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Lista de obras de Ken A. Dill

A Simple Model of Water and the Hydrophobic Effect

artículo científico publicado en 1998

A View of the Hydrophobic Effect

A View of the Hydrophobic Effect

A fast conformational search strategy for finding low energy structures of model proteins

artículo científico publicado en 1996

A grammatical theory for the conformational changes of simple helix bundles

artículo científico publicado en 2006

A kinematic view of loop closure

artículo científico publicado en 2004

A lattice statistical mechanics model of the conformational and sequence spaces of proteins

artículo científico publicado en 1989

A maximum entropy framework for nonexponential distributions ⬇️

artículo científico publicado en 2013

A method for parameter optimization in computational biology

artículo científico publicado en 2000

A microscopic theory of solvation of monoions.

artículo científico publicado en 2012

A path planning-based study of protein folding with a case study of hairpin formation in protein G and L.

artículo científico publicado en 2003

A rhelogical separator for very large DNA molecules ⬇️

artículo científico publicado el 10 de octubre de 1979

A simple analytical model of water.

artículo científico publicado en 2003

A simple model of chaperonin-mediated protein folding

artículo científico publicado en 1996

A simple protein folding algorithm using a binary code and secondary structure constraints.

artículo científico publicado en 1995

A statistical mechanical model for hydrogen exchange in globular proteins

artículo científico publicado en 1995

A statistical mechanical theory for a two-dimensional model of water

artículo científico publicado en 2010

A test of lattice protein folding algorithms

artículo científico publicado en 1995

A test on peptide stability of AMBER force fields with implicit solvation

artículo científico publicado en 2008

A two-dimensional model of water: Solvation of nonpolar solutes

article

A two-dimensional model of water: Theory and computer simulations

article

Accelerating Molecular Dynamics Enrichments of High-Affinity Ligands for Proteins

artículo científico publicado en 2021

Accelerating Protein Folding Molecular Dynamics Using Inter-Residue Distances from Machine Learning Servers

artículo científico publicado en 2022

Accelerating molecular simulations of proteins using Bayesian inference on weak information.

artículo científico publicado en 2015

Accelerating physical simulations of proteins by leveraging external knowledge.

artículo científico publicado en 2017

Adapting the semi-explicit assembly solvation model for estimating water-cyclohexane partitioning with the SAMPL5 molecules.

artículo científico publicado en 2016

Additivity principles in biochemistry

artículo científico publicado en 1997

Advances in free-energy-based simulations of protein folding and ligand binding.

artículo científico publicado en 2016

Aggregation and denaturation of apomyoglobin in aqueous urea solutions

artículo científico publicado en 1993

An improved thermodynamic perturbation theory for Mercedes-Benz water.

artículo científico publicado en 2007

An iterative method for extracting energy-like quantities from protein structures.

artículo científico publicado en 1996

Analytical theory of the hydrophobic effect of solutes in water

artículo científico publicado en 2017

Aqueous alkali halide solutions: can osmotic coefficients be explained on the basis of the ionic sizes alone?

artículo científico publicado en 2010

Are proteins well-packed?

artículo científico publicado en 2001

Assessment of protein structure refinement in CASP9.

artículo científico publicado en 2011

Assessment of the protein-structure refinement category in CASP8

artículo científico publicado en 2009

Autobiography of Ken A. Dill

scientific article published on 01 May 2018

Automatic discovery of metastable states for the construction of Markov models of macromolecular conformational dynamics

artículo científico publicado en 2007

Bacterial growth laws reflect the evolutionary importance of energy efficiency

artículo científico publicado en 2014

Bacterial proteostasis balances energy and chaperone utilization efficiently

artículo científico publicado en 2017

Binding of ionic ligands to polyelectrolytes

artículo científico publicado en 1996

Binding of small-molecule ligands to proteins: "what you see" is not always "what you get".

scientific article published on April 2009

Biomimetic nanostructures: creating a high-affinity zinc-binding site in a folded nonbiological polymer

scientific article published on July 2008

Biophysics. Introduction

artículo científico publicado en 2013

Blind Prediction of Charged Ligand Binding Affinities in a Model Binding Site

artículo científico publicado en 2013

Blind protein structure prediction using accelerated free-energy simulations

artículo científico publicado en 2016

Blind test of physics-based prediction of protein structures.

