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Lista de obras de Steven J Hallam

A compendium of geochemical information from the Saanich Inlet water column

artículo científico publicado en 2017

A compendium of multi-omic sequence information from the Saanich Inlet water column

artículo científico publicado en 2017

A geographically-diverse collection of 418 human gut microbiome pathway genome databases

artículo científico publicado en 2017

A high throughput screen for biomining cellulase activity from metagenomic libraries

artículo científico publicado en 2011

A metagenomic survey of forest soil microbial communities more than a decade after timber harvesting

artículo científico publicado en 2017

A programmable droplet-based microfluidic device applied to multiparameter analysis of single microbes and microbial communities

artículo científico publicado en 2012

A single mutation (V64G) within the RING Domain of Z attenuates Junin virus

scientific article published on 25 September 2020

Ammonium and nitrite oxidation at nanomolar oxygen concentrations in oxygen minimum zone waters

artículo científico publicado en 2016

An Improved Whole-Cell Biosensor for the Discovery of Lignin-Transforming Enzymes in Functional Metagenomic Screens.

artículo científico publicado en 2017

An enzymatic pathway in the human gut microbiome that converts A to universal O type blood

scientific article published on 10 June 2019

Archaeal pre-mRNA splicing: a connection to hetero-oligomeric splicing endonuclease

artículo científico publicado en 2006

Author Correction: A compendium of geochemical information from the Saanich Inlet water column

scholarly article published in Scientific Data

Bacterial, archaeal and eukaryal community structures throughout soil horizons of harvested and naturally disturbed forest stands

artículo científico publicado en 2009

Baseline mapping of Lassa fever virology, epidemiology and vaccine research and development

artículo científico publicado en 2018

Biocatalysts for biomass deconstruction from environmental genomics

artículo científico

Biomining active cellulases from a mining bioremediation system

artículo científico publicado en 2013

CRAGE-mediated insertion of fluorescent chromosomal markers for accurate and scalable measurement of co-culture dynamics in <i>Escherichia coli</i>

scientific article published on 03 September 2020

Combining genomic sequencing methods to explore viral diversity and reveal potential virus-host interactions

artículo científico publicado en 2015

Comparative genomics reveals electron transfer and syntrophic mechanisms differentiating methanotrophic and methanogenic archaea

artículo científico publicado en 2022

Consent insufficient for data release-Response

artículo científico publicado en 2019

Correction: Pathways of Carbon Assimilation and Ammonia Oxidation Suggested by Environmental Genomic Analyses of Marine Crenarchaeota

erratum published in 2006

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

artículo científico publicado en 2018

Corrigendum: Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea

article

DNA extraction from 0.22 microM Sterivex filters and cesium chloride density gradient centrifugation

artículo científico publicado en 2009

Development and Application of a High-Throughput Functional Metagenomic Screen for Glycoside Phosphorylases

artículo científico publicado en 2019

Development of human B cells and antibodies following human hematopoietic stem cell transplantation to Rag2(-/-)γc(-/-) mice

artículo científico publicado en 2015

Diverse Marinimicrobia bacteria may mediate coupled biogeochemical cycles along eco-thermodynamic gradients.

artículo científico publicado en 2017

Diversity and population structure of Marine Group A bacteria in the Northeast subarctic Pacific Ocean

artículo científico publicado en 2012

Draft Genome Sequence of the Pelagic Photoferrotroph Chlorobium phaeoferrooxidans

artículo científico publicado en 2017

Ecology and evolution of viruses infecting uncultivated SUP05 bacteria as revealed by single-cell- and meta-genomics

artículo científico publicado en 2014

Ecology and molecular targets of hypermutation in the global microbiome

artículo científico publicado en 2021

Editorial overview: Remapping the body of the world: Exploring interactions at the interface of microbial ecology, biological engineering and information science

artículo científico publicado en 2016

Effect of oxygen minimum zone formation on communities of marine protists

artículo científico publicado en 2012

Environmental Acquisition of Thiotrophic Endosymbionts by Deep-Sea Mussels of the Genus Bathymodiolus ⬇️

artículo científico publicado el 1 de noviembre de 2003

Erratum: Significant and persistent impact of timber harvesting on soil microbial communities in Northern coniferous forests

article

Expanding the boundaries of local similarity analysis ⬇️

artículo científico publicado el 21 de enero de 2013

Expression of recombinant proteins in the methylotrophic yeast Pichia pastoris

artículo científico publicado en 2010

Extraction of high molecular weight genomic DNA from soils and sediments

artículo científico publicado en 2009

Forest harvesting reduces the soil metagenomic potential for biomass decomposition

artículo científico publicado en 2015

Fractional factorial experimental design for optimizing volatile fatty acids from anaerobic fermentation of municipal sludge: Microbial community and activity investigation

artículo científico publicado en 2022

Genomic analysis of the uncultivated marine crenarchaeote Cenarchaeum symbiosum

artículo científico publicado en 2006

Genomic and transcriptomic studies of an RDX (hexahydro-1,3,5-trinitro-1,3,5-triazine)-degrading actinobacterium

artículo científico publicado en 2012

Genomic properties of Marine Group A bacteria indicate a role in the marine sulfur cycle

artículo científico publicado en 2013

Glycoprotein N-linked glycans play a critical role in arenavirus pathogenicity

artículo científico publicado en 2021

Growth and methane oxidation rates of anaerobic methanotrophic archaea in a continuous-flow bioreactor

artículo científico publicado en 2003

High-Throughput Recovery and Characterization of Metagenome-Derived Glycoside Hydrolase-Containing Clones as a Resource for Biocatalyst Development.

