2015

Chronic intestinal inflammation induces stress-response genes in commensal Escherichia coli.

artículo científico publicado en 2011

Comparing SNOMED and ICPC retrieval accuracies using relational database models ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1997

Complex genetics of pulmonary diseases: lessons from genome-wide association studies and next-generation sequencing

artículo científico publicado en 2016

Complex-disease networks of trait-associated single-nucleotide polymorphisms (SNPs) unveiled by information theory.

artículo científico publicado en 2012

Comprehensive viral oligonucleotide probe design using conserved protein regions

artículo científico publicado en 2008

Computational approaches to phenotyping: high-throughput phenomics.

artículo científico publicado en 2007

Concordance of deregulated mechanisms unveiled in underpowered experiments: PTBP1 knockdown case study

artículo científico publicado en 2014

Conquering computational challenges of omics data and post-ENCODE paradigms

artículo científico publicado en 2013

Correction: Oligo- and Polymetastatic Progression in Lung Metastasis(es) Patients Is Associated with Specific MicroRNAs.

artículo científico publicado en 2013

Current methodologies for translational bioinformatics

artículo científico publicado en 2010

Curvilinear associations between neuroticism and dyadic adjustment in treatment-seeking couples

artículo científico publicado en 2013

Deregulation of a Hox protein regulatory network spanning prostate cancer initiation and progression

artículo científico publicado en 2012

Detection of practice pattern trends through Natural Language Processing of clinical narratives and biomedical literature

scientific article published on 11 October 2007

Developing a 'personalome' for precision medicine: emerging methods that compute interpretable effect sizes from single-subject transcriptomes

artículo científico publicado en 2017

Developing and Evaluating Theory-based Educational Content for WEB Applications.

artículo científico publicado en 2000

Developing tailored theory-based educational content for WEB applications: illustrations from the MI-HEART project.

artículo científico publicado en 2001

Development and validation of a brief version of the dyadic adjustment scale with a nonparametric item analysis model

artículo científico publicado en 2005

Disambiguating ambiguous biomedical terms in biomedical narrative text: an unsupervised method

artículo científico publicado en 2001

Dynamic changes of RNA-sequencing expression for precision medicine: N-of-1-pathways Mahalanobis distance within pathways of single subjects predicts breast cancer survival

artículo científico publicado en 2015

Early exposure to violence, relationship violence, and relationship satisfaction in adolescents and emerging adults: The role of romantic attachment

artículo científico publicado en 2016

Erratum: Wnt7a is a novel inducer of β-catenin-independent tumor-suppressive cellular senescence in lung cancer

artículo científico publicado en 2015

Essential role of pre-B-cell colony enhancing factor in ventilator-induced lung injury

artículo científico publicado en 2008

Evaluation of an Ontology-anchored Natural Language-based Approach for Asserting Multi-scale Biomolecular Networks for Systems Medicine

artículo científico publicado en 2010

Evaluation of high-throughput functional categorization of human disease genes

artículo científico publicado en 2007

Evidence Suggesting That Discontinuous Dosing of ALK Kinase Inhibitors May Prolong Control of ALK+ Tumors

artículo científico publicado en 2015

Exploring SNOMED Using Phylogenetic Analysis Tools

artículo científico publicado en 2002

Exploring Wound-Healing Genomic Machinery with a Network-Based Approach.

artículo científico publicado en 2017

Exprtarget: an integrative approach to predicting human microRNA targets

artículo científico publicado en 2010

Extended attributes of event monitor systems for criteria-based notification modalities.

artículo científico publicado en 2002

GO-Module: functional synthesis and improved interpretation of Gene Ontology patterns ⬇️

artículo científico publicado el 17 de marzo de 2011

Genestrace: phenomic knowledge discovery via structured terminology.

artículo científico publicado en 2005

Genetic interactions between chromosomes 11 and 18 contribute to airway hyperresponsiveness in mice

artículo científico publicado en 2012

Genomic assessment of a multikinase inhibitor, sorafenib, in a rodent model of pulmonary hypertension

artículo científico publicado en 2008

Guideline interaction: a study of interactions among drug-disease contraindication rules.

artículo científico publicado en 2003

Harnessing SNOMED: A Relational Database Design for the Computerized Patient Record (CPR).

artículo científico publicado en 1995

Harnessing Web Information Technologies for Secure, Adaptive and Individualized Health Communications

Identification of Jak-STAT signaling involvement in sarcoidosis severity via a novel microRNA-regulated peripheral blood mononuclear cell gene signature.

artículo científico publicado en 2017

Identification of common microRNA-mRNA regulatory biomodules in human epithelial cancers.

artículo científico publicado en 2010

Identifying clinically disruptive International Classification of Diseases 10th Revision Clinical Modification conversions to mitigate financial costs using an online tool

artículo científico publicado en 2014

Improving the Development of Composite Educational Guidelines Using Decomposition of Concept Lattices.

