Filtros de búsqueda

Lista de obras de

<i>Mycobacterium abscessus</i> biofilms produce an extracellular matrix and have a distinct mycolic acid profile

artículo científico publicado en 2021

A Major Role for Nonenzymatic Antioxidant Processes in the Radioresistance of Halobacterium salinarum

artículo científico publicado el 28 de enero de 2011

A genome wide dosage suppressor network reveals genomic robustness.

artículo científico publicado en 2016

A high-resolution network model for global gene regulation in Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2014

A miRNA-regulatory network explains how dysregulated miRNAs perturb oncogenic processes across diverse cancers.

artículo científico publicado en 2012

A predictive model for transcriptional control of physiology in a free living cell.

artículo científico publicado en 2007

A refined genome-scale reconstruction of Chlamydomonas metabolism provides a platform for systems-level analyses

artículo científico publicado en 2015

A role for programmed cell death in the microbial loop

artículo científico publicado en 2013

A single transcription factor regulates evolutionarily diverse but functionally linked metabolic pathways in response to nutrient availability

artículo científico publicado en 2009

A system-level model for the microbial regulatory genome

artículo científico publicado en 2014

A systems level predictive model for global gene regulation of methanogenesis in a hydrogenotrophic methanogen

artículo científico publicado en 2013

A systems view of haloarchaeal strategies to withstand stress from transition metals

artículo científico publicado en 2006

A systems-level gene regulatory network model for Plasmodium falciparum

artículo científico publicado en 2021

An evolutionarily conserved RNase-based mechanism for repression of transcriptional positive autoregulation

artículo científico publicado en 2014

An integrated systems approach for understanding cellular responses to gamma radiation

artículo científico publicado en 2006

Antibody-recruiting protein-catalyzed capture agents to combat antibiotic-resistant bacteria

artículo científico publicado en 2020

Architecture for interoperable software in biology

artículo científico publicado en 2014

Bicluster Sampled Coherence Metric (BSCM) provides an accurate environmental context for phenotype predictions.

artículo científico publicado en 2015

CTCF physically links cohesin to chromatin

artículo científico publicado en 2008

Causal Mechanistic Regulatory Network for Glioblastoma Deciphered Using Systems Genetics Network Analysis.

artículo científico publicado en 2016

Combining inferred regulatory and reconstructed metabolic networks enhances phenotype prediction in yeast

artículo científico publicado en 2017

Comprehensive de novo structure prediction in a systems-biology context for the archaea Halobacterium sp. NRC-1

artículo científico publicado en 2004

Coordinate regulation of energy transduction modules in Halobacterium sp. analyzed by a global systems approach

artículo científico publicado en 2002

Coordination of frontline defense mechanisms under severe oxidative stress

artículo científico publicado el 1 de julio de 2010

Crippling life support for SARS-CoV-2 and other viruses through synthetic lethality

artículo científico publicado en 2020

Cytoscape: a software environment for integrated models of biomolecular interaction networks

artículo científico publicado en 2003

Data-driven integration of genome-scale regulatory and metabolic network models

artículo científico publicado en 2015

Diurnally entrained anticipatory behavior in archaea

artículo científico publicado en 2009

Effects of H2 and formate on growth yield and regulation of methanogenesis in Methanococcus maripaludis

artículo científico publicado en 2013

Evolution of context dependent regulation by expansion of feast/famine regulatory proteins

artículo científico publicado en 2014

GTC: A web server for integrating systems biology data with web tools and desktop applications

artículo científico publicado en 2010

General transcription factor specified global gene regulation in archaea

artículo científico publicado en 2007

Genome sequence of Haloarcula marismortui: a halophilic archaeon from the Dead Sea

artículo científico publicado en 2004

Genome-wide CRISPR-Cas9 Screens Reveal Loss of Redundancy between PKMYT1 and WEE1 in Glioblastoma Stem-like Cells

artículo científico publicado en 2015

Global analysis of mRNA stability in Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado el 3 de noviembre de 2012

Halobacterium salinarum NRC-1 PeptideAtlas: toward strategies for targeted proteomics and improved proteome coverage

artículo científico publicado en 2008

Harnessing the power of human tumor-derived cell lines for the rational design of cancer therapies.