artículo científico publicado en 2019

High-resolution phylogenetic microbial community profiling

artículo científico publicado en 2016

Histones in crenarchaea

artículo científico publicado en 2005

Hive Panel Explorer: an interactive network visualization tool

artículo científico publicado en 2020

Identification of methyl coenzyme M reductase A (mcrA) genes associated with methane-oxidizing archaea

artículo científico publicado en 2003

Illuminating microbial dark matter in meromictic Sakinaw Lake

artículo científico publicado en 2014

In Silico Analysis of the Metabolic Potential and Niche Specialization of Candidate Phylum "Latescibacteria" (WS3).

artículo científico publicado en 2015

Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter

artículo científico publicado en 2013

Integrating biogeochemistry with multiomic sequence information in a model oxygen minimum zone

artículo científico publicado en 2016

LCA*: an entropy-based measure for taxonomic assignment within assembled metagenomes

artículo científico publicado en 2016

Large insert environmental genomic library production

artículo científico publicado en 2009

Large volume (20L+) filtration of coastal seawater samples

artículo científico publicado en 2009

Leveraging heterogeneous network embedding for metabolic pathway prediction

scientific article published on 20 October 2020

Machupo Virus Expressing GPC of the Candid#1 Vaccine Strain of Junin Virus Is Highly Attenuated and Immunogenic

artículo científico publicado en 2015

Major role of nitrite-oxidizing bacteria in dark ocean carbon fixation.

artículo científico publicado en 2017

Mercury methylation by metabolically versatile and cosmopolitan marine bacteria

artículo científico publicado en 2021

MetaPathways v2.5: quantitative functional, taxonomic and usability improvements

artículo científico publicado en 2015

MetaPathways: a modular pipeline for constructing pathway/genome databases from environmental sequence information ⬇️

artículo científico publicado el 21 de junio de 2013

Metabolic Pathway Prediction Using Non-Negative Matrix Factorization with Improved Precision

artículo científico publicado en 2021

Metabolic pathway inference using multi-label classification with rich pathway features

artículo científico publicado en 2020

Metabolic pathways for the whole community

artículo científico publicado en 2014

Metabolic reprogramming by viruses in the sunlit and dark ocean

artículo científico publicado en 2013

Metagenome of a versatile chemolithoautotroph from expanding oceanic dead zones

artículo científico publicado en 2009

Metagenomes Reveal Global Distribution of Bacterial Steroid Catabolism in Natural, Engineered, and Host Environments

artículo científico publicado en 2018

Metagenomic scaffolds enable combinatorial lignin transformation

artículo científico publicado en 2014

Metagenomics of hydrocarbon resource environments indicates aerobic taxa and genes to be unexpectedly common

artículo científico publicado en 2013

Metagenomics reveals functional synergy and novel polysaccharide utilization loci in the Castor canadensis fecal microbiome

scholarly article by Zachary Armstrong et al published 16 July 2018 in The ISME Journal

Metaproteomics reveals differential modes of metabolic coupling among ubiquitous oxygen minimum zone microbes

artículo científico publicado en 2014

Methanotrophic Community Dynamics in a Seasonally Anoxic Fjord: Saanich Inlet, British Columbia

article

Methanotrophic communities of Saanich Inlet: a microcosm perspective.

artículo científico publicado en 2012

Microbes don't play solitaire: how cooperation trumps isolation in the microbial world

artículo científico publicado en 2015

Microbial and geochemical controls on waste rock weathering and drainage quality

scientific article published on 05 June 2018

Microbial community dynamics in a seasonally anoxic fjord: Saanich Inlet, British Columbia

artículo científico publicado en 2009

Microbial community structure across fluid gradients in the Juan de Fuca Ridge hydrothermal system ⬇️

artículo científico publicado el 17 de septiembre de 2012

Microbial ecology of expanding oxygen minimum zones ⬇️

artículo científico publicado el 14 de mayo de 2012

Microbial life in a liquid asphalt desert

artículo científico publicado en 2011

Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea.

