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Lista de obras de Adrian Shepherd

A computational analysis of the antigenic properties of haemagglutinin in influenza A H3N2.

artículo científico publicado en 2010

A large-scale computational study of inhibitor risk in non-severe haemophilia A.

artículo científico publicado en 2014

A novel approach to the recognition of protein architecture from sequence using Fourier analysis and neural networks

artículo científico publicado en 2003

A realistic assessment of methods for extracting gene/protein interactions from free text

artículo científico publicado en 2009

A text-mining system for extracting metabolic reactions from full-text articles.

artículo científico publicado en 2012

An entropic safety catch controls Hepatitis C virus entry and antibody resistance

artículo científico publicado en 2022

An intuitionistic approach to scoring DNA sequences against transcription factor binding site motifs.

artículo científico publicado en 2010

Analysis of antigenically important residues in human influenza A virus in terms of B-cell epitopes.

artículo científico publicado en 2011

Benchmarking natural-language parsers for biological applications using dependency graphs.

artículo científico publicado en 2007

Characterization of the UK anthrax vaccine and human immunogenicity

artículo científico publicado en 2020

Evaluation of a novel multi-immunogen vaccine strategy for targeting 4E10/10E8 neutralizing epitopes on HIV-1 gp41 membrane proximal external region.

artículo científico

Evolution in the influenza A H3 stalk - a challenge for broad-spectrum vaccines?

artículo científico publicado en 2013

Factor VIII cross-matches to the human proteome reduce the predicted inhibitor risk in missense mutation hemophilia A

artículo científico publicado en 2018

Flexibility and intrinsic disorder are conserved features of hepatitis C virus E2 glycoprotein

scientific article published on 28 February 2020

Gene3D: structural assignment for whole genes and genomes using the CATH domain structure database

artículo científico publicado en 2002

HVint: A Strategy for Identifying Novel Protein-Protein Interactions in Herpes Simplex Virus Type 1

artículo científico publicado en 2016

ImmunoGrid, an integrative environment for large-scale simulation of the immune system for vaccine discovery, design and optimization

artículo científico

ImmunoGrid: towards agent-based simulations of the human immune system at a natural scale

artículo científico

Increased epitope complexity correlated with antibody affinity maturation and a novel binding mode revealed by structures of rabbit antibodies against the third variable loop (V3) of HIV-1 gp120.

artículo científico publicado en 2018

Investigating Substitutions in Antibody-Antigen Complexes Using Molecular Dynamics: A Case Study with Broad-spectrum, Influenza A Antibodies.

artículo científico publicado en 2017

Metabolic Pathway Mining.

artículo científico publicado en 2017

Mining biological networks from full-text articles

artículo científico publicado en 2014

Missed, Not Missing: Phylogenomic Evidence for the Existence of Avian FoxP3.

artículo científico publicado en 2016

N-linked glycans on influenza A H3N2 hemagglutinin constrain binding of host antibodies, but shielding is limited

artículo científico publicado en 2014

OGRDB: a reference database of inferred immune receptor genes

artículo científico publicado en 2020

PFDB: a generic protein family database integrating the CATH domain structure database with sequence based protein family resources

artículo científico publicado en 2002

Prediction of the location and type of beta-turns in proteins using neural networks.

artículo científico publicado en 1999

Studying Antibody Repertoires with Next-Generation Sequencing

artículo científico publicado en 2017

Text mining.

artículo científico publicado en 2008

The CATH database: an extended protein family resource for structural and functional genomics

artículo científico publicado en 2003

The CATH extended protein-family database: providing structural annotations for genome sequences.

artículo científico publicado en 2002

The New ERA in Supervised Learning.

artículo científico publicado en 1997

Toward predicting protein topology: an approach to identifying beta hairpins.

artículo científico publicado en 2002

Utilities for High-Throughput Analysis of B-Cell Clonal Lineages.

artículo científico publicado en 2015

VDJbase: an adaptive immune receptor genotype and haplotype database

artículo científico publicado en 2020

sumrep: A Summary Statistic Framework for Immune Receptor Repertoire Comparison and Model Validation

artículo científico publicado en 2019