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Lista de obras de Elisa Ficarra

A Deep Learning Approach to the Screening of Oncogenic Gene Fusions in Humans

article

A Novel Gaussian Extrapolation Approach for 2-D Gel Electrophoresis Saturated Protein Spots.

artículo científico publicado en 2016

A molecular dynamics study of a miRNA:mRNA interaction.

artículo científico publicado en 2011

A novel Gaussian extrapolation approach for 2D gel electrophoresis saturated protein spots.

artículo científico publicado en 2012

ANAlyte: A modular image analysis tool for ANA testing with indirect immunofluorescence.

artículo científico publicado en 2016

Achieving the way for automated segmentation of nuclei in cancer tissue images through morphology-based approach: a quantitative evaluation

artículo científico publicado en 2010

An automated approach to the segmentation of HEp-2 cells for the indirect immunofluorescence ANA test

artículo científico publicado en 2015

Automated segmentation of cells with IHC membrane staining.

artículo científico publicado en 2011

Automated segmentation of tissue images for computerized IHC analysis.

artículo científico publicado en 2010

Bellerophontes: an RNA-Seq data analysis framework for chimeric transcripts discovery based on accurate fusion model

artículo científico publicado en 2012

Computational Methods for CLIP-seq Data Processing

artículo científico publicado en 2014

Convergent Mutations and Kinase Fusions Lead to Oncogenic STAT3 Activation in Anaplastic Large Cell Lymphoma

Convergent mutations and kinase fusions lead to oncogenic STAT3 activation in anaplastic large cell lymphoma.

artículo científico publicado en 2015

Exploiting Gene Expression Profiles for the Automated Prediction of Connectivity between Brain Regions

article

FuGePrior: A novel gene fusion prioritization algorithm based on accurate fusion structure analysis in cancer RNA-seq samples.

artículo científico publicado en 2017

FunMod: a Cytoscape plugin for identifying functional modules in undirected protein-protein networks

artículo científico publicado en 2014

Gelsius: a literature-based workflow for determining quantitative associations between genes and biological processes

artículo científico

MicroRNA-mRNA interactions underlying colorectal cancer molecular subtypes.

artículo científico publicado en 2015

Mining textural knowledge in biological images: Applications, methods and trends

artículo científico publicado en 2016

Multiscale modeling of cellular actin filaments: from atomistic molecular to coarse-grained dynamics

scientific article published on 13 March 2012

Pegasus: a comprehensive annotation and prediction tool for detection of driver gene fusions in cancer.

artículo científico publicado en 2014

Predicting gene expression levels from DNA sequences and post-transcriptional information with transformers

artículo científico publicado en 2022

RALE051: a novel established cell line of sporadic Burkitt lymphoma

artículo científico publicado en 2017

Selective analysis of cancer-cell intrinsic transcriptional traits defines novel clinically relevant subtypes of colorectal cancer

artículo científico publicado en 2017

Unsupervised HEp-2 mitosis recognition in indirect immunofluorescence imaging.

artículo científico publicado en 2015

VDJSeq-Solver: in silico V(D)J recombination detection tool

artículo científico publicado en 2015

isomiR-SEA: an RNA-Seq analysis tool for miRNAs/isomiRs expression level profiling and miRNA-mRNA interaction sites evaluation

artículo científico publicado en 2016

miREE: miRNA recognition elements ensemble

artículo científico publicado en 2011