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Lista de obras de Samuel H. Wilson

"Action-at-a-distance" mutagenesis. 8-oxo-7, 8-dihydro-2'-deoxyguanosine causes base substitution errors at neighboring template sites when copied by DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 1999

( R )-β,γ-Fluoromethylene-dGTP-DNA Ternary Complex with DNA Polymerase β

artículo científico publicado en 2007

1H, 13C and 15N resonance assignments for the perdeuterated 22 kD palm-thumb domain of DNA polymerase beta

scientific article published on 01 February 2002

A Transition-State Perspective on Y-Family DNA Polymerase η Fidelity in Comparison with X-Family DNA Polymerases λ and β

artículo científico publicado en 2019

A guardian residue hinders insertion of a Fapy•dGTP analog by modulating the open-closed DNA polymerase transition

scientific article published on 01 April 2019

A minor groove binding track in reverse transcriptase

scientific article published on 01 March 1997

A novel DNA polymerase activity found in association with intracisternal A-type particles.

artículo científico publicado en 1972

A role for p53 in base excision repair.

artículo científico publicado en 2001

A structural basis for metal ion mutagenicity and nucleotide selectivity in human DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 1996

A type IB topoisomerase with DNA repair activities

artículo científico publicado en 2001

A vinyl polymer with purine residues deficient in base pairing inhibits murine leukemia virus replication ⬇️

artículo científico publicado el 15 de marzo de 1978

AP endonuclease and poly(ADP-ribose) polymerase-1 interact with the same base excision repair intermediate.

artículo científico publicado en 2004

AP endonuclease-independent DNA base excision repair in human cells

artículo científico publicado en 2004

ATR signaling mediates an S-phase checkpoint after inhibition of poly(ADP-ribose) polymerase activity.

artículo científico publicado en 2007

Alkylation DNA damage in combination with PARP inhibition results in formation of S-phase-dependent double-strand breaks.

artículo científico publicado en 2010

Alpha,beta-methylene-2'-deoxynucleoside 5'-triphosphates as noncleavable substrates for DNA polymerases: isolation, characterization, and stability studies of novel 2'-deoxycyclonucleosides, 3,5'-cyclo-dG, and 2,5'-cyclo-dT.

artículo científico publicado en 2008

Anomalous electrophoretic migration of oligodeoxynucleotides with terminal -OH groups: applications for DNA exonuclease characterization

scientific article published on 01 February 1983

Antibodies from patients and mice with autoimmune diseases react with recombinant hnRNP core protein A1

artículo científico publicado en 1988

Apurinic/apyrimidinic (AP) site recognition by the 5′-dRP/AP lyase in poly(ADP-ribose) polymerase-1 (PARP-1) ⬇️

artículo científico publicado el 2 de diciembre de 2010

Assignments of 1H, 15N, and 13C resonances for the backbone and side chains of the N-terminal domain of DNA polymerase beta. Determination of the secondary structure and tertiary contacts

scientific article published on 01 August 1994

Base excision repair and design of small molecule inhibitors of human DNA polymerase β.

artículo científico publicado en 2010

Base excision repair defects invoke hypersensitivity to PARP inhibition

artículo científico publicado en 2014

Base excision repair in nucleosomes lacking histone tails.

artículo científico publicado en 2005

Base excision repair intermediates induce p53-independent cytotoxic and genotoxic responses.

artículo científico publicado en 2003

Base excision repair of tandem modifications in a methylated CpG dinucleotide.

artículo científico publicado en 2014

Base substitution specificity of DNA polymerase beta depends on interactions in the DNA minor groove

artículo científico publicado en 1999

Binary complex crystal structure of DNA polymerase   reveals multiple conformations of the templating 8-oxoguanine lesion

artículo científico publicado en 2012

Biomedical research leaders: report on needs, opportunities, difficulties, education and training, and evaluation.

artículo científico publicado en 2000

Bisphenol a promotes cell survival following oxidative DNA damage in mouse fibroblasts

artículo científico publicado en 2015

Capturing snapshots of APE1 processing DNA damage.

artículo científico publicado en 2015

Characterization of DNA polymerase beta splicing variants in gastric cancer: the most frequent exon 2-deleted isoform is a non-coding RNA

artículo científico publicado en 2009

Characterization of the tryptophan fluorescence and hydrodynamic properties of rat DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 1994

Chromosomal location of the human gene for DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 1987

Cloning and characterization of a novel member of the human ATF/CREB family: ATF2 deletion, a potential regulator of the human DNA polymerase beta promoter.

artículo científico publicado en 2003

Coincidentally, this first issue marks the 50th anniversary of the seminal discovery of the excision-repair of damaged DNA. Preface.

artículo científico publicado en 2014

Combined Effects of High-Dose Bisphenol A and Oxidizing Agent (KBrO3) on Cellular Microenvironment, Gene Expression, and Chromatin Structure of Ku70-deficient Mouse Embryonic Fibroblasts.

