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Lista de obras de Jack Greenblatt

A Bayesian Networks Approach for Predicting Protein-Protein Interactions from Genomic Data ⬇️

artículo científico publicado el 17 de octubre de 2003

A Role for SlyD in the Escherichia coli Hydrogenase Biosynthetic Pathway

artículo científico publicado en 2004

A Snf2 family ATPase complex required for recruitment of the histone H2A variant Htz1.

artículo científico publicado en 2003

A dual function of the CRISPR-Cas system in bacterial antivirus immunity and DNA repair

artículo científico publicado en 2011

A genome-wide screen identifies the evolutionarily conserved KEOPS complex as a telomere regulator

artículo científico publicado en 2006

A histone code for chromatin assembly

artículo científico publicado en 2008

A lentiviral functional proteomics approach identifies chromatin remodeling complexes important for the induction of pluripotency

artículo científico publicado en 2010

A panoramic view of yeast noncoding RNA processing

artículo científico publicado en 2003

A phosphatase complex that dephosphorylates gammaH2AX regulates DNA damage checkpoint recovery

artículo científico publicado en 2006

A systematic characterization of Cwc21, the yeast ortholog of the human spliceosomal protein SRm300.

artículo científico publicado en 2009

A unified model for yeast transcript definition

artículo científico publicado en 2013

An acetylated form of histone H2A.Z regulates chromosome architecture in Schizosaccharomyces pombe

artículo científico publicado en 2009

An atlas of chaperone-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae: implications to protein folding pathways in the cell

artículo científico publicado en 2009

Array-Based Synthetic Genetic Screens to Map Bacterial Pathways and Functional Networks in Escherichia coli ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2011

Assessment of a method to characterize antibody selectivity and specificity for use in immunoprecipitation

artículo científico publicado en 2015

Association with the origin recognition complex suggests a novel role for histone acetyltransferase Hat1p/Hat2p

artículo científico publicado en 2007

BUR kinase selectively regulates H3 K4 trimethylation and H2B ubiquitylation through recruitment of the PAF elongation complex

artículo científico publicado en 2005

Biosynthesis of the respiratory formate dehydrogenases from Escherichia coli: characterization of the FdhE protein

artículo científico publicado en 2008

Bre1, an E3 ubiquitin ligase required for recruitment and substrate selection of Rad6 at a promoter

artículo científico publicado en 2003

Bridging structural biology and genomics: assessing protein interaction data with known complexes

artículo científico publicado en 2004

Bridging structural biology and genomics: assessing protein interaction data with known complexes

artículo científico publicado en 2002

Bromodomain factor 1 (Bdf1) is phosphorylated by protein kinase CK2

artículo científico publicado en 2004

C2H2 zinc finger proteins greatly expand the human regulatory lexicon

artículo científico publicado en 2015

COMPASS, a histone H3 (Lysine 4) methyltransferase required for telomeric silencing of gene expression

artículo científico publicado en 2002

Chaperone control of the activity and specificity of the histone H3 acetyltransferase Rtt109.

artículo científico publicado en 2008

Conserved network of proteins essential for bacterial viability

artículo científico publicado en 2009

Control of the RNA polymerase II phosphorylation state in promoter regions by CTD interaction domain-containing proteins RPRD1A and RPRD1B ⬇️

artículo científico publicado el 1 de septiembre de 2011

Control of transcriptional elongation and cotranscriptional histone modification by the yeast BUR kinase substrate Spt5.

artículo científico publicado en 2009

Cotranscriptional set2 methylation of histone H3 lysine 36 recruits a repressive Rpd3 complex

artículo científico publicado en 2005

Crosstalk between RNA Pol II C-Terminal Domain Acetylation and Phosphorylation via RPRD Proteins

artículo científico publicado en 2019

DAnCER: disease-annotated chromatin epigenetics resource

artículo científico publicado en 2011

Defining the budding yeast chromatin‐associated interactome ⬇️

artículo científico publicado el 21 de diciembre de 2010

Dephosphorylation of RNA Polymerase I by Fcp1p Is Required for Efficient rRNA Synthesis

scientific article published on 08 April 2004

Direct and selective binding of an acidic transcriptional activation domain to the TATA-box factor TFIID

artículo científico publicado en 1990

Direct interaction between the PRDM3 and PRDM16 tumor suppressors and the NuRD chromatin remodeling complex

artículo científico publicado en 2019

Discovery of a chemical probe for the L3MBTL3 methyllysine reader domain

artículo científico publicado en 2013

ESF1 is required for 18S rRNA synthesis in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2004

