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Lista de obras de Jonathan Weissman

11 Construction of single-ring and two-ring hybrid versions of bacterial chaperonin GroEL

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

2004 Irving Sigal Young Investigator Award

artículo científico publicado en 2004

A Comprehensive, CRISPR-based Functional Analysis of Essential Genes in Bacteria

artículo científico publicado en 2016

A Critical Role for Amino-Terminal Glutamine/Asparagine Repeats in the Formation and Propagation of a Yeast Prion ⬇️

artículo científico publicado el 26 de junio de 1998

A Multiplexed Single-Cell CRISPR Screening Platform Enables Systematic Dissection of the Unfolded Protein Response

artículo científico publicado en 2016

A Regression-Based Analysis of Ribosome-Profiling Data Reveals a Conserved Complexity to Mammalian Translation

artículo científico publicado en 2015

A Stress Response that Monitors and Regulates mRNA Structure Is Central to Cold Shock Adaptation.

artículo científico publicado en 2018

A comprehensive strategy enabling high-resolution functional analysis of the yeast genome.

artículo científico publicado en 2008

A developmentally regulated translational control pathway establishes the meiotic chromosome segregation pattern

artículo científico publicado en 2013

A general lack of compensation for gene dosage in yeast

artículo científico publicado en 2010

A genetic interaction map of RNA-processing factors reveals links between Sem1/Dss1-containing complexes and mRNA export and splicing

artículo científico publicado en 2008

A high-coverage shRNA screen identifies TMEM129 as an E3 ligase involved in ER-associated protein degradation

artículo científico publicado en 2014

A luminal surveillance complex that selects misfolded glycoproteins for ER-associated degradation

artículo científico publicado en 2006

A mitochondrial-focused genetic interaction map reveals a scaffold-like complex required for inner membrane organization in mitochondria

artículo científico publicado en 2011

A molecular caliper mechanism for determining very long-chain fatty acid length

artículo científico publicado en 2007

A pause sequence enriched at translation start sites drives transcription dynamics in vivo

artículo científico publicado en 2014

A protein-tagging system for signal amplification in gene expression and fluorescence imaging

artículo científico publicado en 2014

A ribosome-bound quality control complex triggers degradation of nascent peptides and signals translation stress

artículo científico publicado en 2012

A scalable strategy for high-throughput GFP tagging of endogenous human proteins

artículo científico publicado en 2016

A strategy for extracting and analyzing large-scale quantitative epistatic interaction data

artículo científico publicado en 2006

A systematic mammalian genetic interaction map reveals pathways underlying ricin susceptibility

artículo científico publicado en 2013

Activity motifs reveal principles of timing in transcriptional control of the yeast metabolic network

artículo científico publicado en 2008

Amyloid structure: conformational diversity and consequences ⬇️

artículo científico publicado en 2011

An ER-mitochondria tethering complex revealed by a synthetic biology screen

artículo científico publicado en 2009

An efficient protein transformation protocol for introducing prions into yeast

artículo científico publicado en 2006

Analysis of Dom34 and its function in no-go decay

artículo científico publicado en 2009

Aneuploid yeast strains exhibit defects in cell growth and passage through START

artículo científico publicado en 2013

Assembly of a phased diploid Candida albicans genome facilitates allele-specific measurements and provides a simple model for repeat and indel structure

artículo científico publicado en 2013

Automated identification of pathways from quantitative genetic interaction data

artículo científico publicado en 2010

Backup without redundancy: genetic interactions reveal the cost of duplicate gene loss

artículo científico publicado en 2007

Biotechnology. A prudent path forward for genomic engineering and germline gene modification

artículo científico publicado en 2015

CAT-tailing as a fail-safe mechanism for efficient degradation of stalled nascent polypeptides

artículo científico publicado en 2017

CCR4/NOT complex associates with the proteasome and regulates histone methylation

artículo científico publicado en 2007

CRISPR Approaches to Small Molecule Target Identification

artículo científico publicado en 2017

CRISPR Interference Efficiently Induces Specific and Reversible Gene Silencing in Human iPSCs

artículo científico publicado en 2016

CRISPR-mediated modular RNA-guided regulation of transcription in eukaryotes

artículo científico publicado en 2013

CRISPRi-based genome-scale identification of functional long noncoding RNA loci in human cells

artículo científico publicado en 2016

Causal signals between codon bias, mRNA structure, and the efficiency of translation and elongation

artículo científico publicado en 2014

Ceapins block the unfolded protein response sensor ATF6α by inducing a neomorphic inter-organelle tether

artículo científico publicado en 2019

Cellular noise regulons underlie fluctuations in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2012

