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Lista de obras de Pietro Liò

A Fine-Grained IoT Data Access Control Scheme Combining Attribute-Based Encryption and Blockchain

scientific article published in 2021

A Hybrid of Metabolic Flux Analysis and Bayesian Factor Modeling for Multiomic Temporal Pathway Activation.

artículo científico publicado en 2015

A Multi-modal Convolutional Neural Network Framework for the Prediction of Alzheimer's Disease

artículo científico publicado en 2018

A class-contrastive human-interpretable machine learning approach to predict mortality in severe mental illness

artículo científico publicado en 2021

A design automation framework for computational bioenergetics in biological networks.

artículo científico publicado en 2013

A study on multi-omic oscillations in Escherichia coli metabolic networks

scientific article published on 09 July 2018

Advances in Artificial Life: Synthesis and Simulation of Living Systems: Editorial

artículo científico publicado en 2015

Advances in translational biomedicine from systems approaches

artículo científico publicado en 2014

An LTE Authentication and Key Agreement Protocol Based on the ECC Self-Certified Public Key

scientific article published on 26 September 2022

Analyzing seasonality of tuberculosis across Indian states and union territories.

artículo científico publicado en 2015

Animal inference on human mitochondrial diseases.

artículo científico publicado en 2016

Bayesian Melding Approach to Estimate the Reproduction Number for Tuberculosis Transmission in Indian States and Union Territories.

artículo científico publicado en 2015

Bioremediation in marine ecosystems: a computational study combining ecological modeling and flux balance analysis.

artículo científico publicado en 2014

Cancer Markers Selection Using Network-Based Cox Regression: A Methodological and Computational Practice.

artículo científico publicado en 2016

Cell graph neural networks enable the precise prediction of patient survival in gastric cancer

artículo científico publicado en 2022

CiliateGEM: an open-project and a tool for predictions of ciliate metabolic variations and experimental condition design

artículo científico publicado en 2018

Collective human mobility pattern from taxi trips in urban area.

artículo científico publicado en 2012

Combining Pathway Identification and Breast Cancer Survival Prediction via Screening-Network Methods.

artículo científico publicado en 2018

Community structure in social networks: applications for epidemiological modelling.

artículo científico publicado en 2011

Computational Modeling, Formal Analysis, and Tools for Systems Biology

artículo científico publicado en 2016

CytoCom: a Cytoscape app to visualize, query and analyse disease comorbidity networks

artículo científico publicado en 2014

Distance-Based Opportunistic Mobile Data Offloading.

artículo científico publicado en 2016

Distinct epigenomic features in end-stage failing human hearts

artículo científico publicado en 2011

Draft genomes of three Antarctic Psychrobacter strains producing antimicrobial compounds against Burkholderia cepacia complex, opportunistic human pathogens.

artículo científico publicado en 2014

DrugClust: A machine learning approach for drugs side effects prediction.

artículo científico publicado en 2017

Efficient behavior of photosynthetic organelles via Pareto optimality, identifiability, and sensitivity analysis

artículo científico publicado en 2013

Erratum: Predictive analytics of environmental adaptability in multi-omic network models

artículo científico publicado en 2016

Exploring the complexity of pathway-drug relationships using latent Dirichlet allocation.

artículo científico publicado en 2014

FisHiCal: an R package for iterative FISH-based calibration of Hi-C data.

artículo científico publicado en 2014

Forecasting ultra-early intensive care strain from COVID-19 in England

scientific article (preprint)

Genetic effects of welding fumes on the progression of neurodegenerative diseases

artículo científico publicado en 2018

Genome-Scale Metabolic Network Reconstruction

artículo científico publicado en 2015

Genome-scale metabolic reconstruction and constraint-based modelling of the Antarctic bacterium Pseudoalteromonas haloplanktis TAC125.

artículo científico publicado en 2014

Global gene expression profiling and senescence biomarker analysis of hESC exposed to H2O2 induced non-cytotoxic oxidative stress.

artículo científico

Graph Attention Networks

scholarly article

Identification of sensitive enzymes in the photosynthetic carbon metabolism.

artículo científico publicado en 2012

Identification of targeted analyte clusters for studies of schizophrenia

artículo científico publicado en 2009

Integrating multi-omic features exploiting Chromosome Conformation Capture data.

artículo científico publicado en 2015

Intra- and inter-chromosomal interactions correlate with CTCF binding genome wide.

artículo científico publicado en 2010

Investigating meta-approaches for reconstructing gene networks in a mammalian cellular context.

artículo científico publicado en 2012

Making life difficult for Clostridium difficile: augmenting the pathogen's metabolic model with transcriptomic and codon usage data for better therapeutic target characterization

artículo científico publicado en 2017

MeDuSa: a multi-draft based scaffolder.

artículo científico publicado en 2015

Metabolic disorders: how can systems modelling help?