artículo científico publicado en 2009

Building Markov State Models Using Optimal Transport Theory

Building Markov state models using optimal transport theory

scientific article published on 01 February 2019

Calculating the binding free energies of charged species based on explicit-solvent simulations employing lattice-sum methods: an accurate correction scheme for electrostatic finite-size effects

artículo científico publicado en 2013

Calculating the sensitivity and robustness of binding free energy calculations to force field parameters

scientific article published on July 2013

Caliber Corrected Markov Modeling (C2M2): Correcting Equilibrium Markov Models.

artículo científico publicado en 2018

Cellular Proteomes Have Broad Distributions of Protein Stability ⬇️

artículo científico publicado el 15 de diciembre de 2010

Chain molecules at high densities at interfaces

artículo científico publicado en 1988

Charge asymmetries in hydration of polar solutes.

artículo científico publicado en 2008

Charge effects on folded and unfolded proteins

artículo científico publicado en 1990

Chiral N-substituted glycines can form stable helical conformations ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1997

ClusPro in rounds 38 to 45 of CAPRI: Toward combining template-based methods with free docking

scientific article published on 06 March 2020

Colleagues of Ken A. Dill

scientific article published on 01 May 2018

Communication: Maximum caliber is a general variational principle for nonequilibrium statistical mechanics ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Comparing folding codes for proteins and polymers

artículo científico publicado en 1996

Comparison of Charge Models for Fixed-Charge Force Fields: Small Molecule Hydration Free Energies in Explicit Solvent

Comparison of charge models for fixed-charge force fields: small-molecule hydration free energies in explicit solvent.

artículo científico publicado en 2007

Comprehensive analysis of protein folding activation thermodynamics reveals a universal behavior violated by kinetically stable proteases

artículo científico publicado en 2005

Computed Binding of Peptides to Proteins with MELD-Accelerated Molecular Dynamics

artículo científico publicado en 2017

Computer Simulations of Ionenes, Hydrophobic Ions with Unusual Solution Thermodynamic Properties. The Ion-Specific Effects

article published in 2009

Computing ligands bound to proteins using MELD-accelerated MD

scientific article published on 10 September 2020

Computing protein stabilities from their chain lengths

scientific article published on 17 June 2009

Computing the relative stabilities and the per-residue components in protein conformational changes.

artículo científico publicado en 2013

Computing the transition state populations in simple protein models

artículo científico publicado en 2003

Confined water: a Mercedes-Benz model study

artículo científico publicado en 2006

Constraint methods that accelerate free-energy simulations of biomolecules

artículo científico publicado en 2015

Constraint-based assembly of tertiary protein structures from secondary structure elements

artículo científico publicado en 2000

Controlling the viscosities of antibody solutions through control of their binding sites

scientific article published on 21 November 2017

Cooperativity in protein-folding kinetics ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 1993

Cooperativity in two-state protein folding kinetics.

artículo científico publicado en 2004

Correction to Small Molecule Hydration Free Energies in Explicit Solvent: An Extensive Test of Fixed-Charge Atomistic Simulations

artículo científico publicado en 2015

Correction: Folding Very Short Peptides Using Molecular Dynamics.

artículo científico publicado en 2006

Cryo-EM model validation recommendations based on outcomes of the 2019 EMDataResource challenge

artículo científico publicado en 2021

De novo structure prediction and experimental characterization of folded peptoid oligomers.

artículo científico publicado en 2012

Decisions in force field development: an alternative to those described by Roterman et al. (J. Biomol. Struct. Dyn. 7, 421 (1989)).

artículo científico publicado en 1991

Denatured states of proteins

scientific article published on January 1991

Designing amino acid sequences to fold with good hydrophobic cores

artículo científico publicado en 1995

Designing polymers that mimic biomolecules

artículo científico publicado en 1999

Determining protein structures by combining semireliable data with atomistic physical models by Bayesian inference

artículo científico publicado en 2015

Development of an optimized activatable MMP-14 targeted SPECT imaging probe.

artículo científico publicado en 2008

Diet modulates brain network stability, a biomarker for brain aging, in young adults

artículo científico publicado en 2020

Does compactness induce secondary structure in proteins? A study of poly-alanine chains computed by distance geometry

artículo científico publicado en 1994

Dominant forces in protein folding

artículo científico publicado en 1990

Dynamical fluctuations in biochemical reactions and cycles ⬇️

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 2010

Electrostatics and aggregation: how charge can turn a crystal into a gel.