Epistatic relationships reveal the functional organization of yeast transcription factors

artículo científico publicado en 2010

Erratum: Corrigendum: A phosphatase complex that dephosphorylates γH2AX regulates DNA damage checkpoint recovery

artículo científico publicado en 2006

Esf2p, a U3-associated factor required for small-subunit processome assembly and compaction

artículo científico publicado en 2005

Examining protein protein interactions using endogenously tagged yeast arrays: the cross-and-capture system

artículo científico publicado en 2007

Expanding the landscape of chromatin modification (CM)-related functional domains and genes in human

artículo científico publicado en 2010

Exploration of essential gene functions via titratable promoter alleles

artículo científico publicado en 2004

Exploration of the function and organization of the yeast early secretory pathway through an epistatic miniarray profile

artículo científico publicado en 2005

Extracting high confidence protein interactions from affinity purification data: at the crossroads

artículo científico publicado en 2015

Formation of a distinctive complex between the inducible bacterial lysine decarboxylase and a novel AAA+ ATPase

artículo científico publicado en 2005

Functional characterization of RebL1 highlights the evolutionary conservation of oncogenic activities of the RBBP4/7 orthologue in Tetrahymena thermophila

artículo científico publicado en 2021

Functional dissection of protein complexes involved in yeast chromosome biology using a genetic interaction map

artículo científico publicado en 2007

G9a and ZNF644 Physically Associate to Suppress Progenitor Gene Expression during Neurogenesis

artículo científico publicado en 2016

Genetic interaction maps in Escherichia coli reveal functional crosstalk among cell envelope biogenesis pathways

artículo científico publicado en 2011

Genomic location of the human RNA polymerase II general machinery: evidence for a role of TFIIF and Rpb7 at both early and late stages of transcription

artículo científico publicado en 2008

Global functional atlas of Escherichia coli encompassing previously uncharacterized proteins

artículo científico publicado en 2009

Global landscape of cell envelope protein complexes in Escherichia coli.

artículo científico publicado en 2017

Global landscape of protein complexes in the yeast Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2006

Global mapping of the yeast genetic interaction network

artículo científico publicado en 2004

H2B ubiquitin protease Ubp8 and Sgf11 constitute a discrete functional module within the Saccharomyces cerevisiae SAGA complex.

artículo científico publicado en 2005

High-definition macromolecular composition of yeast RNA-processing complexes

artículo científico publicado en 2004

Histone H2B ubiquitylation is associated with elongating RNA polymerase II

artículo científico publicado en 2005

Hsp110 is required for spindle length control ⬇️

artículo científico publicado el 20 de agosto de 2012

Human-chromatin-related protein interactions identify a demethylase complex required for chromosome segregation

artículo científico publicado en 2014

INO80 and gamma-H2AX interaction links ATP-dependent chromatin remodeling to DNA damage repair.

artículo científico publicado en 2004

Identification and Characterization of USP7 Targets in Cancer Cells

artículo científico publicado en 2018

Identification and characterization of Elf1, a conserved transcription elongation factor in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2005

Identification of Mammalian Protein Complexes by Lentiviral-Based Affinity Purification and Mass Spectrometry ⬇️

artículo científico publicado el 1 de enero de 2011

Identification of Protein Complexes in <em>Escherichia coli</em> using Sequential Peptide Affinity Purification in Combination with Tandem Mass Spectrometry ⬇️

artículo científico publicado el 12 de noviembre de 2012

Identification of a BET family bromodomain/casein kinase II/TAF-containing complex as a regulator of mitotic condensin function

scientific article published on 22 February 2014

Identification of herpesvirus proteins that contribute to G1/S arrest

artículo científico publicado en 2014

Identifying functional modules in the physical interactome of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2007

Inhibition of SCF ubiquitin ligases by engineered ubiquitin variants that target the Cul1 binding site on the Skp1-F-box interface.

