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Lista de obras de Wout Bittremieux

2018 YPIC Challenge: A Case Study in Characterizing an Unknown Protein Sample

scientific article published on 07 October 2019

A Comprehensive Evaluation of Consensus Spectrum Generation Methods in Proteomics

publication published on 13 May 2022

A community proposal to integrate proteomics activities in ELIXIR

artículo científico publicado en 2017

A learned embedding for efficient joint analysis of millions of mass spectra

artículo científico publicado en 2022

A primer to frequent itemset mining for bioinformatics

artículo científico publicado en 2015

Auto-deconvolution and molecular networking of gas chromatography-mass spectrometry data

scientific article published on 09 November 2020

Comparison of Cosine, Modified Cosine, and Neutral Loss Based Spectrum Alignment For Discovery of Structurally Related Molecules

artículo científico publicado en 2022

Computational quality control tools for mass spectrometry proteomics

artículo científico publicado en 2016

Designing biomedical proteomics experiments: state-of-the-art and future perspectives

artículo científico publicado en 2016

Efficient reduction of candidate matches in peptide spectrum library searching using the top k most intense peaks

artículo científico publicado en 2014

Enhancing untargeted metabolomics using metadata-based source annotation

artículo científico publicado en 2022

Extremely Fast and Accurate Open Modification Spectral Library Searching of High-Resolution Mass Spectra Using Feature Hashing and Graphics Processing Units

artículo científico publicado en 2019

Fast Open Modification Spectral Library Searching through Approximate Nearest Neighbor Indexing

artículo científico publicado en 2018

Fragment ion intensity prediction improves the identification rate of non-tryptic peptides in timsTOF

artículo científico publicado en 2024

Grasping frequent subgraph mining for bioinformatics applications

article

Large‐scale tandem mass spectrum clustering using fast nearest neighbor searching

artículo científico publicado en 2021

MESSAR: Automated recommendation of metabolite substructures from tandem mass spectra

artículo científico publicado en 2020

Machine learning applications in proteomics research: how the past can boost the future

artículo científico publicado en 2014

Mining the Enriched Subgraphs for Specific Vertices in a Biological Graph.

artículo científico publicado en 2016

Native metabolomics identifies the rivulariapeptolide family of protease inhibitors ⬇️

artículo científico publicado en 2022

On the feasibility of mining CD8+ T cell receptor patterns underlying immunogenic peptide recognition

artículo científico

Open Science Resources for the Mass Spectrometry-Based Analysis of SARS-CoV-2

artículo científico publicado en 2021

Physicochemical properties determining drug detection in skin

artículo científico publicado en 2021

Proceedings of the EuBIC developer's meeting 2018

article

Proteomics Standards Initiative's ProForma 2.0: Unifying the Encoding of Proteoforms and Peptidoforms

artículo científico publicado en 2022

Quality control in mass spectrometry-based proteomics

artículo científico publicado en 2017

TCRex: a webtool for the prediction of T-cell receptor sequence epitope specificity

The Human Proteome Organization-Proteomics Standards Initiative Quality Control Working Group: Making Quality Control More Accessible for Biological Mass Spectrometry.

artículo científico publicado en 2017

The Proteomics Standards Initiative: Fifteen Years of Progress and Future Work.

artículo científico publicado en 2017

Unified and Standardized Mass Spectrometry Data Processing in Python Using spectrum_utils

scientific article published in 2023

Universal Spectrum Identifier for mass spectra

artículo científico publicado en 2021

Unsupervised Quality Assessment of Mass Spectrometry Proteomics Experiments by Multivariate Quality Control Metrics

artículo científico publicado en 2016

Using Expert Driven Machine Learning to Enhance Dynamic Metabolomics Data Analysis

artículo científico publicado en 2019

iMonDB: Mass Spectrometry Quality Control through Instrument Monitoring

artículo científico publicado en 2015

jqcML: an open-source java API for mass spectrometry quality control data in the qcML format

artículo científico publicado en 2014

ppx: Programmatic Access to Proteomics Data Repositories

artículo científico publicado en 2021

qcML: an exchange format for quality control metrics from mass spectrometry experiments

artículo científico

spectrum_utils: A Python Package for Mass Spectrometry Data Processing and Visualization

scientific article published on 20 December 2019

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