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Lista de obras de Clare Stirzaker

A bioengineered microenvironment to quantitatively measure the tumorigenic properties of cancer-associated fibroblasts in human prostate cancer.

artículo científico publicado en 2013

Acetylated histone variant H2A.Z is involved in the activation of neo-enhancers in prostate cancer.

artículo científico publicado en 2017

Advances in Prognostic Methylation Biomarkers for Prostate Cancer

artículo científico publicado en 2020

BayMeth: improved DNA methylation quantification for affinity capture sequencing data using a flexible Bayesian approach

artículo científico publicado en 2014

Bisulfite sequencing of chromatin immunoprecipitated DNA (BisChIP-seq) directly informs methylation status of histone-modified DNA

artículo científico publicado en 2012

Bisulphite Sequencing of Chromatin Immunoprecipitated DNA (BisChIP-seq).

artículo científico publicado en 2018

Comparison of methyl-DNA immunoprecipitation (MeDIP) and methyl-CpG binding domain (MBD) protein capture for genome-wide DNA methylation analysis reveal CpG sequence coverage bias

artículo científico publicado en 2011

Comprehensive evaluation of genome-wide 5-hydroxymethylcytosine profiling approaches in human DNA.

artículo científico publicado en 2017

Comprehensive evaluation of targeted multiplex bisulphite PCR sequencing for validation of DNA methylation biomarker panels

artículo científico publicado en 2020

Concordant epigenetic silencing of transforming growth factor-beta signaling pathway genes occurs early in breast carcinogenesis.

artículo científico publicado en 2007

Consolidation of the cancer genome into domains of repressive chromatin by long-range epigenetic silencing (LRES) reduces transcriptional plasticity

artículo científico publicado en 2010

Coordinated epigenetic remodelling of transcriptional networks occurs during early breast carcinogenesis.

artículo científico publicado en 2015

Copy-number-aware differential analysis of quantitative DNA sequencing data

artículo científico publicado en 2012

Critical evaluation of the Illumina MethylationEPIC BeadChip microarray for whole-genome DNA methylation profiling.

artículo científico publicado en 2016

Cytosines adjacent to methylated CpG sites can be partially resistant to conversion in genomic bisulfite sequencing leading to methylation artifacts.

artículo científico publicado en 1998

DNA methylation of oestrogen-regulated enhancers defines endocrine sensitivity in breast cancer.

artículo científico publicado en 2015

DNA methylation profile of triple negative breast cancer-specific genes comparing lymph node positive patients to lymph node negative patients

artículo científico publicado en 2016

DNA methylation: Bisulphite modification and analysis

artículo científico publicado en 2006

Detection and measurement of PCR bias in quantitative methylation analysis of bisulphite-treated DNA.

artículo científico publicado en 1997

Enduring epigenetic landmarks define the cancer microenvironment.

artículo científico publicado en 2018

Epigenetic deregulation across chromosome 2q14.2 differentiates normal from prostate cancer and provides a regional panel of novel DNA methylation cancer biomarkers.

artículo científico publicado en 2010

Epigenetic inactivation of a cluster of genes flanking MLH1 in microsatellite-unstable colorectal cancer

artículo científico publicado en 2007

Epigenetic remodeling in colorectal cancer results in coordinate gene suppression across an entire chromosome band.

artículo científico publicado en 2006

Evaluation of affinity-based genome-wide DNA methylation data: effects of CpG density, amplification bias, and copy number variation

artículo científico publicado en 2010

Genome-wide DNA methylation profiling in triple-negative breast cancer reveals epigenetic signatures with important clinical value

artículo científico publicado en 2015

Hypermethylation trigger of the glutathione-S-transferase gene (GSTP1) in prostate cancer cells.

artículo científico publicado en 2002

Identification and resolution of artifacts in bisulfite sequencing.

artículo científico publicado en 2002

Identification of DNA methylation biomarkers with potential to predict response to neoadjuvant chemotherapy in triple-negative breast cancer

artículo científico publicado en 2021

Methyl-CpG-binding domain proteins: readers of the epigenome

artículo científico publicado en 2015

Methyl-CpG-binding protein MBD2 plays a key role in maintenance and spread of DNA methylation at CpG islands and shores in cancer.

artículo científico publicado en 2016

Methylome sequencing in triple-negative breast cancer reveals distinct methylation clusters with prognostic value.

artículo científico

Mining cancer methylomes: prospects and challenges

artículo científico publicado en 2013

Multiplex bisulfite PCR resequencing of clinical FFPE DNA.

artículo científico publicado en 2015

Regional activation of the cancer genome by long-range epigenetic remodeling

artículo científico publicado en 2012

Repitools: an R package for the analysis of enrichment-based epigenomic data

artículo científico publicado en 2010

Three-dimensional disorganization of the cancer genome occurs coincident with long-range genetic and epigenetic alterations.

artículo científico publicado en 2016

Transcriptional gene silencing promotes DNA hypermethylation through a sequential change in chromatin modifications in cancer cells.

artículo científico publicado en 2004

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