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Lista de obras de Steven A. Benner

"Skinny" and "Fat" DNA: Two New Double Helices

scientific article published on 10 September 2018

2'-deoxy-1-methylpseudocytidine, a stable analog of 2'-deoxy-5-methylisocytidine.

artículo científico publicado en 2009

2-Hydroxymethylboronate as a reagent to detect carbohydrates: application to the analysis of the formose reaction

artículo científico publicado en 2006

A Direct Prebiotic Synthesis of Nicotinamide Nucleotide

artículo científico publicado en 2017

A Single Deoxynucleoside Kinase Variant from Drosophila melanogaster Synthesizes Monophosphates of Nucleosides That Are Components of an Expanded Genetic System

artículo científico publicado en 2016

A combinatorial distance-constraint approach to predicting protein tertiary models from known secondary structure ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

A convenient synthesis of N,N'-dibenzyl-2,4-diaminopyrimidine-2'-deoxyribonucleoside and 1-methyl-2'-deoxypseudoisocytidine

artículo científico publicado en 2009

A norovirus detection architecture based on isothermal amplification and expanded genetic systems

artículo científico publicado en 2016

A predicted consensus structure for the N-terminal fragment of the heat shock protein HSP90 family

artículo científico publicado en 1997

A review: synthesis of aryl C-glycosides via the heck coupling reaction

artículo científico publicado en 2006

A word in your protein

artículo científico publicado en 1993

Affinity maturation of a portable Fab-RNA module for chaperone-assisted RNA crystallography

artículo científico publicado en 2018

Alternative Watson-Crick Synthetic Genetic Systems

artículo científico publicado en 2016

Amino acid substitution during functionally constrained divergent evolution of protein sequences

artículo científico publicado en 1994

Amplification, mutation, and sequencing of a six-letter synthetic genetic system

artículo científico publicado en 2011

An Aptamer-Nanotrain Assembled from Six-Letter DNA Delivers Doxorubicin Selectively to Liver Cancer Cells

scientific article published on 19 November 2019

Analysis of combinatorial libraries using electrospray Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry

artículo científico publicado en 1996

Analysis of transitions at two-fold redundant sites in mammalian genomes. Transition redundant approach-to-equilibrium (TREx) distance metrics

artículo científico publicado en 2006

Application of DETECTER, an evolutionary genomic tool to analyze genetic variation, to the cystic fibrosis gene family

artículo científico publicado en 2006

Aptamers against Cells Overexpressing Glypican 3 from Expanded Genetic Systems Combined with Cell Engineering and Laboratory Evolution

artículo científico publicado en 2016

Artificial genetic systems: exploiting the "aromaticity" formalism to improve the tautomeric ratio for isoguanosine derivatives

artículo científico publicado en 2004

Artificial genetic systems: self-avoiding DNA in PCR and multiplexed PCR.

artículo científico publicado en 2010

Artificially Expanded Genetic Information Systems for New Aptamer Technologies.

artículo científico publicado en 2018

Artificially expanded genetic information system: a new base pair with an alternative hydrogen bonding pattern

artículo científico publicado en 2006

Assays To Detect the Formation of Triphosphates of Unnatural Nucleotides: Application to Escherichia coli Nucleoside Diphosphate Kinase

artículo científico publicado en 2016

Biophysics of Artificially Expanded Genetic Information Systems. Thermodynamics of DNA Duplexes Containing Matches and Mismatches Involving 2-Amino-3-nitropyridin-6-one (Z) and Imidazo[1,2-a]-1,3,5-triazin-4(8H)one (P).

