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Lista de obras de Andrei N Lupas

A CTP-dependent archaeal riboflavin kinase forms a bridge in the evolution of cradle-loop barrels

artículo científico publicado en 2007

A Completely Reimplemented MPI Bioinformatics Toolkit with a New HHpred Server at its Core

artículo científico publicado en 2017

A Trimeric Lipoprotein Assists in Trimeric Autotransporter Biogenesis in Enterobacteria

artículo científico publicado en 2014

A coiled-coil motif that sequesters ions to the hydrophobic core

artículo científico publicado en 2009

A conserved glycine residue of trimeric autotransporter domains plays a key role in Yersinia adhesin A autotransport

artículo científico publicado en 2007

A domain dictionary of trimeric autotransporter adhesins

artículo científico publicado en 2015

A galaxy of folds

artículo científico publicado en 2010

A new expression system for protein crystallization using trimeric coiled-coil adaptors

artículo científico publicado en 2008

A soluble mutant of the transmembrane receptor Af1503 features strong changes in coiled-coil periodicity

artículo científico publicado en 2014

A topological refactoring design strategy yields highly stable granulopoietic proteins

artículo científico publicado en 2022

A transition from strong right-handed to canonical left-handed supercoiling in a conserved coiled-coil segment of trimeric autotransporter adhesins

artículo científico publicado en 2010

A vocabulary of ancient peptides at the origin of folded proteins

artículo científico publicado en 2015

AAA proteins

artículo científico publicado en 2002

AbrB-like transcription factors assume a swapped hairpin fold that is evolutionarily related to double-psi beta barrels

artículo científico publicado en 2005

Adenylate cyclases: Receivers, transducers, and generators of signals.

artículo científico publicado en 2018

An Interface-Driven Design Strategy Yields a Novel, Corrugated Protein Architecture

article by Mohammad ElGamacy et al published 27 August 2018 in ACS Synthetic Biology

An endosomal tether undergoes an entropic collapse to bring vesicles together

artículo científico publicado en 2016

Asymmetric protein design from conserved supersecondary structures

artículo científico publicado en 2018

Auto-regulation of Rab5 GEF activity in Rabex5 by allosteric structural changes, catalytic core dynamics and ubiquitin binding

scientific article published on 13 November 2019

Axial helix rotation as a mechanism for signal regulation inferred from the crystallographic analysis of the E. coli serine chemoreceptor

artículo científico publicado en 2014

Barentsz, a new component of the Staufen-containing ribonucleoprotein particles in mammalian cells, interacts with Staufen in an RNA-dependent manner

artículo científico publicado en 2003

Bartonella adhesin a mediates a proangiogenic host cell response

artículo científico publicado en 2004

Bioinformatic analysis of ClpS, a protein module involved in prokaryotic and eukaryotic protein degradation

artículo científico publicado en 2003

Bioinformatics of the TULIP domain superfamily

artículo científico publicado en 2011

CLANS: a Java application for visualizing protein families based on pairwise similarity

artículo científico publicado en 2004

Characterization of AMA, a new AAA protein from Archaeoglobus and methanogenic archaea

artículo científico publicado en 2006

Characterization of a novel signal transducer element intrinsic to class IIIa/b adenylate cyclases and guanylate cyclases

artículo científico publicado en 2017

Characterization of the CrbS/R Two-Component System in Pseudomonas fluorescens Reveals a New Set of Genes under Its Control and a DNA Motif Required for CrbR-Mediated Transcriptional Activation

artículo científico publicado en 2017

Chemical Ligand Space of Cereblon

scientific article published on 14 September 2018

Classification of AAA+ proteins

artículo científico publicado en 2006

Coiled Coils - A Model System for the 21st Century

artículo científico publicado en 2016

Coiled coils meet the chaperone world

artículo científico publicado en 2004

Common evolutionary origin of swapped-hairpin and double-psi beta barrels

artículo científico publicado en 2006

Comparative analysis of coiled-coil prediction methods

artículo científico publicado en 2006

Complete fiber structures of complex trimeric autotransporter adhesins conserved in enterobacteria

artículo científico publicado en 2012

Comprehensive analysis of HAMP domains: implications for transmembrane signal transduction

artículo científico publicado en 2010

Correction: β-Propeller Blades as Ancestral Peptides in Protein Evolution.

