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Lista de obras de S. Joshua Swamidass

A CROC stronger than ROC: measuring, visualizing and optimizing early retrieval.

artículo científico publicado en 2010

A Time-Embedding Network Models the Ontogeny of 23 Hepatic Drug Metabolizing Enzymes

scientific article published on 29 July 2019

A simple model predicts UGT-mediated metabolism.

artículo científico publicado en 2016

An economic framework to prioritize confirmatory tests after a high-throughput screen.

artículo científico publicado en 2010

Automatically detecting workflows in PubChem.

artículo científico publicado en 2012

Bounds and algorithms for fast exact searches of chemical fingerprints in linear and sublinear time.

artículo científico publicado en 2007

CYP2C19 and 3A4 Dominate Metabolic Clearance and Bioactivation of Terbinafine Based on Computational and Experimental Approaches

scientific article published on 10 April 2019

ChemDB update--full-text search and virtual chemical space.

artículo científico publicado en 2007

Combined Analysis of Phenotypic and Target-Based Screening in Assay Networks.

artículo científico publicado en 2014

Computational Approach to Structural Alerts: Furans, Phenols, Nitroaromatics, and Thiophenes.

artículo científico publicado en 2017

Computationally Assessing the Bioactivation of Drugs by N-Dealkylation.

artículo científico publicado en 2018

Deep learning the structural determinants of protein biochemical properties by comparing structural ensembles with DiffNets

artículo científico publicado en 2021

Discovery of power-laws in chemical space.

artículo científico publicado en 2008

Drug repositioning from the combined evaluation of phenotypic and target-based screening

artículo científico publicado en 2013

Education: Initiatives to bridge faith and science.

artículo científico publicado en 2015

Enhancing the rate of scaffold discovery with diversity-oriented prioritization ⬇️

artículo científico publicado el 17 de junio de 2011

Extending P450 site-of-metabolism models with region-resolution data.

artículo científico publicado en 2015

Functional census of mutation sequence spaces: the example of p53 cancer rescue mutants.

artículo científico publicado en 2006

Improved Prediction of CYP-Mediated Metabolism with Chemical Fingerprints.

artículo científico publicado en 2015

Inhibition of DNA Methyltransferases Blocks Mutant Huntingtin-Induced Neurotoxicity

artículo científico publicado en 2016

Kernels for small molecules and the prediction of mutagenicity, toxicity and anti-cancer activity.

artículo científico publicado en 2005

Large scale study of multiple-molecule queries

artículo científico publicado en 2009

Managing missing measurements in small-molecule screens.

artículo científico publicado en 2013

Mining small-molecule screens to repurpose drugs.

artículo científico publicado en 2011

Modeling Epoxidation of Drug-like Molecules with a Deep Machine Learning Network.

artículo científico publicado en 2015

Modeling Small-Molecule Reactivity Identifies Promiscuous Bioactive Compounds

artículo científico publicado en 2018

One- to four-dimensional kernels for virtual screening and the prediction of physical, chemical, and biological properties.

artículo científico publicado en 2007

Opportunities and obstacles for deep learning in biology and medicine.

artículo científico publicado en 2018

RS-WebPredictor: a server for predicting CYP-mediated sites of metabolism on drug-like molecules.

artículo científico publicado en 2012

Scaffold network generator: a tool for mining molecular structures.

artículo científico publicado en 2013

Securely measuring the overlap between private datasets with cryptosets

artículo científico publicado en 2015

Sharing chemical relationships does not reveal structures

artículo científico publicado en 2013

Site of reactivity models predict molecular reactivity of diverse chemicals with glutathione.

artículo científico publicado en 2015

Site-Level Bioactivity of Small-Molecules from Deep-Learned Representations of Quantum Chemistry

artículo científico publicado en 2020

Statistically identifying tumor suppressors and oncogenes from pan-cancer genome-sequencing data

artículo científico publicado en 2015

Structure-based inhibitor design of AccD5, an essential acyl-CoA carboxylase carboxyltransferase domain of Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2006

The Genealogical Adam and Eve

2019 book by S. Joshua Swamidass

The Metabolic Rainbow: Deep Learning Phase I Metabolism in Five Colors

artículo científico publicado en 2020

Using Economic Optimization to Design High-Throughput Screens ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2013

Utility-aware screening with clique-oriented prioritization.

artículo científico publicado en 2011

XenoSite server: a web-available site of metabolism prediction tool

artículo científico publicado en 2014

XenoSite: accurately predicting CYP-mediated sites of metabolism with neural networks.

artículo científico publicado en 2013

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