artículo científico publicado en 2017

Molecular tools for investigating ANME community structure and function

artículo científico publicado en 2011

Molecular tools for investigating microbial community structure and function in oxygen-deficient marine waters

artículo científico publicado en 2013

Monitoring microbial responses to ocean deoxygenation in a model oxygen minimum zone

artículo científico publicado en 2017

Non-symbiotic Bradyrhizobium ecotypes dominate North American forest soils

artículo científico publicado en 2015

Nutrient Acquisition and the Metabolic Potential of Photoferrotrophic Chlorobi

artículo científico publicado en 2017

On Single-Cell Enzyme Assays in Marine Microbial Ecology and Biogeochemistry

scientific article published in 2022

Pathway-Centric Analysis of Microbial Metabolic Potential and Expression Along Nutrient and Energy Gradients in the Western Atlantic Ocean

artículo científico publicado en 2022

Pathways of carbon assimilation and ammonia oxidation suggested by environmental genomic analyses of marine Crenarchaeota

artículo científico publicado en 2006

Patterns of Endemism and Habitat Selection in Coalbed Microbial Communities

artículo científico publicado en 2015

Photophysics and multifunctionality of hypericin-like pigments in heterotrich ciliates: a phylogenetic perspective

artículo científico publicado en 2007

Phylogenetic diversity of transition and anoxic zone bacterial communities within a near-shore anoxic basin: Nitinat Lake

artículo científico publicado en 2009

Phylogeny and physiology of candidate phylum 'Atribacteria' (OP9/JS1) inferred from cultivation-independent genomics

artículo científico publicado en 2015

Potential virus-mediated nitrogen cycling in oxygen-depleted oceanic waters

artículo científico publicado en 2020

Prevalent genome streamlining and latitudinal divergence of planktonic bacteria in the surface ocean

artículo científico publicado en 2013

Previously unknown evolutionary groups dominate the ssDNA gokushoviruses in oxic and anoxic waters of a coastal marine environment

artículo científico publicado en 2015

Prospecting for microbial α-N-acetylgalactosaminidases yields a new class of GH31 O-glycanase

artículo científico publicado en 2019

Rare taxa have potential to make metabolic contributions in enhanced biological phosphorus removal ecosystems

artículo científico publicado en 2015

Recovering cellular biomass from fluids using chemical flocculation

scientific article published on 16 October 2018

Reverse methanogenesis: testing the hypothesis with environmental genomics

artículo científico publicado en 2004

Review of Biology and Replication

article

SYD-1, a presynaptic protein with PDZ, C2 and rhoGAP-like domains, specifies axon identity in C. elegans

artículo científico publicado en 2002

Seasonal and ecohydrological regulation of active microbial populations involved in DOC, CO2, and CH4 fluxes in temperate rainforest soil

scientific article published on 11 December 2018

Seawater sampling and collection

artículo científico publicado en 2009

Sequencing platform and library preparation choices impact viral metagenomes

artículo científico publicado en 2013

Significant and persistent impact of timber harvesting on soil microbial communities in Northern coniferous forests

artículo científico publicado en 2012

Single cell genomics of uncultured marine alveolates shows paraphyly of basal dinoflagellates

artículo científico publicado en 2017

Single-cell genomics-based analysis of virus-host interactions in marine surface bacterioplankton

artículo científico publicado en 2015

Small volume (1-3L) filtration of coastal seawater samples

artículo científico publicado en 2009

Structural and mechanistic analysis of a β-glycoside phosphorylase identified by screening a metagenomic library

artículo científico publicado en 2018

Synthesis and evaluation of a series of 6-chloro-4-methylumbelliferyl glycosides as fluorogenic reagents for screening metagenomic libraries for glycosidase activity

artículo científico publicado en 2016

The Bacteroidetes <i>Aequorivita</i> sp. and <i>Kaistella jeonii</i> Produce Promiscuous Esterases With PET-Hydrolyzing Activity

artículo científico publicado en 2021

The Kwakshua Watersheds Observatory, central coast of British Columbia, Canada

artículo científico publicado en 2021

The art and design of functional metagenomic screens.

artículo científico publicado en 2011

The information science of microbial ecology

artículo científico publicado en 2016

The microbial community of a passive biochemical reactor treating arsenic, zinc, and sulfate-rich seepage

artículo científico publicado en 2015

Thousands of small, novel genes predicted in global phage genomes

scientific article published in 2022

Toward unrestricted use of public genomic data:

artículo científico publicado en 2019

TreeSAPP: The Tree-based Sensitive and Accurate Phylogenetic Profiler

artículo científico publicado en 2020

Two-step activated carbon cloth enhances microbial interactions and methane production during anaerobic digestion of municipal sludge

artículo científico publicado en 2022

Unexpected genomic features in widespread intracellular bacteria: evidence for motility of marine chlamydiae

scientific article published on 23 June 2017

V-REVCOMP: automated high-throughput detection of reverse complementary 16S rRNA gene sequences in large environmental and taxonomic datasets

artículo científico publicado en 2011

Viral dark matter and virus-host interactions resolved from publicly available microbial genomes

artículo científico publicado en 2015

Wide diversity of methane and short-chain alkane metabolisms in uncultured archaea

scientific article published on 04 March 2019

Zika virus infection elicits auto-antibodies to C1q.

artículo científico publicado en 2018

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