artículo científico publicado en 2011

Explicit-water molecular dynamics study of a short-chain 3,3 ionene in solutions with sodium halides

artículo científico publicado en 2009

Exploring zipping and assembly as a protein folding principle

artículo científico publicado en 2007

Extracting Conformational Memory from Single-Molecule Kinetic Data ⬇️

artículo científico publicado el 9 de enero de 2013

Extracting representative structures from protein conformational ensembles.

artículo científico publicado en 2014

Families and the structural relatedness among globular proteins

artículo científico publicado en 1993

Fast protein folding kinetics

scientific article published on 20 October 2003

Fast-folding protein kinetics, hidden intermediates, and the sequential stabilization model

artículo científico publicado en 2002

Field-SEA: a model for computing the solvation free energies of nonpolar, polar, and charged solutes in water

artículo científico publicado en 2013

FlexE: Using elastic network models to compare models of protein structure.

artículo científico publicado en 2012

Fluorescence and kinetic studies on the divalent metal ion induced conformational changes in DNase a ⬇️

artículo científico publicado el 10 de junio de 1981

Foldamer hypothesis for the growth and sequence differentiation of prebiotic polymers

artículo científico publicado en 2017

Folding a nonbiological polymer into a compact multihelical structure

artículo científico publicado en 2005

Folding and binding

artículo científico publicado en 1996

Folding kinetics of two-state proteins: effect of circularization, permutation, and crosslinks.

artículo científico publicado en 2003

Folding proteins with a simple energy function and extensive conformational searching

artículo científico publicado en 1996

Folding rates and low-entropy-loss routes of two-state proteins.

artículo científico publicado en 2003

Folding very short peptides using molecular dynamics

artículo científico publicado en 2006

Forces of tertiary structural organization in globular proteins

artículo científico publicado en 1995

Frequency dependence of NMR spin lattice relaxation in bilayer membranes

From Levinthal to pathways to funnels

artículo científico publicado en 1997

General mechanism of two-state protein folding kinetics

artículo científico publicado en 2014

Great organizing principles

artículo científico publicado en 1996

Grid-based backbone correction to the ff12SB protein force field for implicit-solvent simulations

artículo científico publicado en 2015

Growth rates of protein crystals

artículo científico publicado en 2012

Hierarchy of anomalies in the two-dimensional Mercedes-Benz model of water

scientific article published on 11 September 2018

Highly Charged Proteins: The Achilles' Heel of Aging Proteomes

artículo científico publicado en 2015

How Do Cells Adapt? Stories Told in Landscapes

artículo científico publicado en 2020

How Do Chaperones Protect a Cell's Proteins from Oxidative Damage?

artículo científico publicado en 2018

How Water's Properties Are Encoded in Its Molecular Structure and Energies.

artículo científico publicado en 2017

How ions affect the structure of water

artículo científico publicado en 2002

Hydrogen bonding in globular proteins

artículo científico publicado el 20 de agosto de 1992

In silico selection of therapeutic antibodies for development: viscosity, clearance, and chemical stability

artículo científico publicado en 2014

Incorporation of chemoselective functionalities into peptoids via solid-phase submonomer synthesis

artículo científico publicado en 2004

Inferring Microscopic Kinetic Rates from Stationary State Distributions

artículo científico publicado en 2014

Inferring Transition Rates of Networks from Populations in Continuous-Time Markov Processes

artículo científico publicado en 2015

Inferring a network from dynamical signals at its nodes

artículo científico publicado en 2020

Interphases of chain molecules: Monolayers and lipid bilayer membranes

artículo científico publicado en 1980

Inverse protein folding problem: designing polymer sequences

artículo científico publicado en 1992

Ion pairing in molecular simulations of aqueous alkali halide solutions

artículo científico publicado en 2009

Ion pairing in molecular simulations of aqueous alkali halide solutions

artículo científico publicado en 2009

Iterative assembly of helical proteins by optimal hydrophobic packing.

artículo científico publicado en 2008

Lateral interactions among phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine head groups in phospholipid monolayers and bilayers ⬇️

artículo científico publicado el 3 de mayo de 1988

Ligand binding to proteins: The binding landscape model ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1997

