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Lista de obras de Shankar Balasubramanian

5'-UTR RNA G-quadruplexes: translation regulation and targeting ⬇️

artículo científico publicado el 20 de febrero de 2012

5-Formylcytosine can be a stable DNA modification in mammals

artículo científico publicado en 2015

5-Formylcytosine organizes nucleosomes and forms Schiff base interactions with histones in mouse embryonic stem cells

artículo científico publicado en 2018

A G-Rich Sequence within the c-kit Oncogene Promoter Forms a Parallel G-Quadruplex Having Asymmetric G-Tetrad Dynamics

artículo científico publicado en 2009

A LIN28-dependent structural change in pre-let-7g directly inhibits dicer processing

artículo científico publicado en 2011

A Spontaneous Ring-Opening Reaction Leads to a Repair-Resistant Thymine Oxidation Product in Genomic DNA

scientific article published on 23 October 2019

A novel small molecule that alters shelterin integrity and triggers a DNA-damage response at telomeres

artículo científico publicado en 2008

A screen for hydroxymethylcytosine and formylcytosine binding proteins suggests functions in transcription and chromatin regulation

artículo científico publicado en 2013

A sequence-independent study of the influence of short loop lengths on the stability and topology of intramolecular DNA G-quadruplexes

artículo científico publicado en 2007

A single-molecule platform for investigation of interactions between G-quadruplexes and small-molecule ligands

artículo científico publicado en 2011

A small molecule that disrupts G-quadruplex DNA structure and enhances gene expression

artículo científico publicado en 2009

Accuracy of commercial blood gas analyzers for monitoring ionized calcium at low concentrations

artículo científico publicado en 2016

Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry

artículo científico publicado en 2008

Activation-induced cytidine deaminase localizes to G-quadruplex motifs at mutation hotspots in lymphoma

artículo científico publicado en 2020

An Acetylene‐Bridged 6,8‐Purine Dimer as a Fluorescent Switch‐On Probe for Parallel G‐Quadruplexes ⬇️

artículo científico publicado el 13 de diciembre de 2012

An Activatable Cancer-Targeted Hydrogen Peroxide Probe for Photoacoustic and Fluorescence Imaging

artículo científico publicado en 2019

An Epigenetics-Inspired DNA-Based Data Storage System

artículo científico publicado en 2016

An RNA G-quadruplex in the 5' UTR of the NRAS proto-oncogene modulates translation

artículo científico publicado en 2007

Analysis of human telomerase activity and function by two color single molecule coincidence fluorescence spectroscopy

artículo científico publicado en 2006

Chemical methods for decoding cytosine modifications in DNA

artículo científico publicado en 2015

Chemical profiling of DNA G-quadruplex-interacting proteins in live cells

artículo científico publicado en 2021

Chemical sensing based on catalytic nanomotors: motion-based detection of trace silver

artículo científico publicado en 2009

Chemically Triggered Swarming of Gold Microparticles ⬇️

artículo científico publicado el 10 de enero de 2011

Comparative Structural Effects of HIV-1 Gag and Nucleocapsid Proteins in Binding to and Unwinding of the Viral RNA Packaging Signal ⬇️

artículo científico publicado el 6 de abril de 2012

DNA G-quadruplex structures mold the DNA methylome

artículo científico publicado en 2018

DNA G-quadruplexes in the human genome: detection, functions and therapeutic potential

artículo científico publicado en 2017

DNA molecular motor driven micromechanical cantilever arrays

artículo científico publicado en 2005

Decoding Genomes at High Speed: Implications for Science and Medicine ⬇️

artículo científico publicado el 5 de diciembre de 2011

Detection, Structure and Function of Modified DNA Bases

scientific article published on 28 March 2019

Determination of the fraction and stoichiometry of femtomolar levels of biomolecular complexes in an excess of monomer using single-molecule, two-color coincidence detection

artículo científico publicado en 2006

Diarylethynyl amides that recognize the parallel conformation of genomic promoter DNA G-quadruplexes

artículo científico publicado en 2008

Discovery of G-quadruplex stabilizing ligands through direct ELISA of a one-bead-one-compound library