artículo científico publicado en 2016

Interacting proteins Rtt109 and Vps75 affect the efficiency of non-homologous end-joining in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2008

Interaction landscape of membrane-protein complexes in Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2012

Interaction network containing conserved and essential protein complexes in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2005

Interaction of Fcp1 phosphatase with elongating RNA polymerase II holoenzyme, enzymatic mechanism of action, and genetic interaction with elongator

artículo científico publicado en 2004

Interactions of the Escherichia coli hydrogenase biosynthetic proteins: HybG complex formation

artículo científico publicado en 2005

Interactions of the HIV-1 Tat and RAP74 proteins with the RNA polymerase II CTD phosphatase FCP1

scientific journal article

Investigating the in vivo activity of the DeaD protein using protein-protein interactions and the translational activity of structured chloramphenicol acetyltransferase mRNAs

artículo científico publicado en 2007

Local coherence in genetic interaction patterns reveals prevalent functional versatility

artículo científico publicado en 2008

MKRN2 Physically Interacts with GLE1 to Regulate mRNA Export and Zebrafish Retinal Development

artículo científico publicado en 2020

Maintenance of low histone ubiquitylation by Ubp10 correlates with telomere-proximal Sir2 association and gene silencing.

artículo científico publicado en 2005

Mapping bacterial functional networks and pathways in Escherichia Coli using synthetic genetic arrays

artículo científico publicado en 2012

Mapping the functional yeast ABC transporter interactome

artículo científico publicado en 2013

Multilayered Control of Alternative Splicing Regulatory Networks by Transcription Factors

artículo científico publicado en 2017

Multiparameter functional diversity of human C2H2 zinc finger proteins.

artículo científico publicado en 2016

NMR structure of a complex containing the TFIIF subunit RAP74 and the RNA polymerase II carboxyl-terminal domain phosphatase FCP1

artículo científico publicado en 2003

Navigating the chaperone network: an integrative map of physical and genetic interactions mediated by the hsp90 chaperone

artículo científico publicado en 2005

Novel function discovery with GeneMANIA: a new integrated resource for gene function prediction in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

Optimizing Production of Antigens and Fabs in the Context of Generating Recombinant Antibodies to Human Proteins

artículo científico publicado en 2015

Organization and function of APT, a subcomplex of the yeast cleavage and polyadenylation factor involved in the formation of mRNA and small nucleolar RNA 3'-ends

artículo científico publicado en 2003

OrthoNets: simultaneous visual analysis of orthologs and their interaction neighborhoods across different organisms

artículo científico publicado en 2011

PIPE: a protein-protein interaction prediction engine based on the re-occurring short polypeptide sequences between known interacting protein pairs

artículo científico publicado en 2006

Panorama of ancient metazoan macromolecular complexes

artículo científico publicado en 2015

Proteasome Involvement in the Repair of DNA Double-Strand Breaks

Protein profiling with Epstein-Barr nuclear antigen-1 reveals an interaction with the herpesvirus-associated ubiquitin-specific protease HAUSP/USP7.

artículo científico publicado en 2003

Proteome-wide dataset supporting the study of ancient metazoan macromolecular complexes

artículo científico publicado en 2015

Purification and assay of Saccharomyces cerevisiae phosphatase that acts on the C-terminal domain of the largest subunit of RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2003

Quantitative genome-wide genetic interaction screens reveal global epistatic relationships of protein complexes in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

RIPSeeker: a statistical package for identifying protein-associated transcripts from RIP-seq experiments ⬇️

artículo científico publicado el 28 de febrero de 2013

RNA polymerase II elongation factors of Saccharomyces cerevisiae: a targeted proteomics approach

artículo científico publicado en 2002

RPAP1, a novel human RNA polymerase II-associated protein affinity purified with recombinant wild-type and mutated polymerase subunits

artículo científico publicado en 2004

RPRD1A and RPRD1B are human RNA polymerase II C-terminal domain scaffolds for Ser5 dephosphorylation

artículo científico publicado en 2014

Regulation of chromosome stability by the histone H2A variant Htz1, the Swr1 chromatin remodeling complex, and the histone acetyltransferase NuA4

artículo científico publicado en 2004

Regulation of transcription elongation by phosphorylation

artículo científico publicado en 2002

Ribosome-dependent ATPase interacts with conserved membrane protein in Escherichia coli to modulate protein synthesis and oxidative phosphorylation