artículo científico publicado en 2017

Borate minerals stabilize ribose

artículo científico publicado en 2004

C-5 modified nucleosides: direct insertion of alkynyl-thio functionality in pyrimidines

artículo científico publicado en 2003

Catalysts, Anticatalysts, and Receptors for Unactivated Phosphate Diesters in Water ⬇️

artículo científico publicado el 29 de octubre de 1999

Challenging artificial genetic systems: thymidine analogs with 5-position sulfur functionality

artículo científico publicado en 2002

Conversion Strategy Using an Expanded Genetic Alphabet to Assay Nucleic Acids ⬇️

artículo científico publicado el 17 de abril de 2013

Crystal structures of deprotonated nucleobases from an expanded DNA alphabet

artículo científico publicado en 2016

Design of a novel molecular beacon: modification of the stem with artificially genetic alphabet

artículo científico publicado en 2008

Detecting Darwinism from Molecules in the Enceladus Plumes, Jupiter's Moons, and Other Planetary Water Lagoons

artículo científico

Detecting compensatory covariation signals in protein evolution using reconstructed ancestral sequences

artículo científico publicado en 2002

Detecting respiratory viral RNA using expanded genetic alphabets and self-avoiding DNA.

artículo científico publicado en 2015

Directed evolution of polymerases to accept nucleotides with nonstandard hydrogen bond patterns

artículo científico publicado en 2013

Dynamic assembly of primers on nucleic acid templates

artículo científico publicado en 2006

Eliminating primer dimers and improving SNP detection using self-avoiding molecular recognition systems

artículo científico publicado en 2020

Empirical and structural models for insertions and deletions in the divergent evolution of proteins

artículo científico publicado en 1993

Enzymatic incorporation of a new base pair into DNA and RNA

artículo científico publicado en 1989

Enzymatic incorporation of a new base pair into DNA and RNA extends the genetic alphabet ⬇️

artículo científico publicado el 4 de enero de 1990

Enzymatic incorporation of a third nucleobase pair

artículo científico publicado en 2007

Enzymic recognition of the base pair between isocytidine and isoguanosine ⬇️

artículo científico publicado el 5 de octubre de 1993

Evaluation measures of multiple sequence alignments

artículo científico publicado en 2000

Evolution of functional six-nucleotide DNA.

artículo científico publicado en 2015

Evolutionary history of the uterine serpins

artículo científico publicado en 2000

Evolutionary, mechanistic, and predictive analyses of the hydroxymethyldihydropterin pyrophosphokinase family of proteins

artículo científico publicado en 1999

Exhaustive matching of the entire protein sequence database

artículo científico publicado en 1992

Expanded genetic alphabets in the polymerase chain reaction

artículo científico publicado en 2010

Expanding the genetic lexicon: incorporating non-standard amino acids into proteins by ribosome-based synthesis

artículo científico publicado en 1994

Extracellular 'communicator RNA'.

artículo científico

Fluorescent charge-neutral analogue of xanthosine: synthesis of a 2'-deoxyribonucleoside bearing a 5-aza-7-deazaxanthine base

artículo científico publicado en 2001

Fourier transform-ion cyclotron resonance mass spectrometric resolution, identification, and screening of non-covalent complexes of Hck Src homology 2 domain receptor and ligands from a 324-member peptide combinatorial library

artículo científico publicado en 2002

Free energy differences between enzyme bound states

artículo científico publicado en 1987

Function-structure analysis of proteins using covarion-based evolutionary approaches: Elongation factors

artículo científico publicado en 2001

Hachimoji DNA and RNA: A genetic system with eight building blocks

artículo científico publicado en 2019

Helicase-Dependent Isothermal Amplification of DNA and RNA by Using Self-Avoiding Molecular Recognition Systems

artículo científico publicado en 2015

High-throughput multiplexed xMAP Luminex array panel for detection of twenty two medically important mosquito-borne arboviruses based on innovations in synthetic biology

artículo científico publicado en 2015

Hominids adapted to metabolize ethanol long before human-directed fermentation

artículo científico publicado en 2015

Incorporation of multiple sequential pseudothymidines by DNA polymerases and their impact on DNA duplex structure

artículo científico publicado en 2008

Inferring the palaeoenvironment of ancient bacteria on the basis of resurrected proteins

artículo científico publicado en 2003

Integrating protein structures and precomputed genealogies in the Magnum database: examples with cellular retinoid binding proteins

artículo científico publicado en 2006

Is there a common chemical model for life in the universe?