Combinatorial single-cell CRISPR screens by direct guide RNA capture and targeted sequencing

scientific article published on 30 March 2020

Combined CRISPRi/a-Based Chemical Genetic Screens Reveal that Rigosertib Is a Microtubule-Destabilizing Agent

artículo científico publicado en 2017

Combined chemical-genetic approach identifies cytosolic HSP70 dependence in rhabdomyosarcoma

artículo científico publicado en 2016

Compact and highly active next-generation libraries for CRISPR-mediated gene repression and activation.

artículo científico publicado en 2016

Conformational variations in an infectious protein determine prion strain differences

artículo científico publicado en 2004

Conservation and rewiring of functional modules revealed by an epistasis map in fission yeast.

artículo científico publicado en 2008

Construction, verification and experimental use of two epitope-tagged collections of budding yeast strains

artículo científico publicado en 2005

Correction: Global cellular response to chemotherapy-induced apoptosis.

artículo científico publicado en 2013

Correction: Ribosome profiling reveals pervasive and regulated stop codon readthrough in Drosophila melanogaster.

artículo científico publicado en 2014

Cotranscriptional set2 methylation of histone H3 lysine 36 recruits a repressive Rpd3 complex

artículo científico publicado en 2005

Cycloheximide can distort measurements of mRNA levels and translation efficiency.

artículo científico publicado en 2019

DMS-MaPseq for genome-wide or targeted RNA structure probing in vivo

artículo científico publicado en 2016

Decay of endoplasmic reticulum-localized mRNAs during the unfolded protein response.

artículo científico

Decoding human cytomegalovirus

artículo científico publicado en 2012

Defining the physiological role of SRP in protein-targeting efficiency and specificity.

artículo científico publicado en 2018

Differences in prion strain conformations result from non-native interactions in a nucleus

artículo científico publicado en 2010

Differential scales of protein quality control

artículo científico

Directed evolution of substrate-optimized GroEL/S chaperonins

article

Dissection and design of yeast prions

artículo científico publicado en 2004

Domain architecture of protein-disulfide isomerase facilitates its dual role as an oxidase and an isomerase in Ero1p-mediated disulfide formation.

artículo científico publicado en 2006

Dynamic Imaging of Genomic Loci in Living Human Cells by an Optimized CRISPR/Cas System

article

Dynamic translation regulation in Caulobacter cell cycle control

artículo científico publicado en 2016

Eliminating Ultracentrifugation in the Deep Sequencing of Ribosome-Protected mRNA Fragments Using Polysomes and Monosomes

Emerging principles of conformation-based prion inheritance

artículo científico publicado en 2004

Engineering ER-stress dependent non-conventional mRNA splicing.

artículo científico publicado en 2018

Engineering complex synthetic transcriptional programs with CRISPR RNA scaffolds

artículo científico publicado en 2014

Ero1p: A Novel and Ubiquitous Protein with an Essential Role in Oxidative Protein Folding in the Endoplasmic Reticulum ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1998

Exploration of the function and organization of the yeast early secretory pathway through an epistatic miniarray profile

artículo científico publicado en 2005

Exploration of the topological requirements of ERAD identifies Yos9p as a lectin sensor of misfolded glycoproteins in the ER lumen

artículo científico publicado en 2005

Exploring genetic interaction manifolds constructed from rich single-cell phenotypes

scientific article published on 08 August 2019

Extensive and coordinated control of allele-specific expression by both transcription and translation in Candida albicans

artículo científico publicado en 2014

Fitness effects of CRISPR/Cas9-targeting of long noncoding RNA genes

artículo científico publicado en 2020

From information to knowledge: new technologies for defining gene function

artículo científico publicado en 2009

Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

artículo científico publicado en 2007

Functional genomics platform for pooled screening and generation of mammalian genetic interaction maps