artículo científico publicado en 2016

Comparative assessment of plasmid and oligonucleotide DNA substrates in measurement of in vitro base excision repair activity.

artículo científico publicado en 2007

Complementation of aprataxin deficiency by base excision repair enzymes in mitochondrial extracts.

artículo científico publicado en 2017

Complementation of aprataxin deficiency by base excision repair enzymes.

artículo científico publicado en 2015

Coordination between polymerase beta and FEN1 can modulate CAG repeat expansion.

artículo científico publicado en 2009

Coordination of steps in single-nucleotide base excision repair mediated by apurinic/apyrimidinic endonuclease 1 and DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 2007

Crystal Structures of Human DNA Polymerase β Complexed with Gapped and Nicked DNA: Evidence for an Induced Fit Mechanism, ⬇️

artículo científico publicado el 16 de septiembre de 1997

Crystal structure of rat DNA polymerase beta: evidence for a common polymerase mechanism

artículo científico publicado en 1994

Crystal structures of human DNA polymerase beta complexed with DNA: implications for catalytic mechanism, processivity, and fidelity

artículo científico publicado en 1996

Cultured cell systems and methods for neurobiology.

artículo científico publicado en 1974

Cutting-edge Perspectives in Genomic Maintenance III: Preface

artículo científico publicado en 2016

Cutting-edge Perspectives in Genomic Maintenance. Preface

artículo científico publicado en 2015

Cutting-edge perspectives in genomic maintenance IV

scientific article published on 24 June 2017

Cutting-edge perspectives in genomic maintenance V

artículo científico publicado en 2018

DNA Polymerase   Substrate Specificity: SIDE CHAIN MODULATION OF THE"A-RULE"

artículo científico publicado en 2009

DNA Polymerases β and λ Mediate Overlapping and Independent Roles in Base Excision Repair in Mouse Embryonic Fibroblasts ⬇️

artículo científico publicado el 18 de agosto de 2010

DNA base excision repair: a mechanism of trinucleotide repeat expansion.

artículo científico publicado en 2012

DNA damage response of cloned DNA beta-polymerase promoter is blocked in mutant cell lines deficient in protein kinase A ⬇️

artículo científico publicado el 11 de noviembre de 1992

DNA damage response protein ASCIZ links base excision repair with immunoglobulin gene conversion

artículo científico publicado en 2008

DNA lesion bypass polymerases open up.

artículo científico publicado en 2001

DNA polymerase III of mouse myeloma. Partial purification and characterization ⬇️

artículo científico publicado el 11 de marzo de 1975

DNA polymerase and simian virus 40 infection of resting monkey cells: induction of aphidicolin resistant α-polymerase ⬇️

artículo científico publicado el 10 de diciembre de 1983

DNA polymerase beta -mediated long patch base excision repair. Poly(ADP-ribose)polymerase-1 stimulates strand displacement DNA synthesis.

artículo científico publicado en 2001

DNA polymerase beta and DNA synthesis in Xenopus oocytes and in a nuclear extract

artículo científico publicado el 16 de octubre de 1992

DNA polymerase beta and mammalian base excision repair.

artículo científico publicado en 2000

DNA polymerase beta conducts the gap-filling step in uracil-initiated base excision repair in a bovine testis nuclear extract.

artículo científico publicado en 1995

DNA polymerase beta ribonucleotide discrimination: insertion, misinsertion, extension, and coding.

artículo científico publicado en 2010

DNA polymerase beta-dependent long patch base excision repair in living cells

artículo científico publicado en 2009

DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 2002

DNA polymerase lambda mediates a back-up base excision repair activity in extracts of mouse embryonic fibroblasts

artículo científico publicado en 2005

DNA polymerase lambda protects mouse fibroblasts against oxidative DNA damage and is recruited to sites of DNA damage/repair

artículo científico publicado en 2005

DNA polymerase structure-based insight on the mutagenic properties of 8-oxoguanine.

artículo científico publicado en 2010

DNA polymerase β contains a functional nuclear localization signal at its N-terminus

artículo científico publicado en 2016

DNA polymerase β gap-filling translesion DNA synthesis

artículo científico publicado en 2012

DNA polymerase β uses its lyase domain in a processive search for DNA damage

artículo científico publicado en 2017

DNA polymerase β-dependent cell survival independent of XRCC1 expression

artículo científico publicado en 2014

DNA polymerase β: A missing link of the base excision repair machinery in mammalian mitochondria

artículo científico publicado en 2017

DNA polymerases lose their grip.

artículo científico publicado en 2001

DNA polymerases on the move

artículo científico publicado en 1998

DNA scanning by base excision repair enzymes and implications for pathway coordination

artículo científico publicado en 2018

DNA synthesis and dRPase activities of polymerase beta are both essential for single-nucleotide patch base excision repair in mammalian cell extracts.