artículo científico publicado en 2006

Distinct functions of maternal and somatic Pat1 protein paralogs

artículo científico publicado en 2010

Dynamic covalent chemistry on self-templating peptides: formation of a disulfide-linked beta-hairpin mimic

artículo científico publicado en 2003

Elevated levels of G-quadruplex formation in human stomach and liver cancer tissues

artículo científico publicado en 2014

Enhanced Methylation Analysis by Recovery of Unsequenceable Fragments

artículo científico publicado en 2016

Ensemble and single molecule FRET analysis of the structure and unfolding kinetics of the c-kit promoter quadruplexes

artículo científico publicado en 2009

Exploring a chemical encoding strategy for combinatorial synthesis using Friedel-Crafts alkylation

artículo científico publicado en 1999

FOXM1 binds directly to non-consensus sequences in the human genome

artículo científico publicado en 2015

Formation and abundance of 5-hydroxymethylcytosine in RNA.

artículo científico publicado en 2015

G-quadruplex DNA bound by a synthetic ligand is highly dynamic

artículo científico publicado en 2009

G-quadruplex recognition by bis-indole carboxamides

artículo científico publicado en 2008

G-quadruplexes regulate Epstein-Barr virus-encoded nuclear antigen 1 mRNA translation

artículo científico publicado en 2014

Genetic interactions of G-quadruplexes in humans

artículo científico publicado en 2019

Genome-wide distribution of 5-formylcytosine in embryonic stem cells is associated with transcription and depends on thymine DNA glycosylase

artículo científico publicado en 2012

Genome-wide mapping of 5-hydroxymethyluracil in the eukaryote parasite Leishmania

artículo científico publicado en 2017

Genome-wide mapping of endogenous G-quadruplex DNA structures by chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing.

artículo científico publicado en 2018

High-throughput sequencing of DNA G-quadruplex structures in the human genome

artículo científico publicado en 2015

Identification of putative reader proteins of 5-methylcytosine and its derivatives in RNA

artículo científico publicado en 2022

Identification of small molecule inhibitors of the Lin28-mediated blockage of pre-let-7g processing

artículo científico publicado en 2016

LIN-28 and the poly(U) polymerase PUP-2 regulate let-7 microRNA processing in Caenorhabditis elegans

artículo científico publicado en 2009

Landscape of G-quadruplex DNA structural regions in breast cancer

artículo científico publicado en 2020

Local epigenetic reprogramming induced by G-quadruplex ligands

artículo científico publicado en 2017

Machine learning model for sequence-driven DNA G-quadruplex formation

artículo científico publicado en 2017

Macrocyclic and helical oligoamides as a new class of G-quadruplex ligands

artículo científico publicado en 2007

Measuring single-molecule nucleic acid dynamics in solution by two-color filtered ratiometric fluorescence correlation spectroscopy

artículo científico publicado en 2004

Mechanochemical properties of individual human telomeric RNA (TERRA) G-quadruplexes

artículo científico publicado en 2013

Micromachine-enabled capture and isolation of cancer cells in complex media.

artículo científico publicado en 2011

Minimum length requirement of the alignment domain of human telomerase RNA to sustain catalytic activity in vitro

artículo científico publicado en 2002

Molecular signatures of plastic phenotypes in two eusocial insect species with simple societies

artículo científico publicado en 2015

NOTCH-mediated non-cell autonomous regulation of chromatin structure during senescence.

artículo científico publicado en 2018

Oxazole-based peptide macrocycles: a new class of G-quadruplex binding ligands

artículo científico publicado en 2006

Practical Synthesis of a Dithiane-Protected 3‘,5‘-Dialkoxybenzoin Photolabile Safety-Catch Linker for Solid-Phase Organic Synthesis ⬇️

artículo científico publicado el 11 de enero de 2002

Prevalence of quadruplexes in the human genome

artículo científico publicado en 2005

Promoter G-quadruplex folding precedes transcription and is controlled by chromatin

artículo científico publicado en 2021

Quantitative sequencing of 5-formylcytosine in DNA at single-base resolution

artículo científico publicado en 2014

Quantitative sequencing of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine at single-base resolution

artículo científico publicado en 2012

Quantitative visualization of DNA G-quadruplex structures in human cells

artículo científico publicado en 2013

Reprogramming the mechanism of action of chlorambucil by coupling to a G-quadruplex ligand

artículo científico publicado en 2014

Rigid cyanine dye nucleic acid labels

artículo científico publicado en 2008

Rudimentary G-quadruplex-based telomere capping in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2011

