Filtros de búsqueda

Lista de obras de Michael O'Donnell

A Central Swivel Point in the RFC Clamp Loader Controls PCNA Opening and Loading on DNA

artículo científico publicado el 13 de diciembre de 2011

A TOPRIM domain in the crystal structure of the catalytic core of Escherichia coli primase confirms a structural link to DNA topoisomerases

artículo científico publicado en 2000

A consensus view of DNA binding by the C family of replicative DNA polymerases

scholarly article

A novel function for the conserved glutamate residue in the walker B motif of replication factor C.

artículo científico publicado en 2013

A proposal: Evolution of PCNA's role as a marker of newly replicated DNA

artículo científico publicado en 2015

A proposal: Source of single strand DNA that elicits the SOS response.

artículo científico publicado en 2013

A single subunit directs the assembly of the Escherichia coli DNA sliding clamp loader.

artículo científico publicado en 2010

A sliding-clamp toolbelt binds high- and low-fidelity DNA polymerases simultaneously.

artículo científico publicado en 2005

A slow ATP-induced conformational change limits the rate of DNA binding but not the rate of beta clamp binding by the escherichia coli gamma complex clamp loader.

artículo científico publicado en 2009

A solution to release twisted DNA during chromosome replication by coupled DNA polymerases.

artículo científico publicado en 2013

A tale of toroids in DNA metabolism.

artículo científico publicado en 2000

ATP Binding to the Escherichia coli Clamp Loader Powers Opening of the Ring-shaped Clamp of DNA Polymerase III Holoenzyme

artículo científico publicado el 18 de septiembre de 1998

ATP hydrolysis catalyzed by human replication factor C requires participation of multiple subunits

artículo científico publicado el 29 de septiembre de 1998

Action of CMG with strand-specific DNA blocks supports an internal unwinding mode for the eukaryotic replicative helicase.

artículo científico publicado en 2017

An explanation for origin unwinding in eukaryotes

artículo científico publicado en 2019

An interaction between DNA ligase I and proliferating cell nuclear antigen: implications for Okazaki fragment synthesis and joining

artículo científico publicado en 1997

Biochemical basis of SOS-induced mutagenesis in Escherichia coli: reconstitution of in vitro lesion bypass dependent on the UmuD'2C mutagenic complex and RecA protein.

artículo científico publicado en 1998

CMG helicase and DNA polymerase ε form a functional 15-subunit holoenzyme for eukaryotic leading-strand DNA replication.

artículo científico publicado en 2014

Characterization of a triple DNA polymerase replisome.

artículo científico publicado en 2007

Clamp loader ATPases and the evolution of DNA replication machinery

artículo científico publicado el 20 de abril de 2012

Clamp loader structure predicts the architecture of DNA polymerase III holoenzyme and RFC

artículo científico publicado el 13 de noviembre de 2001

Competitive processivity-clamp usage by DNA polymerases during DNA replication and repair.

artículo científico publicado en 2003

Conserved residues in the delta subunit help the E. coli clamp loader, gamma complex, target primer-template DNA for clamp assembly.

artículo científico publicado en 2008

Cost of rNTP/dNTP pool imbalance at the replication fork

artículo científico publicado el 23 de julio de 2013

Cross-utilization of the beta sliding clamp by replicative polymerases of evolutionary divergent organisms

scientific article published on 01 August 2000

Crystal Structure of the δ′ Subunit of the Clamp-Loader Complex of E. coli DNA Polymerase III

artículo científico publicado el 31 de octubre de 1997

Crystal structure of the processivity clamp loader gamma (gamma) complex of E. coli DNA polymerase III

artículo científico publicado en 2001

Ctf4 organizes sister replisomes and Pol α into a replication factory

artículo científico publicado en 2019

DNA ligase: getting a grip to seal the deal.

artículo científico publicado en 2005

DNA polymerases are error-prone at RecA-mediated recombination intermediates.

scientific article published on 29 July 2013

DNA replication: keep moving and don't mind the gap.

artículo científico publicado en 2006

DNA unwinding mechanism of a eukaryotic replicative CMG helicase

artículo científico publicado en 2020

Devoted to the lagging strand_the chi subunit of DNA polymerase III holoenzyme contacts SSB to promote processive elongation and sliding clamp assembly

artículo científico publicado el 15 de abril de 1998

Direct restart of a replication fork stalled by a head-on RNA polymerase

scientific article published on 01 January 2010

Direct restart of a replication fork stalled by a head-on RNA polymerase.