artículo científico publicado en 2012

Inference of Bacterial Small RNA Regulatory Networks and Integration with Transcription Factor-Driven Regulatory Networks

scientific article published on 02 June 2020

Inference of expanded Lrp-like feast/famine transcription factor targets in a non-model organism using protein structure-based prediction

artículo científico publicado en 2014

Integrated biclustering of heterogeneous genome-wide datasets for the inference of global regulatory networks

artículo científico publicado en 2006

Integration and visualization of systems biology data in context of the genome

artículo científico publicado en 2010

Intricate Genetic Programs Controlling Dormancy in Mycobacterium tuberculosis

scientific article published on 01 April 2020

Large scale physiological readjustment during growth enables rapid, comprehensive and inexpensive systems analysis

artículo científico publicado en 2010

Low-pass sequencing for microbial comparative genomics

artículo científico publicado en 2004

Mapping and manipulating the Mycobacterium tuberculosis transcriptome using a transcription factor overexpression-derived regulatory network

artículo científico publicado en 2014

Mathematical models to study the biology of pathogens and the infectious diseases they cause

publication published on 15 March 2022

Mechanism for microbial population collapse in a fluctuating resource environment.

artículo científico publicado en 2017

Metallochaperones regulate intracellular copper levels

artículo científico publicado en 2013

MiR-155-regulated molecular network orchestrates cell fate in the innate and adaptive immune response to Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2016

Model-based deconvolution of genome-wide DNA binding

artículo científico

Molecular mechanisms of system responses to novel stimuli are predictable from public data

artículo científico publicado en 2013

Network portal: a database for storage, analysis and visualization of biological networks.

artículo científico publicado en 2013

Niche adaptation by expansion and reprogramming of general transcription factors.

artículo científico publicado en 2011

Parallel evolution of transcriptome architecture during genome reorganization

artículo científico publicado en 2011

Path-seq identifies an essential mycolate remodeling program for mycobacterial host adaptation

artículo científico publicado en 2019

Prevalence of transcription promoters within archaeal operons and coding sequences.

artículo científico publicado en 2009

Proteomic analysis of an extreme halophilic archaeon, Halobacterium sp. NRC-1.

artículo científico publicado en 2003

Quantitative prediction of conditional vulnerabilities in regulatory and metabolic networks using PRIME

artículo científico publicado en 2021

Selective Translation of Low Abundance and Upregulated Transcripts in Halobacterium salinarum

artículo científico publicado en 2020

Sense overlapping transcripts in IS1341-type transposase genes are functional non-coding RNAs in archaea

artículo científico publicado en 2015

Structure-based predictions broadly link transcription factor mutations to gene expression changes in cancers

artículo científico publicado en 2014

Synergistic epistasis enhances the co-operativity of mutualistic interspecies interactions

artículo científico

Systems level insights into the stress response to UV radiation in the halophilic archaeon Halobacterium NRC-1

artículo científico publicado en 2004

The DNA-binding network of Mycobacterium tuberculosis

artículo científico publicado en 2015

The Firegoose: two-way integration of diverse data from different bioinformatics web resources with desktop applications

artículo científico publicado en 2007

The Gaggle: an open-source software system for integrating bioinformatics software and data sources

artículo científico publicado en 2006

The Inferelator: an algorithm for learning parsimonious regulatory networks from systems-biology data sets de novo

artículo científico publicado en 2006

The Transcription Factor Nfatc2 Regulates β-Cell Proliferation and Genes Associated with Type 2 Diabetes in Mouse and Human Islets

artículo científico publicado en 2016

The anatomy of microbial cell state transitions in response to oxygen

artículo científico publicado en 2007

The role of predictive modelling in rationally re-engineering biological systems

artículo científico publicado en 2009

Transcription start site associated RNAs (TSSaRNAs) are ubiquitous in all domains of life

artículo científico publicado en 2014

Transcriptional program for nitrogen starvation-induced lipid accumulation in Chlamydomonas reinhardtii

artículo científico publicado en 2015

Transcriptional regulatory networks underlying gene expression changes in Huntington's disease

artículo científico publicado en 2018

Transcriptome signature of cell viability predicts drug response and drug interaction in Mycobacterium tuberculosis

artículo científico

Two transcription factors are necessary for iron homeostasis in a salt-dwelling archaeon

artículo científico publicado el 24 de noviembre de 2010

Visualization of omics data for systems biology

artículo científico publicado en 2010

cMonkey2: Automated, systematic, integrated detection of co-regulated gene modules for any organism

artículo científico publicado en 2015

metaXCMS: second-order analysis of untargeted metabolomics data

artículo científico publicado en 2010

miRvestigator: web application to identify miRNAs responsible for co-regulated gene expression patterns discovered through transcriptome profiling.

artículo científico publicado en 2011