artículo científico publicado en 2004

Labeled Nucleoside Triphosphates with Reversibly Terminating Aminoalkoxyl Groups ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2010

Laboratory evolution of artificially expanded DNA gives redesignable aptamers that target the toxic form of anthrax protective antigen

scientific article published on 03 October 2016

Modern metabolism as a palimpsest of the RNA world

artículo científico publicado en 1989

Multiplexed genetic analysis using an expanded genetic alphabet

artículo científico publicado en 2004

Natural progression

scientific article published in Nature

Natural selection, protein engineering, and the last riboorganism: rational model building in biochemistry

artículo científico publicado en 1987

Nucleoside alpha-thiotriphosphates, polymerases and the exonuclease III analysis of oligonucleotides containing phosphorothioate linkages

artículo científico publicado en 2007

OligArch: A software tool to allow artificially expanded genetic information systems (AEGIS) to guide the autonomous self-assembly of long DNA constructs from multiple DNA single strands

artículo científico

Oligodeoxyribonucleotide analogues with bridging dimethylene sulfide, sulfoxide, and sulfone groups. Toward a second-generation model of nucleic acid structure

artículo científico publicado en 2002

PCR amplification of DNA containing non-standard base pairs by variants of reverse transcriptase from Human Immunodeficiency Virus-1

artículo científico publicado en 2004

Patterns of divergence in homologous proteins as indicators of tertiary and quaternary structure

artículo científico publicado en 1989

Phosphates, DNA, and the search for nonterrean life: a second generation model for genetic molecules

artículo científico publicado en 2002

Planetary systems biology

artículo científico publicado en 2005

Polymerase Interactions with Wobble Mismatches in Synthetic Genetic Systems and Their Evolutionary Implications

artículo científico publicado en 2016

Post-genomic science: converting primary structure into physiological function ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

Prebiotic Chemistry that Could Not Not Have Happened

scientific article published on 14 November 2019

Prebiotic stereoselective synthesis of purine and noncanonical pyrimidine nucleotide from nucleobases and phosphorylated carbohydrates

artículo científico publicado en 2017

Predicting functional divergence in protein evolution by site-specific rate shifts

artículo científico publicado en 2002

Probing minor groove recognition contacts by DNA polymerases and reverse transcriptases using 3-deaza-2'-deoxyadenosine

artículo científico publicado en 2004

Pseudogenes in ribonuclease evolution: a source of new biomacromolecular function?

artículo científico publicado en 1996

Q&A: Life, synthetic biology and risk

artículo científico publicado en 2010

Quantitative analysis of a RNA-cleaving DNA catalyst obtained via in vitro selection

artículo científico publicado en 2004

Quantitative analysis of receptors for adenosine nucleotides obtained via in vitro selection from a library incorporating a cationic nucleotide analog

artículo científico publicado en 1999

Recognition by viral and cellular DNA polymerases of nucleosides bearing bases with nonstandard hydrogen bonding patterns

artículo científico publicado en 1995

Recognition of an expanded genetic alphabet by type-II restriction endonucleases and their application to analyze polymerase fidelity ⬇️

artículo científico publicado el 17 de enero de 2011

Recombinase-based isothermal amplification of nucleic acids with self-avoiding molecular recognition systems (SAMRS).

artículo científico publicado en 2014

Reconstructed evolutionary adaptive paths give polymerases accepting reversible terminators for sequencing and SNP detection

artículo científico publicado en 2010

Reconstructing the evolutionary history of the artiodactyl ribonuclease superfamily

artículo científico publicado en 1995

Resurrecting ancestral alcohol dehydrogenases from yeast

artículo científico publicado en 2005

Ribonucleosides for an artificially expanded genetic information system

artículo científico publicado en 2014

Self-Avoiding Molecular Recognition Systems (SAMRS).

