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A comparison of methanobactins from Methylosinus trichosporium OB3b and Methylocystis strain Sb2 predicts methanobactins are synthesized from diverse peptide precursors modified to create a common core for binding and reducing copper ions

artículo científico publicado en 2010

A comprehensive software suite for protein family construction and functional site prediction

artículo científico publicado en 2017

A guild of 45 CRISPR-associated (Cas) protein families and multiple CRISPR/Cas subtypes exist in prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2005

A strain-variable bacteriocin in Bacillus anthracis and Bacillus cereus with repeated Cys-Xaa-Xaa motifs

artículo científico publicado en 2009

An updated evolutionary classification of CRISPR-Cas systems

artículo científico publicado en 2015

AntiFam: a tool to help identify spurious ORFs in protein annotation

artículo científico publicado en 2012

Archaeosortases and exosortases are widely distributed systems linking membrane transit with posttranslational modification

artículo científico publicado en 2011

Bioinformatic evidence for a widely distributed, ribosomally produced electron carrier precursor, its maturation proteins, and its nicotinoprotein redox partners ⬇️

artículo científico publicado el 11 de enero de 2011

Biological systems discovery in silico: radical S-adenosylmethionine protein families and their target peptides for posttranslational modification

artículo científico publicado en 2011

Both widespread PEP-CTERM proteins and exopolysaccharides are required for floc formation of Zoogloea resiniphila and other activated sludge bacteria

artículo científico publicado en 2018

Cell contact-dependent outer membrane exchange in myxobacteria: genetic determinants and mechanism

artículo científico publicado en 2012

CharProtDB: a database of experimentally characterized protein annotations ⬇️

artículo científico publicado el 2 de diciembre de 2011

Comparative genomic evidence for a close relationship between the dimorphic prosthecate bacteria Hyphomonas neptunium and Caulobacter crescentus

artículo científico publicado en 2006

Comparative genomics of emerging human ehrlichiosis agents

artículo científico publicado en 2006

Comparison of the genome of the oral pathogen Treponema denticola with other spirochete genomes

artículo científico publicado en 2004

Complete Genome Sequence of the Oral Pathogenic Bacterium Porphyromonas gingivalis Strain W83.

artículo científico publicado en 2004

Complete genome sequence of the oral pathogenic Bacterium porphyromonas gingivalis strain W83

artículo científico publicado en 2003

Correction: Comparative Genomics of Emerging Human Ehrlichiosis Agents.

artículo científico publicado en 2006

Creating a specialist protein resource network: a meeting report for the protein bioinformatics and community resources retreat

artículo científico publicado en 2015

DNA sequence of both chromosomes of the cholera pathogen Vibrio cholerae

artículo científico publicado en 2000

Erratum for "New Insights into Dissemination and Variation of the Health Care-Associated Pathogen Acinetobacter baumannii from Genomic Analysis".

artículo científico publicado en 2015

Evidence for lateral gene transfer between Archaea and Bacteria from genome sequence of Thermotoga maritima

artículo científico publicado en 1999

Evolutionary classification of CRISPR-Cas systems: a burst of class 2 and derived variants

artículo científico publicado en 2019

Exopolysaccharide-associated protein sorting in environmental organisms: the PEP-CTERM/EpsH system. Application of a novel phylogenetic profiling heuristic

artículo científico publicado en 2006

Expansion of ribosomally produced natural products: a nitrile hydratase- and Nif11-related precursor family

artículo científico publicado en 2010

Genome Properties: a system for the investigation of prokaryotic genetic content for microbiology, genome annotation and comparative genomics

artículo científico publicado en 2004

Genome analysis of multiple pathogenic isolates of Streptococcus agalactiae: implications for the microbial "pan-genome"

artículo científico publicado en 2005

Genome sequence of Aeromonas hydrophila ATCC 7966T: jack of all trades

artículo científico publicado en 2006

Genome sequence of Silicibacter pomeroyi reveals adaptations to the marine environment

artículo científico publicado en 2004

Genome sequence of the dissimilatory metal ion–reducing bacterium Shewanella oneidensis

artículo científico publicado en 2002

Genome sequence of the human malaria parasite Plasmodium falciparum

artículo científico publicado en 2002

GlyGly-CTERM and rhombosortase: a C-terminal protein processing signal in a many-to-one pairing with a rhomboid family intramembrane serine protease

artículo científico publicado en 2011

HMM-based databases in InterPro

artículo científico publicado en 2002

Identification of widespread adenosine nucleotide binding in Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2013

