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Lista de obras de Robert Gentleman

A Model-Based Background Adjustment for Oligonucleotide Expression Arrays

A graph-theoretic approach to testing associations between disparate sources of functional genomics data

artículo científico publicado en 2004

An extensible application for assembling annotation for genomic data

artículo científico publicado en 2003

An integrative genomic approach identifies p73 and p63 as activators of miR-200 microRNA family transcription

artículo científico publicado en 2011

Analyzing biological data using R: methods for graphs and networks

artículo científico publicado en 2012

Bayesian error-in-variable survival model for the analysis of GeneChip arrays.

artículo científico publicado en 2005

Circulating microRNAs as stable blood-based markers for cancer detection

artículo científico publicado en 2008

Complex regulation of ADAR-mediated RNA-editing across tissues

artículo científico publicado en 2016

Comprehensive genomic analysis identifies SOX2 as a frequently amplified gene in small-cell lung cancer

artículo científico publicado en 2012

Coverage and error models of protein-protein interaction data by directed graph analysis

artículo científico publicado en 2007

Creating a data resource: what will it take to build a medical information commons?

artículo científico publicado en 2017

DATABASE: A new forum for biological databases and curation

artículo científico publicado en 2009

Data quality assessment of ungated flow cytometry data in high throughput experiments

artículo científico publicado en 2007

Data structures and algorithms for analysis of genetics of gene expression with Bioconductor: GGtools 3.x.

artículo científico publicado en 2009

Declining plasma fibrinogen alpha fragment identifies HER2-positive breast cancer patients and reverts to normal levels after surgery

artículo científico publicado en 2006

Differential genomic targeting of the transcription factor TAL1 in alternate haematopoietic lineages

artículo científico publicado en 2011

Erratum: The anatomy of successful computational biology software

article

Estimating node degree in bait-prey graphs

article

Extensions to gene set enrichment

artículo científico publicado en 2006

GGtools: analysis of genetics of gene expression in bioconductor.

artículo científico publicado en 2006

Gene expression profile of adult T-cell acute lymphocytic leukemia identifies distinct subsets of patients with different response to therapy and survival.

artículo científico publicado en 2003

Gene expression profiles of B-lineage adult acute lymphocytic leukemia reveal genetic patterns that identify lineage derivation and distinct mechanisms of transformation

artículo científico publicado en 2005

Gene set enrichment analysis using linear models and diagnostics

artículo científico publicado en 2008

Graphs in molecular biology

artículo científico publicado en 2007

Independent filtering increases detection power for high-throughput experiments

artículo científico publicado en 2010

Knowledge based identification of essential signaling from genome-scale siRNA experiments

artículo científico publicado en 2009

Local modeling of global interactome networks

artículo científico publicado en 2005

Making sense of high-throughput protein-protein interaction data

artículo científico publicado en 2004

Making the most of high-throughput protein-interaction data

artículo científico publicado en 2007

MicroRNA discovery and profiling in human embryonic stem cells by deep sequencing of small RNA libraries

artículo científico publicado en 2008

Modeling synthetic lethality.

artículo científico publicado en 2008

Network structures and algorithms in Bioconductor

artículo científico publicado en 2004

Orchestrating high-throughput genomic analysis with Bioconductor

artículo científico publicado en 2015

Per-channel basis normalization methods for flow cytometry data

artículo científico publicado en 2010

Prediction and Quantification of Splice Events from RNA-Seq Data

artículo científico publicado en 2016

Querying genomic databases: refining the connectivity map.

artículo científico publicado en 2012

R

environment for statistical computing and graphics using the R programming language

R: A Language for Data Analysis and Graphics

scholarly article from 1996

Recurrent R-spondin fusions in colon cancer

artículo científico publicado en 2012

Reply to Talloen et al.: Independent filtering is a generic approach that needs domain specific adaptation

artículo científico publicado en 2010

Reproducible research: a bioinformatics case study

artículo científico

Resampling Methods

article

Rintact: enabling computational analysis of molecular interaction data from the IntAct repository

artículo científico publicado en 2007

ShortRead: a bioconductor package for input, quality assessment and exploration of high-throughput sequence data

artículo científico publicado en 2009

Software for computing and annotating genomic ranges

artículo científico publicado en 2013

The anatomy of successful computational biology software

artículo científico publicado en 2013

The graft response to transplantation: a gene expression profile analysis ⬇️

artículo científico publicado el 29 de septiembre de 2003

The mutation spectrum revealed by paired genome sequences from a lung cancer patient

artículo científico publicado en 2010

Top-down standards will not serve systems biology

artículo científico publicado en 2006

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

Towards BioDBcore: a community-defined information specification for biological databases

artículo científico publicado en 2011

VariantTools: an extensible framework for developing and testing variant callers

artículo científico publicado en 2017

Wavelet thresholding with bayesian false discovery rate control

artículo científico publicado en 2005

arrayQualityMetrics--a bioconductor package for quality assessment of microarray data

artículo científico publicado en 2008

flowCore: a Bioconductor package for high throughput flow cytometry

artículo científico publicado en 2009

gCMAP: user-friendly connectivity mapping with R.

artículo científico publicado en 2013

iFlow: A Graphical User Interface for Flow Cytometry Tools in Bioconductor

artículo científico publicado en 2009

rtracklayer: an R package for interfacing with genome browsers

artículo científico publicado en 2009

R

lenguaje de programación para el cálculo estadístico

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