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Lista de obras de Suzanna Lewis

A Whole-Genome Analysis Framework for Effective Identification of Pathogenic Regulatory Variants in Mendelian Disease

artículo científico publicado en 2016

A high throughput screen to identify secreted and transmembrane proteins involved in Drosophila embryogenesis

artículo científico publicado en 1998

A knowledge based approach to matching human neurodegenerative disease and animal models

artículo científico publicado en 2013

A short study on the success of the Gene Ontology

2004 article

Anatomy of BioJS, an open source community for the life sciences

artículo científico publicado en 2015

Annotation of the Drosophila melanogaster euchromatic genome: a systematic review

artículo científico publicado en 2002

Apollo: Democratizing genome annotation

Apollo: Democratizing genome annotation

artículo científico publicado en 2019

Apollo: a community resource for genome annotation editing

artículo científico publicado en 2009

Assessing the effectiveness of knowledge-based interventions in increasing skin cancer awareness, knowledge, and protective behaviors in skin of color populations

artículo científico publicado en 2017

Assessment of genome-wide protein function classification for Drosophila melanogaster

artículo científico

Best Practice Data Life Cycle Approaches for the Life Sciences

scholarly article

Best practice data life cycle approaches for the life sciences

article

BioJS: an open source standard for biological visualisation - its status in 2014

artículo científico publicado en 2014

Calling on a million minds for community annotation in WikiProteins

artículo científico publicado en 2008

Comparative genome and proteome analysis of Anopheles gambiae and Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2002

Construction and accessibility of a cross-species phenotype ontology along with gene annotations for biomedical research

artículo científico

Construction and accessibility of a cross-species phenotype ontology along with gene annotations for biomedical research

article

Correction: Reactome: a knowledge base of biologic pathways and processes.

artículo científico publicado en 2009

Coxsackie eruption arising in areas of epidermolytic ichthyosis

artículo científico publicado en 2015

Deletions of chromosomal regulatory boundaries are associated with congenital disease

artículo científico publicado en 2014

Disease insights through cross-species phenotype comparisons

artículo científico publicado en 2015

EGASP: the human ENCODE Genome Annotation Assessment Project

artículo científico publicado en 2006

Effective diagnosis of genetic disease by computational phenotype analysis of the disease-associated genome

artículo científico publicado en 2014

Emerging semantics to link phenotype and environment

artículo científico publicado en 2015

Entity/quality-based logical definitions for the human skeletal phenome using PATO

artículo científico publicado en 2009

Finding our way through phenotypes

artículo científico publicado en 2015

Gearing up to handle the mosaic nature of life in the quest for orthologs

artículo científico publicado en 2017

Gene Ontology Causal Activity Modeling (GO-CAM) moves beyond GO annotations to structured descriptions of biological functions and systems

scientific article published on 01 October 2019

Gene Ontology: looking backwards and forwards

artículo científico publicado en 2005

Improved exome prioritization of disease genes through cross-species phenotype comparison

artículo científico publicado en 2014

Integrating phenotype ontologies across multiple species

artículo científico publicado en 2010

Integrative analysis of the Caenorhabditis elegans genome by the modENCODE project

artículo científico publicado en 2010

Invariance (?) of mutational parameters for relative fitness over 400 generations of mutation accumulation in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2012

JBrowse: a dynamic web platform for genome visualization and analysis

artículo científico publicado en 2016

Joining forces in the quest for orthologs

artículo científico publicado en 2009

Large-scale inference of gene function through phylogenetic annotation of Gene Ontology terms: case study of the apoptosis and autophagy cellular processes

artículo científico publicado en 2016

Large-scale trends in the evolution of gene structures within 11 animal genomes

artículo científico publicado en 2006

Linking human diseases to animal models using ontology-based phenotype annotation

artículo científico publicado en 2009

MSAViewer: interactive JavaScript visualization of multiple sequence alignments

artículo científico publicado en 2016

Model organism data evolving in support of translational medicine

artículo científico publicado en 2018

Modelling data across labs, genomes, space and time

artículo científico publicado en 2006

MouseFinder: Candidate disease genes from mouse phenotype data

artículo científico publicado en 2012

National Center for Biomedical Ontology: advancing biomedicine through structured organization of scientific knowledge

artículo científico publicado en 2006

Navigating the Phenotype Frontier: The Monarch Initiative

artículo científico publicado en 2016

Navigating the phenotype frontier: The Monarch Initiative

Novel sequence feature variant type analysis of the HLA genetic association in systemic sclerosis

artículo científico publicado en 2010

OBO Foundry in 2021: operationalizing open data principles to evaluate ontologies

artículo científico publicado en 2021

OBO-Edit--an ontology editor for biologists

artículo científico publicado en 2007

On ontologies for biologists: the Gene Ontology--untangling the web.

