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Lista de obras de Joshua B. Plotkin

A machine-vision approach for automated pain measurement at millisecond timescales

scientific article published on 06 August 2020

A statistical theory for sampling species abundances

artículo científico publicado en 2007

Absorption and fixation times for neutral and quasi-neutral populations with density dependence

scientific article published on 18 September 2008

Age-Correlated Gene Expression in Normal and Neurodegenerative Human Brain Tissues ⬇️

artículo científico publicado el 29 de septiembre de 2010

Aging and gene expression in the primate brain

artículo científico publicado en 2005

Ancel (2000) on the Baldwin effect

artículo científico publicado en 2019

Assessing the determinants of evolutionary rates in the presence of noise

scientific article published on 07 March 2007

Assortative mating can impede or facilitate fixation of underdominant alleles

artículo científico publicado en 2016

Cell biology. The lives of proteins

artículo científico publicado en 2011

Cluster analysis of spatial patterns in Malaysian tree species

artículo científico publicado en 2002

Coding-sequence determinants of gene expression in Escherichia coli

artículo científico publicado en 2009

Codon bias and frequency-dependent selection on the hemagglutinin epitopes of influenza A virus ⬇️

artículo científico publicado el 14 de mayo de 2003

Codon usage and selection on proteins

artículo científico publicado en 2006

Codon usage influences fitness through RNA toxicity

article published in the Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Codon usage influences fitness through RNA toxicity

Collapse of cooperation in evolving games ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Consequences of defaunation for a tropical tree community ⬇️

artículo científico publicado el 12 de marzo de 2013

Contingency and entrenchment in protein evolution under purifying selection ⬇️

artículo científico publicado en 2015

Coordinated Evolution of Influenza A Surface Proteins

artículo científico publicado en 2015

Detecting epistasis from an ensemble of adapting populations.

artículo científico publicado en 2015

Detecting evolutionary forces in language change.

artículo científico publicado en 2017

Detecting selection using a single genome sequence of M. tuberculosis and P. falciparum

artículo científico publicado en 2004

Directionality in the evolution of influenza A haemagglutinin

artículo científico publicado en 2008

Directionality in the evolution of influenza A haemagglutinin.

artículo científico publicado en 2009

Dynamical resonance can account for seasonality of influenza epidemics

artículo científico publicado en 2004

Dynamics of Neutral and Selected Alleles When the Offspring Distribution Is Skewed ⬇️

artículo científico publicado el 1 de junio de 2012

Environmental robustness and the adaptability of populations

scientific article published on 11 January 2012

Epistasis Increases the Rate of Conditionally Neutral Substitution in an Adapting Population ⬇️

artículo científico publicado el 1 de febrero de 2011

Epistasis and the Dynamics of Reversion in Molecular Evolution

artículo científico publicado en 2016

Estimating selection pressures from limited comparative data

scientific article published on 05 June 2006

Evolution and persistence of influenza A and other diseases

artículo científico publicado en 2004

Evolution of empathetic moral evaluation

scientific article published on 09 April 2019

Evolution, safety, and highly pathogenic influenza viruses

artículo científico publicado en 2012

Evolution. In evolution, the sum is less than its parts

artículo científico publicado en 2011

Evolutionary Rescue Through Partly Heritable Phenotypic Variability

article

Evolutionary consequences of behavioral diversity.

artículo científico publicado en 2016

Evolutionary games with environmental feedbacks

artículo científico publicado en 2020

Experimentally guided models reveal replication principles that shape the mutation distribution of RNA viruses

artículo científico publicado en 2015

Explosive radiation of a bacterial species group

artículo científico publicado en 2012

Extortion and cooperation in the Prisoner's Dilemma

artículo científico publicado en 2012

Formal properties of the probability of fixation: identities, inequalities and approximations

artículo científico publicado en 2014

From extortion to generosity, evolution in the Iterated Prisoner's Dilemma.

artículo científico publicado en 2013

Generalized population models and the nature of genetic drift ⬇️

artículo científico publicado el 28 de junio de 2011

Genome landscapes and bacteriophage codon usage

artículo científico publicado en 2008

Genome-Wide Survey of Natural Selection on Functional, Structural, and Network Properties of Polymorphic Sites in Saccharomyces paradoxus ⬇️

artículo científico publicado el 3 de abril de 2011

Genome-wide analysis of natural selection on human cis-elements

artículo científico publicado en 2008

Hemagglutinin sequence clusters and the antigenic evolution of influenza A virus

artículo científico publicado en 2002

Host-Pathogen Coevolution and the Emergence of Broadly Neutralizing Antibodies in Chronic Infections

artículo científico publicado en 2016

Identifying signatures of selection in genetic time series

artículo científico publicado en 2013

Immune history shapes specificity of pandemic H1N1 influenza antibody responses.

artículo científico publicado en 2013

Improved Ribosome-Footprint and mRNA Measurements Provide Insights into Dynamics and Regulation of Yeast Translation.

artículo científico

Inferring fitness landscapes by regression produces biased estimates of epistasis. ⬇️

artículo científico publicado en 2014

Inferring the Dynamics of Diversification: A Coalescent Approach ⬇️

artículo científico publicado el 28 de septiembre de 2010

Inferring the shape of global epistasis.