artículo científico publicado en 2000

In Silico cancer cell versus stroma cellularity index computed from species-specific human and mouse transcriptome of xenograft models: towards accurate stroma targeting therapy assessment.

artículo científico publicado en 2014

Information visualization techniques in bioinformatics during the postgenomic era ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2004

Integrating Governance of Research Informatics and Health Care IT Across an Enterprise: Experiences from the Trenches

scientific article published on 18 March 2013

Integration of Neuroimaging and Microarray Datasets through Mapping and Model-Theoretic Semantic Decomposition of Unstructured Phenotypes

scientific article published on 01 March 2009

Integration of Neuroimaging and Microarray Datasets through Mapping and Model-Theoretic Semantic Decomposition of Unstructured Phenotypes.

artículo científico publicado en 2009

Integration of curated databases to identify genotype-phenotype associations

artículo científico publicado en 2006

Integrative genomics analyses unveil downstream biological effectors of disease-specific polymorphisms buried in intergenic regions

artículo científico publicado en 2016

Interpreting personal transcriptomes: personalized mechanism-scale profiling of RNA-seq data

artículo científico publicado en 2013

Kinase inhibition-related adverse events predicted from in vitro kinome and clinical trial data

artículo científico publicado en 2010

Lessons Learned in the Early Phase of the MI-HEART Clinical Trial.

artículo científico publicado en 2001

Linking biomedical language information and knowledge resources: GO and UMLS.

artículo científico publicado en 2003

MAP17 Is a Necessary Activator of Renal Na+/Glucose Cotransporter SGLT2.

artículo científico publicado en 2016

MI-HEART: a Comprehensive Management System to Deliver, Monitor and Measure Efficacy of Individualized Web-based Education.

artículo científico publicado en 2001

Measuring the Accuracy of a Nomenclature Encoder Supporting Postcoordination

artículo científico publicado en 1998

Mechanism-anchored profiling derived from epigenetic networks predicts outcome in acute lymphoblastic leukemia

artículo científico publicado en 2009

Metrics and tools for consistent cohort discovery and financial analyses post-transition to ICD-10-CM

artículo científico publicado en 2015

MicroRNA expression characterizes oligometastasis(es)

artículo científico publicado en 2011

Microbes Are Associated with Host Innate Immune Response in Idiopathic Pulmonary Fibrosis

artículo científico publicado en 2017

Mining OMIM for insight into complex diseases.

artículo científico publicado en 2004

Modeling patient response to acute myocardial infarction: implications for a tailored technology-based program to reduce patient delay

artículo científico publicado en 1999

Monitoring the function and use of a clinical decision support system

artículo científico publicado en 2007

Murine lung responses to ambient particulate matter: genomic analysis and influence on airway hyperresponsiveness.

artículo científico publicado en 2008

N-of-1-pathways MixEnrich: advancing precision medicine via single-subject analysis in discovering dynamic changes of transcriptomes

artículo científico publicado en 2017

Natural language processing and visualization in the molecular imaging domain

artículo científico publicado en 2006

Network modeling identifies molecular functions targeted by miR-204 to suppress head and neck tumor metastasis

artículo científico publicado en 2010

Network models of genome-wide association studies uncover the topological centrality of protein interactions in complex diseases

artículo científico publicado en 2013

New autosomal recessive mutations in aquaporin-2 causing nephrogenic diabetes insipidus through deficient targeting display normal expression in Xenopus oocytes.

artículo científico publicado en 2010

Non-muscle myosin light chain kinase isoform is a viable molecular target in acute inflammatory lung injury.

artículo científico publicado en 2010

Oligo- and polymetastatic progression in lung metastasis(es) patients is associated with specific microRNAs

artículo científico publicado en 2012

Overcoming the Barriers of Web-Based Interventions for Elder Patients: Enabling Strategies for the MI HEART Clinical Trial

artículo científico publicado en 1999

Panmicrobial Oligonucleotide Array for Diagnosis of Infectious Diseases

artículo científico publicado en 2007

Particulate matter induces cardiac arrhythmias via dysregulation of carotid body sensitivity and cardiac sodium channels.

artículo científico publicado en 2011

Partitioning knowledge bases between advanced notification and clinical decision support systems

artículo científico publicado en 2005

People, organizational, and leadership factors impacting informatics support for clinical and translational research.

artículo científico publicado en 2013

Peripheral blood mononuclear cell gene expression profiles predict poor outcome in idiopathic pulmonary fibrosis

artículo científico publicado en 2013

PhenoGO: an integrated resource for the multiscale mining of clinical and biological data

artículo científico publicado en 2009

PhenoGO: assigning phenotypic context to gene ontology annotations with natural language processing.

