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Lista de obras de Hong-Yu Ou

A novel strategy for the identification of genomic islands by comparative analysis of the contents and contexts of tRNA sites in closely related bacteria

artículo científico publicado en 2006

Acinetobacter insertion sequence ISAba11 belongs to a novel family that encodes transposases with a signature HHEK motif

artículo científico publicado en 2011

Analysis of a genomic island housing genes for DNA S-modification system in Streptomyces lividans 66 and its counterparts in other distantly related bacteria

artículo científico publicado en 2007

Analysis of nucleotide distribution in the genome of Streptomyces coelicolor A3(2) using the Z curve method.

artículo científico publicado en 2003

Characterization of a novel chaperone/usher fimbrial operon present on KpGI-5, a methionine tRNA gene-associated genomic island in Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2012

Cleavage of Phosphorothioated DNA and Methylated DNA by the Type IV Restriction Endonuclease ScoMcrA ⬇️

artículo científico publicado el 23 de diciembre de 2010

Comparative Analysis of CRISPR Loci Found in Streptomyces Genome Sequences

artículo científico publicado en 2018

Complete genome sequence of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae HS11286, a multidrug-resistant strain isolated from human sputum.

artículo científico publicado en 2012

Coronavirus phylogeny based on a geometric approach

artículo científico publicado en 2005

Deletion of TnAbaR23 results in both expected and unexpected antibiogram changes in a multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strain

artículo científico publicado en 2012

Emergence of the third-generation cephalosporin-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae due to the acquisition of a self-transferable blaDHA-1-carrying plasmid by an ST23 strain

artículo científico publicado en 2018

Expansion of the known Klebsiella pneumoniae species gene pool by characterization of novel alien DNA islands integrated into tmRNA gene sites.

artículo científico publicado en 2010

GS-Finder: a program to find bacterial gene start sites with a self-training method.

artículo científico publicado en 2004

Genome sequence of the thermophilic strain Bacillus coagulans 2-6, an efficient producer of high-optical-purity L-lactic acid

artículo científico publicado en 2011

Genomic analysis and temperature-dependent transcriptome profiles of the rhizosphere originating strain Pseudomonas aeruginosa M18.

artículo científico publicado en 2011

ICEberg 2.0: an updated database of bacterial integrative and conjugative elements

artículo científico publicado en 2019

ICEberg: a web-based resource for integrative and conjugative elements found in Bacteria

artículo científico publicado en 2011

Identification and characterization of acetyltransferase-type toxin-antitoxin locus in Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2018

Identification of Horizontally-transferred Genomic Islands and Genome Segmentation Points by Using the GC Profile Method

artículo científico publicado en 2014

Insights into fluorometabolite biosynthesis in Streptomyces cattleya DSM46488 through genome sequence and knockout mutants.

artículo científico publicado en 2012

PSP: rapid identification of orthologous coding genes under positive selection across multiple closely related prokaryotic genomes

artículo científico publicado en 2013

Pathogenicity islands PAPI-1 and PAPI-2 contribute individually and synergistically to the virulence of Pseudomonas aeruginosa strain PA14

artículo científico publicado en 2010

Prediction of proteinase cleavage sites in polyproteins of coronaviruses and its applications in analyzing SARS-CoV genomes.

artículo científico publicado en 2003

Recognition of translation initiation sites of eukaryotic genes based on an EM algorithm.

artículo científico publicado en 2003

SecReT4: a web-based bacterial type IV secretion system resource

artículo científico publicado en 2012

TADB 2.0: an updated database of bacterial type II toxin-antitoxin loci

artículo científico publicado en 2017

The Z curve database: a graphic representation of genome sequences

artículo científico publicado en 2003

ThioFinder: a web-based tool for the identification of thiopeptide gene clusters in DNA sequences

artículo científico publicado en 2012

Transmission of Nonconjugative Virulence or Resistance Plasmids Mediated by a Self-Transferable IncN3 Plasmid from Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae

artículo científico publicado en 2022

Whole-Genome-Sequencing characterization of bloodstream infection-causing hypervirulent Klebsiella pneumoniae of capsular serotype K2 and ST374.

artículo científico publicado en 2018

ZCURVE: a new system for recognizing protein-coding genes in bacterial and archaeal genomes

artículo científico publicado en 2003

ZCURVE_CoV: a new system to recognize protein coding genes in coronavirus genomes, and its applications in analyzing SARS-CoV genomes.

artículo científico publicado en 2003

dndDB: a database focused on phosphorothioation of the DNA backbone

artículo científico publicado en 2009

mGenomeSubtractor: a web-based tool for parallel in silico subtractive hybridization analysis of multiple bacterial genomes.

artículo científico publicado en 2010

oriTfinder: a web-based tool for the identification of origin of transfers in DNA sequences of bacterial mobile genetic elements.

artículo científico publicado en 2018

sRNAscanner: a computational tool for intergenic small RNA detection in bacterial genomes

artículo científico publicado en 2010

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