artículo científico publicado en 2014

Functional organization of the S. cerevisiae phosphorylation network

artículo científico publicado en 2009

Functional repurposing revealed by comparing S. pombe and S. cerevisiae genetic interactions

artículo científico publicado en 2012

Ganglion-specific splicing of TRPV1 underlies infrared sensation in vampire bats

artículo científico publicado en 2011

Generation of prion transmission barriers by mutational control of amyloid conformations

artículo científico publicado en 2003

Genetic influences on translation in yeast

artículo científico publicado en 2014

Genome-Scale CRISPR-Mediated Control of Gene Repression and Activation

artículo científico publicado en 2014

Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profiling

artículo científico publicado en 2009

Genome-wide probing of RNA structure reveals active unfolding of mRNA structures in vivo

artículo científico publicado en 2013

Global analysis of protein expression in yeast

artículo científico publicado en 2003

Global analysis of protein localization in budding yeast

artículo científico publicado en 2003

Global cellular response to chemotherapy-induced apoptosis

artículo científico publicado en 2013

Global landscape of protein complexes in the yeast Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2006

GroEL-GroES-mediated protein folding requires an intact central cavity ⬇️

artículo científico publicado el 13 de octubre de 1998

H3K4 trimethylation by Set1 promotes efficient termination by the Nrd1-Nab3-Sen1 pathway

artículo científico publicado en 2011

High-resolution view of the yeast meiotic program revealed by ribosome profiling

artículo científico publicado en 2012

High-throughput genetic interaction mapping in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe

artículo científico publicado en 2007

High-throughput, quantitative analyses of genetic interactions in E. coli

artículo científico publicado en 2008

Htm1p-Pdi1p is a folding-sensitive mannosidase that marks N-glycoproteins for ER-associated protein degradation

artículo científico publicado en 2016

Identification of a transporter complex responsible for the cytosolic entry of nitrogen-containing bisphosphonates.

artículo científico publicado en 2018

Identification of yeast proteins necessary for cell-surface function of a potassium channel

artículo científico publicado en 2007

Immunogenetics. Dynamic profiling of the protein life cycle in response to pathogens

artículo científico publicado en 2015

In vivo monitoring of the prion replication cycle reveals a critical role for Sis1 in delivering substrates to Hsp104

artículo científico publicado en 2008

Integrated platform for genome-wide screening and construction of high-density genetic interaction maps in mammalian cells

artículo científico publicado en 2013

J domain co-chaperone specificity defines the role of BiP during protein translocation

artículo científico publicado en 2010

Journal club. A biochemist looks at how DNA sequencing can reveal more than just sequences

artículo científico publicado en 2009

KSHV 2.0: a comprehensive annotation of the Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus genome using next-generation sequencing reveals novel genomic and functional features

artículo científico publicado en 2014

LOCAL TRANSLATION. Response to Comment on "Principles of ER cotranslational translocation revealed by proximity-specific ribosome profiling".

artículo científico publicado en 2015

Life span extension by glucose restriction is abrogated by methionine supplementation: Cross-talk between glucose and methionine and implication of methionine as a key regulator of life span

artículo científico publicado en 2020

Ligand-binding domains of nuclear receptors facilitate tight control of split CRISPR activity

artículo científico publicado en 2016

Lipid Homeostasis Is Maintained by Dual Targeting of the Mitochondrial PE Biosynthesis Enzyme to the ER.

artículo científico publicado en 2017

MTCH2 is a mitochondrial outer membrane protein insertase

artículo científico publicado en 2022

Mammalian microRNAs predominantly act to decrease target mRNA levels

artículo científico publicado en 2010

Many things from one

artículo científico publicado en 2006

Mapping information-rich genotype-phenotype landscapes with genome-scale Perturb-seq

artículo científico publicado en 2022

Mapping the genetic landscape of DNA double-strand break repair

artículo científico publicado en 2021

Mec1/Tel1 phosphorylation of the INO80 chromatin remodeling complex influences DNA damage checkpoint responses

artículo científico publicado en 2007

Mechanism of cross-species prion transmission: an infectious conformation compatible with two highly divergent yeast prion proteins

artículo científico publicado en 2005

Mechanism of prion propagation: amyloid growth occurs by monomer addition

artículo científico publicado en 2004

Membranes in balance: mechanisms of sphingolipid homeostasis

artículo científico publicado en 2010

Misfolded proteins induce aggregation of the lectin Yos9.

