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Lista de obras de Dirk Gevers

A Microbiome Foundation for the Study of Crohn's Disease

artículo científico publicado en 2017

A catalog of reference genomes from the human microbiome

artículo científico publicado en 2010

A metagenomic approach to characterization of the vaginal microbiome signature in pregnancy

artículo científico publicado en 2012

A novel Ruminococcus gnavus clade enriched in inflammatory bowel disease patients

artículo científico publicado en 2017

Advancing the microbiome research community

artículo científico publicado en 2014

Alterations in oral bacterial communities are associated with risk factors for oral and oropharyngeal cancer

artículo científico publicado en 2017

Application of multilocus sequence analysis (MLSA) for rapid identification of Enterococcus species based on rpoA and pheS genes

artículo científico publicado en 2005

Associations between host gene expression, the mucosal microbiome, and clinical outcome in the pelvic pouch of patients with inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2015

Biogeography of the intestinal mucosal and lumenal microbiome in the rhesus macaque

artículo científico publicado en 2015

Bioinformatics for the Human Microbiome Project

artículo científico publicado en 2012

Biphasic kinetics of growth and bacteriocin production with Lactobacillus amylovorus DCE 471 occur under stress conditions

artículo científico publicado en 2003

Comparative and functional genomics of Rhodococcus opacus PD630 for biofuels development

artículo científico publicado en 2011

Comparative genomics of enterococci: variation in Enterococcus faecalis, clade structure in E. faecium, and defining characteristics of E. gallinarum and E. casseliflavus

artículo científico publicado en 2012

Complex host genetics influence the microbiome in inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2014

Composition of the adult digestive tract bacterial microbiome based on seven mouth surfaces, tonsils, throat and stool samples

artículo científico publicado en 2012

ConStrains identifies microbial strains in metagenomic datasets

artículo científico publicado en 2015

Conservation of the chitin utilization pathway in the Vibrionaceae

artículo científico publicado en 2008

Corrigendum. Pediatric Crohn disease patients exhibit specific ileal transcriptome and microbiome signature

artículo científico publicado en 2015

Defined microbiota transplant restores Th17/RORγt+ regulatory T cell balance in mice colonized with inflammatory bowel disease microbiotas

scientific article published on 18 August 2020

Detection of low-abundance bacterial strains in metagenomic datasets by eigengenome partitioning

artículo científico publicado en 2015

Dirk Gevers

artículo científico publicado en 2015

Disease-specific alterations in the enteric virome in inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2015

Distinct microbiome in pouchitis compared to healthy pouches in ulcerative colitis and familial adenomatous polyposis ⬇️

artículo científico publicado el 15 de septiembre de 2010

Diversity analysis of dairy and nondairy Lactococcus lactis isolates, using a novel multilocus sequence analysis scheme and (GTG)5-PCR fingerprinting

artículo científico publicado en 2007

Dysfunction of the intestinal microbiome in inflammatory bowel disease and treatment

artículo científico publicado en 2012

Early microbial and metabolomic signatures predict later onset of necrotizing enterocolitis in preterm infants

artículo científico publicado en 2013

Ectopic colonization of oral bacteria in the intestine drives TH1 cell induction and inflammation

artículo científico publicado en 2017

Efficient and robust RNA-seq process for cultured bacteria and complex community transcriptomes

artículo científico publicado en 2012

Experimental and analytical tools for studying the human microbiome

artículo científico publicado en 2011

Fecal microbiota transplant for relapsing Clostridium difficile infection using a frozen inoculum from unrelated donors: a randomized, open-label, controlled pilot study

artículo científico publicado en 2014

Gene duplication and biased functional retention of paralogs in bacterial genomes

artículo científico publicado en 2004

Gene-targeted metagenomic analysis of glucan-branching enzyme gene profiles among human and animal fecal microbiota

scientific article published on 10 October 2013

Genomic analysis identifies association of Fusobacterium with colorectal carcinoma

artículo científico publicado en 2012

Genomic and phenotypic comparison of Bacillus fumarioli isolates from geothermal Antarctic soil and gelatine

artículo científico publicado en 2004

Gut microbiome composition and function in experimental colitis during active disease and treatment-induced remission

artículo científico publicado en 2014

High-quality draft genome sequences of 28 Enterococcus sp. isolates

artículo científico publicado en 2010

Horizontal transfer of tet(M) and erm(B) resistance plasmids from food strains of Lactobacillus plantarum to Enterococcus faecalis JH2-2 in the gastrointestinal tract of gnotobiotic rats

artículo científico publicado en 2007

Host genetic variation impacts microbiome composition across human body sites

artículo científico publicado en 2015

Identification of Bifidobacterium species using rep-PCR fingerprinting

artículo científico publicado en 2003

Identification of lactobacilli by pheS and rpoA gene sequence analyses

artículo científico publicado en 2007

Identifying personal microbiomes using metagenomic codes

artículo científico publicado en 2015

In vitro conjugal transfer of tetracycline resistance from Lactobacillus isolates to other Gram-positive bacteria

artículo científico publicado en 2003

Inflammatory bowel disease microbiotas alter gut CD4 T-cell homeostasis and drive colitis in mice

Interplay of host genetics and gut microbiota underlying the onset and clinical presentation of inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2016

Meeting report for the 1st skin microbiota workshop, boulder, CO October 15-16 2012.

