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Lista de obras de Peter Willett

A Simulation Study of the Use of Similarity Fusion for Virtual Screening

artículo científico publicado en 2011

A bibliometric analysis of the Journal of Molecular Graphics and Modelling

artículo científico publicado en 2007

A bibliometric analysis of the Journal of Molecular Graphics and Modelling: An update

artículo científico publicado en 2022

A fourier fingerprint-based method for protein surface representation.

artículo científico publicado en 2005

A graph-theory method for pattern identification in geographical epidemiology--a preliminary application to deprivation and mortality

scientific article published on 13 May 2009

A sphere-based descriptor for matching protein structures

artículo científico publicado en 2002

A structural similarity analysis of double-helical DNA

artículo científico publicado en 2004

Academic communities

Alignment of three-dimensional molecules using an image recognition algorithm

artículo científico publicado en 2004

Analysis and display of the size dependence of chemical similarity coefficients

artículo científico publicado en 2003

Analysis and use of fragment-occurrence data in similarity-based virtual screening

artículo científico publicado en 2009

Analysis of data fusion methods in virtual screening: similarity and group fusion

artículo científico publicado en 2006

Analysis of data fusion methods in virtual screening: theoretical model

artículo científico publicado en 2006

Analysis of neighborhood behavior in lead optimization and array design

artículo científico publicado en 2009

Applications of n‐grams in textual information systems

Ask the experts: focus on computational chemistry

artículo científico publicado en 2011

Assessment of additive/nonadditive effects in structure-activity relationships: implications for iterative drug design

artículo científico publicado en 2008

Bibliometric analysis of Chinese research on cyclization, MALDI-TOF, and antibiotics.

artículo científico publicado en 2010

Bit-String Methods for Selective Compound Acquisition

artículo científico publicado en 2000

CLIP: similarity searching of 3D databases using clique detection

artículo científico publicado en 2003

COGNAC: a web server for searching and annotating hydrogen-bonded base interactions in RNA three-dimensional structures

artículo científico publicado en 2014

Calculating the knowledge-based similarity of functional groups using crystallographic data

artículo científico publicado en 2001

Calculation of intersubstituent similarity using R-group descriptors

artículo científico publicado en 2003

Calculation of substructural analysis weights using a genetic algorithm

artículo científico publicado en 2015

Chemical Similarity Searching

artículo científico publicado en 1998

Chemical graph matching using transputer networks

artículo científico publicado en 1988

Chemoinformatics - similarity and diversity in chemical libraries

artículo científico publicado en 2000

Chemoinformatics Research at the University of Sheffield: A History and Citation Analysis

Chemoinformatics Techniques for Processing Chemical Structure Databases

artículo científico publicado en 2006

Chemoinformatics at the University of Sheffield 2002-2014.

artículo científico publicado en 2015

Clustering files of chemical structures using the Székely-Rizzo generalization of Ward's method

artículo científico publicado en 2009

Clustering files of chemical structures using the fuzzy k-means clustering method

artículo científico publicado en 2004

Combination Rules for Group Fusion in Similarity-Based Virtual Screening

artículo científico publicado en 2010

Combination of fingerprint-based similarity coefficients using data fusion

artículo científico publicado en 2003

Combination of similarity rankings using data fusion

artículo científico publicado en 2013

Combinatorial library design using a multiobjective genetic algorithm

artículo científico publicado en 2002

Combining multiple classifications of chemical structures using consensus clustering

artículo científico publicado en 2012

Commentary: the first twelve years of the Journal of Cheminformatics

Comparison of Maximum Common Subgraph Isomorphism Algorithms for the Alignment of 2D Chemical Structures

artículo científico publicado en 2017

Comparison of US and UK rankings of LIS journals

Comparison of chemical clustering methods using graph- and fingerprint-based similarity measures

artículo científico publicado en 2003

Comparison of fingerprint-based methods for virtual screening using multiple bioactive reference structures

artículo científico publicado en 2004

Comparison of ranking methods for virtual screening in lead-discovery programs

artículo científico publicado en 2003

Comparison of topological descriptors for similarity-based virtual screening using multiple bioactive reference structures

artículo científico publicado en 2004

Computational methods for the analysis of molecular diversity

artículo científico publicado en 2002

Computer analysis of chemical reaction information for storage and retrieval ⬇️

PhD thesis of Prof. Peter Willet

Cross-Classified Multilevel Modelling of the Effectiveness of Similarity-Based Virtual Screening

artículo científico publicado en 2017

Designing focused libraries using MoSELECT.

artículo científico publicado en 2002

Development and validation of a genetic algorithm for flexible docking

artículo científico publicado en 1997

Effect of data standardization on chemical clustering and similarity searching

artículo científico publicado en 2009

Effectiveness of 2D Fingerprints for Scaffold Hopping ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2011