artículo científico publicado en 2014

Model-guided optogenetic study of PKA signaling in budding yeast

artículo científico publicado en 2016

Molecular basis of infrared detection by snakes

artículo científico publicado en 2010

Molecular chaperones and protein quality control

artículo científico publicado en 2006

Msn2 coordinates a stoichiometric gene expression program

artículo científico publicado en 2013

Nascent transcript sequencing visualizes transcription at nucleotide resolution

artículo científico publicado en 2011

Native elongating transcript sequencing (NET-seq).

artículo científico publicado en 2012

New factors for protein transport identified by a genome-wide CRISPRi screen in mammalian cells

scientific article published on 05 September 2019

Next-generation NAMPT inhibitors identified by sequential high-throughput phenotypic chemical and functional genomic screens

artículo científico publicado en 2013

Noise rules

scientific article published in Nature

Nucleosomes impede Cas9 access to DNA in vivo and in vitro

artículo científico publicado en 2016

OpenCell: Endogenous tagging for the cartography of human cellular organization

artículo científico publicado en 2022

Operon mRNAs are organized into ORF-centric structures that predict translation efficiency.

artículo científico publicado en 2017

Origins and kinetic consequences of diversity in Sup35 yeast prion fibers

artículo científico publicado en 2002

Orm family proteins mediate sphingolipid homeostasis

artículo científico publicado en 2010

Oxidative protein folding in eukaryotes: mechanisms and consequences

artículo científico publicado en 2004

Paradoxical resistance of multiple myeloma to proteasome inhibitors by decreased levels of 19S proteasomal subunits

artículo científico publicado en 2015

Perturb-Seq: Dissecting Molecular Circuits with Scalable Single-Cell RNA Profiling of Pooled Genetic Screens

artículo científico publicado en 2016

Pervasive functional translation of noncanonical human open reading frames

artículo científico publicado en 2020

Pharmacological dimerization and activation of the exchange factor eIF2B antagonizes the integrated stress response

artículo científico publicado en 2015

Plastid: nucleotide-resolution analysis of next-generation sequencing and genomics data

artículo científico publicado en 2016

Principles of ER cotranslational translocation revealed by proximity-specific ribosome profiling

artículo científico publicado en 2014

Protein kinase Ypk1 phosphorylates regulatory proteins Orm1 and Orm2 to control sphingolipid homeostasis in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2011

Protein synthesis. Rqc2p and 60S ribosomal subunits mediate mRNA-independent elongation of nascent chains

artículo científico publicado en 2015

Proto-genes and de novo gene birth

artículo científico publicado en 2012

Quantifying absolute protein synthesis rates reveals principles underlying allocation of cellular resources

artículo científico publicado en 2014

Radically different amyloid conformations dictate the seeding specificity of a chimeric Sup35 prion

artículo científico publicado en 2011

Rapid creation and quantitative monitoring of high coverage shRNA libraries

scientific article published on 17 May 2009

Regulated Ire1-dependent decay of messenger RNAs in mammalian cells

artículo científico publicado en 2009

Regulation of mRNA translation during mitosis

artículo científico publicado en 2015

Reprogramming human T cell function and specificity with non-viral genome targeting

Ribosome profiling provides evidence that large noncoding RNAs do not encode proteins

artículo científico publicado en 2013

Ribosome profiling reveals pervasive and regulated stop codon readthrough in Drosophila melanogaster

artículo científico publicado en 2013

Ribosome profiling reveals pervasive translation outside of annotated protein-coding genes

artículo científico publicado en 2014

Ribosome profiling reveals the what, when, where and how of protein synthesis

artículo científico publicado en 2015

Road to Ruin: Targeting Proteins for Degradation in the Endoplasmic Reticulum ⬇️

artículo científico publicado el 25 de noviembre de 2011

Selective ribosome profiling as a tool for studying the interaction of chaperones and targeting factors with nascent polypeptide chains and ribosomes

artículo científico publicado en 2013

Selective ribosome profiling reveals the cotranslational chaperone action of trigger factor in vivo

artículo científico publicado en 2011

Single-cell analysis of long non-coding RNAs in the developing human neocortex

artículo científico publicado en 2016

Small-molecule aggregates inhibit amyloid polymerization

artículo científico publicado en 2008

Special Issue: The Molecular and Cellular Mechanisms of Amyloidosis

artículo científico publicado en 2012

Strain conformation, primary structure and the propagation of the yeast prion [PSI+].