artículo científico publicado en 2018

Isolation and characterization of adenoviruses persistently shed from the gastrointestinal tract of non-human primates

artículo científico publicado en 2009

Matrix dimensions bias demographic inferences: implications for comparative plant demography

artículo científico publicado en 2010

Molecular evolution: Hidden diversity sparks adaptation

scientific article published on 01 June 2011

Molecular evolution: No escape from the tangled bank

artículo científico publicado en 2017

Moonshots, investment booms, and selection bias in the transmission of cultural traits

artículo científico publicado en 2021

Mortality due to influenza in the United States--an annualized regression approach using multiple-cause mortality data

artículo científico publicado en 2005

Mutational robustness can facilitate adaptation

artículo científico publicado en 2010

On the accessibility of adaptive phenotypes of a bacterial metabolic network

artículo científico publicado en 2009

Persistent expression of Pax3 in the neural crest causes cleft palate and defective osteogenesis in mice

artículo científico publicado en 2008

Phenotypic Plasticity Promotes Balanced Polymorphism in Periodic Environments by a Genomic Storage Effect

artículo científico publicado en 2016

Phenotypic plasticity promotes recombination and gene clustering in periodic environments

artículo científico publicado en 2017

Prevalence of epistasis in the evolution of influenza A surface proteins

artículo científico publicado en 2011

Rate-limiting steps in yeast protein translation

artículo científico publicado en 2013

Rational spatio-temporal strategies for controlling a Chagas disease vector in urban environments

artículo científico publicado en 2010

Reconciling molecular phylogenies with the fossil record ⬇️

artículo científico publicado el 19 de septiembre de 2011

Reconstructing influenza incidence by deconvolution of daily mortality time series

scholarly article

Redundancy, antiredundancy, and the robustness of genomes

artículo científico publicado en 2002

Regulated CRISPR Modules Exploit a Dual Defense Strategy of Restriction and Abortive Infection in a Model of Prokaryote-Phage Coevolution

artículo científico publicado en 2015

Reinforcement of pre-zygotic isolation and karyotype evolution in Agrodiaetus butterflies

artículo científico publicado en 2005

Retracing micro-epidemics of Chagas disease using epicenter regression

artículo científico publicado en 2011

SAMPLING THE SPECIES COMPOSITION OF A LANDSCAPE

article

Sampling the Species Composition of a Landscape

article

Seed dispersal and spatial pattern in tropical trees

artículo científico publicado en 2006

Selection biases the prevalence and type of epistasis along adaptive trajectories

artículo científico publicado en 2013

Selection for Protein Stability Enriches for Epistatic Interactions

article

Single hemagglutinin mutations that alter both antigenicity and receptor binding avidity influence influenza virus antigenic clustering

artículo científico publicado en 2013

Small groups and long memories promote cooperation

artículo científico publicado en 2016

Some consequences of demographic stochasticity in population genetics

artículo científico publicado en 2010

Spatial patterns in discordant diagnostic test results for Chagas disease: links to transmission hotspots

artículo científico publicado en 2009

Spatial structure and genetic diversity of three tropical tree species with different habitat preferences within a natural forest

article

Structure and age jointly influence rates of protein evolution

artículo científico publicado en 2012

Synonymous but not the same: the causes and consequences of codon bias

artículo científico publicado en 2010

The different effects of apoptosis and DNA repair on tumorigenesis

artículo científico publicado en 2002

The dynamics of adaptation on correlated fitness landscapes

scientific article published on 26 October 2009

The equilibrium allele frequency distribution for a population with reproductive skew

artículo científico publicado en 2014

The evolution of complex gene regulation by low-specificity binding sites

artículo científico publicado en 2013

The evolution of genetic architectures underlying quantitative traits.

artículo científico publicado en 2013

The evolutionary advantage of heritable phenotypic heterogeneity

artículo científico publicado en 2017

The inevitability of unconditionally deleterious substitutions during adaptation

artículo científico publicado en 2014

The polymorphism frequency spectrum of finitely many sites under selection

artículo científico publicado en 2008

The population genetics of cooperative gene regulation

artículo científico publicado en 2012

The population genetics of dN/dS ⬇️

artículo científico publicado en 2008

The role of epistasis in protein evolution.

artículo científico publicado en 2013

The structure of allelic diversity in the presence of purifying selection ⬇️

artículo científico publicado el 16 de diciembre de 2011

The structure of genealogies in the presence of purifying selection: a fitness-class coalescent

artículo científico publicado en 2011

Tissue-specific codon usage and the expression of human genes

scholarly article

Transcriptional errors and the drift barrier

artículo científico publicado en 2016

Transcriptional regulation is only half the story

artículo científico publicado en 2010

Using protein complexes to predict phenotypic effects of gene mutation

artículo científico publicado en 2007

Vaccinating to protect a vulnerable subpopulation

artículo científico publicado en 2007

Variations in the progranulin gene affect global gene expression in frontotemporal lobar degeneration

artículo científico publicado en 2008

Weak 5'-mRNA secondary structures in short eukaryotic genes.

artículo científico publicado en 2012

Why transcription factor binding sites are ten nucleotides long.

artículo científico publicado en 2012

Young proteins experience more variable selection pressures than old proteins

artículo científico publicado en 2010

riboviz: analysis and visualization of ribosome profiling datasets.

artículo científico publicado en 2017

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