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Lista de obras de

3D reconstruction and comparison of shapes of DNA minicircles observed by cryo-electron microscopy

artículo científico publicado en 2006

A Direct Observation of Highly Bent and Twisted DNA at the Single Molecule Level

A glycine-arginine domain in control of the human MRE11 DNA repair protein

artículo científico publicado en 2008

A histone-fold complex and FANCM form a conserved DNA-remodeling complex to maintain genome stability

artículo científico publicado en 2010

A knotty story

artículo científico publicado en 2003

A topological view of the replicon

artículo científico publicado en 2004

Activation of human meiosis-specific recombinase Dmc1 by Ca2+.

artículo científico publicado en 2005

Another strand to the DNA story.

artículo científico publicado en 2004

Are TADs supercoiled?

Bacillus subtilis bacteriophage SPP1 hexameric DNA helicase, G40P, interacts with forked DNA.

artículo científico publicado en 2002

Bending modes of DNA directly addressed by cryo-electron microscopy of DNA minicircles

artículo científico publicado en 2009

Binding of double-strand breaks in DNA by human Rad52 protein

artículo científico publicado en 1999

Binding of double-strand breaks in DNA by human Rad52 protein

artículo científico publicado en 1999

Broken symmetry.

artículo científico publicado en 2001

Chromatin Is Frequently Unknotted at the Megabase Scale

scientific article published on 13 November 2019

Chromatin Loop Extrusion and Chromatin Unknotting.

artículo científico publicado en 2018

Chromatin-loop extrusion and chromatin unknotting

Closing the DNA replication cycle: from simple circular molecules to supercoiled and knotted DNA catenanes

scientific article published on 01 August 2019

Conformational changes modulate the activity of human RAD51 protein

artículo científico publicado en 2004

Conservation of complex knotting and slipknotting patterns in proteins ⬇️

artículo científico publicado el 8 de junio de 2012

Construction and electrophoretic migration of single-stranded DNA knots and catenanes

artículo científico publicado en 2002

Cooperation of breast cancer proteins PALB2 and piccolo BRCA2 in stimulating homologous recombination ⬇️

artículo científico publicado el 26 de septiembre de 2010

Cooperative kinking at distant sites in mechanically stressed DNA.

artículo científico publicado en 2011

DNA helical repeats

artículo científico publicado en 1989

DNA knots and DNA supercoiling

artículo científico publicado en 2011

DNA supercoiling and its role in DNA decatenation and unknotting

artículo científico publicado en 2009

DNA supercoiling inhibits DNA knotting

artículo científico publicado en 2008

DNA's golden jubilee

scholarly article by Andrzej Stasiak published in October 2003

DNA-DNA interactions in bacteriophage capsids are responsible for the observed DNA knotting

artículo científico publicado en 2009

Design of Potent Inhibitors of Human RAD51 Recombinase Based on BRC Motifs of BRCA2 Protein: Modeling and Experimental Validation of a Chimera Peptide ⬇️

artículo científico publicado el 12 de agosto de 2010

Effect of knotting on polymer shapes and their enveloping ellipsoids.

artículo científico publicado en 2009

Effective stiffening of DNA due to nematic ordering causes DNA molecules packed in phage capsids to preferentially form torus knots ⬇️

artículo científico publicado el 22 de febrero de 2012

Effects of physiological self-crowding of DNA on shape and biological properties of DNA molecules with various levels of supercoiling

artículo científico publicado en 2015

Effects of supercoiling on enhancer-promoter contacts

artículo científico publicado en 2014

Eight controversies.

artículo científico publicado en 2004

Electrophoretic mobility of DNA knots

artículo científico publicado en 1996

Electrophoretic mobility of supercoiled, catenated and knotted DNA molecules.

artículo científico publicado en 2014

Explaining explanations.

artículo científico publicado en 2004

Fission yeast rad51 and dmc1, two efficient DNA recombinases forming helical nucleoprotein filaments

artículo científico publicado en 2005

Functional and structural basis for a bacteriophage homolog of human RAD52.

artículo científico publicado en 2008

Gene therapy

artículo científico publicado en 2001

Generation of supercoils in nicked and gapped DNA drives DNA unknotting and postreplicative decatenation

artículo científico publicado en 2015

Geometry and physics of knots

artículo científico publicado en 1996

Grid diagrams as tools to investigate knot spaces and topoisomerase-mediated simplification of DNA topology

artículo científico publicado en 2020

Helicase-defective RuvB D113E promotes RuvAB-mediated branch migration in Vitro 1 1Edited by J. Karn

article published in 1999

How topoisomerase IV can efficiently unknot and decatenate negatively supercoiled DNA molecules without causing their torsional relaxation

artículo científico publicado en 2016

Identifying knots in proteins ⬇️

artículo científico publicado el 1 de abril de 2013

In Search of Functional Advantages of Knots in Proteins.

artículo científico publicado en 2016

Interplay of DNA supercoiling and catenation during the segregation of sister duplexes.

scientific article published on 24 June 2009

Knot localization in proteins.