artículo científico publicado en 2001

Deregulation of DNA polymerase ? by sense and antisense RNA expression in mouse 3T3 cells alters cell growth ⬇️

artículo científico publicado el 1 de julio de 1990

Determination of lysine pK values using [5-13C]lysine: application to the lyase domain of DNA Pol beta.

artículo científico publicado en 2006

Different DNA polymerases are involved in the short- and long-patch base excision repair in mammalian cells

scientific article published on 01 March 1998

Different structural states in oligonucleosomes are required for early versus late steps of base excision repair.

artículo científico publicado en 2007

Differing conformational pathways before and after chemistry for insertion of dATP versus dCTP opposite 8-oxoG in DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 2007

Direct interaction between mammalian DNA polymerase beta and proliferating cell nuclear antigen.

artículo científico publicado en 2002

Disruption of transcription in vitro and gene expression in vivo by DNA adducts derived from a benzo[a]pyrene diol epoxide located in heterologous sequences.

artículo científico publicado en 1997

Down-regulation of DNA polymerase beta accompanies somatic hypermutation in human BL2 cell lines

artículo científico publicado en 2006

Dynamic characterization of a DNA repair enzyme: NMR studies of [methyl-13C]methionine-labeled DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 2004

Editorial

Editorial

Effect of β,γ-CHF- and β,γ-CHCl-dGTP halogen atom stereochemistry on the transition state of DNA polymerase β.

artículo científico publicado en 2012

Efficiency of correct nucleotide insertion governs DNA polymerase fidelity.

artículo científico publicado en 2002

Enzymes for modifying and labeling DNA and RNA

artículo científico publicado en 1987

Eukaryotic Base Excision Repair: New Approaches Shine Light on Mechanism

scientific article published on 01 June 2019

Evidence for abasic site sugar phosphate-mediated cytotoxicity in alkylating agent treated Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2012

Evidence for an imino intermediate in the DNA polymerase beta deoxyribose phosphate excision reaction

artículo científico publicado en 1996

Expression and purification of the HIV-1 reverse transcriptase using the baculovirus expression vector system.

artículo científico publicado en 1993

Expression of human DNA polymerase beta in Escherichia coli and characterization of the recombinant enzyme

artículo científico publicado en 1988

Expression of polypeptides of human immunodeficiency virus-1 reverse transcriptase in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 1993

FEN1 functions in long patch base excision repair under conditions of oxidative stress in vertebrate cells

artículo científico publicado en 2010

FEN1 stimulation of DNA polymerase beta mediates an excision step in mammalian long patch base excision repair.

artículo científico publicado en 2000

Folate deficiency induces neurodegeneration and brain dysfunction in mice lacking uracil DNA glycosylase

artículo científico publicado en 2008

Gastrointestinal hyperplasia with altered expression of DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 2009

Genetic relatedness of human DNA polymerase beta and terminal deoxynucleotidyltransferase

artículo científico publicado en 1987

HIV-1 reverse transcriptase is phosphorylated in vitro and in a cellular system

artículo científico publicado en 1999

HIV-1 reverse transcriptase: inhibition by 2',5'-oligoadenylates.

artículo científico publicado en 1993

HMGB1 is a cofactor in mammalian base excision repair

artículo científico publicado en 2007

HMGB1: roles in base excision repair and related function.

artículo científico publicado en 2010

Hiding in Plain Sight: The Bimetallic Magnesium Covalent Bond in Enzyme Active Sites.

artículo científico publicado en 2016

High-level expression and purification of untagged and histidine-tagged HIV-1 reverse transcriptase.

artículo científico publicado en 2004

Highly organized but pliant active site of DNA polymerase beta: compensatory mechanisms in mutant enzymes revealed by dynamics simulations and energy analyses.

artículo científico publicado en 2004

Histone H3 Lysine 56 Acetylation Enhances AP Endonuclease 1-Mediated Repair of AP Sites in Nucleosome Core Particles

artículo científico publicado en 2019

Human DNA Polymerase-beta Promoter: Phorbol Ester Activation Is Mediated through the cAMP Response Element and cAMP-Response-Element-Binding Protein

artículo científico publicado en 1997

Human DNA polymerase beta deoxyribose phosphate lyase. Substrate specificity and catalytic mechanism

scientific article published on 01 June 1998

Human DNA polymerase theta possesses 5'-dRP lyase activity and functions in single-nucleotide base excision repair in vitro

artículo científico publicado en 2009

Human base excision repair enzymes apurinic/apyrimidinic endonuclease1 (APE1), DNA polymerase beta and poly(ADP-ribose) polymerase 1: interplay between strand-displacement DNA synthesis and proofreading exonuclease activity

artículo científico publicado en 2005

Identification and properties of the catalytic domain of mammalian DNA polymerase beta

scientific article published on 01 August 1990

Identification of a nuclear protein binding element within the rat brain protein kinase C gamma promoter that is related to the developmental control of this gene.