artículo científico publicado en 2016

Modeling Social Groups, Policies and Cognitive Behavior in COVID-19 Epidemic Phases. Basic Scenarios

artículo científico publicado en 2020

Modeling TGF-β in early stages of cancer tissue dynamics.

artículo científico publicado en 2014

Modelling circulating tumour cells for personalised survival prediction in metastatic breast cancer

artículo científico publicado en 2015

Modelling osteomyelitis

artículo científico publicado en 2012

MtPAN(3): site-class specific amino acid replacement matrices for mitochondrial proteins of Pancrustacea and Collembola.

artículo científico publicado en 2014

Multi -omics and metabolic modelling pipelines: challenges and tools for systems microbiology

artículo científico publicado en 2015

Multi-Target Analysis and Design of Mitochondrial Metabolism.

artículo científico publicado en 2015

Multilevel computational modeling and quantitative analysis of bone remodeling.

artículo científico publicado en 2012

Multiplex methods provide effective integration of multi-omic data in genome-scale models

artículo científico publicado en 2016

Muxstep: an open-source C ++ multiplex HMM library for making inferences on multiple data types.

artículo científico publicado en 2016

Network regularised Cox regression and multiplex network models to predict disease comorbidities and survival of cancer

artículo científico publicado en 2015

Network-based analysis of comorbidities risk during an infection: SARS and HIV case studies

artículo científico publicado en 2014

Neural network fusion: a novel CT-MR Aortic Aneurysm image segmentation method

scientific article published on 01 March 2018

NuChart: an R package to study gene spatial neighbourhoods with multi-omics annotations.

artículo científico publicado en 2013

On synergy between ultrahigh throughput screening and machine learning in biocatalyst engineering

artículo científico publicado en 2024

Opportunities for community awareness platforms in personal genomics and bioinformatics education.

artículo científico publicado en 2016

Optimization of Multi-Omic Genome-Scale Models: Methodologies, Hands-on Tutorial, and Perspectives.

artículo científico publicado en 2018

Parapred: antibody paratope prediction using convolutional and recurrent neural networks

artículo científico publicado en 2018

Pareto optimality in organelle energy metabolism analysis

artículo científico publicado en 2013

Pathway-based Bayesian inference of drug-disease interactions

artículo científico publicado en 2014

Physio-environmental sensing and live modeling.

artículo científico publicado en 2013

Predictive analytics of environmental adaptability in multi-omic network models.

artículo científico publicado en 2015

Quantifying the Role of Homophily in Human Cooperation Using Multiplex Evolutionary Game Theory

artículo científico publicado en 2015

Quantifying the propagation of distress and mental disorders in social networks

artículo científico publicado en 2018

Robust design of microbial strains.

artículo científico publicado en 2012

STAble: a novel approach to de novo assembly of RNA-seq data and its application in a metabolic model network based metatranscriptomic workflow

artículo científico publicado en 2018

Seeing the wood for the trees: a forest of methods for optimization and omic-network integration in metabolic modelling.

artículo científico publicado en 2017

Simultaneous Transients of Intracranial Pressure and Heart Rate in Traumatic Brain Injury: Methods of Analysis

artículo científico publicado en 2018

Single-cell RNA-sequencing uncovers transcriptional states and fate decisions in haematopoiesis

artículo científico publicado en 2017

Social dynamics modeling of chrono-nutrition

artículo científico publicado en 2019

State of the Art and Potentialities of Graph-level Learning

artículo científico publicado en 2024

Statistical approaches to use a model organism for regulatory sequences annotation of newly sequenced species

artículo científico publicado en 2012

Statistical mechanics of rumour spreading in network communities

Stochastic analysis of a miRNA-protein toggle switch.

artículo científico publicado en 2011

System Neural Network: Evolution and Change Based Structure Learning

scientific article published in 2022

Systems medicine of inflammaging.

artículo científico publicado en 2015

The BioMart community portal: an innovative alternative to large, centralized data repositories

artículo científico publicado en 2015

The Genome Conformation As an Integrator of Multi-Omic Data: The Example of Damage Spreading in Cancer

artículo científico publicado en 2016

The Impact of Heterogeneity and Awareness in Modeling Epidemic Spreading on Multiplex Networks

artículo científico publicado en 2016

The onset of type 2 diabetes: proposal for a multi-scale model.

artículo científico publicado en 2013

The puzzling role of CXCR4 in human immunodeficiency virus infection.

artículo científico publicado en 2013

TrafficMOT: A Challenging Dataset for Multi-Object Tracking in Complex Traffic Scenarios

artículo científico publicado en 2024

Transcriptome and proteome analysis of Salmonella enterica serovar Typhimurium systemic infection of wild type and immune-deficient mice.

artículo científico publicado en 2017

Warped Matrix Factorisation for Multi-view Data Integration

comoR: a software for disease comorbidity risk assessment.

artículo científico publicado en 2014

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