Filtros de búsqueda

Lista de obras de Jane S. Richardson

A high resolution structure of an inhibitor complex of the extracellular nuclease of Staphylococcus aureus. I. Experimental procedures and chain tracing

artículo científico publicado en 1971

A new generation of crystallographic validation tools for the protein data bank

artículo científico publicado en 2011

A new way to see RNAs

artículo científico publicado en 2020

A test of enhancing model accuracy in high-throughput crystallography

artículo científico publicado en 2005

Advances, interactions, and future developments in the CNS, Phenix, and Rosetta structural biology software systems

artículo científico publicado en 2013

Algorithm for backrub motions in protein design

artículo científico publicado en 2008

All-atom contacts: a new approach to structure validation

artículo científico publicado en 2003

Alpha-carbon coordinates for bovine Cu,Zn superoxide dismutase

artículo científico publicado el 21 de abril de 1975

Amino acid preferences for specific locations at the ends of alpha helices

artículo científico publicado en 1988

An algorithm for smoothly tessellating beta-sheet structures in proteins

artículo científico publicado en 1995

An illustrated museum of protein structures

artículo científico publicado en 1980

Asparagine and glutamine: using hydrogen atom contacts in the choice of side-chain amide orientation

artículo científico publicado en 1999

Assessment of Molecular Construction in Undergraduate Biochemistry

article

Assessment of detailed conformations suggests strategies for improving cryoEM models: Helix at lower resolution, ensembles, pre-refinement fixups, and validation at multi-residue length scale

Autofix for backward-fit sidechains: using MolProbity and real-space refinement to put misfits in their place

artículo científico publicado en 2008

Automated identification of elemental ions in macromolecular crystal structures

artículo científico publicado en 2014

Away from the edge II: in-house Se-SAS phasing with chromium radiation

artículo científico publicado en 2005

Biophysical highlights from 54 years of macromolecular crystallography

artículo científico publicado en 2014

Broad Analysis of Vicinal Disulfides: Occurrences, Conformations with Cis or with Trans Peptides, and Functional Roles Including Sugar Binding

artículo científico publicado en 2017

Computational Methods for RNA Structure Validation and Improvement

artículo científico publicado en 2015

Constructing atomic structural models into cryo-EM densities using molecular dynamics - Pros and cons

artículo científico publicado en 2018

Cryo-EM model validation recommendations based on outcomes of the 2019 EMDataResource challenge

artículo científico publicado en 2021

Crystallographic model validation: from diagnosis to healing ⬇️

artículo científico publicado el 21 de septiembre de 2013

De novo design, expression, and characterization of Felix: a four-helix bundle protein of native-like sequence

artículo científico publicado en 1990

Describing patterns of protein tertiary structure

artículo científico publicado en 1985

Doing Molecular Biophysics: Finding, Naming, and Picturing Signal Within Complexity ⬇️

artículo científico publicado el 28 de febrero de 2013

Electrostatic recognition between superoxide and copper, zinc superoxide dismutase

artículo científico publicado en 1983

Facile chemical synthesis and equilibrium unfolding properties of CopG.

artículo científico publicado en 2004

Graphical tools for macromolecular crystallography in PHENIX

artículo científico publicado en 2012

Helix lap-joints as ion-binding sites: DNA-binding motifs and Ca-binding "EF hands" are related by charge and sequence reversal

artículo científico publicado en 1988

Improved AlphaFold modeling with implicit experimental information

artículo científico publicado en 2022

Improved chemistry restraints for crystallographic refinement by integrating the Amber force field into Phenix

scientific article published on 01 January 2020

Interpretation of electron density maps

artículo científico publicado en 1985

KinImmerse: Macromolecular VR for NMR ensembles

artículo científico publicado en 2009

Kinemages--simple macromolecular graphics for interactive teaching and publication

artículo científico publicado en 1994

Kinetic role of helix caps in protein folding is context-dependent

artículo científico publicado en 2004

MOLPROBITY: structure validation and all-atom contact analysis for nucleic acids and their complexes

artículo científico publicado en 2004

Macromolecular structure determination using X-rays, neutrons and electrons: recent developments in Phenix

scientific article published on 02 October 2019

Making the invisible enemy visible

scientific article published on 07 October 2020

Making the invisible enemy visible

artículo científico publicado en 2021

Manganese superoxide dismutases from Escherichia coli and from yeast mitochondria: preliminary x-ray crystallographic studies

artículo científico publicado el 5 de agosto de 1976

Mismodeled purines: implicit alternates and hidden Hoogsteens

artículo científico publicado en 2017

Model validation: local diagnosis, correction and when to quit

artículo científico publicado en 2018

MolProbity: More and better reference data for improved all-atom structure validation

artículo científico publicado en 2017

MolProbity: all-atom contacts and structure validation for proteins and nucleic acids

artículo científico publicado en 2007

MolProbity: all-atom structure validation for macromolecular crystallography

artículo científico publicado en 2010

Molecular conformation of erabutoxin b; Atomic coordinates at 2.5 Å resolution ⬇️

artículo científico publicado el 13 de junio de 1979

Molprobity's ultimate rotamer-library distributions for model validation

artículo científico publicado en 2016

Multiscale conformational heterogeneity in staphylococcal protein a: possible determinant of functional plasticity

artículo científico publicado en 2014

Natural beta-sheet proteins use negative design to avoid edge-to-edge aggregation