artículo científico publicado en 1993

Identification of novel mRNA isoforms for human DNA polymerase beta

artículo científico publicado en 1996

Identification of one of the apurinic/apyrimidinic lyase active sites of topoisomerase V by structural and functional studies

artículo científico publicado en 2013

Identification of small molecule synthetic inhibitors of DNA polymerase beta by NMR chemical shift mapping.

artículo científico publicado en 2004

Impact of Ribonucleotide Backbone on Translesion Synthesis and Repair of 7,8-Dihydro-8-oxoguanine.

artículo científico publicado en 2016

Impairment of proliferating cell nuclear antigen-dependent apurinic/apyrimidinic site repair on linear DNA.

artículo científico publicado en 1998

Improved conditions for activity gel analysis of DNA polymerase catalytic polypeptides

artículo científico publicado en 1983

In situ analysis of repair processes for oxidative DNA damage in mammalian cells.

artículo científico publicado en 2004

In vitro Assay to Measure DNA Polymerase β Nucleotide Insertion Coupled with the DNA Ligation Reaction during Base Excision Repair.

artículo científico publicado en 2017

Increased PARP-1 Association with DNA in Alkylation Damaged, PARP-Inhibited Mouse Fibroblasts ⬇️

artículo científico publicado el 13 de enero de 2012

Influence of DNA structure on DNA polymerase beta active site function: extension of mutagenic DNA intermediates.

artículo científico publicado en 2004

Inhibition of HIV-1 reverse transcriptase-catalyzed synthesis by intercalated DNA Benzo[a]Pyrene 7,8-Dihydrodiol-9,10-Epoxide adducts

artículo científico publicado en 2013

Inhibition of cell-free globin synthesis by polydeoxythymidylate ⬇️

artículo científico publicado el 4 de febrero de 1973

Inhibitors of HIV-1 reverse transcriptase and fidelity of in vitro DNA replication

artículo científico publicado el 1 de enero de 1992

Insights into the conformation of aminofluorene-deoxyguanine adduct in a DNA polymerase active site.

artículo científico publicado en 2013

Interactions between DNA polymerase beta and the major covalent adduct of the carcinogen (+)-anti-benzo[a]pyrene diol epoxide with DNA at a primer-template junction.

artículo científico publicado en 1998

Interactions of the A1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein and its proteolytic derivative, UP1, with RNA and DNA: Evidence for multiple RNA binding domains and salt-dependent binding mode transitions ⬇️

artículo científico publicado el 19 de marzo de 1991

Interplay between DNA polymerases beta and lambda in repair of oxidation DNA damage in chicken DT40 cells

artículo científico publicado en 2007

Intrinsic mutagenic properties of 5-chlorocytosine: A mechanistic connection between chronic inflammation and cancer

artículo científico publicado en 2015

Involvement of DNA polymerase beta in protection against the cytotoxicity of oxidative DNA damage.

artículo científico publicado en 2002

Involvement of poly(ADP-ribose) polymerase activity in regulating Chk1-dependent apoptotic cell death.

artículo científico publicado en 2005

Kinetic analysis of Sp1-mediated transcriptional activation of a TATA-containing promoter.

artículo científico publicado en 2000

Kinetic analysis of Sp1-mediated transcriptional activation of the human DNA polymerase beta promoter

artículo científico publicado en 2000

Kinetic analysis of template.primer interactions with recombinant forms of HIV-1 reverse transcriptase

scientific article published on 01 September 1993

Levels and size complexity of DNA polymerase beta mRNA in rat regenerating liver and other organs.

artículo científico publicado en 1989

Localization of a polynucleotide binding region in the HIV-1 reverse transcriptase: implications for primer binding ⬇️

artículo científico publicado el 5 de noviembre de 1991

Localization of the deoxyribose phosphate lyase active site in human DNA polymerase iota by controlled proteolysis.

artículo científico publicado en 2003

Loss of DNA polymerase beta stacking interactions with templating purines, but not pyrimidines, alters catalytic efficiency and fidelity.

artículo científico publicado en 2001

Magnesium-induced assembly of a complete DNA polymerase catalytic complex.

artículo científico publicado en 2006

Mammalian Base Excision Repair: Functional Partnership between PARP-1 and APE1 in AP-Site Repair.

artículo científico publicado en 2015

Mammalian DNA beta-polymerase in base excision repair of alkylation damage.

artículo científico publicado en 2001

Mammalian DNA polymerase beta: characterization of a 16-kDa transdomain fragment containing the nucleic acid-binding activities of the native enzyme

artículo científico publicado el 27 de octubre de 1992

Mammalian base excision repair and DNA polymerase beta ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 1998

Mammalian beta-polymerase promoter: large-scale purification and properties of ATF/CREB palindrome binding protein from bovine testes.

