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Lista de obras de Simon J van Heeringen

A genome-wide survey of maternal and embryonic transcripts during Xenopus tropicalis development

artículo científico publicado en 2013

A hierarchy of H3K4me3 and H3K27me3 acquisition in spatial gene regulation in Xenopus embryos.

artículo científico publicado en 2009

ANANSE: an enhancer network-based computational approach for predicting key transcription factors in cell fate determination

scientific article published on 28 June 2021

APR-246/PRIMA-1(MET) rescues epidermal differentiation in skin keratinocytes derived from EEC syndrome patients with p63 mutations

artículo científico publicado en 2013

Antisense transcription of the myotonic dystrophy locus yields low-abundant RNAs with and without (CAG)n repeat.

artículo científico publicado en 2017

ChIP-Seq of ERalpha and RNA polymerase II defines genes differentially responding to ligands

artículo científico publicado en 2009

ChIP-chip designs to interrogate the genome of Xenopus embryos for transcription factor binding and epigenetic regulation

artículo científico publicado en 2010

ChIP-seq Data Processing for PcG Proteins and Associated Histone Modifications.

artículo científico publicado en 2016

Characterization of genome-wide p53-binding sites upon stress response.

artículo científico publicado en 2008

Combinatorial transcription factor activities on open chromatin induce embryonic heterogeneity in vertebrates

artículo científico publicado en 2021

Dynamics of enhancer chromatin signatures mark the transition from pluripotency to cell specification during embryogenesis.

artículo científico publicado en 2012

Embryonic transcription is controlled by maternally defined chromatin state.

artículo científico publicado en 2015

Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis

artículo científico publicado en 2016

Genome-wide profiling of liver X receptor, retinoid X receptor, and peroxisome proliferator-activated receptor α in mouse liver reveals extensive sharing of binding sites

artículo científico publicado en 2011

Genome-wide profiling of p63 DNA-binding sites identifies an element that regulates gene expression during limb development in the 7q21 SHFM1 locus.

artículo científico publicado en 2010

Genomic organization and modulation of gene expression of the TGF-β and FGF pathways in the allotetraploid frog Xenopus laevis

artículo científico publicado en 2016

GimmeMotifs: a de novo motif prediction pipeline for ChIP-sequencing experiments ⬇️

artículo científico publicado el 15 de noviembre de 2010

Global absolute quantification reveals tight regulation of protein expression in single Xenopus eggs.

artículo científico publicado en 2014

Heterochromatic histone modifications at transposons in Xenopus tropicalis embryos

artículo científico publicado en 2016

Investigating the effect of dependence between conditions with Bayesian Linear Mixed Models for motif activity analysis

artículo científico publicado en 2020

MTF2 recruits Polycomb Repressive Complex 2 by helical-shape-selective DNA binding

artículo científico publicado en 2018

Normal formation of a vertebrate body plan and loss of tissue maintenance in the absence of ezh2.

artículo científico publicado en 2016

Nucleotide composition-linked divergence of vertebrate core promoter architecture.

artículo científico publicado en 2011

Principles of nucleation of H3K27 methylation during embryonic development.

artículo científico publicado en 2013

Regulatory remodeling in the allo-tetraploid frog Xenopus laevis

artículo científico publicado en 2017

Role of p53 serine 46 in p53 target gene regulation

artículo científico publicado en 2011

The epigenome in early vertebrate development.

artículo científico publicado en 2011

The novel p53 target gene IRF2BP2 participates in cell survival during the p53 stress response

artículo científico publicado en 2008

Transcription factor p63 bookmarks and regulates dynamic enhancers during epidermal differentiation.

artículo científico publicado en 2015

fluff: exploratory analysis and visualization of high-throughput sequencing data

artículo científico publicado en 2016

genomepy: download genomes the easy way

artículo científico publicado en 2017

p63 exerts spatio-temporal control of palatal epithelial cell fate to prevent cleft palate

artículo científico publicado en 2017

β-Glucan Reverses the Epigenetic State of LPS-Induced Immunological Tolerance

artículo científico publicado en 2016

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