Local and nonlocal interactions in globular proteins and mechanisms of alcohol denaturation

artículo científico publicado en 1993

Long‐Time Protein Folding Dynamics from Short‐Time Molecular Dynamics Simulations

article

MELD x MD Folds Nonthreadables, Giving Native Structures and Populations

scientific article published on 21 November 2018

MELD-Path Efficiently Computes Conformational Transitions, Including Multiple and Diverse Paths

artículo científico publicado en 2018

MOPED: method for optimizing physical energy parameters using decoys.

artículo científico publicado en 2003

Markov processes follow from the principle of maximum caliber ⬇️

artículo científico publicado el 14 de febrero de 2012

Maximum Caliber: a variational approach applied to two-state dynamics

artículo científico publicado en 2008

Measuring flux distributions for diffusion in the small-numbers limit

artículo científico publicado en 2007

Mechanisms for achieving high speed and efficiency in biomolecular machines

artículo científico publicado en 2019

Minimal constraints for maximum caliber analysis of dissipative steady-state systems

scientific article published on 01 July 2019

Modeling Hofmeister Effects.

artículo científico publicado en 2009

Modeling Stochastic Dynamics in Biochemical Systems with Feedback Using Maximum Caliber ⬇️

artículo científico publicado el 27 de abril de 2011

Modeling aqueous solvation with semi-explicit assembly ⬇️

artículo científico publicado el 7 de febrero de 2011

Modeling beta-sheet peptide-protein interactions: Rosetta FlexPepDock in CAPRI rounds 38-45

artículo científico publicado en 2019

Modeling compact denatured states of proteins

scientific article published on 01 May 1994

Modeling protein stability as heteropolymer collapse.

artículo científico publicado en 1995

Modeling the Overproduction of Ribosomes when Antibacterial Drugs Act on Cells

artículo científico publicado en 2016

Modeling the effects of mutations on the denatured states of proteins ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 1992

Modeling the solvation of nonpolar amino acids in guanidinium chloride solutions

artículo científico publicado en 2014

Modeling water, the hydrophobic effect, and ion solvation

artículo científico publicado en 2005

Models of cooperativity in protein folding

artículo científico publicado en 1995

Molecular Motors: Power Strokes Outperform Brownian Ratchets

artículo científico publicado en 2016

Molecular Simulations Find Stable Structures in Fragments of Protein G.

artículo científico publicado en 2008

Molecular Simulations Identify Binding Poses and Approximate Affinities of Stapled α-Helical Peptides to MDM2 and MDMX.

artículo científico publicado en 2017

Molecular organization in micelles and vesicles

artículo científico publicado en 1981

Monte Carlo on the manifold and MD refinement for binding pose prediction of protein-ligand complexes: 2017 D3R Grand Challenge

scientific article published on 12 November 2018

NMR determination of the major solution conformation of a peptoid pentamer with chiral side chains ⬇️

artículo científico publicado el 14 de abril de 1998

NMR-assisted protein structure prediction with MELDxMD

scientific article published on 08 August 2019

Native protein fluctuations: the conformational-motion temperature and the inverse correlation of protein flexibility with protein stability

artículo científico publicado en 1998

Nonadditive entropies yield probability distributions with biases not warranted by the data.

artículo científico publicado en 2013

Nonuniversal power law scaling in the probability distribution of scientific citations

artículo científico publicado en 2010

Oil/water transfer is partly driven by molecular shape, not just size

artículo científico publicado en 2010

On the use of orientational restraints and symmetry corrections in alchemical free energy calculations

artículo científico publicado en 2006

Opposing Pressures of Speed and Efficiency Guide the Evolution of Molecular Machines

scientific article published on 01 December 2019

Origins of structure in globular proteins

artículo científico publicado en 1990

Peptoid conformational free energy landscapes from implicit-solvent molecular simulations in AMBER.

artículo científico publicado en 2011

Perspective: Maximum caliber is a general variational principle for dynamical systems.

artículo científico publicado en 2018

Phi values in protein-folding kinetics have energetic and structural components.

artículo científico publicado en 2005

Phospholipid interactions in model membrane systems. I. Experiments on monolayers

artículo científico publicado en 1992

Phospholipid interactions in model membrane systems. II. Theory

artículo científico publicado en 1992

Physical Modeling of Aqueous Solvation

artículo científico publicado en 2011

Physical limits of cells and proteomes ⬇️

artículo científico publicado el 17 de octubre de 2011

Polymer principles and protein folding

artículo científico publicado en 1999

Polymer principles in protein structure and stability.