artículo científico publicado en 1991

Mammalian beta-polymerase promoter: phosphorylation of ATF/CRE-binding protein and regulation of DNA binding.

artículo científico publicado en 1991

Mammalian heterogeneous ribonucleoprotein A1 and its constituent domains. Nucleic acid interaction, structural stability and self-association

artículo científico publicado en 1993

Mapping Functional Substrate-Enzyme Interactions in the pol β Active Site through Chemical Biology: Structural Responses to Acidity Modification of Incoming dNTPs

artículo científico publicado en 2018

Mapping of the gene for DNA polymerase beta to mouse chromosome 8

scientific article published on 01 January 1990

Mapping of the interaction interface of DNA polymerase beta with XRCC1.

artículo científico publicado en 2002

Measurement of the rate and velocity of movement by single heart cells in culture

artículo científico publicado en 1973

Metal-induced DNA translocation leads to DNA polymerase conformational activation ⬇️

artículo científico publicado el 14 de diciembre de 2011

Micro-irradiation tools to visualize base excision repair and single-strand break repair

artículo científico publicado en 2015

Minor groove interactions at the DNA polymerase beta active site modulate single-base deletion error rates

scientific article published on 01 September 2000

Mismatch-induced conformational distortions in polymerase beta support an induced-fit mechanism for fidelity.

artículo científico publicado en 2005

Modulating the DNA polymerase β reaction equilibrium to dissect the reverse reaction

artículo científico publicado en 2017

Molecular basis for the faithful replication of 5-methylcytosine and its oxidized forms by DNA polymerase β

scientific article published on 18 March 2019

Multiple forms of DNA polymerase in mouse myeloma.

scientific article published on February 1974

Mutagenesis dependent upon the combination of activation-induced deaminase expression and a double-strand break ⬇️

artículo científico publicado el 9 de septiembre de 2010

Mutagenesis is elevated in male germ cells obtained from DNA polymerase-beta heterozygous mice

scientific article published on 23 July 2008

Mutations associated with base excision repair deficiency and methylation-induced genotoxic stress

artículo científico publicado en 2002

Negligible impact of pol iota expression on the alkylation sensitivity of pol beta-deficient mouse fibroblast cells.

artículo científico publicado en 2008

New assay technique for reactions that produce radioactive gases ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1971

New structural snapshots provide molecular insights into the mechanism of high fidelity DNA synthesis.

artículo científico publicado en 2015

Nuclear Localization of the DNA Repair Scaffold XRCC1: Uncovering the Functional Role of a Bipartite NLS

artículo científico publicado en 2015

OGG1 initiates age-dependent CAG trinucleotide expansion in somatic cells

scientific article published on 22 April 2007

Observing a DNA Polymerase Choose Right from Wrong

artículo científico publicado en 2013

On the measurement of tritium in DNA and its applications to the assay of DNA polymerase activity

artículo científico publicado el 1 de enero de 1976

Oncornavirus expression in human x mouse hybrid cells segregating mouse chromosomes.

artículo científico publicado en 1974

Optimal and variant metal-ion routes in DNA polymerase β's conformational pathways

artículo científico publicado en 2014

Oxidant and environmental toxicant-induced effects compromise DNA ligation during base excision DNA repair

artículo científico publicado en 2015

Oxidized dNTPs and the OGG1 and MUTYH DNA glycosylases combine to induce CAG/CTG repeat instability.

scientific article published on 14 March 2016

Oxidized nucleotide insertion by pol β confounds ligation during base excision repair

artículo científico publicado en 2017

PARP inhibition during alkylation-induced genotoxic stress signals a cell cycle checkpoint response mediated by ATM.

artículo científico publicado en 2009

PARP1 changes from three-dimensional DNA damage searching to one-dimensional diffusion after auto-PARylation or in the presence of APE1.

artículo científico publicado en 2017

Passing the baton in base excision repair

scientific article published on 01 March 2000

Patterns of albumin and general protein synthesis in rat liver as revealed by gel electrophoresis

artículo científico publicado en 1972

Personalized exposure assessment: promising approaches for human environmental health research

artículo científico publicado en 2005

Perspective: pre-chemistry conformational changes in DNA polymerase mechanisms

artículo científico publicado en 2012

Phorbol ester abrogates up-regulation of DNA polymerase beta by DNA-alkylating agents in Chinese hamster ovary cells.

artículo científico publicado en 1995

Phylogenetic analysis and evolutionary origins of DNA polymerase X-family members

artículo científico publicado en 2014

Physical studies of tyrosine and tryptophan residues in mammalian A1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein. Support for a segmented structure

artículo científico publicado en 1991

Physiology of rat-liver polysomes. The stability of messenger ribonucleic acid and ribosomes.

artículo científico publicado en 1967

Pol β associated complex and base excision repair factors in mouse fibroblasts.