artículo científico publicado en 2014

Cradle-loop barrels and the concept of metafolds in protein classification by natural descent.

artículo científico publicado en 2008

Crystal structure of SpoVT, the final modulator of gene expression during spore development in Bacillus subtilis

artículo científico publicado en 2009

Crystal structure of a dimeric archaeal cleavage and polyadenylation specificity factor

artículo científico publicado en 2011

Crystallographic snapshot of the Escherichia coli EnvZ histidine kinase in an active conformation

artículo científico publicado en 2014

Delineation of structural domains and identification of functionally important residues in DNA repair enzyme exonuclease VII.

artículo científico publicado en 2012

Design of novel granulopoietic proteins by topological rescaffolding

artículo científico publicado en 2020

Domain annotation of trimeric autotransporter adhesins--daTAA

artículo científico publicado en 2008

Editorial

Evolution of the beta-propeller fold

artículo científico publicado en 2008

Evolutionary relationships of microbial aromatic prenyltransferases

artículo científico publicado en 2011

Expression, crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of the outer membrane protein OmpW from Escherichia coli

artículo científico publicado en 2006

Fold recognition without folds

artículo científico publicado en 2002

From ancestral peptides to designed proteins

artículo científico publicado en 2017

Functional mapping of YadA- and Ail-mediated binding of human factor H to Yersinia enterocolitica serotype O:3.

artículo científico publicado en 2008

Gene duplication of the eight-stranded beta-barrel OmpX produces a functional pore: a scenario for the evolution of transmembrane beta-barrels

artículo científico publicado en 2006

HAMP domain-mediated signal transduction probed with a mycobacterial adenylyl cyclase as a reporter

artículo científico publicado en 2011

HHomp--prediction and classification of outer membrane proteins

artículo científico publicado en 2009

HHsenser: exhaustive transitive profile search using HMM-HMM comparison

artículo científico publicado en 2006

Histones predate the split between bacteria and archaea

artículo científico publicado en 2019

Historical review: another 50th anniversary--new periodicities in coiled coils

artículo científico publicado en 2003

Homology of SMP domains to the TULIP superfamily of lipid-binding proteins provides a structural basis for lipid exchange between ER and mitochondria

artículo científico publicado en 2010

Inherent chaperone-like activity of aspartic proteases reveals a distant evolutionary relation to double-psi barrel domains of AAA-ATPases

artículo científico publicado en 2007

Journal of Structural Biology - Paper of the Year 2017.

artículo científico publicado en 2018

Measuring the conformational space of square four-helical bundles with the program samCC.

artículo científico publicado en 2010

Mechanism of regulation of receptor histidine kinases

artículo científico publicado en 2012

Model structure of the prototypical non-fimbrial adhesin YadA of Yersinia enterocolitica

artículo científico publicado en 2006

Modeling AAA+ ring complexes from monomeric structures

artículo científico publicado en 2006

More than the sum of their parts: on the evolution of proteins from peptides

artículo científico publicado en 2003

On the origin of the histone fold

artículo científico publicado en 2007

Origin of a folded repeat protein from an intrinsically disordered ancestor

artículo científico publicado en 2016

PhyloGenie: automated phylome generation and analysis

artículo científico publicado en 2004

Phylogenetic analysis of AAA proteins

artículo científico publicado en 2004

PrlF and YhaV form a new toxin-antitoxin system in Escherichia coli

scholarly article published April 2006

Prokaryotic ancestry of eukaryotic protein networks mediating innate immunity and apoptosis

artículo científico publicado en 2013

Protein Design. What I cannot create, I do not understand

artículo científico publicado en 2014

Purification of the YadA membrane anchor for secondary structure analysis and crystallization

artículo científico publicado en 2006

REPPER--repeats and their periodicities in fibrous proteins

artículo científico publicado en 2005

Ribosomal proteins as documents of the transition from unstructured (poly)peptides to folded proteins