artículo científico publicado en 2011

Structural and mechanistic basis of the EMC-dependent biogenesis of distinct transmembrane clients

artículo científico publicado en 2020

Systematic screen of Schizosaccharomyces pombe deletion collection uncovers parallel evolution of the phosphate signal transduction pathway in yeasts

artículo científico publicado en 2010

Systems biology: Reverse engineering the cell

artículo científico publicado en 2008

Targeting RAS-driven human cancer cells with antibodies to upregulated and essential cell-surface proteins

artículo científico publicado en 2018

Targeting and plasticity of mitochondrial proteins revealed by proximity-specific ribosome profiling

artículo científico publicado en 2014

Targeting the AAA ATPase p97 as an Approach to Treat Cancer through Disruption of Protein Homeostasis

artículo científico publicado en 2015

The Action of Molecular Chaperones in the Early Secretory Pathway ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2001

The Contribution of Systematic Approaches to Characterizing the Proteins and Functions of the Endoplasmic Reticulum ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 2013

The ER membrane protein complex interacts cotranslationally to enable biogenesis of multipass membrane proteins.

artículo científico publicado en 2018

The ER membrane protein complex is required to ensure correct topology and stable expression of flavivirus polyproteins

scientific article published on 13 September 2019

The Epistemology of Cell Biology ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 2010

The FAD- and O(2)-dependent reaction cycle of Ero1-mediated oxidative protein folding in the endoplasmic reticulum

artículo científico publicado en 2002

The GET complex mediates insertion of tail-anchored proteins into the ER membrane

artículo científico publicado en 2008

The Human Cell Atlas

artículo científico publicado en 2017

The Human Cell Atlas

The Human Cell Atlas White Paper ⬇️

artículo científico publicado en 2018

The Ins and Outs of GroEL-Mediated Protein Folding ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 2001

The SND proteins constitute an alternative targeting route to the endoplasmic reticulum

artículo científico publicado en 2016

The anti-Shine-Dalgarno sequence drives translational pausing and codon choice in bacteria

artículo científico publicado en 2012

The coding and noncoding architecture of the Caulobacter crescentus genome

artículo científico publicado en 2014

The helicase Ded1p controls use of near-cognate translation initiation codons in 5' UTRs

artículo científico publicado en 2018

The mTOR Complex Controls HIV Latency ⬇️

artículo científico publicado en 2016

The physical basis of how prion conformations determine strain phenotypes

artículo científico publicado en 2006

The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments

artículo científico publicado en 2012

The structural basis of yeast prion strain variants

artículo científico publicado en 2007

The translational landscape of mTOR signalling steers cancer initiation and metastasis

artículo científico publicado en 2012

The utility of prions

artículo científico publicado en 2002

Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Cell RNA Sequencing

artículo científico publicado en 2020

Titrating gene expression using libraries of systematically attenuated CRISPR guide RNAs

scientific article published on 13 January 2020

Toward a comprehensive atlas of the physical interactome of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2007

Translation from unconventional 5' start sites drives tumour initiation

artículo científico publicado en 2017

Uniform nomenclature for the mitochondrial contact site and cristae organizing system

artículo científico publicado en 2014

Unraveling the mechanism of cell death induced by chemical fibrils

artículo científico publicado en 2014

Validation of the Hsp70-Bag3 protein-protein interaction as a potential therapeutic target in cancer

artículo científico publicado en 2015

[KIL-d] Protein Element Confers Antiviral Activity via Catastrophic Viral Mutagenesis

artículo científico publicado en 2015

rRNA:mRNA pairing alters the length and the symmetry of mRNA-protected fragments in ribosome profiling experiments

artículo científico publicado en 2013

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