Effectiveness of graph-based and fingerprint-based similarity measures for virtual screening of 2D chemical structure databases

artículo científico publicado en 2002

Enhancing the Effectiveness of Virtual Screening by Fusing Nearest Neighbor Lists:  A Comparison of Similarity Coefficients

artículo científico publicado en 2004

Enhancing the effectiveness of similarity-based virtual screening using nearest-neighbor information

artículo científico publicado en 2005

Evaluation of a Bayesian inference network for ligand-based virtual screening

artículo científico publicado en 2009

Evaluation of machine-learning methods for ligand-based virtual screening

artículo científico publicado en 2007

Evaluation of molecular similarity and molecular diversity methods using biological activity data

artículo científico publicado en 2004

Evaluation of similarity measures for searching the dictionary of natural products database

artículo científico publicado en 2003

Evaluation of the EVA descriptor for QSAR studies: 3. The use of a genetic algorithm to search for models with enhanced predictive properties (EVA_GA).

artículo científico publicado en 2000

From chemical documentation to chemoinformatics: 50 years of chemical information science

artículo científico publicado en 2008

Fusing similarity rankings in ligand-based virtual screening

artículo científico publicado en 2013

GALAHAD: 1. pharmacophore identification by hypermolecular alignment of ligands in 3D.

artículo científico publicado en 2006

GAPDOCK: a Genetic Algorithm Approach to Protein Docking in CAPRI round 1.

artículo científico publicado en 2003

Generation and display of activity-weighted chemical hyperstructures

artículo científico publicado en 2003

Genetic algorithms in molecular recognition and design

artículo científico publicado en 1995

Genomic data analysis using DNA structure: an analysis of conserved nongenic sequences and ultraconserved elements

artículo científico publicado en 2006

Graph-theoretic techniques for macromolecular docking

artículo científico publicado en 2000

Guest editorial

Heuristics for similarity searching of chemical graphs using a maximum common edge subgraph algorithm

artículo científico publicado en 2002

IMAAAGINE: a webserver for searching hypothetical 3D amino acid side chain arrangements in the Protein Data Bank

artículo científico publicado en 2013

Identification of Diverse Database Subsets using Property-Based and Fragment-Based Molecular Descriptions

artículo científico publicado en 2002

Identification of target-specific bioisosteric fragments from ligand-protein crystallographic data

artículo científico publicado en 2006

Implementation of nearest-neighbor searching in an online chemical structure search system

artículo científico publicado en 2005

In memoriam: Karen Spärck Jones

Information Use, Information Needs, and Information Behavior of Graduate Students at Kuwait University ⬇️

artículo científico publicado en 2020

Introduction to three-dimensional chemical structure handling

artículo científico publicado en 1990

Inverse Frequency Weighting of Fragments for Similarity-Based Virtual Screening ⬇️

artículo científico publicado el 23 de agosto de 2010

Knowledge-based interaction fingerprint scoring: a simple method for improving the effectiveness of fast scoring functions

artículo científico publicado en 2006

Lead optimization using matched molecular pairs: inclusion of contextual information for enhanced prediction of HERG inhibition, solubility, and lipophilicity

artículo científico publicado en 2010

Ligand-based virtual screening using Bayesian networks

artículo científico publicado en 2010

Ligand-based virtual screening using binary kernel discrimination

Matching two-dimensional chemical graphs using genetic algorithms

artículo científico publicado en 1994

Maximum common subgraph isomorphism algorithms for the matching of chemical structures

artículo científico publicado en 2002

Maximum common substructure-based data fusion in similarity searching

artículo científico publicado en 2015

Measuring the spatial accuracy of the spatial scan statistic

artículo científico publicado en 2011

Mining for Context-Sensitive Bioisosteric Replacements in Large Chemical Databases

Molecular recognition of receptor sites using a genetic algorithm with a description of desolvation

artículo científico publicado en 1995

Molecular similarity considerations in the licensing of orphan drugs

artículo científico publicado en 2016

Motivations, understandings, and experiences of open-access mega-journal authors: Results of a large-scale survey

artículo científico publicado en 2019

Multiple search methods for similarity-based virtual screening: analysis of search overlap and precision

artículo científico publicado en 2011

NASSAM: a server to search for and annotate tertiary interactions and motifs in three-dimensional structures of complex RNA molecules ⬇️

artículo científico publicado en 2012

New methods for ligand-based virtual screening: use of data fusion and machine learning to enhance the effectiveness of similarity searching

artículo científico publicado en 2006

Novel base triples in RNA structures revealed by graph theoretical searching methods

artículo científico publicado en 2011

Open access megajournals: The publisher perspective (Part 1: Motivations)

Open access megajournals: The publisher perspective (Part 2: Operational realities)

scholarly article by Simon Wakeling et al published 4 September 2017 in Learned Publishing