Insights on Evolution of Virulence and Resistance from the Complete Genome Analysis of an Early Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus Strain and a Biofilm-Producing Methicillin-Resistant Staphylococcus epidermidis Strain

artículo científico publicado en 2005

InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database

artículo científico publicado en 2012

InterPro in 2011: new developments in the family and domain prediction database

artículo científico publicado en 2012

InterPro, progress and status in 2005

artículo científico publicado en 2005

InterPro: an integrated documentation resource for protein families, domains and functional sites

artículo científico publicado en 2002

InterPro: the integrative protein signature database

artículo científico publicado en 2009

Life in hot carbon monoxide: the complete genome sequence of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901

artículo científico publicado en 2005

Methanobactin and MmoD work in concert to act as the 'copper-switch' in methanotrophs

artículo científico publicado en 2013

Modes of particle transport

artículo científico publicado en 1989

Mycofactocin-associated mycobacterial dehydrogenases with non-exchangeable NAD cofactors

artículo científico publicado en 2017

New developments in the InterPro database

artículo científico publicado en 2007

New insights into dissemination and variation of the health care-associated pathogen Acinetobacter baumannii from genomic analysis

artículo científico publicado en 2014

Orphan SelD proteins and selenium-dependent molybdenum hydroxylases

artículo científico publicado en 2008

Pathogenomic inference of virulence-associated genes in Leptospira interrogans

artículo científico publicado en 2013

ProPhylo: partial phylogenetic profiling to guide protein family construction and assignment of biological process ⬇️

artículo científico publicado el 9 de noviembre de 2011

RefSeq: an update on prokaryotic genome annotation and curation

artículo científico publicado en 2017

Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: current status, taxonomic expansion, and functional annotation

artículo científico publicado en 2016

Ribosomally synthesized and post-translationally modified peptide natural products: overview and recommendations for a universal nomenclature

artículo científico publicado en 2013

SMURF: Genomic mapping of fungal secondary metabolite clusters

artículo científico publicado en 2010

Simultaneous non-contiguous deletions using large synthetic DNA and site-specific recombinases

artículo científico publicado en 2014

Sites Inferred by Metabolic Background Assertion Labeling (SIMBAL): adapting the Partial Phylogenetic Profiling algorithm to scan sequences for signatures that predict protein function

artículo científico publicado en 2010

Skewed genomic variability in strains of the toxigenic bacterial pathogen, Clostridium perfringens

artículo científico publicado en 2006

Structural flexibility in the Burkholderia mallei genome

artículo científico publicado en 2004

TIGRFAMs and Genome Properties in 2013.

artículo científico publicado en 2012

TIGRFAMs and Genome Properties: tools for the assignment of molecular function and biological process in prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2007

The COMBREX project: design, methodology, and initial results

artículo científico publicado en 2013

The InterPro database, 2003 brings increased coverage and new features

artículo científico publicado en 2003

The InterPro protein families database: the classification resource after 15 years

artículo científico publicado en 2015

The TIGRFAMs database of protein families

artículo científico publicado en 2003

The complete genome sequence of Chlorobium tepidum TLS, a photosynthetic, anaerobic, green-sulfur bacterium

artículo científico publicado en 2002

The complete genome sequence of the Arabidopsis and tomato pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000

artículo científico publicado en 2003

The genome sequence of Bacillus anthracis Ames and comparison to closely related bacteria

artículo científico publicado en 2003

The genome sequence of the anaerobic, sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio vulgaris Hildenborough

artículo científico publicado en 2004

The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

artículo científico publicado en 2008

Three genomes from the phylum Acidobacteria provide insight into the lifestyles of these microorganisms in soils

artículo científico publicado en 2009

Unexpected abundance of coenzyme F(420)-dependent enzymes in Mycobacterium tuberculosis and other actinobacteria

artículo científico publicado en 2010

Using comparative genomics to drive new discoveries in microbiology

artículo científico publicado en 2015

What Makes a Bacterial Species Pathogenic?:Comparative Genomic Analysis of the Genus Leptospira

artículo científico publicado en 2016

Whole genome comparisons of serotype 4b and 1/2a strains of the food-borne pathogen Listeria monocytogenes reveal new insights into the core genome components of this species

artículo científico publicado en 2004

Whole-genome sequence analysis of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448A reveals divergence among pathovars in genes involved in virulence and transposition

artículo científico publicado en 2005

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