artículo científico publicado en 2012

Pol μ dGTP mismatch insertion opposite T coupled with ligation reveals promutagenic DNA repair intermediate

artículo científico publicado en 2018

Poly(ADP-ribose) polymerase activity prevents signaling pathways for cell cycle arrest after DNA methylating agent exposure.

artículo científico publicado en 2005

Polymerase beta simulations suggest that Arg258 rotation is a slow step rather than large subdomain motions per se.

artículo científico publicado en 2002

Polynucleotide recognition by DNA alpha-polymerase ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 1977

Preventing oxidation of cellular XRCC1 affects PARP-mediated DNA damage responses.

artículo científico publicado en 2013

Probing DNA Base-Dependent Leaving Group Kinetic Effects on the DNA Polymerase Transition State.

artículo científico publicado en 2018

Probing structure/function relationships of HIV-1 reverse transcriptase with styrene oxide N2-guanine adducts

scientific article published on 01 March 1997

Processive searching ability varies among members of the gap-filling DNA polymerase X family.

artículo científico publicado en 2017

Properties of a novel oligonucleotide-releasing bidirectional DNA exonuclease from mouse myeloma.

artículo científico publicado en 1984

Protection against methylation-induced cytotoxicity by DNA polymerase beta-dependent long patch base excision repair

artículo científico publicado en 2000

Protein-protein interactions of HIV-1 reverse transcriptase: implication of central and C-terminal regions in subunit binding ⬇️

artículo científico publicado el 17 de diciembre de 1991

Purification and characterization of a DNA polymerase beta promoter initiator element-binding transcription factor from bovine testis.

artículo científico publicado en 1996

Push and pull of base flipping

artículo científico publicado en 1996

REV1 mediated mutagenesis in base excision repair deficient mouse fibroblast.

artículo científico publicado en 2005

Rapid segmental and subdomain motions of DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 2002

Recombinogenic phenotype of human activation-induced cytosine deaminase.

artículo científico publicado en 2004

Reduced frameshift fidelity and processivity of HIV-1 reverse transcriptase mutants containing alanine substitutions in helix H of the thumb subdomain.

artículo científico publicado en 1995

Regulated over-expression of DNA polymerase beta mediates early onset cataract in mice

scientific article published on 01 May 2003

Regulation of Acetylcholinesterase in Neuroblastoma Cells ⬇️

artículo científico publicado el 1 de octubre de 1970

Regulation of DNA repair fidelity by molecular checkpoints: "gates" in DNA polymerase beta's substrate selection

artículo científico publicado en 2006

Regulation of expression of type C virion DNA polymerase (reverse transcriptase) in human x mouse and human x rat hybrid cells ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 1979

Regulation of in vitro nucleic acid strand annealing activity of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein protein A1 by reversible phosphorylation

scientific journal article

Repair pathway for PARP-1 DNA-protein crosslinks

artículo científico publicado en 2018

Replication of O6-methylguanine-containing DNA by repair and replicative DNA polymerases

artículo científico publicado en 1996

Report on the First US-Japan DNA Repair Meeting. Sendai, Japan, October 27-31, 2002

artículo científico publicado en 2003

Reprint of "Oxidant and environmental toxicant-induced effects compromise DNA ligation during base excision DNA repair".

artículo científico publicado en 2015

Requirement for NBS1 in the S phase checkpoint response to DNA methylation combined with PARP inhibition ⬇️

artículo científico publicado el 3 de diciembre de 2010

Requirement of mammalian DNA polymerase-beta in base-excision repair.

artículo científico publicado en 1996

Residues in the alphaH and alphaI helices of the HIV-1 reverse transcriptase thumb subdomain required for the specificity of RNase H-catalyzed removal of the polypurine tract primer

artículo científico publicado en 1999

Rev1 is a base excision repair enzyme with 5'-deoxyribose phosphate lyase activity.

artículo científico publicado en 2016

Revealing an Internal Stabilization Deficiency in the DNA Polymerase β K289M Cancer Variant through the Combined Use of Chemical Biology and X-ray Crystallography

scientific article published on 12 February 2020

Revealing the role of the product metal in DNA polymerase β catalysis

artículo científico publicado en 2017

Role of DNA polymerase β oxidized nucleotide insertion in DNA ligation failure.

artículo científico publicado en 2017

Role of polymerase β in complementing aprataxin deficiency during abasic-site base excision repair

artículo científico publicado en 2014

Role of the "helix clamp" in HIV-1 reverse transcriptase catalytic cycling as revealed by alanine-scanning mutagenesis

artículo científico publicado en 1996

Role of the oxidized form of XRCC1 in protection against extreme oxidative stress

artículo científico publicado en 2017

Selective photochemical modification by trichloroethanol of tryptophan residues in proteins with a high tyrosine-to-tryptophan ratio

artículo científico publicado el 15 de agosto de 1992

Single-nucleotide base excision repair DNA polymerase activity in C. elegans in the absence of DNA polymerase β

artículo científico publicado en 2011

Site-directed mutagenesis of HIV reverse transcriptase to probe enzyme processivity and drug binding ⬇️

artículo científico publicado el 1 de agosto de 1994

Specific inhibition of DNA polymerase beta by its 14 kDa domain: role of single- and double-stranded DNA binding and 5'-phosphate recognition.