artículo científico publicado en 2017

SMG6 interacts with the exon junction complex via two conserved EJC-binding motifs (EBMs) required for nonsense-mediated mRNA decay

artículo científico publicado en 2010

STAC--A New Domain Associated with Transmembrane Solute Transport and Two-Component Signal Transduction Systems

artículo científico publicado en 2015

Salmonella Pathogenicity Island 4 encodes a giant non-fimbrial adhesin and the cognate type 1 secretion system

artículo científico publicado en 2007

Some of the most interesting CASP11 targets through the eyes of their authors

artículo científico publicado en 2015

Structural diversity of oligomeric β-propellers with different numbers of identical blades

artículo científico publicado en 2019

Structural dynamics of the cereblon ligand binding domain

artículo científico publicado en 2015

Structure and activity of the N-terminal substrate recognition domains in proteasomal ATPases

artículo científico publicado en 2009

Structure and evolution of N-domains in AAA metalloproteases

artículo científico publicado en 2015

Structure and function of tripeptidyl peptidase II, a giant cytosolic protease ⬇️

artículo científico publicado el 13 de julio de 2011

Structure of the head of the Bartonella adhesin BadA

artículo científico publicado en 2008

TPRpred: a tool for prediction of TPR-, PPR- and SEL1-like repeats from protein sequences

artículo científico publicado en 2007

The GD box: a widespread noncontiguous supersecondary structural element

artículo científico publicado en 2009

The HAMP domain structure implies helix rotation in transmembrane signaling

artículo científico publicado en 2006

The HHpred interactive server for protein homology detection and structure prediction

artículo científico publicado en 2005

The MPI Bioinformatics Toolkit for protein sequence analysis

artículo científico publicado en 2006

The MPI bioinformatics Toolkit as an integrative platform for advanced protein sequence and structure analysis

artículo científico publicado en 2016

The Origin of Mitochondria-Specific Outer Membrane β-Barrels from an Ancestral Bacterial Fragment

artículo científico publicado en 2018

The Structure and Topology of α-Helical Coiled Coils

artículo científico publicado en 2017

The Sulfolobus solfataricus AAA protein Sso0909, a homologue of the eukaryotic ESCRT Vps4 ATPase

artículo científico publicado en 2008

The TULIP superfamily of eukaryotic lipid-binding proteins as a mediator of lipid sensing and transport

artículo científico publicado en 2016

The archaeal proteasome is regulated by a network of AAA ATPases

artículo científico publicado en 2012

The breakthrough in protein structure prediction

scientific article published in 2021

The first prokaryotic trehalose synthase complex identified in the hyperthermophilic crenarchaeon Thermoproteus tenax

artículo científico publicado en 2013

The genome sequence of the thermoacidophilic scavenger Thermoplasma acidophilum

artículo científico publicado en 2000

The head of Bartonella adhesin A is crucial for host cell interaction of Bartonella henselae

artículo científico publicado en 2008

The long coming of computational structural biology.

artículo científico publicado en 2008

The mechanisms of HAMP-mediated signaling in transmembrane receptors

artículo científico publicado en 2011

The structure of E. coli IgG-binding protein D suggests a general model for bending and binding in trimeric autotransporter adhesins

artículo científico publicado en 2011

The structure of alpha-helical coiled coils

artículo científico publicado en 2005

The thalidomide-binding domain of cereblon defines the CULT domain family and is a new member of the β-tent fold

artículo científico publicado en 2015

Thermoplasma acidophilum TAA43 is an archaeal member of the eukaryotic meiotic branch of AAA ATPases.

artículo científico publicado en 2004

Trimeric autotransporter adhesins: variable structure, common function

artículo científico publicado en 2006

Two unique membrane-bound AAA proteins from Sulfolobus solfataricus

artículo científico publicado en 2009

WIPI-1alpha (WIPI49), a member of the novel 7-bladed WIPI protein family, is aberrantly expressed in human cancer and is linked to starvation-induced autophagy

artículo científico publicado en 2004

prlF and yhaV encode a new toxin-antitoxin system in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2007

α/β coiled coils

artículo científico publicado en 2016

β-Propeller blades as ancestral peptides in protein evolution

artículo científico publicado en 2013

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