Lista de obras - Paola Bonizzoni - Dominio Público Uruguay

A Decision Procedure for Reflexive Regular Splicing Languages

A characterization of (regular) circular languages generated by monotone complete splicing systems

artículo científico publicado en 2010

A fast and practical approach to genotype phasing and imputation on a pedigree with erroneous and incomplete information

artículo científico publicado en 2012

APPROXIMATING THE MAXIMUM ISOMORPHIC AGREEMENT SUBTREE IS HARD

ASGAL: aligning RNA-Seq data to a splicing graph to detect novel alternative splicing events

artículo científico publicado en 2018

ASPIC: a novel method to predict the exon-intron structure of a gene that is optimally compatible to a set of transcript sequences

artículo científico publicado en 2005

ASPIC: a web resource for alternative splicing prediction and transcript isoforms characterization

artículo científico publicado en 2006

ASPicDB: a database of annotated transcript and protein variants generated by alternative splicing

artículo científico publicado en 2011

ASPicDB: a database resource for alternative splicing analysis.

artículo científico publicado en 2008

An efficient algorithm for haplotype inference on pedigrees with recombinations and mutations.

artículo científico publicado en 2011

Circular splicing and regularity

artículo científico publicado en 2004

Computational methods for alternative splicing prediction

artículo científico publicado en 2006

Computing the multi-string BWT and LCP array in external memory

artículo científico publicado en 2021

DNA and circular splicing?

artículo científico publicado en 2001

Detecting alternative gene structures from spliced ESTs: a computational approach

artículo científico publicado en 2009

Does Relaxing the Infinite Sites Assumption Give Better Tumor Phylogenies? An ILP-Based Comparative Approach

artículo científico publicado en 2019

Editorial

Exemplar longest common subsequence.

artículo científico publicado en 2007

Experimenting an approximation algorithm for the LCS

Explaining evolution via constrained persistent perfect phylogeny

artículo científico publicado en 2014

FSG: Fast String Graph Construction for De Novo Assembly.

artículo científico

Fingerprint Clustering with Bounded Number of Missing Values

Further steps in TANGO: improved taxonomic assignment in metagenomics.

artículo científico publicado en 2013

HapCHAT: adaptive haplotype assembly for efficiently leveraging high coverage in long reads.

artículo científico publicado en 2018

HapCol: accurate and memory-efficient haplotype assembly from long reads

artículo científico publicado en 2015

LSG: An External-Memory Tool to Compute String Graphs for Next-Generation Sequencing Data Assembly.

artículo científico publicado en 2016

MALVIRUS: an integrated web application for viral variant calling

artículo científico publicado en 2020

Modeling alternative splicing variants from RNA-Seq data with isoform graphs