artículo científico publicado en 1995

Spotlight on DNA repair and responses to DNA damage.

artículo científico publicado en 2016

Steady-state kinetics of mouse DNA polymerase beta

artículo científico publicado el 24 de julio de 1979

Stereospecific Formation of a Ternary Complex of (S)-α,β-Fluoromethylene-dATP with DNA Pol β

artículo científico publicado en 2012

Stimulation of DNA polymerase activity by the combination of p-hydroxymercuribenzoate and dithiothreitol

artículo científico publicado en 1974

Stimulation of NEIL2-mediated oxidized base excision repair via YB-1 interaction during oxidative stress

artículo científico publicado en 2007

Strategic Combination of DNA-Damaging Agent and PARP Inhibitor Results in Enhanced Cytotoxicity

scientific article published on 30 September 2013

Structural Insights into the Origins of DNA Polymerase Fidelity ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 2003

Structural basis for proficient oxidized ribonucleotide insertion in double strand break repair

artículo científico publicado en 2021

Structural comparison of DNA polymerase architecture suggests a nucleotide gateway to the polymerase active site

artículo científico publicado en 2013

Structural design of a eukaryotic DNA repair polymerase: DNA polymerase beta.

artículo científico publicado en 2000

Structural insight into the DNA polymerase beta deoxyribose phosphate lyase mechanism.

artículo científico publicado en 2005

Structural insights into DNA polymerase beta deterrents for misincorporation support an induced-fit mechanism for fidelity

scientific article published on 01 October 2004

Structural insights into DNA polymerase beta fidelity: hold tight if you want it right

scientific article published on 01 January 1998

Structure and mechanism of DNA polymerase Beta.

artículo científico publicado en 2006

Structure and mechanism of DNA polymerase β

artículo científico publicado en 2014

Structure of DNA polymerase beta with the mutagenic DNA lesion 8-oxodeoxyguanine reveals structural insights into its coding potential

artículo científico publicado en 2003

Structures of DNA Polymerase Mispaired DNA Termini Transitioning to Pre-catalytic Complexes Support an Induced-Fit Fidelity Mechanism

artículo científico publicado en 2016

Structures of DNA Polymerase β with Active-Site Mismatches Suggest a Transient Abasic Site Intermediate during Misincorporation

artículo científico publicado en 2008

Structures of dNTP Intermediate States during DNA Polymerase Active Site Assembly

artículo científico publicado en 2012

Structures of human DNA polymerases ν and θ expose their end game.

artículo científico publicado en 2015

Structures of ternary complexes of rat DNA polymerase beta, a DNA template-primer, and ddCTP

artículo científico publicado en 1994

Studies of the strand-annealing activity of mammalian hnRNP complex protein A1 ⬇️

artículo científico publicado el 4 de diciembre de 1990

Studies on DNA alpha-polymerase of mouse myeloma: partial purification and comparison of three molecular forms of the enzyme

artículo científico publicado en 1976

Studies on DNA synthesis in murine myeloma. II. Activation of latent RNA-dependent DNA polymerase activity in membrane fractions

artículo científico publicado en 1972

Studies on the physiology of rat liver polyribosomes: quantition and intracellular distribution of ribosomes.

artículo científico publicado en 1965

Studies on the relationship between deoxyribonucleic acid polymerase activity and intracisternal A-type particles in mouse myeloma.

artículo científico publicado en 1974

Substrate channeling in mammalian base excision repair pathways: passing the baton

artículo científico publicado en 2010

Substrate rescue of DNA polymerase β containing a catastrophic L22P mutation

artículo científico publicado en 2014

Substrate-induced DNA polymerase β activation.

artículo científico publicado en 2014

Subunits of human replication protein A are crosslinked by photoreactive primers synthesized by DNA polymerases.

artículo científico publicado en 1998

Suicidal cross-linking of PARP-1 to AP site intermediates in cells undergoing base excision repair.

artículo científico publicado en 2014

Syn-full behavior by T7 DNA polymerase.

