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Lista de obras de Ronan Mt Fleming

3D Cultures of Parkinson's Disease-Specific Dopaminergic Neurons for High Content Phenotyping and Drug Testing

artículo científico publicado en 2018

A community effort towards a knowledge-base and mathematical model of the human pathogen Salmonella Typhimurium LT2

artículo científico publicado en 2011

A community-driven global reconstruction of human metabolism. ⬇️

artículo científico publicado en 2013

A constraint-based modelling approach to metabolic dysfunction in Parkinson's disease

artículo científico publicado en 2015

A systems approach reveals distinct metabolic strategies among the NCI-60 cancer cell lines

artículo científico

A systems biology approach to drug targets in Pseudomonas aeruginosa biofilm

artículo científico publicado en 2012

A systems biology approach to studying the role of microbes in human health.

artículo científico publicado en 2012

A variational principle for computing nonequilibrium fluxes and potentials in genome-scale biochemical networks.

artículo científico publicado en 2011

Automated microfluidic cell culture of stem cell derived dopaminergic neurons

artículo científico publicado en 2019

CHRR: coordinate hit-and-run with rounding for uniform sampling of constraint-based models.

artículo científico publicado en 2017

Cardinality optimization in constraint-based modelling: application to human metabolism

artículo científico publicado en 2023

Community-driven roadmap for integrated disease maps

artículo científico publicado en 2018

Comparative evaluation of atom mapping algorithms for balanced metabolic reactions: application to Recon 3D.

artículo científico publicado en 2017

Comparative evaluation of open source software for mapping between metabolite identifiers in metabolic network reconstructions: application to Recon 2

artículo científico publicado en 2014

Conditions for duality between fluxes and concentrations in biochemical networks

artículo científico publicado en 2016

Creation and analysis of biochemical constraint-based models using the COBRA Toolbox v.3.0.

scientific article published on 01 March 2019

Derivation of Human Midbrain-Specific Organoids from Neuroepithelial Stem Cells

artículo científico publicado en 2017

DistributedFBA.jl: high-level, high-performance flux balance analysis in Julia.

artículo científico publicado en 2017

Do genome-scale models need exact solvers or clearer standards?

artículo científico publicado en 2015

Embryonic development of selectively vulnerable neurons in Parkinson's disease.

artículo científico publicado en 2017

Generation of genome-scale metabolic reconstructions for 773 members of the human gut microbiota.

artículo científico publicado en 2016

Genome-scale reconstruction of Escherichia coli's transcriptional and translational machinery: a knowledge base, its mathematical formulation, and its functional characterization

artículo científico publicado en 2009

Identification of Conserved Moieties in Metabolic Networks by Graph Theoretical Analysis of Atom Transition Networks ⬇️

artículo científico publicado en 2016

Integrated Analyses of Microbiome and Longitudinal Metabolome Data Reveal Microbial-Host Interactions on Sulfur Metabolism in Parkinson's Disease

artículo científico publicado en 2019

LC-MS/MS analysis of the central energy and carbon metabolites in biological samples following derivatization by dimethylaminophenacyl bromide

scientific article published on 31 July 2019

MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing

artículo científico publicado en 2020

MetaboTools: A Comprehensive Toolbox for Analysis of Genome-Scale Metabolic Models

artículo científico publicado en 2016

Modeling the effects of commonly used drugs on human metabolism

artículo científico publicado en 2014

Monitoring metabolites consumption and secretion in cultured cells using ultra-performance liquid chromatography quadrupole-time of flight mass spectrometry (UPLC-Q-ToF-MS).

artículo científico publicado en 2011

Personalized whole-body models integrate metabolism, physiology, and the gut microbiome

artículo científico publicado en 2020

Prediction of intracellular metabolic states from extracellular metabolomic data

artículo científico publicado en 2014

Publisher Correction: MEMOTE for standardized genome-scale metabolic model testing

artículo científico publicado en 2020

Quantitative assignment of reaction directionality in a multicompartmental human metabolic reconstruction.

artículo científico publicado en 2012

Quantitative assignment of reaction directionality in constraint-based models of metabolism: application to Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

Quantitative prediction of cellular metabolism with constraint-based models: the COBRA Toolbox v2.0

artículo científico publicado en 2011

Recon3D enables a three-dimensional view of gene variation in human metabolism.

artículo científico publicado en 2018

ReconMap: an interactive visualization of human metabolism

artículo científico publicado en 2016

Reply to "Challenges in modeling the human gut microbiome"

scientific article published on 01 August 2018

Robust flux balance analysis of multiscale biochemical reaction networks.

artículo científico publicado en 2013

The Virtual Metabolic Human database: integrating human and gut microbiome metabolism with nutrition and disease

artículo científico publicado en 2019

Whole-body metabolic modelling predicts isoleucine dependency of SARS-CoV-2 replication

scientific article published in 2022

fastGapFill: efficient gap filling in metabolic networks

artículo científico publicado en 2014

von Bertalanffy 1.0: a COBRA toolbox extension to thermodynamically constrain metabolic models

artículo científico publicado en 2010

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