artículo científico publicado en 2014

MetaRef: a pan-genomic database for comparative and community microbial genomics

artículo científico publicado en 2013

Metabolic reconstruction for metagenomic data and its application to the human microbiome

artículo científico publicado en 2012

Metagenomic Characterization of Microbial Communities In Situ Within the Deeper Layers of the Ileum in Crohn's Disease

artículo científico publicado en 2016

Metagenomic biomarker discovery and explanation

artículo científico publicado en 2011

Microbial community function and biomarker discovery in the human microbiome

artículo científico publicado en 2011

Microbial community function and biomarker discovery in the human microbiome

Microbiotas from Humans with Inflammatory Bowel Disease Alter the Balance of Gut Th17 and RORγt+ Regulatory T Cells and Exacerbate Colitis in Mice.

artículo científico publicado en 2019

Minimum information about a marker gene sequence (MIMARKS) and minimum information about any (x) sequence (MIxS) specifications

artículo científico publicado en 2011

Molecular characterization of tet(M) genes in Lactobacillus isolates from different types of fermented dry sausage

artículo científico publicado en 2003

Natural history of the infant gut microbiome and impact of antibiotic treatment on bacterial strain diversity and stability

artículo científico publicado en 2016

Nitric oxide reductase (norB) gene sequence analysis reveals discrepancies with nitrite reductase (nir) gene phylogeny in cultivated denitrifiers

artículo científico publicado en 2007

Non-invasive mapping of the gastrointestinal microbiota identifies children with inflammatory bowel disease

artículo científico publicado en 2012

Opinion: Re-evaluating prokaryotic species

artículo científico publicado en 2005

Pediatric Crohn disease patients exhibit specific ileal transcriptome and microbiome signature

artículo científico publicado en 2014

Population-based metagenomics analysis reveals markers for gut microbiome composition and diversity

artículo científico publicado en 2016

Potential role of intratumor bacteria in mediating tumor resistance to the chemotherapeutic drug gemcitabine

artículo científico publicado en 2017

Prevalence and diversity of tetracycline resistant lactic acid bacteria and their tet genes along the process line of fermented dry sausages

artículo científico publicado en 2003

Quality-filtering vastly improves diversity estimates from Illumina amplicon sequencing

artículo científico publicado en 2012

Reducing the effects of PCR amplification and sequencing artifacts on 16S rRNA-based studies

artículo científico publicado en 2011

Relating the metatranscriptome and metagenome of the human gut.

artículo científico publicado en 2014

Resource partitioning and sympatric differentiation among closely related bacterioplankton.

artículo científico publicado en 2008

Sequence-based discovery of Bradyrhizobium enterica in cord colitis syndrome

artículo científico publicado en 2013

Skin microbiome imbalance in patients with STAT1/STAT3 defects impairs innate host defense responses

artículo científico publicado en 2013

Stepping stones towards a new prokaryotic taxonomy

artículo científico publicado en 2006

Strain Tracking Reveals the Determinants of Bacterial Engraftment in the Human Gut Following Fecal Microbiota Transplantation

artículo científico publicado en 2018

Sub-clinical detection of gut microbial biomarkers of obesity and type 2 diabetes

artículo científico publicado en 2016

Taxon K, a complex within the Burkholderia cepacia complex, comprises at least two novel species, Burkholderia contaminans sp. nov. and Burkholderia lata sp. nov.

artículo científico publicado en 2009

The Dynamics of the Human Infant Gut Microbiome in Development and in Progression toward Type 1 Diabetes

scholarly article published by Päivi Pöhö in 2016

The Gut Microbiome Contributes to a Substantial Proportion of the Variation in Blood Lipids

artículo científico publicado en 2015

The Human Microbiome Project strategy for comprehensive sampling of the human microbiome and why it matters ⬇️

artículo científico publicado el 19 de noviembre de 2012

The Human Microbiome Project: a community resource for the healthy human microbiome

artículo científico publicado en 2012

The classroom microbiome and asthma morbidity in children attending 3 inner-city schools

scholarly article by Peggy S Lai et al published June 2018 in The Journal of Allergy and Clinical Immunology

The dynamics of the human infant gut microbiome in development and in progression toward type 1 diabetes

artículo científico publicado en 2015

The genome of th17 cell-inducing segmented filamentous bacteria reveals extensive auxotrophy and adaptations to the intestinal environment

artículo científico publicado en 2011

The genome of the versatile nitrogen fixer Azorhizobium caulinodans ORS571

artículo científico publicado en 2008

The incidence of nirS and nirK and their genetic heterogeneity in cultivated denitrifiers

artículo científico publicado en 2006

The influence of a short-term gluten-free diet on the human gut microbiome

artículo científico publicado en 2016

The interpersonal and intrapersonal diversity of human-associated microbiota in key body sites

artículo científico publicado en 2012

The microbiome in inflammatory bowel disease: current status and the future ahead

artículo científico publicado en 2014

The treatment-naive microbiome in new-onset Crohn's disease

artículo científico publicado en 2014

Towards a prokaryotic genomic taxonomy

artículo científico publicado en 2005

Urban Transit System Microbial Communities Differ by Surface Type and Interaction with Humans and the Environment

artículo científico publicado en 2016

Variation in Microbiome LPS Immunogenicity Contributes to Autoimmunity in Humans

artículo científico publicado en 2016

Vibrio chromosomes share common history

artículo científico publicado en 2010

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