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Lista de obras de Arian F. A. Smit

A Third Approach to Gene Prediction Suggests Thousands of Additional Human Transcribed Regions

article

A call for benchmarking transposable element annotation methods

artículo científico publicado en 2015

A novel abundant family of retroposed elements (DAS-SINEs) in the nine-banded armadillo (Dasypus novemcinctus).

artículo científico publicado en 2004

A third approach to gene prediction suggests thousands of additional human transcribed regions

artículo científico publicado en 2006

Analysis of genetic inheritance in a family quartet by whole-genome sequencing

artículo científico publicado en 2010

Author Correction: Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes

artículo científico publicado en 2022

Chromosomal haplotypes by genetic phasing of human families

artículo científico publicado en 2011

Comparative and demographic analysis of orang-utan genomes

artículo científico publicado en 2011

Covariation in frequencies of substitution, deletion, transposition, and recombination during eutherian evolution

artículo científico publicado en 2003

Curation Guidelines for de novo Generated Transposable Element Families

artículo científico publicado en 2021

Dfam: a database of repetitive DNA based on profile hidden Markov models

artículo científico publicado en 2013

Discovery of a new repeat family in the Callithrix jacchus genome

artículo científico publicado en 2016

DupMasker: a tool for annotating primate segmental duplications

artículo científico publicado en 2008

Evolution and gene capture in ancient endogenous retroviruses - insights from the crocodilian genomes

artículo científico publicado en 2014

Evolutionary and Biomedical Insights from the Rhesus Macaque Genome

artículo científico publicado en 2007

Evolutionary constraint and innovation across hundreds of placental mammals

artículo científico publicado en 2023

Functional noncoding sequences derived from SINEs in the mammalian genome

artículo científico publicado en 2006

Genome Organization

Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution

artículo científico publicado en 2008

Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution

artículo científico publicado en 2008

Genome sequence of the Brown Norway rat yields insights into mammalian evolution

artículo científico publicado en 2004

Genomic Analysis of the Olfactory Receptor Region of the Mouse and Human T-Cell Receptor α/δ Loci ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2002

Gibbon genome and the fast karyotype evolution of small apes

artículo científico publicado en 2014

Growth signals employ CGGBP1 to suppress transcription of Alu-SINEs ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Human-mouse alignments with BLASTZ

artículo científico publicado en 2003

Initial sequencing and analysis of the human genome

artículo científico publicado en 2001

Initial sequencing and comparative analysis of the mouse genome

artículo científico publicado en 2002

Insights into mammalian TE diversity through the curation of 248 genome assemblies ⬇️

Mobile DNA in Old World monkeys: a glimpse through the rhesus macaque genome

artículo científico publicado en 2007

Molecular evolution and tempo of amplification of human LINE-1 retrotransposons since the origin of primates.

artículo científico publicado en 2005

MultiPipMaker and supporting tools: Alignments and analysis of multiple genomic DNA sequences

artículo científico publicado en 2003

Multiple lineages of ancient CR1 retroposons shaped the early genome evolution of amniotes

artículo científico publicado en 2014

Multiscale representation of genomic signals

artículo científico publicado en 2014

Orangutan Alu quiescence reveals possible source element: support for ancient backseat drivers ⬇️

artículo científico publicado el 30 de abril de 2012

Patterns of insertions and their covariation with substitutions in the rat, mouse, and human genomes

scientific article published on April 2004

Realistic artificial DNA sequences as negative controls for computational genomics

artículo científico publicado en 2014

RepeatModeler2 for automated genomic discovery of transposable element families

scientific article published on 16 April 2020

Sequence and comparative analysis of the chicken genome provide unique perspectives on vertebrate evolution

artículo científico publicado en 2004

The Dfam community resource of transposable element families, sequence models, and genome annotations

artículo científico publicado en 2021

The Dfam database of repetitive DNA families

artículo científico publicado en 2015

The UCSC Genome Browser database: 2015 update

artículo científico publicado en 2014

The genome of a songbird

artículo científico publicado en 2010

The transposable element-rich genome of the cereal pest Sitophilus oryzae

artículo científico

Three crocodilian genomes reveal ancestral patterns of evolution among archosaurs

artículo científico publicado en 2014

Whole-Genome Shotgun Assembly and Analysis of the Genome of Fugu rubripes

artículo científico publicado en 2002

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