artículo científico publicado en 2002

On the Use of Gene Ontology Annotations to Assess Functional Similarity among Orthologs and Paralogs: A Short Report

artículo científico publicado en 2012

Ontology annotation: mapping genomic regions to biological function

artículo científico publicado en 2007

PANTHER version 7: improved phylogenetic trees, orthologs and collaboration with the Gene Ontology Consortium

artículo científico publicado en 2010

PhenoDigm: analyzing curated annotations to associate animal models with human diseases

artículo científico publicado en 2013

Phenotype Ontology Research Coordination Network meeting report: creating a community network for comparing and leveraging phenotype-genotype knowledge across species

artículo científico publicado en 2012

Phenotypic overlap in the contribution of individual genes to CNV pathogenicity revealed by cross-species computational analysis of single-gene mutations in humans, mice and zebrafish

artículo científico publicado en 2012

Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium

artículo científico publicado en 2011

Promoting coherent minimum reporting guidelines for biological and biomedical investigations: the MIBBI project

artículo científico publicado en 2008

Quest for Orthologs Entails Quest for Tree of Life: In Search of the Gene Stream

artículo científico publicado en 2015

Reactome knowledgebase of human biological pathways and processes

artículo científico publicado en 2009

Reactome: a knowledge base of biologic pathways and processes

artículo científico publicado en 2007

Sequence ontology annotation guide

artículo científico

Standardized benchmarking in the quest for orthologs

artículo científico publicado en 2016

Standardized description of scientific evidence using the Evidence Ontology (ECO)

artículo científico publicado en 2014

Survey-based naming conventions for use in OBO Foundry ontology development

artículo científico publicado en 2009

Systematic determination of patterns of gene expression during Drosophila embryogenesis

artículo científico publicado en 2002

The Confidence Information Ontology: a step towards a standard for asserting confidence in annotations

artículo científico publicado en 2015

The Human Phenotype Ontology project: linking molecular biology and disease through phenotype data

artículo científico publicado en 2014

The Monarch Initiative in 2019: an integrative data and analytic platform connecting phenotypes to genotypes across species

artículo científico publicado en 2020

The Monarch Initiative: Insights across species reveal human disease mechanisms

The Monarch Initiative: an integrative data and analytic platform connecting phenotypes to genotypes across species

artículo científico publicado en 2017

The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration

artículo científico publicado en 2007

The RNA Ontology Consortium: an open invitation to the RNA community

artículo científico publicado en 2006

The Sequence Ontology: a tool for the unification of genome annotations

artículo científico publicado en 2005

The Vision and Challenges of the Gene Ontology

artículo científico

The environment ontology in 2016: bridging domains with increased scope, semantic density, and interoperation

artículo científico publicado en 2016

The environment ontology: contextualising biological and biomedical entities

article

The generic genome browser: a building block for a model organism system database

artículo científico publicado en 2002

The influence of disease categories on gene candidate predictions from model organism phenotypes

artículo científico publicado en 2014

The minimum information about a genome sequence (MIGS) specification

artículo científico publicado en 2008

The modENCODE Data Coordination Center: lessons in harvesting comprehensive experimental details

artículo científico publicado en 2011

The transposable elements of the Drosophila melanogaster euchromatin: a genomics perspective

artículo científico publicado en 2002

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Uberon, an integrative multi-species anatomy ontology

artículo científico publicado en 2012

Uberon: towards a comprehensive multi-species anatomy ontology

Uberon: towards a comprehensive multi-species anatomy ontology

Unification of multi-species vertebrate anatomy ontologies for comparative biology in Uberon

artículo científico publicado en 2014

Use of animal models for exome prioritization of rare disease genes

article

Use of model organism and disease databases to support matchmaking for human disease gene discovery

artículo científico publicado en 2015

Using ontologies to define the relation between neurodegenerative disease and associated animal model phenotypes

Web Apollo: a web-based genomic annotation editing platform

artículo científico publicado en 2013

Wrestling with SUMO and bio-ontologies

artículo científico publicado en 2006

modMine: flexible access to modENCODE data

artículo científico publicado en 2011

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