artículo científico publicado en 2013

KnotProt 2.0: a database of proteins with knots and other entangled structures

artículo científico publicado en 2019

KnotProt: a database of proteins with knots and slipknots

artículo científico publicado en 2014

Knoto-ID: a tool to study the entanglement of open protein chains using the concept of knotoids

artículo científico publicado en 2018

Life cycle of a biologist.

artículo científico publicado en 2003

Linear Random Knots and Their Scaling Behavior

article published in 2005

Local selection rules that can determine specific pathways of DNA unknotting by type II DNA topoisomerases

artículo científico publicado en 2007

Lucky Jim.

artículo científico publicado en 2002

Lucky experiment

MRE11-RAD50-NBS1 is a critical regulator of FANCD2 stability and function during DNA double-strand break repair

artículo científico publicado en 2009

Mathematics. Best packing in proteins and DNA.

artículo científico publicado en 2000

Measuring limits of telomere movement on nuclear envelope

artículo científico publicado en 2005

Mechanical Analysis Methodology for DNA Minicircles Observed by Cryo-Em

Model of DNA topology simplification has come full (supercoiled) circle after two decades of research: Comment on "Disentangling DNA molecules" by Alexander Vologodskii

scientific article published on 17 June 2016

Modelling of crowded polymers elucidate effects of double-strand breaks in topological domains of bacterial chromosomes

artículo científico publicado en 2013

Models that include supercoiling of topological domains reproduce several known features of interphase chromosomes

artículo científico publicado en 2013

Molecular Dynamics Simulation of Supercoiled, Knotted, and Catenated DNA Molecules, Including Modeling of Action of DNA Gyrase

artículo científico publicado en 2017

Myths in science.

artículo científico publicado en 2003

Nature’s shapes.

artículo científico publicado en 2002

Nucleic acid-binding properties of the RRM-containing protein RDM1

artículo científico publicado en 2006

Nullification of Small Knots

ParA2, a Vibrio cholerae chromosome partitioning protein, forms left-handed helical filaments on DNA.

artículo científico publicado en 2010

Presence control of DNA repair controllers

artículo científico publicado en 2015

Probing Rad51-DNA interactions by changing DNA twist

artículo científico publicado en 2012

Protein Knotting by Active Threading of Nascent Polypeptide Chain Exiting from the Ribosome Exit Channel

artículo científico publicado en 2018

RDM1, a novel RNA recognition motif (RRM)-containing protein involved in the cell response to cisplatin in vertebrates.

artículo científico publicado en 2004

Remorins form a novel family of coiled coil-forming oligomeric and filamentous proteins associated with apical, vascular and embryonic tissues in plants

artículo científico publicado en 2004

Role of Topological Exclusion in Formation and Organization of Chromosomal Territories

Rosalind Franklin

artículo científico publicado en 2001

Saccharomyces cerevisiae Dmc1 and Rad51 Proteins Preferentially Function with Tid1 and Rad54 Proteins, Respectively, to Promote DNA Strand Invasion during Genetic Recombination ⬇️

artículo científico publicado el 29 de junio de 2012

Scaling behavior of random knots

artículo científico publicado en 2003

Sedimentation of macroscopic rigid knots and its relation to gel electrophoretic mobility of DNA knots.

artículo científico publicado en 2013

Simulations of action of DNA topoisomerases to investigate boundaries and shapes of spaces of knots

artículo científico publicado en 2004

Stimulation of fission yeast and mouse Hop2-Mnd1 of the Dmc1 and Rad51 recombinases

artículo científico publicado en 2007

Structural Characterization of Torsional Destabilization in DNA

Structural motifs of biomolecules

artículo científico publicado en 2007

Studies of global and local entanglements of individual protein chains using the concept of knotoids

artículo científico publicado en 2017

Subknots in ideal knots, random knots, and knotted proteins

artículo científico publicado en 2015

Symmetry-breaking in cumulative measures of shapes of polymer models.

artículo científico publicado en 2010

The Fanconi anemia protein FANCM can promote branch migration of Holliday junctions and replication forks

artículo científico publicado en 2008

The first lady of DNA.

artículo científico publicado en 2003

The role of transcription factories-mediated interchromosomal contacts in the organization of nuclear architecture

artículo científico publicado en 2010

Tightening of DNA knots by supercoiling facilitates their unknotting by type II DNA topoisomerases

artículo científico publicado en 2011

Topological Models for Open-Knotted Protein Chains Using the Concepts of Knotoids and Bonded Knotoids

artículo científico publicado en 2017

Topological aspects of DNA function and protein folding

artículo científico publicado en 2013

Topological locking restrains replication fork reversal

artículo científico publicado en 2007

Topological origins of chromosomal territories

artículo científico publicado en 2009

Transcription-induced supercoiling as the driving force of chromatin loop extrusion during formation of TADs in interphase chromosomes

artículo científico publicado en 2017

Transcription-induced supercoiling explains formation of self-interacting chromatin domains in S. pombe

artículo científico publicado en 2017

Two convergent pathways of DNA knotting in replicating DNA molecules as revealed by θ-curve analysis

article by Danielle O'Donnol et al published 28 September 2018 in Nucleic Acids Research

Viral transport of DNA damage that mimics a stalled replication fork

artículo científico publicado en 2005

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