artículo científico publicado en 2010

Division of labor--sequential ATP hydrolysis drives assembly of a DNA polymerase sliding clamp around DNA.

artículo científico publicado en 1999

DnaB drives DNA branch migration and dislodges proteins while encircling two DNA strands.

artículo científico publicado en 2002

Dual functions, clamp opening and primer-template recognition, define a key clamp loader subunit.

artículo científico publicado en 2004

Evolution of replication machines

artículo científico publicado en 2015

Functional uncoupling of twin polymerases: mechanism of polymerase dissociation from a lagging-strand block.

artículo científico publicado en 2004

Getting ready for DNA duplication

scientific article published on 27 September 2019

How a DNA Polymerase Clamp Loader Opens a Sliding Clamp

artículo científico publicado el 23 de diciembre de 2011

Human CD4(+) T lymphocytes consistently respond to the latent Epstein-Barr virus nuclear antigen EBNA1.

artículo científico publicado en 2000

Human RPA (hSSB) interacts with EBNA1, the latent origin binding protein of Epstein-Barr virus

artículo científico publicado el 15 de enero de 1998

Interaction of the beta sliding clamp with MutS, ligase, and DNA polymerase I.

artículo científico publicado en 2001

Involvement of the beta clamp in methyl-directed mismatch repair in vitro.

artículo científico publicado en 2009

Mcm10 promotes rapid isomerization of CMG-DNA for replisome bypass of lagging strand DNA blocks.

artículo científico publicado en 2017

Mcm4,6,7 uses a "pump in ring" mechanism to unwind DNA by steric exclusion and actively translocate along a duplex.

artículo científico publicado en 2003

Mechanism of asymmetric polymerase assembly at the eukaryotic replication fork.

artículo científico publicado en 2014

Mechanism of beta clamp opening by the delta subunit of Escherichia coli DNA polymerase III holoenzyme.

artículo científico publicado en 2001

Mechanism of polymerase collision release from sliding clamps on the lagging strand.

artículo científico publicado en 2009

Mechanism of the E. coli tau processivity switch during lagging-strand synthesis

artículo científico publicado en 2003

Mechanisms of DNA replication.

artículo científico publicado en 2000

Motors and switches: AAA+ machines within the replisome.

artículo científico publicado en 2002

Multiple competition reactions for RPA order the assembly of the DNA polymerase delta holoenzyme.

artículo científico publicado en 1999

New insights into replisome fluidity during chromosome replication

artículo científico publicado en 2013

Nuclease dead Cas9 is a programmable roadblock for DNA replication

artículo científico publicado en 2019

Ordered ATP hydrolysis in the gamma complex clamp loader AAA+ machine.

artículo científico publicado en 2003

Overproduction and analysis of eukaryotic multiprotein complexes in Escherichia coli using a dual-vector strategy.

artículo científico publicado en 2003

Phosphorylation of CMG helicase and Tof1 is required for programmed fork arrest

artículo científico publicado en 2016

Polymerase trafficking: A role for transcription factors in preventing replication fork arrest.

artículo científico publicado en 2010

Preferential D-loop extension by a translesion DNA polymerase underlies error-prone recombination

artículo científico publicado el 19 de mayo de 2013

Principles and Concepts of DNA Replication in Bacteria, Archaea, and Eukarya

artículo científico publicado el 1 de julio de 2013

Processivity factors

artículo científico publicado en 1999

Protein trafficking on sliding clamps.

artículo científico publicado en 2004

Proteomic and genomic characterization of chromatin complexes at a boundary

artículo científico publicado en 2005

RecA acts as a switch to regulate polymerase occupancy in a moving replication fork.

artículo científico publicado en 2013

Reconstitution of a eukaryotic replisome reveals suppression mechanisms that define leading/lagging strand operation.

artículo científico publicado en 2015

Reconstitution of a eukaryotic replisome reveals the mechanism of asymmetric distribution of DNA polymerases

artículo científico publicado en 2016

Reconstitution of the Mcm2-7p heterohexamer, subunit arrangement, and ATP site architecture.

artículo científico publicado en 2003

Replication Factor C Is a More Effective Proliferating Cell Nuclear Antigen (PCNA) Opener than the Checkpoint Clamp Loader, Rad24-RFC

artículo científico publicado el 24 de noviembre de 2011

Replication bypass of the acrolein-mediated deoxyguanine DNA-peptide cross-links by DNA polymerases of the DinB family.