artículo científico publicado en 1991

Potential of mean force between two hydrophobic solutes in water

artículo científico publicado en 2002

Predicting Ligand Binding Affinity with Alchemical Free Energy Methods in a Polar Model Binding Site

artículo científico publicado en 2009

Predicting Protein Dimer Structures Using MELD × MD

scientific article published on 05 April 2019

Predicting absolute ligand binding free energies to a simple model site

artículo científico publicado en 2007

Predicting conformational switches in proteins

artículo científico publicado en 1999

Predicting peptide structures in native proteins from physical simulations of fragments

artículo científico publicado en 2009

Predicting the structures of 18 peptides using Geocore

artículo científico publicado en 1999

Predictions of hydration free energies from all-atom molecular dynamics simulations.

artículo científico publicado en 2009

Preface: Special Topic on Coarse Graining of Macromolecules, Biopolymers, and Membranes.

artículo científico publicado en 2015

Principles of protein folding--a perspective from simple exact models.

artículo científico publicado en 1995

Probing antibody internal dynamics with fluorescence anisotropy and molecular dynamics simulations

artículo científico publicado en 2013

Protein Structure and Energy Landscape Dependence on Sequence Using a Continuous Energy Function ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1997

Protein aggregation in salt solutions

artículo científico publicado en 2015

Protein evolution speed depends on its stability and abundance and on chaperone concentrations

article published in the Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Protein folding by zipping and assembly

artículo científico publicado en 2007

Protein folding in the landscape perspective: Chevron plots and non-arrhenius kinetics ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

Protein stability: electrostatics and compact denatured states

scientific article published on May 1991

Protein storytelling through physics

artículo científico publicado en 2020

Protein surgery.

artículo científico publicado en 1987

Proteostasis collapse is a driver of cell aging and death

scientific article published on 16 October 2019

Proteostasis is adaptive: Balancing chaperone holdases against foldases

artículo científico publicado en 2020

RNA folding energy landscapes.

artículo científico publicado en 2000

Receptacle Model of Salting-In by Tetramethylammonium Ions ⬇️

artículo científico publicado el 28 de octubre de 2010

Reply to C. Tsallis’ “Conceptual Inadequacy of the Shore and Johnson Axioms for Wide Classes of Complex Systems”

artículo científico publicado en 2015

Reply to Vazquez: Optimal density is robust to variations in calculation.

artículo científico publicado en 2012

Response to “Comment on ‘The Mechanism of Hydrophobic Solvation Depends on Solute Radius',J.Phys. Chem. B2000,104, 1326”

article

Retention mechanisms of reversed-phase liquid chromatography: determination of solute-solvent interaction free energies

scientific article published on 01 November 1989

Role of Proteome Physical Chemistry in Cell Behavior

artículo científico publicado en 2016

Rotational superposition and least squares: the SVD and quaternions approaches yield identical results. Reply to the preceding comment by G. Kneller

artículo científico publicado en 2005

Routes are trees: the parsing perspective on protein folding.

artículo científico publicado en 2007

Sampling and refinement protocols for template-based macrocycle docking: 2018 D3R Grand Challenge 4

artículo científico publicado en 2019

Selected Publications of Ken A. Dill

scientific article published on 01 May 2018

Separated topologies--a method for relative binding free energy calculations using orientational restraints

artículo científico publicado en 2013

Sequence-specific polypeptoids: A diverse family of heteropolymers with stable secondary structure ⬇️

artículo científico publicado el 14 de abril de 1998

Sequence-structure relationships in proteins and copolymers

artículo científico publicado en 1993

Side-chain entropy and packing in proteins

artículo científico publicado en 1994

Simple Model of Hydrophobic Hydration ⬇️

artículo científico publicado el 21 de mayo de 2012

Simple liquid models with corrected dielectric constants

artículo científico publicado en 2012

Simulated Evolution of Protein-Protein Interaction Networks with Realistic Topology ⬇️

artículo científico publicado el 29 de junio de 2012

Single molecule conformational memory extraction: p5ab RNA hairpin

artículo científico publicado en 2014

Small molecule hydration free energies in explicit solvent: An extensive test of fixed-charge atomistic simulations

artículo científico publicado en 2009

Small molecule solvation changes due to the presence of salt are governed by the cost of solvent cavity formation and dispersion.

artículo científico publicado en 2014

Solute partitioning into lipid bilayer membranes

artículo científico publicado en 1988

Solvation: how to obtain microscopic energies from partitioning and solvation experiments ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1997

