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Lista de obras de

A consensus view of protein dynamics

artículo científico publicado en 2007

A fast method for the determination of fractional contributions to solvation in proteins.

artículo científico publicado en 2006

A procedure for identifying homologous alternative splicing events

artículo científico publicado en 2007

BIGNASim: a NoSQL database structure and analysis portal for nucleic acids simulation data

artículo científico publicado en 2015

BioExcel Building Blocks Workflows (BioBB-Wfs), an integrated web-based platform for biomolecular simulations

artículo científico publicado en 2022

Coarse-grained representation of protein flexibility. Foundations, successes, and shortcomings.

artículo científico

DNA structure directs positioning of the mitochondrial genome packaging protein Abf2p.

artículo científico publicado en 2016

Exploration of conformational transition pathways from coarse-grained simulations.

artículo científico publicado en 2013

Finding Conformational Transition Pathways from Discrete Molecular Dynamics Simulations

artículo científico publicado en 2012

FlexServ: an integrated tool for the analysis of protein flexibility.

artículo científico publicado en 2009

How accurate are accurate force-fields for B-DNA?

artículo científico publicado en 2017

Long-timescale dynamics of the Drew-Dickerson dodecamer.

artículo científico publicado en 2016

MDWeb and MDMoby: an integrated web-based platform for molecular dynamics simulations.

artículo científico publicado en 2012

Mechanism of Structural Tuning of the Hepatitis C Virus Human Cellular Receptor CD81 Large Extracellular Loop.

artículo científico publicado en 2016

MoDEL (Molecular Dynamics Extended Library): a database of atomistic molecular dynamics trajectories

artículo científico publicado en 2010

Molecular dynamics simulations: advances and applications

artículo científico publicado en 2015

Molecular dynamics study of naturally existing cavity couplings in proteins

artículo científico publicado en 2015

NAFlex: a web server for the study of nucleic acid flexibility.

artículo científico publicado en 2013

Predicting the Limit of Intramolecular Hydrogen Bonding with Classical Molecular Dynamics

scientific article published on 14 February 2019

Small Details Matter: The 2'-Hydroxyl as a Conformational Switch in RNA.

artículo científico publicado en 2016

The Multiple Roles of Waters in Protein Solvation

artículo científico publicado en 2017

The Role of Unconventional Hydrogen Bonds in Determining BII Propensities in B-DNA.

artículo científico publicado en 2016

Using interactive Jupyter Notebooks and BioConda for FAIR and reproducible biomolecular simulation workflows

artículo científico publicado en 2024