artículo científico publicado en 2002

New insights into Hoogsteen base pairs in DNA duplexes from a structure-based survey

artículo científico publicado en 2015

New tools and data for improving structures, using all-atom contacts

artículo científico publicado en 2003

New tools in MolProbity validation: CaBLAM for CryoEM backbone, UnDowser to rethink "waters," and NGL Viewer to recapture online 3D graphics

artículo científico publicado en 2019

New tools provide a second look at HDV ribozyme structure, dynamics and cleavage

artículo científico publicado en 2014

OSPREY: protein design with ensembles, flexibility, and provable algorithms

artículo científico publicado en 2013

PHENIX: a comprehensive Python-based system for macromolecular structure solution

artículo científico publicado en 2010

Preliminary X-ray diffraction studies of acyl carrier protein from Escherichia coli

artículo científico publicado en 1985

Protein imperfections: separating intrinsic from extrinsic variation of torsion angles.

artículo científico publicado en 2004

Puzzle pieces defined: locating common packing units in tertiary protein contacts ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 1996

RNA backbone is rotameric ⬇️

artículo científico publicado el 11 de noviembre de 2003

RNA backbone rotamers--finding your way in seven dimensions

artículo científico publicado en 2005

RNA backbone: consensus all-angle conformers and modular string nomenclature (an RNA Ontology Consortium contribution)

artículo científico publicado en 2008

Recent developments in phasing and structure refinement for macromolecular crystallography

artículo científico publicado en 2009

Recommendations of the wwPDB NMR Validation Task Force

artículo científico publicado en 2013

Schematic drawings of protein structures

artículo científico publicado en 1985

Scientific benchmarks for guiding macromolecular energy function improvement

artículo científico publicado en 2013

Simultaneous comparison of three protein sequences

artículo científico publicado en 1985

Structural and transcriptional analyses of a purine nucleotide-binding protein from Pyrococcus furiosus: a component of a novel, membrane-bound multiprotein complex unique to this hyperthermophilic archaeon

artículo científico publicado en 2007

Structural genomics of Pyrococcus furiosus: X-ray crystallography reveals 3D domain swapping in rubrerythrin

artículo científico publicado en 2004

Structure and mechanism of copper, zinc superoxide dismutase ⬇️

artículo científico publicado el 17 de noviembre de 1983

Structure of the hypothetical protein PF0899 fromPyrococcus furiosusat 1.85 Å resolution

artículo científico publicado en 2007

Structure validation by Calpha geometry: phi,psi and Cbeta deviation

artículo científico publicado en 2003

Structures of the bacterial ribosome in classical and hybrid states of tRNA binding

artículo científico publicado en 2011

Studying and polishing the PDB's macromolecules

artículo científico publicado en 2013

SymROP: ROP protein with identical helices redesigned by all-atom contact analysis and molecular dynamics.

artículo científico publicado en 2000

THE DE NOVO DESIGN OF PROTEIN STRUCTURES

artículo científico publicado en 1990

Target domain definition and classification in CASP8

artículo científico publicado en 2009

Teaching and Assessing Three-Dimensional Molecular Literacy in Undergraduate Biochemistry

artículo científico publicado en 2002

Teaching molecular 3-D literacy

artículo científico publicado en 2002

The Phenix software for automated determination of macromolecular structures

artículo científico publicado en 2011

The RNA Ontology Consortium: an open invitation to the RNA community

artículo científico publicado en 2006

The anatomy and taxonomy of protein structure

artículo científico publicado en 1981

The backrub motion: how protein backbone shrugs when a sidechain dances

artículo científico publicado en 2006

The cis-Pro touch-turn: a rare motif preferred at functional sites.

artículo científico publicado en 2004

The extracellular nuclease of Staphylococcus aureus: structures of the native enzyme and an enzyme-inhibitor complex at 4 A resolution

artículo científico publicado en 1969

The high-throughput protein-to-structure pipeline at SECSG.

artículo científico publicado en 2005

The other 90% of the protein: assessment beyond the Calphas for CASP8 template-based and high-accuracy models

artículo científico publicado en 2009

The penultimate rotamer library

artículo científico publicado en 2000

The penultimate rotamer library

scholarly article by Simon C. Lovell published in January 2000

The protein surface is a moving target

artículo científico publicado en 2004

The role of local backrub motions in evolved and designed mutations

artículo científico publicado en 2012

The simple construction of protein alpha-carbon models

artículo científico publicado en 1972

The singly-wound parallel β barrel: A proposed structure for 2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase ⬇️

artículo científico publicado el 12 de septiembre de 1979

The toxin-agglutinin fold. A new group of small protein structures organized around a four-disulfide core

artículo científico publicado en 1980

Three dimensional structure of erabutoxin b neurotoxic protein: inhibitor of acetylcholine receptor ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 1976

Two Crystal Forms of Bovine Superoxide Dismutase ⬇️

artículo científico publicado el 10 de octubre de 1972

Use of knowledge-based restraints in phenix.refine to improve macromolecular refinement at low resolution

artículo científico publicado en 2012

VIEW

artículo científico publicado en 1993

Visualizing and quantifying molecular goodness-of-fit: small-probe contact dots with explicit hydrogen atoms

artículo científico publicado en 1999

phenix.model_vs_data: a high-level tool for the calculation of crystallographic model and data statistics

artículo científico publicado en 2010

Dominio Público Uruguay está sostenido por:

Acerca de Dominio Público Uruguay

Ayuda