artículo científico publicado en 2008

Setting the Stage: The History, Chemistry, and Geobiology behind RNA ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2012

Signatures of a shadow biosphere

artículo científico publicado en 2009

Solubility of polyethers in hydrocarbons at low temperatures. A model for potential genetic backbones on warm titans

artículo científico publicado en 2015

Standard and AEGIS nicking molecular beacons detect amplicons from the Middle East respiratory syndrome coronavirus

artículo científico publicado en 2016

Structural basis for a six nucleotide genetic alphabet

artículo científico publicado en 2015

Structural determinants of stereospecificity in yeast alcohol dehydrogenase

artículo científico publicado en 1991

Structure and Biophysics for a Six Letter DNA Alphabet that Includes Imidazo[1,2-a]-1,3,5-triazine-2(8H)-4(3H)-dione (X) and 2,4-Diaminopyrimidine (K).

artículo científico publicado en 2017

Structure prediction in a post-genomic environment: a secondary and tertiary structural model for the initiation factor 5A family

artículo científico publicado en 1998

Synthesis and Biodistribution of a Short Nonionic Oligonucleotide Analogue in Mouse with a Potential to Mimic Peptides ⬇️

artículo científico publicado el 29 de enero de 1998

Synthesis and Enzymology of 2'-Deoxy-7-deazaisoguanosine Triphosphate and Its Complement: A Second Generation Pair in an Artificially Expanded Genetic Information System

artículo científico publicado en 2016

Synthesis of pyrophosphates for in vitro selection of catalytic RNA molecules

artículo científico publicado en 2008

Synthesis, structure and activity of artificial, rationally designed catalytic polypeptides

artículo científico publicado en 1993

Synthetic biology

artículo científico publicado en 2005

Synthetic biology for improved personalized medicine

artículo científico publicado en 2008

The NASA Astrobiology Roadmap

artículo científico publicado en 2003

The challenges of sequencing by synthesis

artículo científico publicado en 2009

The crystal structure of eEF1A refines the functional predictions of an evolutionary analysis of rate changes among elongation factors

artículo científico publicado en 2002

The design of synthetic genes

artículo científico publicado en 1988

The evolution of seminal ribonuclease: pseudogene reactivation or multiple gene inactivation events?

artículo científico publicado en 2007

The last ribo-organism

artículo científico publicado en 1987

The missing organic molecules on Mars

artículo científico publicado en 2000

The natural history of class I primate alcohol dehydrogenases includes gene duplication, gene loss, and gene conversion

artículo científico publicado en 2012

The past as the key to the present: resurrection of ancient proteins from eosinophils

artículo científico publicado en 2002

The planetary biology of ascorbate and uric acid and their relationship with the epidemic of obesity and cardiovascular disease

artículo científico publicado en 2008

The planetary biology of cytochrome P450 aromatases

artículo científico publicado en 2004

The return of pancreatic ribonucleases

artículo científico publicado en 1989

The ribonuclease from an extinct bovid ruminant

artículo científico publicado en 1990

The use of thymidine analogs to improve the replication of an extra DNA base pair: a synthetic biological system

artículo científico publicado en 2005

The “Strong” RNA World Hypothesis: Fifty Years Old ⬇️

artículo científico publicado el 3 de abril de 2013

Transcription, reverse transcription, and analysis of RNA containing artificial genetic components

artículo científico publicado en 2014

Uncertainty in ancient phylogenies

scientific article published in Nature

Understanding nucleic acids using synthetic chemistry

artículo científico publicado en 2004

Unite efforts and conquer mysteries of artificial genetics

artículo científico publicado en 2000

Uniting Natural History with the Molecular Sciences. The Ultimate Multidisciplinarity

artículo científico publicado en 2017

Unusual Hydrogen Bonding Patterns and the Role of the Backbone in Nucleic Acid Information Transfer

artículo científico publicado en 2016

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