Selective Chemical Functionalization at N6-Methyladenosine Residues in DNA Enabled by Visible-Light-Mediated Photoredox Catalysis

scientific article published on 11 December 2020

Selective inhibitors of trypanosomal uridylyl transferase RET1 establish druggability of RNA post-transcriptional modifications

artículo científico publicado en 2016

Sequencing 5-Hydroxymethyluracil at Single-Base Resolution

scientific article published on 04 July 2018

Sequencing abasic sites in DNA at single-nucleotide resolution

artículo científico publicado en 2019

Sequencing nucleic acids: from chemistry to medicine ⬇️

artículo científico publicado el 4 de mayo de 2011

Single molecule conformational analysis of DNA G-quadruplexes

artículo científico publicado en 2008

Single molecule conformational analysis of the biologically relevant DNA G-quadruplex in the promoter of the proto-oncogene c-MYC.

artículo científico publicado en 2008

Single-molecule conformational analysis of G-quadruplex formation in the promoter DNA duplex of the proto-oncogene c-kit.

artículo científico publicado en 2007

Single-molecule visualization of DNA G-quadruplex formation in live cells

artículo científico publicado en 2020

Solid-phase synthesis of symmetrical 3,6-bispeptide-acridone conjugates

artículo científico publicado en 2002

Stimuli-responsive magnetic nanomicelles as multifunctional heat and cargo delivery vehicles

artículo científico publicado en 2013

Studies on the structure and dynamics of the human telomeric G quadruplex by single-molecule fluorescence resonance energy transfer

artículo científico publicado en 2003

Suppression of the FOXM1 transcriptional programme via novel small molecule inhibition

artículo científico publicado en 2014

Synthesis and biophysical analysis of modified thymine-containing DNA oligonucleotides

artículo científico publicado en 2017

Synthesis and hybridization analysis of a small library of peptide- oligonucleotide conjugates ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 1998

Synthesis of bis-indole carboxamides as G-quadruplex stabilizing and inducing ligands.

artículo científico publicado en 2011

Targeting DNA G-quadruplexes with helical small molecules

artículo científico publicado en 2014

Targeting G-quadruplexes in gene promoters: a novel anticancer strategy?

artículo científico publicado en 2011

Targeting RNA-protein interactions within the human immunodeficiency virus type 1 lifecycle

artículo científico publicado en 2013

Targeting multiple effector pathways in pancreatic ductal adenocarcinoma with a G-quadruplex-binding small molecule.

artículo científico publicado en 2018

The BCL-2 5′ Untranslated Region Contains an RNA G-Quadruplex-Forming Motif That Modulates Protein Expression ⬇️

artículo científico publicado el 28 de septiembre de 2010

The Kinetics and Folding Pathways of Intramolecular G-Quadruplex Nucleic Acids ⬇️

artículo científico publicado el 12 de noviembre de 2012

The Profile and Dynamics of RNA Modifications in Animals

artículo científico publicado en 2017

The regulation and functions of DNA and RNA G-quadruplexes

scientific article published on 20 April 2020

Triarylpyridines: a versatile small molecule scaffold for G-quadruplex recognition

artículo científico publicado en 2008

Trisubstituted isoalloxazines as a new class of G-quadruplex binding ligands: small molecule regulation of c-kit oncogene expression

artículo científico publicado en 2007

Ultrasensitive coincidence fluorescence detection of single DNA molecules

artículo científico publicado en 2003

Unusual Activity of a Chlamydomonas TET/JBP Family Enzyme

scientific article published on 22 August 2019

oxBS-450K: a method for analysing hydroxymethylation using 450K BeadChips.

artículo científico publicado en 2014

rG4-seq reveals widespread formation of G-quadruplex structures in the human transcriptome

artículo científico publicado en 2016

Studies on the reaction mechanism of chorismate synthase

tesis doctoral

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