artículo científico publicado en 2006

Prognostic implication of pulmonary function at the beginning of postoperative radiotherapy in non-small cell lung cancer

artículo científico publicado en 2014

Protein interaction network underpins concordant prognosis among heterogeneous breast cancer signatures

artículo científico publicado en 2010

Protein-network modeling of prostate cancer gene signatures reveals essential pathways in disease recurrence.

artículo científico publicado en 2011

Putting data integration into practice: using biomedical terminologies to add structure to existing data sources

artículo científico publicado en 2003

Replication analysis for severe diabetic retinopathy

artículo científico publicado en 2012

Rethinking the role and impact of health information technology: informatics as an interventional discipline

artículo científico publicado en 2016

Robust informatics methods for accurate diagnosis using highly multiplexed virus arrays

artículo científico publicado en 2007

Robust methods for accurate diagnosis using pan-microbiological oligonucleotide microarrays

artículo científico publicado en 2009

Role of FAM18B in diabetic retinopathy

artículo científico publicado en 2014

Role of sphingolipids in murine radiation‐induced lung injury: protection by sphingosine 1‐phosphate analogs ⬇️

artículo científico publicado el 28 de junio de 2011

Selected proceedings of the 2009 Summit on Translational Bioinformatics

artículo científico publicado en 2009

Selected proceedings of the First Summit on Translational Bioinformatics 2008.

artículo científico publicado en 2009

Semantic Modeling for Exposomics with Exploratory Evaluation in Clinical Context.

artículo científico publicado en 2017

Semantic webs for life sciences

artículo científico publicado en 2006

Simulation of ICD-9 to ICD-10-CM Transition for Family Medicine: Simple or Convoluted?

artículo científico publicado en 2016

Simvastatin attenuates radiation-induced murine lung injury and dysregulated lung gene expression.

artículo científico publicado en 2010

Single sample expression-anchored mechanisms predict survival in head and neck cancer

artículo científico publicado en 2012

Stimulating effect of external Myo-inositol on the expression of mutant forms of aquaporin 2.

artículo científico publicado en 2010

Terminology model discovery using natural language processing and visualization techniques

artículo científico

Testing for differentially expressed genetic pathways with single-subject N-of-1 data in the presence of inter-gene correlation.

artículo científico publicado en 2017

The MI-HEART Project: Information Technology (IT) for One-to-One Tailored Patient Communication

artículo científico publicado en 2001

The SNOMED model: a knowledge source for the controlled terminology of the computerized patient record

artículo científico publicado el 1 de junio de 1998

The TEAM evaluation approach to Project FAMUS, a pan-Canadian risk register for primary care

artículo científico publicado en 1992

The complexity and challenges of the International Classification of Diseases, Ninth Revision, Clinical Modification to International Classification of Diseases, 10th Revision, Clinical Modification transition in EDs

artículo científico publicado en 2015

The discriminatory cost of ICD-10-CM transition between clinical specialties: metrics, case study, and mitigating tools

artículo científico publicado en 2013

The emergence of genome-based drug repositioning

artículo científico publicado en 2011

The mitochondrial cardiolipin remodeling enzyme lysocardiolipin acyltransferase is a novel target in pulmonary fibrosis

artículo científico publicado en 2014

The rise of translational bioinformatics

artículo científico publicado en 2012

The transition to ICD-10-CM: challenges for pediatric practice

artículo científico publicado en 2014

Topological analysis of large-scale biomedical terminology structures.

artículo científico

Towards a PBMC "virogram assay" for precision medicine: Concordance between ex vivo and in vivo viral infection transcriptomes

artículo científico publicado en 2015

Towards mechanism classifiers: expression-anchored Gene Ontology signature predicts clinical outcome in lung adenocarcinoma patients ⬇️

artículo científico publicado el 3 de noviembre de 2012

Translating Mendelian and complex inheritance of Alzheimer's disease genes for predicting unique personal genome variants ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2012

Translational bioinformatics: linking knowledge across biological and clinical realms

artículo científico publicado en 2011

Up-regulation of a HOXA-PBX3 homeobox-gene signature following down-regulation of miR-181 is associated with adverse prognosis in patients with cytogenetically abnormal AML.

artículo científico publicado en 2012

Variants affecting exon skipping contribute to complex traits.

artículo científico publicado en 2012

Web-based tailoring and its effect on self-efficacy: results from the MI-HEART randomized controlled trial.

artículo científico publicado en 2002

Wnt7a is a novel inducer of β-catenin-independent tumor-suppressive cellular senescence in lung cancer

artículo científico publicado en 2015

binomialRF: interpretable combinatoric efficiency of random forests to identify biomarker interactions

artículo científico publicado en 2020

eQTL networks unveil enriched mRNA master integrators downstream of complex disease-associated SNPs.

artículo científico publicado en 2015

iDEG: A single-subject method for assessing gene differential expression from two transcriptomes of an individual

article

kMEn: Analyzing noisy and bidirectional transcriptional pathway responses in single subjects

artículo científico publicado en 2016

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