artículo científico publicado en 2008

Replication factor C clamp loader subunit arrangement within the circular pentamer and its attachment points to proliferating cell nuclear antigen.

artículo científico publicado en 2003

Replisome Dynamics during Chromosome Duplication

artículo científico

Replisome bypass of a protein-based R-loop block by Pif1

artículo científico publicado en 2020

Replisome dynamics and use of DNA trombone loops to bypass replication blocks.

artículo científico publicado en 2008

Replisome fate upon encountering a leading strand block and clearance from DNA by recombination proteins

artículo científico publicado en 2007

Replisome mechanics: insights into a twin DNA polymerase machine

artículo científico publicado en 2007

Replisome mechanics: lagging strand events that influence speed and processivity

artículo científico publicado en 2014

Role of the adenovirus DNA-binding protein in in vitro adeno-associated virus DNA replication.

artículo científico publicado en 1998

RuvA is a sliding collar that protects Holliday junctions from unwinding while promoting branch migration.

artículo científico publicado en 2005

Single-molecule analysis of the Escherichia coli replisome and use of clamps to bypass replication barriers.

scientific article published on 11 April 2010

Single-molecule studies reveal the function of a third polymerase in the replisome

artículo científico publicado el 11 de diciembre de 2011

Sliding clamps: a (tail)ored fit.

artículo científico publicado en 2000

Structural biology. Getting DNA to unwind

artículo científico publicado en 2007

Structure of eukaryotic DNA polymerase δ bound to the PCNA clamp while encircling DNA

artículo científico publicado en 2020

Structure of the eukaryotic replicative CMG helicase suggests a pumpjack motion for translocation

artículo científico publicado en 2016

Structure of the polymerase ε holoenzyme and atomic model of the leading strand replisome

artículo científico publicado en 2020

Subunit sharing among high- and low-fidelity DNA polymerases

artículo científico publicado el 23 de julio de 2012

The ATP sites of AAA+ clamp loaders work together as a switch to assemble clamps on DNA

artículo científico publicado en 2014

The DNA replication machine of a gram-positive organism.

artículo científico publicado en 2000

The Escherichia coli Clamp Loader Can Actively Pry Open the β-Sliding Clamp

artículo científico publicado el 4 de octubre de 2011

The Escherichia coli DNA polymerase III holoenzyme contains both products of the dnaX gene, tau and gamma, but only tau is essential.

artículo científico publicado en 1993

The Eukaryotic Replication Machine.

artículo científico publicado en 2016

The Eukaryotic Replisome Goes Under the Microscope

artículo científico publicado en 2016

The Mechanism of ATP-Dependent Primer-Template Recognition by a Clamp Loader Complex

artículo científico publicado en 2009

The RFC clamp loader: structure and function

artículo científico publicado en 2012

The architecture of a eukaryotic replisome.

artículo científico publicado en 2015

The beta sliding clamp binds to multiple sites within MutL and MutS.

artículo científico publicado en 2006

The eukaryotic CMG helicase pumpjack and integration into the replisome

artículo científico publicado en 2016

The replication factor C clamp loader requires arginine finger sensors to drive DNA binding and proliferating cell nuclear antigen loading

artículo científico publicado en 2006

The ring-shaped hexameric helicases that function at DNA replication forks

artículo científico publicado en 2018

The ring-type polymerase sliding clamp family

artículo científico publicado en 2001

The sliding clamp of DNA polymerase III holoenzyme encircles DNA.

artículo científico publicado en 1992

Thermus thermophilis dnaX homolog encoding gamma- and tau-like proteins of the chromosomal replicase

artículo científico publicado en 1997

Three-dimensional structure of the beta subunit of E. coli DNA polymerase III holoenzyme: a sliding DNA clamp

artículo científico publicado el 1 de mayo de 1992

Toroidal proteins: Running rings around DNA

artículo científico publicado el 29 de enero de 1998

Trading places on DNA--a three-point switch underlies primer handoff from primase to the replicative DNA polymerase

artículo científico publicado en 1999

Translesion DNA polymerases remodel the replisome and alter the speed of the replicative helicase.

scholarly article

Twin DNA Pumps of a Hexameric Helicase Provide Power to Simultaneously Melt Two Duplexes

artículo científico publicado en 2004

What happens when replication and transcription complexes collide?

artículo científico publicado en 2010

cDNA cloning and gene mapping of human homologs for Schizosaccharomyces pombe rad17, rad1, and hus1 and cloning of homologs from mouse, Caenorhabditis elegans, and Drosophila melanogaster

scientific journal article