Open-Access Mega-Journals: A Bibliometric Profile

artículo científico publicado en 2016

Open-access mega-journals

artículo científico publicado en 2017

Pattern Identification in Public Health Data Sets

article

Pharmacophoric pattern matching in files of three-dimensional chemical structures: implementation of flexible searching

artículo científico

Pharmacophoric pattern matching in files of three-dimensional chemical structures: use of bounded distance matrices for the representation and searching of conformationally flexible molecules

artículo científico publicado el 1 de diciembre de 1992

Pharmacophoric pattern matching in files of three-dimensional chemical structures: use of smoothed bounded distances for incompletely specified query patterns ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 1991

Prediction of ion channel activity using binary kernel discrimination.

artículo científico publicado en 2007

Readers' perceptions of authors' citation behaviour

Recent trends in hierarchic document clustering: A critical review

article

Representation, searching and discovery of patterns of bases in complex RNA structures

artículo científico publicado en 2003

Representing Clusters Using a Maximum Common Edge Substructure Algorithm Applied to Reduced Graphs and Molecular Graphs.

artículo científico publicado en 2007

Representing clusters using a maximum common edge substructure algorithm applied to reduced graphs and molecular graphs

artículo científico publicado en 2007

SPRITE and ASSAM: web servers for side chain 3D-motif searching in protein structures

artículo científico publicado en 2012

Scaffold hopping using clique detection applied to reduced graphs

artículo científico publicado en 2006

Searching for patterns of amino acids in 3D protein structures

artículo científico publicado en 2003

Searching techniques for databases of two- and three-dimensional chemical structures

artículo científico publicado en 2005

Sequence-dependent DNA structure: a database of octamer structural parameters

artículo científico publicado en 2003

Similarity Searching Using 2D Structural Fingerprints ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2011

Similarity Searching Using Reduced Graphs

artículo científico publicado en 2003

Similarity coefficients for binary chemoinformatics data: overview and extended comparison using simulated and real data sets

artículo científico publicado en 2012

Similarity searching in databases of flexible 3D structures using autocorrelation vectors derived from smoothed bounded distance matrices

artículo científico publicado en 2006

Similarity searching in databases of flexible 3D structures using smoothed bounded distance matrices

artículo científico publicado en 2003

Similarity-based approaches to virtual screening

artículo científico publicado en 2003

Similarity-based virtual screening using 2D fingerprints

artículo científico publicado en 2006

Special Issue: Chemoinformatics

artículo científico publicado en 2016

Structural DNA profiles: single sequence queries

scientific article published on 01 March 2006

Structural Search Codes for On-Line Compound Registration

artículo científico publicado en 1978

Structural resemblance between the families of bacterial signal-transduction proteins and of G proteins revealed by graph theoretical techniques

artículo científico publicado en 1990

Structural similarity between binding sites in influenza sialidase and isocitrate dehydrogenase: implications for an alternative approach to rational drug design

artículo científico publicado en 1994

Structure and singly occupied molecular orbital analysis of anionic tautomers of guanine

artículo científico publicado en 2008

SuperStar: improved knowledge-based interaction fields for protein binding sites

artículo científico publicado en 2001

Techniques for the calculation of three-dimensional structural similarity using inter-atomic distances ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1991

The Calculation of Molecular Structural Similarity: Principles and Practice

artículo científico publicado en 2014

The Information School at the University of Sheffield, 1963-2013

The Journal of Chemical Documentation and the Journal of Chemical Information and Computer Sciences: Publication and Citation Statistics ⬇️

artículo científico publicado el 14 de octubre de 2010

The Journal of Computer-Aided Molecular Design: a bibliometric note ⬇️

artículo científico publicado el 16 de noviembre de 2011

The Journal of Mathematical Chemistry: a bibliometric profile

The Literature of Chemoinformatics: 1978-2018

scientific article published on 04 August 2020

The use of 2D fingerprint methods to support the assessment of structural similarity in orphan drug legislation

artículo científico publicado en 2014

Transitioning from a Conventional to a ‘Mega’ Journal: A Bibliometric Case Study of the Journal Medicine

Turbo similarity searching: Effect of fingerprint and dataset on virtual-screening performance

artículo científico publicado en 2009

USING CHEMOINFORMATICS TOOLS TO ANALYZE CHEMICAL ARRAYS IN LEAD OPTIMIZATION

Unsupervised 3D ring template searching as an ideas generator for scaffold hopping: use of the LAMDA, RigFit, and field-based similarity search (FBSS) methods

scientific article published on 01 September 2006

Use of Reduced Graphs To Encode Bioisosterism for Similarity-Based Virtual Screening

artículo científico publicado en 2009

Use of a maximum common subgraph algorithm in the automatic identification of ostensible bond changes occurring in chemical reactions

artículo científico publicado en 1981

Use of graph theory to identify patterns of deprivation and high morbidity and mortality in public health data sets

artículo científico publicado en 2005

Virtual screening using binary kernel discrimination: analysis of pesticide data

artículo científico publicado en 2006

Virtual screening using binary kernel discrimination: effect of noisy training data and the optimization of performance

artículo científico publicado en 2006

“Let the community decide”? The vision and reality of soundness-only peer review in open-access mega-journals

article

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