artículo científico publicado en 2005

Synthesis and biological evaluation of fluorinated deoxynucleotide analogs based on bis-(difluoromethylene)triphosphoric acid ⬇️

artículo científico publicado el 19 de agosto de 2010

Synthesis of DNA polymerase by in vitro translation of calf RNA

artículo científico publicado en 1984

Synthesis of catalytically active polymerase alpha by in vitro translation of calf RNA

artículo científico publicado en 1984

Template specific inhibitor of mammalian DNA polymerases ⬇️

artículo científico publicado el 1 de marzo de 1976

The 3rd Japan-US DNA Repair Meeting, Sendai, Japan, May 7-11, 2007

artículo científico publicado en 2007

The ATF/CREB transcription factor-binding site in the polymerase beta promoter mediates the positive effect of N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidine on transcription ⬇️

artículo científico publicado el 1 de mayo de 1991

The Environmental Genome Project: phase I and beyond.

artículo científico publicado en 2004

The HIV-1 transactivator protein Tat is a potent inducer of the human DNA repair enzyme beta-polymerase.

artículo científico publicado en 2001

The Pol β variant containing exon α is deficient in DNA polymerase but has full dRP lyase activity

scientific article published on 09 July 2019

The X family portrait: structural insights into biological functions of X family polymerases.

artículo científico publicado en 2007

The base substitution fidelity of DNA polymerase beta-dependent single nucleotide base excision repair.

artículo científico publicado en 2003

The bovine DNA polymerase beta promoter: cloning, characterization and comparison with the human core promoter.

artículo científico publicado en 1995

The cloned promoter of the human DNA beta-polymerase gene contains a cAMP response element functional in HeLa cells

artículo científico publicado en 1992

The dark side of DNA repair

artículo científico publicado en 2014

The domain organization and properties of individual domains of DNA topoisomerase V, a type 1B topoisomerase with DNA repair activities.

artículo científico publicado en 2001

The fidelity of DNA polymerase beta during distributive and processive DNA synthesis

artículo científico publicado en 1999

The human DNA polymerase beta gene structure. Evidence of alternative splicing in gene expression

artículo científico publicado en 1994

Thermodynamics of human DNA ligase I trimerization and association with DNA polymerase beta

scientific journal article

Time-lapse crystallography snapshots of a double-strand break repair polymerase in action

artículo científico

Transcriptional mutagenesis mediated by 8-oxoG induces translational errors in mammalian cells.

artículo científico publicado en 2018

Transition state in DNA polymerase β catalysis: rate-limiting chemistry altered by base-pair configuration.

scientific article published on 12 March 2014

Transitions in DNA polymerase β μs-ms dynamics related to substrate binding and catalysis

artículo científico publicado en 2018

Two Scaffolds from Two Flips: (α,β)/(β,γ) CH2/NH "Met-Im" Analogues of dTTP

artículo científico publicado en 2015

Uncovering the polymerase-induced cytotoxicity of an oxidized nucleotide

artículo científico publicado en 2014

Understanding the loss-of-function in a triple missense mutant of DNA polymerase β found in prostate cancer.

artículo científico publicado en 2013

Unencumbered Pol β lyase activity in nucleosome core particles

artículo científico publicado en 2017

Up-regulation of base excision repair correlates with enhanced protection against a DNA damaging agent in mouse cell lines ⬇️

artículo científico publicado el 15 de abril de 1998

Vertebrate POLQ and POLbeta cooperate in base excision repair of oxidative DNA damage

artículo científico publicado en 2006

Vertical-scanning mutagenesis of a critical tryptophan in the "minor groove binding track" of HIV-1 reverse transcriptase. Major groove DNA adducts identify specific protein interactions in the minor groove.

artículo científico publicado en 2000

Vertical-scanning mutagenesis of a critical tryptophan in the minor groove binding track of HIV-1 reverse transcriptase. Molecular nature of polymerase-nucleic acid interactions

artículo científico publicado en 1998

Watching a DNA polymerase in action

artículo científico publicado en 2014

Watching a double strand break repair polymerase insert a pro-mutagenic oxidized nucleotide

artículo científico publicado en 2021

XRCC1 phosphorylation affects aprataxin recruitment and DNA deadenylation activity.

artículo científico publicado en 2018

XRCC1-mediated repair of strand breaks independent of PNKP binding.

artículo científico publicado en 2017

Yeast open reading frame YCR14C encodes a DNA beta-polymerase-like enzyme

artículo científico publicado en 1993

dNTP binding site in rat DNA polymerase beta revealed by controlled proteolysis and azido photoprobe cross-linking

artículo científico publicado en 1996

dNTP binding to HIV-1 reverse transcriptase and mammalian DNA polymerase beta as revealed by affinity labeling with a photoreactive dNTP analog.

artículo científico publicado en 1996

α,β-Difluoromethylene Deoxynucleoside 5′-Triphosphates: A Convenient Synthesis of Useful Probes for DNA Polymerase β Structure and Function

artículo científico publicado en 2009

β,γ-CHF- and β,γ-CHCl-dGTP Diastereomers: Synthesis, Discrete 31 P NMR Signatures, and Absolute Configurations of New Stereochemical Probes for DNA Polymerases

artículo científico publicado en 2012

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