artículo científico publicado en 2011

Riding high on the TATA box

artículo científico publicado en 1992

SARS-CoV-2 Nucleocapsid protein attenuates stress granule formation and alters gene expression via direct interaction with host mRNAs

artículo científico publicado en 2020

SARS-CoV-2 Nucleocapsid protein attenuates stress granules and interacts with mRNAs to impair host stress response

artículo científico publicado en 2021

SMN and symmetric arginine dimethylation of RNA polymerase II C-terminal domain control termination

scientific journal article

Sequential Peptide Affinity (SPA) system for the identification of mammalian and bacterial protein complexes.

artículo científico publicado en 2004

Sequential peptide affinity purification system for the systematic isolation and identification of protein complexes from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

Solution structure of the carboxyl-terminal domain of RAP74 and NMR characterization of the FCP1-binding sites of RAP74 and human TFIIB

artículo científico publicado en 2003

Stable complex formation between HIV Rev and the nucleosome assembly protein, NAP1, affects Rev function

artículo científico publicado en 2009

Structure of a SLC26 anion transporter STAS domain in complex with acyl carrier protein: implications for E. coli YchM in fatty acid metabolism

artículo científico publicado en 2010

Systematic analysis of the protein interaction network for the human transcription machinery reveals the identity of the 7SK capping enzyme

artículo científico publicado en 2007

Systematic characterization of the protein interaction network and protein complexes in Saccharomyces cerevisiae using tandem affinity purification and mass spectrometry

artículo científico publicado en 2009

Systems-level analyses identify extensive coupling among gene expression machines

artículo científico publicado en 2006

Systems-level approaches for identifying and analyzing genetic interaction networks in Escherichia coli and extensions to other prokaryotes

scientific article published on 31 July 2009

Termination of transcription by nusA gene protein of Escherichia coli

artículo científico publicado en 1981

The Glc7 phosphatase subunit of the cleavage and polyadenylation factor is essential for transcription termination on snoRNA genes.

artículo científico publicado en 2008

The Med31 Conserved Component of the Divergent Mediator Complex in Tetrahymena thermophila Participates in Developmental Regulation

scientific article published on 04 July 2019

The MoxR ATPase RavA and its cofactor ViaA interact with the NADH:ubiquinone oxidoreductase I in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2014

The Paf1 complex is required for histone H3 methylation by COMPASS and Dot1p: linking transcriptional elongation to histone methylation

artículo científico publicado en 2003

The RNA polymerase II kinase Ctk1 regulates positioning of a 5' histone methylation boundary along genes.

artículo científico publicado en 2006

The Saccharomyces cerevisiae histone H2A variant Htz1 is acetylated by NuA4.

artículo científico publicado en 2006

The Shwachman-Bodian-Diamond syndrome protein family is involved in RNA metabolism

artículo científico publicado en 2005

The carboxyl terminus of Rtt109 functions in chaperone control of histone acetylation

artículo científico publicado en 2013

The ctf13-30/CTF13 genomic haploinsufficiency modifier screen identifies the yeast chromatin remodeling complex RSC, which is required for the establishment of sister chromatid cohesion

artículo científico publicado en 2004

The evolutionary landscape of the chromatin modification machinery reveals lineage specific gains, expansions, and losses

artículo científico publicado en 2010

The functional landscape of mouse gene expression

artículo científico publicado en 2004

The highly conserved glutamic acid 791 of Rpb2 is involved in the binding of NTP and Mg(B) in the active center of human RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2005

The minimum information required for reporting a molecular interaction experiment (MIMIx).

artículo científico publicado en 2007

The program for processing newly synthesized histones H3.1 and H4

artículo científico publicado en 2010

The yeast Rat1 exonuclease promotes transcription termination by RNA polymerase II.

artículo científico publicado en 2004

Toward a comprehensive atlas of the physical interactome of Saccharomyces cerevisiae

artículo científico publicado en 2007

Two-color cell array screen reveals interdependent roles for histone chaperones and a chromatin boundary regulator in histone gene repression

artículo científico publicado en 2009

eSGA: E. coli synthetic genetic array analysis

artículo científico publicado en 2008

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