Solvent denaturation and stabilization of globular proteins

artículo científico publicado en 1991

Stabilization of Proteins in Confined Spaces†

scientific article published on 01 September 2001

Statistical mechanics of helix bundles using a dynamic programming approach.

artículo científico publicado en 2007

Statistical potentials extracted from protein structures: how accurate are they?

artículo científico publicado en 1996

Stochastic innovation as a mechanism by which catalysts might self-assemble into chemical reaction networks

artículo científico publicado en 2007

Strengthening biomedicine's roots

artículo científico publicado en 1999

Structural and Spectroscopic Studies of Peptoid Oligomers with α-Chiral Aliphatic Side Chains ⬇️

artículo científico publicado el 5 de noviembre de 2003

Surfaces affect ion pairing

artículo científico publicado en 2005

TRIFORCE: Tessellated Semianalytical Solvent Exposed Surface Areas and Derivatives

artículo científico publicado en 2014

Teaching the principles of statistical dynamics ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2006

Temperature dependence of retention in reversed-phase liquid chromatography. 2. Mobile-phase considerations

artículo científico publicado en 1992

Testing the semi-explicit assembly model of aqueous solvation in the SAMPL4 challenge

scientific article published on 29 January 2014

Testing the semi-explicit assembly solvation model in the SAMPL3 community blind test ⬇️

artículo científico publicado el 29 de diciembre de 2011

The Confine-and-Release Method: Obtaining Correct Binding Free Energies in the Presence of Protein Conformational Change

artículo científico publicado en 2007

The Maximum Caliber Variational Principle for Nonequilibria

artículo científico publicado en 2020

The Mechanism of Hydrophobic Solvation Depends on Solute Radius

The Protein-Folding Problem, 50 Years On ⬇️

artículo científico publicado el 23 de noviembre de 2012

The chain conformations in membranes and micelles

artículo científico publicado en 1986

The effect of multiple binding modes on empirical modeling of ligand docking to proteins

artículo científico publicado en 1999

The elastic net algorithm and protein structure prediction.

artículo científico publicado en 2002

The flexibility in the proline ring couples to the protein backbone

artículo científico publicado en 2005

The meaning of hydrophobicity

artículo científico publicado en 1990

The protein folding problem

artículo científico publicado en 2008

The protein folding problem: when will it be solved?

artículo científico publicado en 2007

The stabilities of protein crystals

artículo científico publicado en 2010

The three states of globular proteins: acid denaturation

artículo científico publicado en 1991

The ultimate speed limit to protein folding is conformational searching

artículo científico publicado en 2007

Theory for protein folding cooperativity: helix bundles

artículo científico publicado en 2009

Theory for protein mutability and biogenesis

artículo científico publicado en 1990

Theory for the folding and stability of globular proteins

artículo científico publicado en 1985

Theory for the separation of very large DNA molecules by radial migration

artículo científico publicado en 1979

Theory for the solvation of nonpolar solutes in water

artículo científico publicado en 2007

Theory for the three-dimensional Mercedes-Benz model of water

artículo científico publicado en 2009

Thermal stabilities of globular proteins

artículo científico publicado en 1989

Trajectory approach to two-state kinetics of single particles on sculpted energy landscapes

artículo científico publicado en 2009

Transition states and the meaning of Phi-values in protein folding kinetics

artículo científico publicado en 2001

Transition-states in protein folding kinetics: the structural interpretation of Phi values

scientific article published on 28 October 2006

Treating entropy and conformational changes in implicit solvent simulations of small molecules

artículo científico publicado en 2008

Use of the Weighted Histogram Analysis Method for the Analysis of Simulated and Parallel Tempering Simulations

artículo científico publicado en 2007

Using interpolation for fast and accurate calculation of ion-ion interactions

artículo científico publicado en 2014

Using motion planning to map protein folding landscapes and analyze folding kinetics of known native structures

artículo científico publicado en 2003

Using quaternions to calculate RMSD

artículo científico publicado en 2004

Water Is a Cagey Liquid ⬇️

artículo científico publicado en 2018

Water's hydrogen bonds in the hydrophobic effect: a simple model

artículo científico publicado en 2005

What drives amyloid molecules to assemble into oligomers and fibrils?

artículo científico publicado en 2011

Why Do Fast-Growing Bacteria Enter Overflow Metabolism? Testing the Membrane Real Estate Hypothesis

artículo científico publicado en 2017

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